Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Практика_4_БИ_М_2014

.pdf
Скачиваний:
5
Добавлен:
24.03.2015
Размер:
449.17 Кб
Скачать

Этап 4a: Изменения необязательных параметров

Максимальное кол-во выравниваний в выдаче

Вероятность нахождения последовательностей с таким же скором по случайным причинам

Scoring matrix

Этап 4a: Изменения необязательных параметров

Автоматическая подстройка под параметров под короткие последовательности

Для белка стандартно - 3, можно установить 2 для короткого белка, или 4-5 для более точного поиска

Автоматическая подстройка под контекстные особенности организмов (GC состав)

Этап 4a: Изменения необязательных параметров

Замаскировать low-complexity

районы

Задание на дом

Провести BLAST последовательности

Определить гомологов

Определить потенциальную функцию белка

Дать статистическую оценку найденным гомологам