Pokrovskiy_Briko_Ruk-vo_Obschaya_Epidemiologia

Основы поиска доказательной информации в БД (на примере поиска в БД

MEDLINE, размещенной на сайте www.pubmed.сот).

Информационный поиск в области доказательной медицины требует использования системного подхода. Для успешного поиска необходимой информации по вопросам доказательной медицины большое значение имеют выбор соответствующих БД и применение оптимальной методологии поиска (использование рубрикации, поиск в определенных полях БД). Однако даже при самом тщательном и квалифицированном поиске не всегда удается найти необходимую информацию о проведенных КИ (например, из-за некачественного индексирования или нежелания фирм-спонсоров публиковать отрицательные результаты КИ). По этой причине при поиске доказательной информации компьютерный отбор необходимо дополнять другими методами поиска: «ручным» поиском информации о КИ, описание которых отсутствует в электронных БД; изучением

списков литературы в найденных статьях; запросами исследователям и производителям ЛС.

Булева логика

Для проведения поиска в большинстве электронных БД необходимо использовать операторы булевой логики (Джордж Буль — английский математик, 1815—1864гг.): АND, ОR., МОТ.

В большинстве БД операторы булевой логики следует вводить верхнем регистре. Оператор АND — «и» обозначает, что будут найдены статьи содержащие оба

термина. Например, при поиске статей по лапароскопической холецистэктомии надо написать следующий запрос: «laparoscopic AND cholecystectomy

Оператор ОR — «или», то есть когда надо подобрать статьи, содержащие и один и второй (логически) связанные термины. Например, необходимо подобрать статьи о применении холецистэктомии и холецистостомии, то есть все статьи, в которых содержатся первый или второй термин. Запрос будет выглядеть следующим образом: «cholecystecomy OR cholecystectomy».

Оператор NОТ — «не». Когда надо исключить заведомо ненужные темы. Например, вы ищите информацию о лапароскопической холецистэктомии, но надо исключить все статьи о традиционной (лапаротомной) холецистэктомии. Запрос будет выглядеть так: «laparoscopic AND cholecystectomy NOT laparotomy».

Поля баз данных

Поиск в БД можно проводить в конкретном поле. Часто для поиска достаточно только внести термин и указать поле поиска при помощи соответствующего суффикса (аббревиатуры): год публикации, место публикации, поиск по авторам и т.д. Для обозначения полей используют суффиксы, которые используют при построении поисковых запросов. Синтаксис суффиксов может различаться в различных поисковых системах. Так, на сайте РubMed суффиксы следует вводить в квадратных скобах. Обычно на носителе или на сайте, на котором предоставляется MEDLINE-ссылка указана на полный перечень полей. На сайте РubМеd предоставляется ссылка на файл помощи, с которым следует ознакомиться перед началом работы с этим сайтом.

Поле авторы — [au]. Например, необходимы все статьи под авторством David S. А. Запрос будет выглядеть так: David S. А. [аu].

Поле [sо]. Ограничение области поиска по месту публикации. Для того чтобы ограничить перечень изданий, на которые будут выдаваться ссылки при поиске, можно написать в запросе краткие обозначения соответствующих изданий. Например, если вы хотите найти все статьи о лапароскопической холецистэктомии в журнале Клиническая Медицина, необходимо сформировать следующий запрос: laparoscopic cholecystectomy [mn] AND (Klin-MedMosk)- суффикс поля краткого названия журнала.

Поле [sb] (subset) — фильтры подмножеств журналов, предметных областей, типов публикаций. Предлагается три основных подмножества журналов: АIM — предметная область примерно 120 ведущих журналов мира, перечисленных в списке Abridged Index Medicus; Nursing— область библиографического справочника International Nursing Index (сестринское дело); Dental — стоматология — Index to Dental Literature.

Таблица 6-3. Предметные области в МЕDLINE, для которых встроены специальные фильтры поиска

Поля [ti] (название) и [jn] (журнал). Если вы знаете название статьи (или приблизительное название) и, возможно, журнал, в котором она была опубликована, можно использовать ключи поиска по названию или журналу. Другие поля БД MEDLINE представлены в табл. 6-4.

Таблица 6-4. Основные поля БД МЕОЬШЕ

Использование предметных рубрик системы индексации гпезН при поиске статей в базе данных тесШпе

МеSН (медицинские предметные рубрики) — список терминов (ключевых слов), при помощи которых индексируются статьи в БД МEDLINE. Подбор МеSН-термина или терминов можно сделать в два этапа. На первом этапе эмпирически подобрать термин, а затем посмотреть полученный результат в тех статьях, которые подходят, выбрать ключевые слова и использовать их в дальнейшем поиске. На втором этапе на сайте РubMed можно выбрать ссылку на базу ключевых слов МеSН и просмотреть иерархическое расположение термина и его подрубрики.

Для того чтобы использовать ключевые слова (МеSН), необходимо создать запрос по типу «ключевое слово из списка МеSН». Например, если вы ищите информацию о

лапароскопической холецистэктомии, то ключевым словом будет — laparoscopic cholecystectomy, и запрос будет выглядеть следующим образом: laparoscopic cholecystectomy [mh]

Символ «*» в MEDLINE (PubMed)

Символ «*» используют в двух вариантах.

•Для поиска всех возможных окончаний слова, при этом число вариантов ограничивается 600, первыми найденными. Например, вариант «ерidemiol*» уже дает более 410 вариантов, а при поиске «ерid*» вариантов слова более 600.

•В базе терминов МеSН символ «*» в начале слова означает, что данный термин описывает основное содержание статьи. Запрос «*epidemiology [mh]» означает поиск статей, где главная тема — эпидемиология.

Использование суффиксов подрубрик МеSН

Один из способов конкретизировать поиск — использование под-рубрик системы МеSН. Подрубрики — дополнительная надстройка системы индексирования в МЕDICAL. При помощи подрубрик статьи в МЕDICAL в зависимости от МеSН-термина могут быть классифицированы на этиологию, профилактику, лечение, побочные эффекты и т.д. Наиболее полезные подрубрики представлены в табл. 6-5.

Таблица 6-5. Наиболее часто используемые подрубрики МеSН

Обратите внимание на то, что подрубрика /th относится к немедикаментозному лечению заболеваний, а подрубрика /dt. означает лекарственную терапию. Подрубрику /tu используют исключительно для ЛС и она означает «терапевтическое применение чего-либо». Подрубрику /рх используют для непсихических заболеваний, как в этом примере — diabetes/ рх = психология диабета.

Типы вопросов и стратегии поиска

Эффективный поиск в МЕDLINE предполагает сочетание поиска по медицинским предметным рубрикам (ключевым словам) с поиском по словам из текста (слова,

содержащиеся в названии и реферате статьи) — только таким образом можно выбрать все публикации по интересующей вас теме.

Следующие простейшие варианты запросов в комбинации с ключевыми словами (например МеSН-терминами) могут быть использованы для таких типов эпидемиологических исследований в области изучения:

•этиологии: Risc[tw];

•диагностики: Sensitivity and specificity [mh];

•прогноза: Cohort Studies [mh];

•лечения: Clinical Trial [pt].

Ниже представлены более эффективные стратегии поиска в РubMed МЕDICINE в зависимости от типа вопроса.

Лечение Чтобы найти статьи по терапии:

•введите название болезни (термин МеSН);

•выберите подрубрики /th (therapy — терапия), /dt (drug therapy — лекарственная терапия), /рс (prevention and control — профилактика и контроль);

•введите название воздействия (название ЛС) (термин МеSН);

•и выберите Подрубрику /tu (therapeutic use— терапевтическое применение);

•объедините результаты этих двух поисков оператором АND. Можно также присоединить (АND) к результатам рубрику МеSН (двойной слепой метод). Это ограничит ваш поиск исследованиями, использующими двойной слепой метод контроля, который наиболее надежен.

Диагностические исследования

Самый быстрый и эффективный путь поиска достоверных статей по диагностике состоит в том, чтобы в базе МеSН:

•ввести диагноз и использовать соответствующий термин МеSН;

•ввести название диагностического теста;

•соединить результаты первого и второго списка АND;

•затем объединить их с МеSН-рубрикой Sensivity и Spesivity (AND).

Прогностические исследования

Эффективный механизм поиска прогностических исследований — со-

ответствующая рубрика Ргоgnosis в МеSН.

Как правило, лучшая схема исследования для ответа на вопросы о прогнозах — когортное исследование. Лучший способ поиска таких исследований — использование рубрики МеSН Cohort Studies.

Оптимальная стратегия поиска исследований по прогнозам — расширенный поиск по рубрикам Ргоgnosis и Cohort Studies и объединение расширенного поиска по рубрике Prognosis и расширенного поиска по рубрике Cohort Studies с помощью оператора ОR. В зависимости от типа интересующего вас прогноза для поиска можно использовать и другие термины (рубрики МеSН)

Исследования факторов риска

Наиболее тесно связана с исследованиями вопросов вреда и этиологии МеSНрубрика Risc. В таких исследованиях почти всегда применяют метод когортных исследований (Cohort Study). Это означает, что наилучшая простая стратегия поиска состоит в том, чтобы провести поиск с вашей темой по рубрикам Risc and Cohort Study и затем объединить результаты, используя, оператор ОR.

Clinical Queries

Клинические запросы — фильтры методологи эпидемиологических исследований На сайте РubMed расположена встроенная система фильтров Clinical Queries

(рис. 6-1), разработанная на основе определенных стратегий и позволяющая проводить поиск исследований по этиологии, лечению, диагностики, прогнозу, а также клинических рекомендаций.

Для того чтобы воспользоваться системой фильтров, необходимо указать один или несколько терминов, связанных операторами булевой логики, затем выбрать категорию, и отметить расширенный (чувствительный) или более узкий (специфичный) поиск.

Эталоны ответов к заданиям для самоподготовки

К задаче 1.

Данную статью легко найти, используя названия городов, где проводились исследования «St. Petersburg» или «Petersburg» и «Leipzig» (названия можно посмотреть в словарях.).

Вводим в окно поиска: Petersburg AND Leipzig. Выпадет несколько статей, в том числе искомая.

Названия городов указанны в заголовке статьи, поэтому если добавить к названиями городов суффикс [ti] — поиск только в заголовке: Petersburg [ti] АND Leipzig [ti], то сразу выпадет нужная статья.

2.В строке поиска набрать «Users’ guides to the medical literature». Далее перейти в раздел «Limits». Выбрать журнал — «JАМА». Вести временное ограничение с 1992 по 2003 г. Запустить поиск. Будет получен список из нужных публикаций данного руководства (разделы с I по XXV).

3.Поиск статьи можно выполнить по следующему алгоритму: в строке поиска набрать термины: ear АND rectal AND children. В результате данного запроса будут найдены, около восьмидесяти статей, среди которых будет искомая. Для того, чтобы найти именно данную статью следует задать более ограниченный поиск. Сначала необходимо перейти в раздел «Limits». В этом разделе внизу страницы найти раздел

«Таg terms» (рис. 6-2)

Далее следует, очистить строку поиска, и указать имя автора — Сraig. В разделе «Publication Type» (Тип публикации) выбрать — «геview»» (обзор). Указать временной интервал, с 1995 по 2005 год (расширенный, поскольку год публикации точно не известен). Далее перейти в раздел «History». В этом разделе сохраняются текущие поисковые запросы под отдельными номерами. Следует уточнить номер интересующих нас запросов.

Нас интересуют поисковые запросы:

#... Search Ear AND rectum AND children

#... Search Craig Field; First Author; Limits: Review

Теперь комбинируем эти запросы при помощи оператора АND: Будет получена следующая статья:

4.Перейти в «Limits»; выбрать журнал — «Lancet»; вести авторов: Grimes ОА, Schultz KF; указать интервал дат публикации 2001 — 2003 гг. Получаем одиннадцать статей.

5.В «Limits» необходимо найти все варианты написания имени автора. И добавить их в строку поиска при помощи оператора булевой логики «ОR». Можно использовать контекстное меню. Поиск будет иметь следующий вид:

довательно выбрать ту и иную методологию исследований, оставив используемый по умолчанию специфичный (узкий) тип поиска (narrow, Specific search).

Далее следует просмотреть найденное и отобрать интересующие статьи. Следует отметить, что в основном окне поиска высвечивается стратегия, используемая фильтром. Для ее уточнения можно также нажать на кнопку «Details» и посмотреть, как выглядит используемый запрос.

Для поиска обзоров следует воспользоваться «Limits» и, например выбрать в «Publication type» выбрать «review».

Для поиска систематических обзоров можно воспользоваться фильтром Для поиска систематических обзоров. Следует скопировать запрос по одному из типов исследований из основного окна поиска, затем перейти в «Clinical Queries» и вставить скопированный запрос в окно поиска фильтра, либо же добавить к поиску АND systematic [sb] (то же самое добавляет и фильтр)

РАБОТА НА ЗАНЯТИИ Вопросы для отработки на практическом занятии

1.Информационные системы в медицине.

2.Содержание и особенности поиска БД, содержащих сведения по доказательной медицине. (Задачи №1 и 2).

3.Стратегии поискового запроса в зависимости от типа клинического вопроса (Задачи №1 и 2).

4.Чувствительность и специфичность поиска при использовании методологических фильтров на сайте РubMed. (Задача № 2).

5.использование найденной информации для принятия практических решений (Задачи №1 и 2).

Указанные вопросы отрабатываются на ситуационных задачах:

Ситуационные задачи

Задача 1. Найдите доказательную информацию для ответа на представленные ниже вопросы, выполнив следующую последовательность действий:

• определите тип представленного вопроса;

• проведите анализ вопроса по формуле ПВСИ (РIСО);

• определите наиболее пригодный дизайн эпидемиологического исследования, позволяющий получить ответ на поставленный вопрос;

• найдите в БД МЕDICAL набор из 3 статей, дающих ответ на данный вопрос;

• проведите аналогичный поиск в Кохрановской библиотеке, отдавая предпочтения систематическим обзорам.

1.Целесообразно ли использовать антидепрессанты для профилактики депрессии

впослеродовый период?

2.Влияют ли аборты на риск возникновения рака молочной железы?

3.Эффективно ли и безопасно внутривенное введение иммуноглобулина для лечения болезни Кавасаки у детей?

4.Обусловлена ли высокая заболеваемость ишемической болезнью сердца в этнических группах в Азии различиями в уровне инсулина?

5.Какие факторы связаны с риском развития ожирения у детей?

6.Следует ли применять ПЦР тест для скрининга хламидиоза у молодых людей, ведущих активную половую жизнь?

7.Эффективно ли применение вакцины БЦЖ для иммунотерапии туберкулеза?

8.Эффективно ли использование плацебо для лечения больных психическими растройствами?

9.Насколько точно выявляет компьютерная томография аневризмы головного

мозга.

10.Следует ли применять гипербарическую оксигенацию при лечении ишемического инсульта?

11.Снижает ли назначение витамина Е риск смерти недоношенных?

12.Следует ли назначать нистатин как профилактическое и лечебное средство для лечения больных с тяжелыми иммунодефицитами?

13.Как изменяется вероятность смерти от всех причин при отказе от курения у лиц с коронарной болезнью сердца.

14.Насколько точно можно пересказать преждевременное начало родов основываясь на результатах цервиковагинального теста на фибрино-эктин?

15.Какова точность гистероскопии для диагностики гиперплазии и рака эндометрия?

Задача 2. Используя возможность чувствительного поиска фильтров Clinical Queries, размещенные на сайте PubMed, найдите не менее 4 статей, посвященных исследованию: • факторов риска;

• эффективности профилактических вмешательств и ЛС при следующих нозологических формах:

Орак предстательной железы;

Орак пищевода;

Осиндром хронической усталости;

Оаллопеция;

О аневризма левого желудочка сердца; О болезнь Кавасаки; О болезнь Меньера.

Итоговый контроль знаний

Выполните задания и ответьте на вопросы

1. Выполните следующую последовательность действий.

а) сформулируйте один вопрос по любой теме которая вас интересует (или может стать темой для систематического обзора стандартной практики);

б) разбейте его на максимальное (из 4 возможных) число ПВСИ (Р1СО)- составляющих;

в) определите тип своего вопроса; г) определите тип эпидемиологического исследования, которое позволит найти

ответ на этот вопрос.

2.Назовите 5 зарубежных или отечественных периодических изданий, публикующих первичную медицинскую информацию.

3.Назовите 5 источников медицинской информации, публикующих вторичные материалы (резюме РКИ и систематических обзоров, систематические обзоры),

4.Укажите достоинства и недоставки следующих источников медицинской информации:

а) журналы первичной информации; б) журналы вторичной информации; в) списки рассылки; г) Кохрановская библиотека;

д) MEDLINE е) WWW