ФБТ БИ 2курс / Оля
.docx
Назва білку |
Geiardia intestiralis |
||||||||
E-число |
Gone ID |
Функція білку |
|||||||
mamA |
2e-06
|
EET01207.1
|
Tetratricopeptide repeat
|
||||||
Query 88 IAYVKTGAVDRGTELLERSIADAPDNIKVATVLGLTYVQVQKYDLAVPLLVKVAEANPVN 147 I + +D L + + + DNI+V T L L Y+ ++Y A L + E++ +N Sbjct 87 ITLFRLQMIDAAFGLFDSGLDISADNIQVITQLALLYLICERYSEAEALFSSIVESSTLN 146
Query 148 FNV---RFRLGVALDNLGRFDEAIDS------FKIALGLRPNEGKVHRAIAYSYEQMGSH 198 N +F +++G F E DS F IA V IA ++G+H Sbjct 147 KNALSEQFE-----EDVGPFREIFDSLHTYETFLIA---------VLNNIAICNSKLGNH 192
Query 199 EEALPHFKKA 208 AL HF++A Sbjct 193 ALALKHFQQA 202
|
Region 111..208 /region_name="TPR_12" /note="Tetratricopeptide repeat; pfam13424" /db_xref="CDD:205602"
|
||||||||
mamB |
1e-06
|
XP_001707701.1
|
Сімя Cation efflux Члени цього сімейства інтегральних мембранних білків, які знаходяться збільшити толерантність до двовалентних іонів металів, таких як кадмій, цинк і кобальт. Ці білки, як вважається, откачивающих, що видалення цих іонів з клітки. |
||||||
Query 30 ILGLMSGSVALVADSLHSGADVVASGVTQLSLKISNKPADERYPFGYGNIQYISSAIVGS 89 I+G++ S+ LV D+ H +D+++ + +SL + K A + FGY + I S Sbjct 44 IVGIVGNSLTLVGDAFHMLSDLLSLVIGLISLVLGRKQASAQATFGYKRSETIGGFFNAS 103
Query 90 LLLIGASFLMYGSVVKLIS 108 LL A FL+ +V KLI+ Sbjct 104 FLLSTAFFLVTEAVQKLIT 122
|
Region 37..>131 /region_name="Cation_efflux" /note="Cation efflux family; pfam01545" /db_xref="CDD:201849"
|
||||||||
mamO |
4e-04
|
XP_001707090.1
|
WD40 області, виявили в ряді еукаріотичних білків, які охоплюють широкий спектр функцій, включаючи адаптер / регуляторних модулів в передачі сигналу, пре-мРНК обробки і збірки цитоскелету, як правило, містить дипептид GH 11-24 залишків від N-кінця і WD дипептид на С-кінці і становить 40 залишків довго, звідси і назва WD40, між ГР і WD лежить консервативний ядро; служить стабільний пропелер, як платформа, на яку білки можуть зв'язувати або стабільно або оборотно, утворює гвинтом типу структура з декількома лезами, де кожна лопать складається з чотирьох багатожильних анти-паралельних B-лист; екземпляри з декількома виявлені копії припустили в більш великі структури шляхом димеризації, кожен WD40 повторити послідовність утворює перші три нитки одного леза і останній нитка в наступному леза, останній с-кінцевий повтор WD40 завершує лезо структуру першого WD40 повторити, щоб створити замкнуте кільце гвинта-структури, залишки на верхній і нижній поверхні гвинта пропонується координувати взаємодію з іншими білками та / або малих лігандів, 7 копій повтору присутні в цьому вирівнювання. |
||||||
Query 505 LPEGPTRSAVLGLPMGLFSGILGISGG----VIEVPLQRYIGRISL---QNAIANSSVLV 557 L EGP R M L + IS G +++VP +R + +I L +I ++S + Sbjct 509 LAEGPIRG------MTLIGDVCAISCGRIVALVDVPKRRQLNKIELGSRMTSITHNSKYI 562
Query 558 FWASVAGSVVAFIHG 572 F S AG++ F HG Sbjct 563 FAGSEAGTLYVFTHG 577
|
Region 305..616 /region_name="WD40" /note="WD40 domain, found in a number of eukaryotic proteins that cover a wide variety of functions including adaptor/regulatory modules in signal transduction, pre-mRNA processing and cytoskeleton assembly; typically contains a GH dipeptide 11-24 residues from...; cl02567" /db_xref="CDD:207648"
|
||||||||
mamE |
0.007
|
EFO62247.1
|
|
||||||
Query 209 SGEIVKMDE-----ALDLALL--KITPKVQ-LTAAVLGDSDAVNVADEVIAIGTPFGLDM 260 S +I+K+ E A+DL LL ++T K++ + L SD V+ A E + + + Sbjct 461 SADIIKLAENALTSAVDLELLPSELTKKLEDIVENALATSDDVDKAKETQQYSSEERVSV 520
Query 261 TVSRGIISAKRKTM---------VIEGMTHSNLLQTDAAINQGNS 296 T + +I + K + I+ +T SN+++T A I G+S Sbjct 521 TEIQRLIMLREKALQHINTAAQEFIDQLTTSNVMRTTATIEDGSS 565
|
|
||||||||
mamN
|
0.014
|
EFO61633.1
|
Dynein важкі ланцюги і області D6 дінеіна двигуна Це сімейство являє C-кінцевий області дінеіна важкої ланцюга. Ланцюг містить також діяльність АТФази і мікротрубочок зв'язує здатність і виступає в якості двигуна для руху органел і везикул уздовж мікротрубочок. Dynein також бере участь у вій і джгутиків руху. Субодиниці дінеіна складається як мінімум з двох важких ланцюгів, а також ряд середніх і легких ланцюгів. 380 кДа блок двигуна дінеіна належить AAA класу, як шаперон-АТФази. Основними з 380 блок двигуна кДа містить каскадні ланцюга шести AAA модулів, чотири з яких відповідають ATP сайти зв'язування з Р-петля підписів описаний раніше, і два модуля, в якому цикл P було втрачено в процесі еволюції. Це С-кінцевий домен несе D6 області рухового дінеіна, де Р-петля була втрачена в еволюції, але загальна структура потенційного сайт зв'язування АТФ-видимому, зберігається. |
||||||
Query 366 GIMAGSCAALSGATAGALAMNQYSGFVKRHPELASAAAAGLQFTHR 411 G GS + +G AL +NQ G + R P+L A L++ R Sbjct 4561 GDAEGSSQSSTGNDKNALLLNQAQGLLDRCPDLFDVEAVSLKYPTR 4606
|
Region 4115..4873 /region_name="Dynein_heavy" /note="Dynein heavy chain and region D6 of dynein motor; pfam03028" /db_xref="CDD:145919"
|
||||||||
mamM |
1e-05 |
XP_001707701.1
|
Сім'я Катіоніт витікання Члени цього сімейства інтегральних мембранних білків, які знаходяться збільшити толерантність до двовалентних іонів металів, таких як кадмій, цинк і кобальт. Ці білки, як вважається, откачивающих, що видалення цих іонів з клітки. |
||||||
Query 25 MVMKAFVGLIGGSQAMLADAMYSLKDMLNALMVIIGTTISSKPLDAEHPYGHGKVEFILS 84 M+ + VG++G S ++ DA + L D+L+ ++ +I + K A+ +G+ + E I Sbjct 39 MLAELIVGIVGNSLTLVGDAFHMLSDLLSLVIGLISLVLGRKQASAQATFGYKRSETIGG 98
Query 85 MVVSVVFIVLTGYLLVHAVQILLDESLHRTPHL-IVLWAALVSIGVNV-GMYFY 136 + + +L+ AVQ L+ H+ +VL A+ + VN+ G++ + Sbjct 99 FFNASFLLSTAFFLVTEAVQKLITAEGVDLNHIDLVLGVAIGGLVVNIAGLFIF 152
|
Region 37..>131 /region_name="Cation_efflux" /note="Cation efflux family; pfam01545" /db_xref="CDD:201849"
|