Практика_4_БИ_М_2014
.pdfЭтап 4a: Изменения необязательных параметров
Максимальное кол-во выравниваний в выдаче
Вероятность нахождения последовательностей с таким же скором по случайным причинам
Scoring matrix
Этап 4a: Изменения необязательных параметров
Автоматическая подстройка под параметров под короткие последовательности
Для белка стандартно - 3, можно установить 2 для короткого белка, или 4-5 для более точного поиска
Автоматическая подстройка под контекстные особенности организмов (GC состав)
Этап 4a: Изменения необязательных параметров
Замаскировать low-complexity
районы
Задание на дом
Провести BLAST последовательности
Определить гомологов
Определить потенциальную функцию белка
Дать статистическую оценку найденным гомологам