Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Лагун, Жаворонок (2012)_Молек.выявл.антибиотикорезистентности

.pdf
Скачиваний:
6
Добавлен:
13.02.2016
Размер:
152.56 Кб
Скачать

Лагун Л.В.1, Жаворонок СВ.2 1 Гомельский государственный медицинский университет, Гомель, Беларусь

белорусская медицинская академия последипломного образования, Минск, Беларусь

Молекулярнотенетическая технология выявления резистентности энтеробактерий кбета-лактамным антибиотикам на основе геноиндикации бета-лактамаз расширенного спектра1

УДК 579.25:616.61 -002.3]:575

Поступила в редакцию 26.03.2012 г.

Контакты:

e-mail: llagun@mail.ru

Резюме

В статье представлена информация о геноиндикации р-лактамаз расширенного спектра различных классов у возбудителей с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР). Бета-лактамазная активность расширенного спектра у клинических изолятов энтеробакте­ рий - возбудителей пиелонефритов - опосредована наличием генов CTX-M.

Наличие генов бета-лактамаз других типов (ТЕМ, SHV), как правило, не связано с расшире­ нием бета-лактамазной активности.

Ключевыеслова:(3-лактамазырасширенногоспектра,геноиндикация, возбудители пиело­ нефритов.

1Работа выполнена при поддержке Белорусского республиканского фонда фундаментальных исследова­ ний в рамках гранта БРФФИ Б08М-128.

74

Оригинальные исследования / Молекулярная генетика Ш

• ВВЕДЕНИЕ

Энтеробактерии, главным образом Escherichia coli, а также Proteus

Неблагоприятное

mirabilis и Klepsiella pneumoniae, рассматриваются как возбудители

течение заболевания

ряда заболеваний внутренних органов, в том числе пиелонефрита, ши-

обычно связывается

роко распространенного среди взрослых и детей, характеризующегося

с недостаточной

большой длительностью течения, значительной потерей трудоспособ-

антибактериальной

ности и возможным неблагоприятным исходом [1-7].

эффективностью

В последнее время резистентность энтеробактерии к ряду антибио-

используемых

тиков, особенно р-лактамным, приобретает все большее распростра-

в ходе его лечения

нение. Продукция (3-лактамаз расширенного спектра (БЛРС) - один из

препаратов.

наиболее распространенных и клинически значимых механизмов ре­

 

зистентности энтеробактерии к современным р-лактамным антибио­

 

тикам.

 

Термин «р-лактамазы расширенного спектра» (от англ. extended-

 

spectrum p-lactamases - ESBL) объединяет большое число бактери­

 

альных ферментов, которые отличаются способностью расщеплять

 

оксиимино-р-лактамы (цефалоспорины III-IV поколений и азтреонам),

 

наряду с пенициллинами и ранними цефалоспоринами, и проявляют

 

чувствительность к ингибиторам: клавулановой кислоте, сульбактаму и

 

тазобактаму [8,9].

 

Стандартные методы определения чувствительности бактерий к ан­

 

тимикробным препаратам не всегда позволяют выявить истинную ре­

 

зистентность БЛРС-продуцирующих энтеробактерии к антибиотикам.

 

Это служит основанием для использования более эффективных мето­

 

дов выявления устойчивости бактериальной флоры к антибиотикам.

 

Различные фенотипические методы, применяемые в настоящее время

 

для обнаружения продукции БЛРС, основаны на эффекте подавления

 

их активности в отношении оксиимино-р-лактамов в присутствии кла­

 

вулановой кислоты [10,11].

 

К сожалению, традиционные микробиологические методы не обе­

 

спечивают детекции БЛРС у 100% штаммов энтеробактерии. Ситуация

 

существенно затрудняется в достаточно часто встречающихся случаях

 

наличия у микроорганизмов нескольких детерминант устойчивости

 

одновременно.

 

Успех в решении этой задачи в значительной степени определяет­

 

ся использованием молекулярно-генетических методов исследования,

 

основанных на использовании полимеразной цепной реакции (ПЦР).

 

Их применение позволяет не только выявить наличие генов р-лактамаз,

 

но и определить классы БЛРС, выявить мутации в различных генах, свя­

 

занных с формированием антибиотикорезистентности [12-14].

 

Из изложенного следует, что оптимальная эффективная стратегия

 

борьбы с антибиотикорезистентностью может быть достигнута путем

 

отслеживания фенотипов антибиотикорезистентности клинических

 

изолятов, перекрестной проверки с целью скрининга качества те­

 

стирования, сбора сведений о генах, приводящих к определенному

 

фенотипу, оценки значимости этих фенотипов, определения тактики

 

рациональной и эффективной антибиотикопрофилактики и антибио-

 

тикотерапии.

 

«Лабораторная диагностика» № 2 (02), 2012

75

 

Молекулярно-генетическая технология выявления резистентности энтеробактерий

 

к бета-лактамным антибиотикам на основе геноиндикации бета-лактамаз расширенного спектра

 

• ЦЕЛЬ

i

Разработать молекулярно-генетическую технологию определения

 

генов антибиотикорезистентности энтеробактерий (БЛРС различных

J

классов - ТЕМ, ОХА, SHV, СТХ-М) у возбудителей пиелонефритов.

 

• МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

 

Исследование выполнено на материале 115 клинических изолятов

 

энтеробактерий (70 - Escherichia coli, 35 - Proteus spp., 10 - Klebsiella

 

pneumoniae), выделенных в 2005-2008 гг. из мочи госпитализирован­

 

ных пациентов с острыми и хроническими пиелонефритами в Гомель­

 

ской областной клинической больнице.

г

С использованием метода «двойных дисков» осуществлен феноти-

 

пический скрининг продукции бета-лактамаз расширенного спектра

для исследуемых штаммов микроорганизмов с различными профилями

 

резистентности к антибиотикам.

 

Для выявления генов БЛРС различных классов (ТЕМ, ОХА, SHV,

 

СТХ-М) проведена полимеразная цепная реакция с электрофоретиче-

Ь

ской детекцией продуктов амплификации. Определена групповая при­

 

надлежность БЛРС классов ТЕМ и СТХ-М в мультиплексной ПЦР в реаль­

ном времени. Для тестирования отобраны 49 культур энтеробактерий с подтвержденным БЛРС-фенотипом (Е. coli - 29 штаммов, К. pneumo­ niae - 5 штаммов, Proteus spp. - 15 штаммов).

Выделение бактериальной ДНК

Три-четыре колонии из суточной культуры исследуемого микроор­ ганизма, выращенной на Мюллер-Хинтон агаре, переносили в центри­ фужную пробирку, содержащую 500 мкл стерильной деионизированной воды, и суспендировали с помощью шейкера. Микробные клетки осаж­ дали центрифугированием в течение 1 мин при 10 000 об/мин. Супернатант удаляли, добавляли 100 мкл ТЕ-буфера и ресуспендировали осадок шейкером. Пробирки инкубировали в твердотельном термостате в тече­ ние 20 мин при 99°С. После термостатирования образцы повторно под­ вергали центрифугированию в течение 1 мин при 10 000 об/мин. Супернатант в объеме 75 мкл переносили в полистироловые микропробирки и замораживали до проведения ПЦР.

Геноиндикация БЛРС класса ОХА

Определению ОХА-карбапенемаз с БЛРС-активностью (ОХА-23, ОХА-40, ОХА-58) было подвергнуто 49 культур энтеробактерий с под­ твержденным БЛРС-фенотипом.

Реакционную смесь для амплификации участков генов карбапенемаз групп ОХА-23, ОХА-40, ОХА-58 готовили в пересчете на необходимое количество реакций.

Использовали три пары праймеров:

• OXA-58-fwd (5'-GGGCTTGTGCTGAGCATAGT-3') и OXA-58-rev (5'-CGTAGAGCAATATCATCACCAGC-3');

• OXA-40-fwd (5'-GATGAAGCTCAAACACAGGGTG-3') и OXA-40-rev (5'-TTTCCATTAGCTTGCTCCACC-3');

• OXA-23-fwd (5'-TTTCTTTCTGGTTGTACGGTTCA-3') и OXA-23-rev (5'-CATTTCTGACCGCATTTCCA-3').

76

 

Оригинальные исследования / Молекулярная генетика Ш

 

В качестве контрольных штаммов использовали культуры микроор­

Отдельно вносили

ганизмов, полученные в НИИ антимикробной химиотерапии (Смоленск,

2 мкл образца ДНК

Российская Федерация):

исследуемых

A. baumanii RESORT 547 (позитивный контроль, ОХА-23);

и контрольных

A. baumanii RESORT 797 (позитивный контроль, ОХА-58);

штаммов (общий объем

Е. coli ATCC 25922 (негативный контроль).

реакции составлял

 

Амплификация осуществлялась на термоциклере Rotor Gene 3000

25 мкл).

согласно протоколу. Для идентификации продуктов амплификации проводился анализ кривых плавления в режиме 72-94°С (ГС/10 с) с детекцией флуоресценции по SYBR Green I.

Сравнению подлежали кривые плавления опытных образцов с кри­ выми плавления позитивных контрольных штаммов.

Геноиндикация БЛРС класса ТЕМ

Для выявления бета-лактамаз класса ТЕМ с БЛРС-активностью вы­ полнялся анализ мутаций в позициях 104,164,237-240ТЕМ (3-лактамаз. Метод основан на амплификации 3 коротких (50-80 п.н.) фрагментов гена ЫаТЕМ, соответствующих областям кодонов 104, 164 и 237-240, с использованием 3 пар праймеров и 4 зондов, меченых различ­ ными флуорофорами (FAM, R6G, ROX, Су5). Идентификация мутаций в интересующих участках гена осуществлялась на основании оценки температур плавления (Тт) зондов. В качестве контрольных об­ разцов использовались штаммы с известными мутациями в генах ЫаТЕМ.

Реакционную смесь готовили в пересчете на необходимое коли­ чество реакций. Для постановки ПЦР вначале в пробирки помещали нижнюю смесь, затем поверх ее наносили каплю расплавленного вос­ ка и после его застывания - верхнюю смесь. После этого в каждую пробирку для постановки ПЦР добавляли 5 мкл образца ДНК иссле­ дуемых или контрольных штаммов. В качестве контрольных штаммов использовали культуры микроорганизмов, полученные в НИИ анти­ микробной химиотерапии (Смоленск, Российская Федерация):

Е. coli 197 (позитивный контроль, ТЕМ-1 В);

Е. coli J53.2 (позитивный контроль, ТЕМ-3:104К, 238S);

Е. coli J53 (позитивный контроль, ТЕМ-10:164S, 240К);

Е. coli J53 (позитивный контроль, ТЕМ-11:164Н);

К. pneumoniae 3151 (позитивный контроль, ТЕМ-68:238S, 240К);

Е. coli ATCC 25922 (негативный контроль).

Общий объем реакционной смеси составлял 25 мкл. Амплификацию проводили на термоциклере Rotor Gene 3000 в ва­

рианте «горячего старта».

Для идентификации продуктов амплификации анализировали кри­ вые плавления в режиме 45-80°С (ГС/10 с), с детекцией флуоресцен­ ции по FAM, R6G, ROX, Су5 в автоматическом режиме. Сравнивали кри­ вые плавления опытных образцов с кривыми плавления позитивных контрольных штаммов.

Данный метод позволяет идентифицировать одновременно все известные мутации (7 полиморфизмов в 5 кодонах), связанные с БЛРСактивностью ТЕМ, в одной пробирке за 2 часа.

«Лабораторная диагностика» № 2 (02), 2012

77

Молекулярно-генетическая технология выявления резистентности энтеробактерий к бета-лактамным антибиотикам на основе геноиндикации бета-лактамаз расширенного спектра

 

 

Геноиндикация БЛРС класса SHV

 

 

Амплификация с использованием пары праймеров SHV-1R и SHV-1F

 

выполнялась на термоциклере Rotor Gene 3000, с последующей детекци­

 

ей продуктов амплификации в гель-электрофорезе. Проводилось сопо­

 

ставление ампликонов контрольных и опытных образцов ДНК по молеку­

 

лярной массе. В качестве контролей использовали штаммы из коллекции

 

НИИ антимикробной химиотерапии (Смоленск, Российская Федерация):

 

Е. coll ATCC 25922 (негативный контроль);

 

• К. pneumoniae ATCC 700603 (позитивный контроль, SHV-18);

 

• Е. coli DH5a CTA-2 (позитивный контроль, SHV-2);

 

Е. coli DH5a CTA-8 (позитивный контроль, SHV-8);

 

Е. cloacae RESORT 555 (позитивный контроль, SHV-5).

 

 

Для типирования БЛРС класса SHV использовалась мультиплексная

 

ПЦР с последующей оценкой температур плавления зондов, позволя­

 

ющая выявлять точечные мутации, придающие расширенный спектр

 

бета-лактамазной активности в кодонах 179 и 238-240 Ыа5т/-генов. Диф­

 

ференциация мутаций, соответствующих аминокислотным заменам в

Сравнению подлежали

кодонах D179-^G/N/A, G238^S/A и Е240^>К, осуществлялась с помо­

кривые плавления

щью двух зондов, меченых различными флуорофорами: R6G (кодон 179)

опытных образцов

и FAM (кодоны 238-240).

с кривыми плавления

 

Идентификация продуктов амплификации проводилась на основе

позитивных

анализа кривых плавления в режиме 45-85°С (ГС/10 с), с детекцией

контрольных штаммов.

флуоресценции по FAM и R6G в автоматическом режиме.

Геноиндикация БЛРС класса СТХ-М

В качестве контролей были использованы следующие штаммы микроорганизмов: Е. coli ТОРЮ/Sty (СТХ-М-5, позитивный контроль); Е. coli RESORT 1224 (СТХ-М-3, позитивный контроль); Е. coli RESORT 333 (СТХ-М-14, позитивный контроль); С. amalonaticus Rio-2 (CTX-M-8, пози­ тивный контроль); Е. coli ATCC 25922 (негативный контроль).

Для ПЦР-амплификации генов СТХ-М применялся общий для всех типов СТХ-М прямой праймер CTX-M-Fext и два обратных праймера: CTX-M(1-2)-Rnest, специфичный для генов СТХ-М-1- и СТХ-М-2-род- ственных ферментов, и CTX-M-R1c, специфичный для генов СТХ-М-8/25- и СТХ-М-9-родственных ферментов.

 

 

Структура праймеров:

 

CTX-M-Fext (5'-TTTGCGATGTGCAGTACCAGTAA-3');

 

CTX-M-R1 с (5'-CCGCTGCCGGTCTTATC-3');

 

CTX-M0 -2)-RNest (5'-TGATCTCAACGCGCTGATTTA-3').

 

 

Реакционную смесь готовили в пересчете на необходимое коли­

 

чество реакций. Вначале вносили в пробирки для ПЦР нижнюю смесь,

 

затем поверх ее каплю расплавленного воска и после его застывания -

Общий объем смеси -

верхнюю смесь. После этого в каждую пробирку для ПЦР добавляли

25 мкл.

2,5 мкл образца ДНК исследуемых или контрольных штаммов.

 

 

Амплификация была проведена на термоциклере Rotor Gene 3000 в

 

варианте «горячего старта».

 

 

Детекция продуктов амплификации ДНК контрольных и опытных

 

штаммов выполнялась с использованием гель-электрофореза. Для

 

определения групп СТХ-М генов было проведено сопоставление и диф-

ференцировка ампликонов контрольных и опытных образцов ДНК по молекулярным массам, приведенным в табл.

78

Оригинальные исследования / Молекулярная генетика 11

Таблица Размер ампликонов для генов СТХ-М различных кластеров

СТХ-М группа (кластер)

Длина ПЦР-продукта, п.н.

 

 

СТХ-М-1

97

 

 

СТХ-М-2

97

 

 

СТХ-М-8/25

518

 

 

СТХ-М-9

518

 

 

Дополнительно для дифференциации представителей генетиче­ ских кластеров СТХ-М-1 и СТХ-М-2, СТХ-М-8/25 и СТХ-М-9 выполнял­ ся анализ температур плавления ПЦР-продуктов (СТХ-М-1 - 82,8°С, СТХ-М-2 - 84,3°С, СТХ-М-8/25 - 89,3°С, СТХ-М-9 - 90,7°С) с детекцией флуоресценции по SYBR Green I.

• РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Геноиндикация БЛРС класса ОХА

Результаты определения ОХА-БЛРС представлены на рис. 1. Выяв­ лены гены БЛРС ОХА-23 (ампликон размером 723 пар нуклеотидов) и ОХА-58 (ампликон размером 723 пар нуклеотидов) у соответствующих контрольных штаммов A. baumanii. Ни в одном из представителей 49 ис­ следованных штаммов, как и в негативном контроле, Е. coli ATCC 25922 бета-лактамазы расширенного спектра класса ОХА обнаружены не были (ОХА-).

Из полученных результатов следует, что выявленная скрининговым фенотипическим методом БЛРС-активность исследуемых штаммов не была обусловлена наличием ОХА-генов.

Norm. Fluoro.

dF/dT

0,65 I

I

5

10

15

20

25

30

Cycle

Threshold ?5

8Q

g5

gQ

deg

 

 

 

А

 

 

 

 

 

В

 

 

Рис. 1. Кривые амплификации (А) и плавления (В) участков генов ЫаОХА-23 (723 п.н.)

 

 

и ЫаОХА-58 (738 п.н.)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

«Лабораторная диагностика» № 2 (02), 2012

 

 

 

 

 

 

79

Молекулярнотенетическая технология выявления резистентности энтеробактерий к бета-лактамным антибиотикам на основе геноиндикации бета-лактамаз расширенного спектра

Рис. 2. Анализ кривых плавления для идентификации БЛРС-мутаций в 164 позиции гена Ыа

Геноиндикация БЛРС класса ТЕМ

Результаты определения мутаций в 164 позиции гена ЫаТЕМ/ придаю­ щими БЛРС-активность, представлены на рис. 2.

При анализе кривых плавления выявлены нуклеотидные замены в этой позиции гена ЫаТЕМ только для контрольных штаммов Е. coli J53 (ТЕМ-10: 164S), Е. coli J53 (ТЕМ-11: 164Н). У 34 из 49 исследуемых штам­ мов также амплифицировался участок гена ЫаТЕМ/ однако нуклеотидных замен в 164 позиции, придающих БЛРС-активность, установлено не было (WT, дикий тип).

Результаты определения мутаций в 237-240 позициях гена ЫаТЕМ, придающих БЛРС-активность, представлены на рис. 3.

При анализе кривых плавления нуклеотидные замены в этой пози­ ции гена ЫаТЕМ выявлены только для трех контрольных штаммов: Е. coli J53.2 (ТЕМ-3:238S), Е. coli J53 (ТЕМ-10:240К), К. pneumoniae 3151 (ТЕМ-68: 238S, 240К).

У 38 из 49 исследуемых штаммов также амплифицировался данный участок гена ЫаТЕМ, однако нуклеотидных замен в позициях 237-240, придающих БЛРС-активность, выявлено не было (WT, дикий тип).

Результаты определения мутаций в 104 позиции гена ЫаТЕМ, придаю­

щими БЛРС-активность, представлены на рис. 4.

 

 

При анализе кривых плавления выявлены

нуклеотидные

заме­

ны в

этой

позиции гена

ЫаТЕМ

только для контрольного штамма

Е. coli

J53.2

(ТЕМ-3: 104К).

У 38

из 49

исследуемых штаммов

также

амплифицировался участок

гена

ЫаТЕМ,

однако

нуклеотидных

замен

в 104 позиции, придающих БЛРС-активность, выявлено не было (WT, ди­ кий тип).

80

Оригинальные исследования / Молекулярная генетика Ш

Рис. 3. Анализ кривых плавления для идентификации БЛРС-мутаций в 237-240 позициях гена ЫаТ[

Рис. 4. Анализ кривых плавления для идентификации БЛРС-мутаций в 104 позиции гена Ыат,

«Лабораторная диагностика» № 2 (02), 2012

81

Молекулярно-генетическая технология выявления резистентности энтеробактерий кбета-лактамным антибиотикам на основе геноиндикации бета-лактамаз расширенного спектра

Таким образом, выявленные у 38 исследуемых изолятов гены ЫаТЕМ не имели нуклеотидных замен, придающих расширенную бета-лакта- мазную активность (WT, дикий тип), что позволило отнести их к генети­

 

ческой группе ТЕМ-1.

 

Геноиндикация БЛРС класса SHV

 

ПЦР-детекция бета-лактамаз SHV-типа осуществлена для 29 штам­

 

мов Е. coli, 15 штаммов Proteus spp. и 5 штаммов К. pneumoniae, у кото­

 

рых с помощью метода «двойных дисков» ранее был определен БЛРС-

 

фенотип. Также в исследование включены 5 штаммов К. pneumoniae и

 

15 штаммов E.coli без БЛРС-активности.

 

У всех представителей позитивных контролей (Е. coli DH5a CTA-2,

 

Е. coli DH5a CTA-8, E. cloacae RESORT 555) выявлен продукт амплифи­

 

кации размером около 260 п.н. Аналогичный ампликон обнаружен и у

 

всех опытных БЛРС-позитивных штаммов К. pneumoniae и 4-х штаммов

 

К. pneumoniae без определяемой фенотипическими методами БЛРС-

 

активности. У всех исследованных штаммов Proteus spp. и Е. coli (неза­

 

висимо от наличия или отсутствия фенотипически определяемой БЛРС-

 

активности) гены blaSHV не детектировались. Не выявлены продукты

 

амплификации и в негативном контроле Е. coli ATCC 25922.

Большинство БЛРС

Проведенное исследование позволило установить наличие

класса SHV являются

Ыа5НУ-генов как у БЛРС-позитивных, так и БЛРС-негативных штаммов

производными SHV-1, К. pneumoniae. Данный факт можно объяснить присутствием у БЛРС-

детерминирующие

негативных штаммов плазмидно-кодируемой пенициллиназы SHV-1,

их гены отличаются

не обладающей расширенным спектром активности в отношении бета-

от гена blaSHV-1

лактамных антибиотиков. Большинство БЛРС класса SHV являются про-

единичными

изводными SHV-1, детерминирующие их гены отличаются от гена blaSHV-1

точечными мутациями

единичными точечными мутациями в 149,156,179, 238 и 240 позициях,

в 149,156,179,238

а единичные аминокислотные замены расширяют спектр ферментатив-

и 240 позициях,

ной активности.

а единичные

Анализ кривых плавления зондов не выявил точечных мутаций в

аминокислотные

анализируемых кодонах (179, 238-240) Ыа5НУ-генов исследуемых штам-

замены

мов клебсиелл (WT, дикий тип).

расширяют спектр

Таким образом, обнаруженные у 5 штаммов К. pneumoniae blaSHV-

ферментативной

гены относятся к генетической группе SHV-1 (плазмидно-кодируемые

активности.

пенициллиназы SHV-1, не обладающие расширенным спектром актив­

 

ности в отношении бета-лактамных антибиотиков).

 

Геноиндикация БЛРС класса СТХ-М

 

У14 штаммов Е. coli, 8 штаммов P. mirabilis и 5 штаммов К. pneumoniae

 

выявлен продукт амплификации длиной около 97 п.н. с температу­

 

рой плавления около 82,8-83,0°С. Аналогичный ПЦР-продукт ампли-

 

фицировался для позитивного контроля Е. coli RESORT 1224 (СТХ-М-3,

 

генетическая группа СТХ-М-1). У 2 штаммов Е. coli обнаружен продукт

 

амплификации длиной 518 п.н. с температурой плавления около 91 °С.

 

Аналогичный ПЦР-продукт амплифицировался для позитивного кон­

 

троля Е. coli RESORT 333 (СТХ-М-14, генетическая группа СТХ-М-9).

 

У контрольного штамма энтеробактерий Е. coli ТОРЮ/Sty (СТХ-М-5,

 

генетическая группа СТХ-М-2) выявлен продукт амплификации длиной

 

97 п.н. с температурой плавления 84,5°С. Для штамма С. amalonaticus

82

Оригинальные исследования / Молекулярная генетика 11

Norm. Fluoro.

0,9

 

 

 

 

 

, . - " • " "

0,85

 

 

 

 

 

/

 

0,8

 

 

 

 

/

 

0,75

 

 

 

 

 

 

0,7

 

 

 

 

 

_

 

0,65

СТХ-М+

 

 

 

 

 

0,6

 

 

 

 

 

 

0,55

 

 

 

 

 

"

 

0,5

 

 

<

 

 

 

0,45

 

 

 

 

 

0,4

 

 

 

 

 

0,35

 

 

 

 

 

 

 

0,3

 

 

 

 

 

 

 

0,25

 

 

 

 

стх-м-

0,2

 

 

 

 

0,15

 

 

 

 

 

1

 

0,1

 

 

 

 

 

 

Threshold

 

 

 

 

t

0,05

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

10

15

20

 

25

 

5,0

4,5

4,0

3,5

3,0

2,5

2,0

1,5

1,0

0,5

СТХ-М-1

 

СТХ-М-2

 

 

 

/

_

СТХ-М-8

 

 

 

 

 

 

 

А

 

СТХ-М-9

 

 

 

 

/

 

/ ^

 

f ч

 

//

 

\

/

^

 

 

/

1

 

1

'

 

/

 

^

1 /

^

 

/

 

\

/

 

\

 

 

\

^Ц^—~" 1Г_1ГГ-С'Л

"* " *

 

 

/

Threshold

. — - _ _

 

 

deg

Рис. 5. Кривые амплификации (А) и плавления (В) участков генов Ыас т х .м контрольных и опытных штаммов

Rio-2 (СТХ-М-8) характерен продукт амплификации длиной 518 п.н. с температурой плавления 89,5°С. Не выявлены продукты амплификации в негативном контроле Е. coli ATCC 25922 (рис. 5).

Проведенное исследование позволило установить присутствие Ыастх.м-генов двух генетических кластеров (СТХ-М-1 и СТХ-М-9) среди штаммов Е. coli, P. mirabilis и К. pneumoniae с подтвержденной фенотипической БЛРС-активностью.

• выводы

1.Показано, что определяемая скрининговым фенотипическим мето­ дом БЛРС-активность исследуемых штаммов не обусловлена нали­ чием ОХА-генов.

2.Выявлено присутствие Ыастх-генов двух генетических кластеров (СТХ-М-1 и СТХ-М-9) среди штаммов Е. coli, P. mirabilis и К. pneumoniae

сподтвержденной фенотипической БЛРС-активностью.

3.Обнаружение генов SHV и ТЕМ не является однозначным свидетель­ ством БЛРС-активности и требует анализа наличия точечных мута­ ций в позициях, увеличивающих спектр активности в отношении цефалоспоринов III-IV поколений.

4.Разработанная технология молекулярно-генетического исследова­ ния, базирующаяся на обнаружении нуклеотидных замен в генах SHV и ТЕМ с использованием зондовых методик и анализа кривых плавления, может быть использована в качестве подтверждающего метода в лабораториях молекулярной генетики для выявления рас­ ширенной бета-лактамазной активности, обусловливающей антибиотикорезистентность.

5.Полученные результаты исследования заслуживают повседневного использования как в работе лечебных учреждений и лабораторий клинической микробиологии, так и для проведения референтных исследований в лабораториях молекулярной генетики.

«Лабораторная диагностика» № 2 (02), 2012