Тема+8,9.+Источники+научной+информации.+Поиск+и+анализ+научной+информации

Тема 8,9. Источники научной информации. Постановка вопросов и поиск ответов

Цель занятия: познакомиться с различными источниками научных данных, приобрести опыт поиска информации в базах данных медицинской литературы.

Студент должен знать:

1.Источники научных данных: оригинальные статьи в журналах, обзоры, рефераты

вдоказательных журналах, компьютеризированные системы поддержки решений; иерархию степени доказательности различных источников.

2.Принципы работы с информационно-поисковыми системами и базами данных медицинской литературы.

Уметь:

1.Провести литературный поиск информации в библиотеке и Internet-ресурсах по заданной теме на основе сформулированного клинического вопроса.

2.Осуществить поиск в базе данных медицинской литературы PubMed.

3.Провести анализ полученных результатов поиска и оформить их в виде обзора литературы и библиографического списка.

Вопросы для самоподготовки:

1.Виды источников научной информации в печатных и электронных ресурсах.

2.Правила формулирования вопроса для поиска доказательной информации: PICOвопрос, выбора лучшего способа решения вопроса.

3.Способы поиска медицинской информации в PubMed.

4.Назначение и правила оформления обзоров и систематических обзоров.

Домашнее задание

1.На учебном портале educa.usma.ru в разделе Ресурсы / Электронные образовательные ресурсы размещены ссылки на учебные фильмы-лекции.

Фильм-лекцию Наукометрия+. PubMed-инструкция по применению (https://youtu.be/TD3X7QZsEdQ) прослушать обязательно, остальные по желанию.

2.Ознакомиться с приведенным ниже информационным материалом.

3.Подумать и сформулировать ключевой научный вопрос (проблему) ответ на который вы хотели бы получить в результате поиска научной медицинской информации в электронных ресурсах.

Работа на занятии

Стратегия поиска информации в информационно-поисковой системе:

1.Формулировка ключевого вопроса, на который надо найти ответ в виде

PICO-вопроса (Один из примеров: https://youtu.be/-tbpkhkJuXA)

PICO-вопрос:

Patient – пациент или проблема

Intervention – вмешательство (факторы риска, причина, диагностика, лечение, профилактика…)

Comparision – сравнение/контроль или альтернативное вмешательство Outcome – исходы (выздоровление, симптомы, заболеваемость, смертность…)

2.Лучший способ решения данного вопроса (кокой вид исследования поможет решить данную проблему).

3.Найти ответ на вопрос в ресурсе открытого доступа PubMed

(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov) используя различные сценарии поиска (ключевые слова; MeSH – медицинские тематические рубрики; издание; статья, автор; дополнительные условия: тип публикаций (резюме, статьи, обзоры), год издания, регион, возрастно-половая группа, человек/животные; некоторые технические параметры: логические операторы (and, or, not), знак * в конце слова (любые возможные варианты окончания слова и т.д.

4.Отбор публикаций, отвечающих критериям поиска

Если вы не смогли сформулировать ключевой вопрос, используйте предлженный ниже.

Задача. Как оценить дополнительный риск ожирения или избыточной массы тела для ребенка с низкой физической активностью?

Сформулируйте PICO-вопрос, определите лучший способ решения вопроса. Проведите поиск публикаций в PubMed.

Информационный материал

Источники научной информации:

1.Оригинальные статьи, опубликованные в журналах

2.Обзоры и систематические обзоры

3.Рефераты в доказательных журналах

4.Компьютеризированные системы поддержки решения

Поиск доказательной информации. Базы данных

Выбор стратегии поиска информации

Часто встречающиеся типы вопросов в медицинской практике

Из множества вопросов, которые могут интересовать медицинских работников можно выделить наиболее часто встречаемые типы. Это вопросы, касающиеся клинических данных, симптомов заболевания, прогноза, профилактики, этиологии и причин заболевания, вреда и риска, диагностических тестов, дифференциальной диагностики, качества жизни, терапии, экономической эффективности и др.

Для целей разработки стратегий информационного поиска можно указать 5 общих типов клинических вопросов, которые включают в себя все прочие типы.

•Лечение (терапия) - вопросы о том, какое лечение (если таковое возможно) надо назначить и какими могут быть результаты различных методов лечения. Эта группа включает также вопросы относительно профилактики, организации программ скрининга, повышения качества медицинской помощи.

•Диагностика - вопросы относительно степени надежности и клинической полезности конкретного теста, которые обычно ставят, чтобы определить, принесет ли данный тест достаточную пользу конкретному пациенту. В большинстве статей по диагностике результаты исследуемого диагностического теста сравнивают с результатами другого, стандартного теста, который рассматривают как эталонный или авторитетный («золотой стандарт»). Сюда же относят вопросы по дифференциальной диагностике.

•Прогноз - вопросы относительно будущего состояния здоровья пациента, продолжительности и качества его жизни при выборе того или иного конкретного варианта лечения.

•Этиология/побочные эффекты - вопросы относительно взаимосвязей между болезнью и возможными ее причинами, включая побочные эффекты, связанный с различными вариантами лечения (ЛС, терапевтическими и диагностическими вмешательствами).

•Экономическая эффективность - вопросы относительно экономической эффективности различных лечебных, профилактических и диагностических процедур.

Использование технологии доказательной медицины предполагает поиск информации в литературе и БД. Первоочередной шаг научно обоснованной практики (доказательной медицины) - точная формулировка «сфокусированного» вопроса.

Формулировка вопроса

В 1995 г. группа ученных во главе с Richardson предложили своеобразную «анатомию» хорошо сформулированного вопроса, которая носит название «формула ПВСИ (PICO)» и позволяет практикующим медицинским работникам определить четыре компонента правильно сформулированного вопроса.

•Population (или Patient) - целевой контингент (Популяция или Пациент): кого имеют ввиду?

•Intervention (иногда Exposure) - Вмешательство, (Воздействие): что в отношении пациентов делают или что с ними происходит?

•Comparison - Сопоставление (Сравнение): какова альтернатива?

•Outcomes - Результаты, (Исходы): как можно измерить результат вмешательства или воздействия?

Таким образом, эти четыре компонента позволяют выбрать дизайн эпидемиологических исследований, результаты которых можно использовать для решения соответствующих практических задач в медицине.

Типы вопросов и соответствующий им дизайн эпидемиологических исследова-

ний

MEDLINE

URL: http://www. pubmed. com

БД Национальной медицинской библиотеки США, содержащая библиографические описания статей и их рефераты (70 % статей имеют рефераты). В настоящее время БД охватывает почти 4500 журналов, издаваемых в США и более чем в 70 других странах.

MEDLINE включает описания 12 млн. статей, опубликованных с 1966 года по настоящее время. Новые записи добавляются еженедельно, 400 000 записей в год. Для каждой записи в MEDLINE задаются медицинские предметные рубрики (MeSH Terms) и типы публикаций (Publication Types) из словаря, контролируемого Национальной медицинской библиотекой США. Библиографические описания и рефераты MEDLINE образуют основу и доступны в составе БД Национальной медицинской библиотеки США PubMed, в которой можно проводить поиск через Интернет. MEDLINE содержит более 13 миллионов записей. Хотя сама БД не включает полных текстов статей, но их можно найти по ссылке на другом сайте (где они представлены бесплатно или платно).

Основы поиска доказательной информации в БД (на примере поиска в БД MEDLINE, размещенной на сайте www.PubMed.com).

Информационный поиск в области доказательной медицины требует использования системного подхода. Для успешного поиска необходимой информации по вопросам доказательной медицины большое значение имеют выбор соответствующих БД и применение оптимальной методологии поиска (использование рубрикации, поиск в определенных полях БД). Однако даже при самом тщательном и квалифицированном поиске не всегда уда-

ется найти необходимую информацию о проведенных КИ (например, из-за некачественного индексирования или нежелания фирм-спонсоров публиковать отрицательные результаты КИ). По этой причине при поиске доказательной информации компьютерный отбор необходимо дополнять другими методами поиска: «ручным» поиском информации о КИ, описание которых отсутствует в электронных БД; изучением списков литературы в найденных статьях; запросами исследователям и производителям ЛС.

Булева логика

Для проведения поиска в большинстве электронных БД необходимо использовать операторы булевой логики (Джордж Буль - английский математик, 1815-1864 гг.): AND,

OR, NOT.

В большинстве БД операторы булевой логики следует вводить верхнем регистре.

Оператор AND - «и» обозначает, что будут найдены статьи содержащие оба термина. Например, при поиске статей по лапароскопической холецистэктомии надо написать следующий запрос: «laparoscopic AND cholecystectomy».

Оператор OR - «или», то есть когда надо подобрать статьи, содержащие и один и второй (логически) связанные термины. Например, необходимо подобрать статьи о применении холецистэктомии и холецистостомии, то есть все статьи, в которых содержатся первый или второй термин. Запрос будет выглядеть следующим образом: «cholecystecomy OR cholecystostomy».

Оператор NOT - «не». Когда надо исключить заведомо ненужные темы. Например, вы ищите информацию о лапароскопической холецистэктомии, но надо исключить все статьи о традиционной (лапаротомной) холецистэктомии. Запрос будет выглядеть так: «laparoscopic AND cholecystectomy NOT laparotomy».

Поля баз данных

Поиск в БД можно проводить в конкретном поле. Часто для поиска достаточно только внести термин и указать поле поиска при помощи соответствующего суффикса (аббревиатуры): год публикации, место публикации, поиск по авторам и т. д. Для обозначения полей используют суффиксы, которые используют при построении поисковых запросов. Синтаксис суффиксов может различаться в различных поисковых системах. Так, на сайте PubMed суффиксы следует вводить в квадратных скобах. Обычно на носителе или на сайте, на котором предоставляется MEDLINE-ссылка указана на полный перечень полей. На сайте PubMed предоставляется ссылка на файл помощи, с которым следует ознакомиться перед началом работы с этим сайтом. (URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bookres. fcgi/helppubmed/pubmedhelp. pdf).

Поле авторы - [au]. Например, необходимы все статьи под авторством David S. A. Запрос будет выглядеть так: David SA [au]. Или все статьи о лапароскопической холеци-

стэктомии под авторством David S. A. - laparoscopic cholecystectomy. me AND David SA [au].

Поле [so]. Ограничение области поиска по месту публикации. Для того чтобы ограничить перечень изданий, на которые будут выдаваться ссылки при поиске, можно написать в запросе краткие обозначения соответствующих изданий. Например, если вы хотите найти все статьи о лапароскопической холецистэктомии в журнале Клиническая Медицина, необходимо сформировать следующий запрос: laparoscopic cholecystectomy [mh] AND (Klin-MedMosk) [so]. Где so - суффикс поля краткого названия журнала.

Поле [sb] (subset) - фильтры подмножеств журналов, предметных областей, типов публикаций. Предлагается три основных подмножества журналов: AIM - предметная область примерно 120 ведущих журналов мира, перечисленных в списке Abridged Index

Использование предметных рубрик системы индексации mesh при поиске статей в базе данных medline

MeSH - medical subject heading (медицинские предметные рубрики) - список терминов (ключевых слов), при помощи которых индексируются статьи в БД MEDLINE. Подбор MeSH-термина или терминов можно сделать в два этапа. На первом этапе эмпирически подобрать термин, а затем посмотреть полученный результат в тех статьях, которые подходят, выбрать ключевые слова и использовать их в дальнейшем поиске. На втором этапе на сайте PubMed можно выбрать ссылку на базу ключевых слов MeSH и просмотреть иерархическое расположение термина и его подрубрики.

Для того чтобы использовать ключевые слова (MeSH), необходимо создать запрос по типу «ключевое слово из списка MeSH». Например, если вы ищите информацию о ла-

пароскопической холецистэктомии, то ключевым словом будет - laparoscopic cholecystectomy, и запрос будет выглядеть следующим образом: laparoscopic cholecystectomy [mh].

Символ «*» в MEDLINE(PubMed)

Символ «*» используют в двух вариантах.

•Для поиска всех возможных окончаний слова, при этом число вариантов ограничивается 600, первыми найденными. Например, вариант «epidemiol*» уже дает более 410 вариантов, а при поиске «epid*» вариантов слова более 600.

•В базе терминов MeSH символ «*» в начале слова означает, что данный термин описывает основное содержание статьи. Запрос «*epidemiology [mh]» означает поиск статей, где главная тема - эпидемиология.

Использование суффиксов подрубрик MeSH

Один из способов конкретизировать поиск - использование подрубрик системы MeSH. Подрубрики - дополнительная надстройка системы индексирования в MEDLINE. При помощи подрубрик статьи в MEDLINE в зависимости от MeSH-термина могут быть классифицированы на этиологию, профилактику, лечение, побочные эффекты и т. д. Наиболее полезные подрубрики представлены в табл. 6-5.

Таблица 6-5. Наиболее часто используемые подрубрики MeSH

Обратите внимание на то, что подрубрика /th относится к немедикаментозному лечению заболеваний, а подрубрика /dt означает лекарственную терапию. Подрубрику /tu используют исключительно для ЛС и она означает «терапевтическое применение чеголибо». Подрубрику /рх используют для непсихических заболеваний, как в этом примере - diabetes/ px = психология диабета.

Типы вопросов и стратегии поиска

Эффективный поиск в MEDLINE предполагает сочетание поиска по медицинским предметным рубрикам (ключевым словам) с поиском по словам из текста (слова, содержащиеся в названии и реферате статьи) - только таким образом можно выбрать все публикации по интересующей вас теме.

Следующие простейшие варианты запросов в комбинации с ключевыми словами (например MeSH-терминами) могут быть использованы для таких типов эпидемиологических исследований в области изучения:

•этиологии: Risk [tw];

•диагностики: Sensitivity and specificity [mh];

•прогноза: Cohort Studies [mh];

•лечения: Clinrcal Trial [pt].

Ниже представлены более эффективные стратегии поиска в PubMed MEDLINE в зависимости от типа вопроса.

Лечение

Чтобы найти статьи по терапии:

•введите название болезни (термин MeSH);

•выберите подрубрики /th (therapy - терапия), /dt (drug therapy - лекарственная тера-

пия), /pc (prevention and control - профилактика и контроль);

•введите название воздействия (название ЛС) (термин MeSH);

•и выберите подрубрику /tu (therapeutic use - терапевтическое применение);

•объедините результаты этих двух поисков оператором AND. Можно также присоединить (AND) к результатам рубрику MeSH

«double-blind method» (двойной слепой метод). Это ограничит ваш поиск исследованиями, использующими двойной слепой метод контроля, который наиболее надежен.

Диагностические исследования

Самый быстрый и эффективный путь поиска достоверных статей по диагностике состоит в том, чтобы в базе MeSH:

•ввести диагноз и использовать соответствующий термин MeSH;

•ввести название диагностического теста;

•соединить результаты первого и второго списка AND;

•затем объединить их с MeSH-рубрикой Sensitivity и Specificity. (AND).

Прогностические исследования

Эффективный механизм поиска прогностических исследований - соответствующая рубрика Prognosis в MeSH.

Как правило, лучшая схема исследования для ответа на вопросы о прогнозах - когортное исследование. Лучший способ поиска таких исследований - использование руб-

рики MeSH Cohort Studies.

Оптимальная стратегия поиска исследований по прогнозам - расширенный поиск по рубрикам Prognosis и Cohort Studies и объединение расширенного поиска по рубрике Prognosis и расширенного поиска по рубрике Cohort Studies с помощью оператора OR. В зависимости от типа интересующего вас прогноза для поиска можно использовать и другие термины (рубрики MeSH), например: Mortality - смертность, Morbidity - заболеваемость, Risk - риск.

Исследования факторов риска

Наиболее тесно связана с исследованиями вопросов вреда и этиологии MeSHрубрика Risk. В таких исследованиях почти всегда применяют метод когортных исследований (Cohort Study). Это означает, что наилуч-

шая простая стратегия поиска состоит в том, чтобы провести поиск с вашей темой по рубрикам Risk и Cohort Study и затем объединить результаты, используя, оператор OR.

Clinical Queries

Клинические запросы - фильтры методологи эпидемиологических исследований

На сайте PubMed расположена встроенная система фильтров Clinical Queries (рис. 6- 1), разработанная на основе определенных стратегий и позволяющая проводить поиск исследований по этиологии, лечению, диагностики, прогнозу, а также клинических рекомендаций.

Рис. 6-1. Интерфейс системы фильтров Clinical Queries на сайте PubMed

Для того чтобы воспользоваться системой фильтров, необходимо указать один или несколько терминов, связанных операторами булевой логики, затем выбрать категорию, и отметить расширенный (чувствительный) или более узкий (специфичный) поиск.