Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
3 КУРС / Карта метаболизма proteus mirabilis.docx
Скачиваний:
39
Добавлен:
28.03.2019
Размер:
1.4 Mб
Скачать

Карта метаболизма организма Proteus mirabilis

Название организма: Proteus mirabilis

Описание: Грамотрицательная кишечная бактерия Proteus mirabilis, комменсальная бактерия человека, является частой причиной инфекций мочевыводящих путей у людей с длительными постоянными катетерами или при проблемах и повреждениях мочевыводящих путей (например, из-за повреждения спинного мозга или анатомической аномалии). Инфекция может привести к острому пиелонефриту, лихорадке, бактериемии, образованию камней в почках и мочевом пузыре или закупорке постоянных мочевых катетеров. Бактерия очень подвижна. Клетки обладают сильными адгезионными способностями, которые позволяют ему поражать мочевой пузырь, почки и даже проникать в кровоток. 

Систематика:

Kingdom:

Bacteria

Phylum:

Proteobacteria

Class:

Gammaproteobacteria

Order:

Enterobacteriales

Family:

Enterobacteriaceae

Genus:

Proteus

Species:

Mirabilis

Внешний вид: Грамотрицательная, спорообразующая, факультативно анаэробная палочка.

Рис.1. Микрофотография Proteus mirabilis

Strain (Штамм)

HI4320

Complete (Завершён)

Yes

Sequencing centre

(Центр секвенирования)

(18-FEB-2008) Sebaihia M., Sulston Laboratories, Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, (25-AUG-2008) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA

Sequencing quality

(Качество секвенирования)

Level 6: Finished

Sequencing method

(Метод)

Sanger

Isolation site

(Источник)

Urine of a nursing home patient with a long term (>30 day) indwelling urinary catheter.

Number of replicons (Количество репликонов)

2

Gram staining properties

(Окраска по Граму)

Negative

Shape

Bacilli

Flagellar presence

(Наличие жгутиков)

Yes

Number of membranes

(Количество мембран)

2

Oxygen requirements

(Чувствительность к 02)

Aerobic

Optimal temperature

(Оптимальная температура)

37.0

Temperature range

(Температурная зона)

Mesophilic

Habitat

(Среда обитания)

HostAssociated

Biotic relationship

(Биологические отношения)

Free living

Host name

(Носитель)

Homo sapiens

Sporulation (Спороношение)

Nonsporulating

Diseases

(Болезни)

Encephalitis, urinary tract infections, surgical wound infections, pyelonephritis, pneumonia, septicemia

Гликолиз / глюконеогенез:

Номер

Название (английское)

Название (русское)

1.1.1.1

S-(hydroxymethyl) alcohol dehydrogenase

S- (гидроксиметил) алкогольдегидрогеназа

1.2.1.12

glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase

глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа

1.2.4.1

pyruvate dehydrogenase E1 component

компонент пируватдегидрогеназы Е1

1.8.1.4

dihydrolipoamide dehydrogenase

дигидролипоамиддегидрогеназа

2.3.1.12

pyruvate dehydrogenase E2 component

компонент пируватдегидрогеназы Е2

2.7.1.-

PTS system, sugar-specific IIA component

Система PTS, специфичный для сахара компонент IIA

2.7.1.11

6-phosphofructokinase 1

6-фосфофруктокиназа 1

2.7.1.199

PTS system, sugar-specific IIA component

Система PTS, специфичный для сахара компонент IIA

2.7.1.40

pyruvate kinase II

Пируваткиназа 2

2.7.2.3

phosphoglycerate kinase

фосфоглицерат киназа

3.1.3.11

fructose-1,6-bisphosphatase II

фруктоза-1,6-бисфосфатаза II

3.2.1.86

6-phospho-beta-glucosidase

6-фосфо-бета-глюкозидазы

3.3.3.10

glucose-1-phosphatase

глюкозо-1-фосфатазы

4.1.1.49

phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)

фосфоенолпируват карбоксикиназа

4.1.2.13

fructose-bisphosphate aldolase, class II

фруктоза-бисфосфат альдолаза, класс II

4.2.1.11

enolase

енолаза

5.1.3.15

glucose-6-phosphate 1-epimerase

глюкозо-6-фосфат-1-эпимераза

5.1.3.3

aldose 1-epimerase

альдозо-1-эпимераза

5.1.3.9

glucose-6-phosphate isomerase

глюкозо-6-фосфат-изомераза

5.3.1.1

triosephosphate isomerase (TIM)

триозофосфатизомераза (TIM)

5.4.2.11

2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase

2,3-бисфосфоглицерат-зависимая фосфоглицерат мутаза

5.4.2.12

probable phosphoglycerate mutase

вероятная фосфоглицерат мутаза

5.4.2.2

phosphoglucomutase

фосфоглюкомутазы

6.2.1.1

acetyl-CoA synthetase

ацетил-КоА-синтетаза

Описание:

Гликолиз - это процесс превращения глюкозы в пируват и генерирования небольших количеств АТФ (энергии) и НАДН (восстановительной способности). Это центральный путь, который продуцирует важные метаболиты-предшественники: шестиуглеродные соединения глюкозы-6P и фруктозы-6P и трехуглеродные соединения глицерона-P, глицеральдегида-3P, глицерата-3P, фосфоенолпирувата и пирувата. Ацетил-КоА, другой важный метаболит-предшественник, получают окислительным декарбоксилированием пирувата.

Суммарное уравнение гликолиза: Глюкоза + 2НАД+ + 2АДФ + 2Pi → 2 пируват + 2НАДH + 2Н+ + 2АТФ + 2Н2O

Глюконеогенез - это путь синтеза глюкозы из неуглеводных предшественников. По сути, это инверсия гликолиза с небольшими вариациями альтернативных путей.

Суммарное уравнение глюконеогенеза выглядит следующим образом: 2 Пируват + 4ATP + 2GTP + 2NADH + 2H+ + 6H2O → глюкоза + 4ADP + 2GDP + 6Pi + 2NAD+[4].

Источники:

http://bacmap.wishartlab.com/organisms/677#kegg-pathways https://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?pmr00010

Используемый здесь штамм HI4320, был выделен из мочи пациента дома престарелых с длительным (> 30 дней) постоянным мочевым катетером.