Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

ФБТ БИ 2курс / Оля

.docx
Скачиваний:
25
Добавлен:
10.04.2018
Размер:
25.17 Кб
Скачать

Назва білку

Geiardia intestiralis

E-число

Gone ID

Функція білку

mamA

2e-06

EET01207.1

Tetratricopeptide repeat

Query 88 IAYVKTGAVDRGTELLERSIADAPDNIKVATVLGLTYVQVQKYDLAVPLLVKVAEANPVN 147

I + +D L + + + DNI+V T L L Y+ ++Y A L + E++ +N

Sbjct 87 ITLFRLQMIDAAFGLFDSGLDISADNIQVITQLALLYLICERYSEAEALFSSIVESSTLN 146

Query 148 FNV---RFRLGVALDNLGRFDEAIDS------FKIALGLRPNEGKVHRAIAYSYEQMGSH 198

N +F +++G F E DS F IA V IA ++G+H

Sbjct 147 KNALSEQFE-----EDVGPFREIFDSLHTYETFLIA---------VLNNIAICNSKLGNH 192

Query 199 EEALPHFKKA 208

AL HF++A

Sbjct 193 ALALKHFQQA 202

Region 111..208

/region_name="TPR_12"

/note="Tetratricopeptide repeat; pfam13424"

/db_xref="CDD:205602"

mamB

1e-06

XP_001707701.1

Сімя Cation efflux

Члени цього сімейства інтегральних мембранних білків, які знаходяться збільшити толерантність до двовалентних іонів металів, таких як кадмій, цинк і кобальт. Ці білки, як вважається, откачивающих, що видалення цих іонів з клітки.

Query 30 ILGLMSGSVALVADSLHSGADVVASGVTQLSLKISNKPADERYPFGYGNIQYISSAIVGS 89

I+G++ S+ LV D+ H +D+++ + +SL + K A + FGY + I S

Sbjct 44 IVGIVGNSLTLVGDAFHMLSDLLSLVIGLISLVLGRKQASAQATFGYKRSETIGGFFNAS 103

Query 90 LLLIGASFLMYGSVVKLIS 108

LL A FL+ +V KLI+

Sbjct 104 FLLSTAFFLVTEAVQKLIT 122

Region 37..>131

/region_name="Cation_efflux"

/note="Cation efflux family; pfam01545"

/db_xref="CDD:201849"

mamO

4e-04

XP_001707090.1

WD40 області, виявили в ряді еукаріотичних білків, які охоплюють широкий спектр функцій, включаючи адаптер / регуляторних модулів в передачі сигналу, пре-мРНК обробки і збірки цитоскелету, як правило, містить дипептид GH 11-24 залишків від N-кінця і WD дипептид на С-кінці і становить 40 залишків довго, звідси і назва WD40, між ГР і WD лежить консервативний ядро; служить стабільний пропелер, як платформа, на яку білки можуть зв'язувати або стабільно або оборотно, утворює гвинтом типу структура з декількома лезами, де кожна лопать складається з чотирьох багатожильних анти-паралельних B-лист; екземпляри з декількома виявлені копії припустили в більш великі структури шляхом димеризації, кожен WD40 повторити послідовність утворює перші три нитки одного леза і останній нитка в наступному леза, останній с-кінцевий повтор WD40 завершує лезо структуру першого WD40 повторити, щоб створити замкнуте кільце гвинта-структури, залишки на верхній і нижній поверхні гвинта пропонується координувати взаємодію з іншими білками та / або малих лігандів, 7 копій повтору присутні в цьому вирівнювання.

Query 505 LPEGPTRSAVLGLPMGLFSGILGISGG----VIEVPLQRYIGRISL---QNAIANSSVLV 557

L EGP R M L + IS G +++VP +R + +I L +I ++S +

Sbjct 509 LAEGPIRG------MTLIGDVCAISCGRIVALVDVPKRRQLNKIELGSRMTSITHNSKYI 562

Query 558 FWASVAGSVVAFIHG 572

F S AG++ F HG

Sbjct 563 FAGSEAGTLYVFTHG 577

Region 305..616

/region_name="WD40"

/note="WD40 domain, found in a number of eukaryotic

proteins that cover a wide variety of functions including

adaptor/regulatory modules in signal transduction,

pre-mRNA processing and cytoskeleton assembly; typically

contains a GH dipeptide 11-24 residues from...; cl02567"

/db_xref="CDD:207648"

mamE

0.007

EFO62247.1

Query 209 SGEIVKMDE-----ALDLALL--KITPKVQ-LTAAVLGDSDAVNVADEVIAIGTPFGLDM 260

S +I+K+ E A+DL LL ++T K++ + L SD V+ A E + + +

Sbjct 461 SADIIKLAENALTSAVDLELLPSELTKKLEDIVENALATSDDVDKAKETQQYSSEERVSV 520

Query 261 TVSRGIISAKRKTM---------VIEGMTHSNLLQTDAAINQGNS 296

T + +I + K + I+ +T SN+++T A I G+S

Sbjct 521 TEIQRLIMLREKALQHINTAAQEFIDQLTTSNVMRTTATIEDGSS 565

mamN

0.014

EFO61633.1

Dynein важкі ланцюги і області D6 дінеіна двигуна

Це сімейство являє C-кінцевий області дінеіна важкої ланцюга. Ланцюг містить також діяльність АТФази і мікротрубочок зв'язує здатність і виступає в якості двигуна для руху органел і везикул уздовж мікротрубочок. Dynein також бере участь у вій і джгутиків руху. Субодиниці дінеіна складається як мінімум з двох важких ланцюгів, а також ряд середніх і легких ланцюгів. 380 кДа блок двигуна дінеіна належить AAA класу, як шаперон-АТФази. Основними з 380 блок двигуна кДа містить каскадні ланцюга шести AAA модулів, чотири з яких відповідають ATP сайти зв'язування з Р-петля підписів описаний раніше, і два модуля, в якому цикл P було втрачено в процесі еволюції. Це С-кінцевий домен несе D6 області рухового дінеіна, де Р-петля була втрачена в еволюції, але загальна структура потенційного сайт зв'язування АТФ-видимому, зберігається.

Query 366 GIMAGSCAALSGATAGALAMNQYSGFVKRHPELASAAAAGLQFTHR 411

G GS + +G AL +NQ G + R P+L A L++ R

Sbjct 4561 GDAEGSSQSSTGNDKNALLLNQAQGLLDRCPDLFDVEAVSLKYPTR 4606

Region 4115..4873

/region_name="Dynein_heavy"

/note="Dynein heavy chain and region D6 of dynein motor;

pfam03028"

/db_xref="CDD:145919"

mamM

1e-05

XP_001707701.1

Сім'я Катіоніт витікання

Члени цього сімейства інтегральних мембранних білків, які знаходяться збільшити толерантність до двовалентних іонів металів, таких як кадмій, цинк і кобальт. Ці білки, як вважається, откачивающих, що видалення цих іонів з клітки.

Query 25 MVMKAFVGLIGGSQAMLADAMYSLKDMLNALMVIIGTTISSKPLDAEHPYGHGKVEFILS 84

M+ + VG++G S ++ DA + L D+L+ ++ +I + K A+ +G+ + E I

Sbjct 39 MLAELIVGIVGNSLTLVGDAFHMLSDLLSLVIGLISLVLGRKQASAQATFGYKRSETIGG 98

Query 85 MVVSVVFIVLTGYLLVHAVQILLDESLHRTPHL-IVLWAALVSIGVNV-GMYFY 136

+ + +L+ AVQ L+ H+ +VL A+ + VN+ G++ +

Sbjct 99 FFNASFLLSTAFFLVTEAVQKLITAEGVDLNHIDLVLGVAIGGLVVNIAGLFIF 152

Region 37..>131

/region_name="Cation_efflux"

/note="Cation efflux family; pfam01545"

/db_xref="CDD:201849"

Соседние файлы в папке ФБТ БИ 2курс