Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

ФБТ БИ 2курс / протокол 3

.docx
Скачиваний:
25
Добавлен:
10.04.2018
Размер:
15.27 Кб
Скачать

Прізвище І. П., група, факультет

Лабораторна робота

Пошук та аналіз гомологів білків магнітосомного острівця МТБ у людини

Мета роботи: здійснити порівняльний аналіз амінокислотних послідовностей білків магнітосомного острівця магнітотаксисних бактерій (МТБ) Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 з білками людини, враховуючи їх функціональну класифікацію.

Для порівняння використали білок mam… Mam… - білок, без якого не може здійснюватись біомінералізація.

Хід роботи

  1. Здійснюємо порівняльний аналіз амінокислотних послідовностей білків магітосомного острівця МТБ і людини. Для цього використовуємо програму BLAST online ресурсу NCBI. Встановлюємо стандартні параметри для виявлення гомологів та стандартні методи оцінки статистичної значущості вирівнювань білкових послідовностей. Результати заносимо до таблиці 1.

Табл. 1. Порівняльна таблиця статистично значущих вирівнювань білку mam… і білків людини із застосуванням стандартних параметрів BLAST.

За результатами табл. 1 можна зробити висновок, що …..

  1. Визначаємо ступінь гомології за діапазонами домен6ів, що співпадають. Результати подані в таблиці 2.

Табл. 2. Гомологи білків mam… людини з доменами.

  1. За допомогою ресурсу The Human Protein Atlas визначаємо рівні експресії та локалізації білків-гомологів в різних тканинах та органах людини.

Табл. Табл. Табл.

Висновки:

Соседние файлы в папке ФБТ БИ 2курс