- •Молекулярно- генетические исследования, ПЦР в диагностике заболеваний
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА
- •ПЦР в диагностике заболеваний
- •ПЦР в диагностике заболеваний
- •ПЦР в диагностике заболеваний
- •Что такое ПЦР
- •Особенности метода
- •Изобретение
- •Механизм ПЦР
- •Стадии постановки ПЦР
- •Пробоподготовка (подготовка пробы биологического материала)
- •На чем основана амплификация
- •Механизм ПЦР
- •Детекция
- •Стадии
- •Как все происходит
- •Экспоненциальная
- •Проблема контаминации
- •Варианты контаминации продуктами амплификации
- •Изобретение флуоресцентной ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Варианты флуоресцентной ПЦР
- •Кинетические кривые PCR
- •Сравнение принципов качественного и количественного ПЦР анализа
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Особенности «флуоресцентной» ПЦР
- •Тест-системы для “real-time” PCR
- •Организация ПЦР-лаборатории
- •Устройство ПЦР-лаборатории с
- •Устройство ПЦР-лаборатории с
- •Устройство ПЦР-лаборатории с флуоресцентной детекцией (количественный анализ)
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Нанодиагностика (обнаружение ДНК)
- •Контроль за прохождением реакции
- •Качественный и количественный анализ
- •Эпоха ПЦР
- •Особенности «классической» ПЦР
- •Особенности «флуоресцентной» ПЦР
- •Применение ПЦР
- •Применение ПЦР
- •Медицина
- •Гемотрансфузионные инфекции
- •ПЦР в диагностике ВИЧ
- •Гемотрансфузионные инфекции
- •Оппортунистические инфекции
- •ИППП
- •ПЦР в диагностике ИППП
- •Заболевания дыхательной системы
- •Диагностика наследственных заболеваний
- •Онкология
- •Иммунология
- •Эпидемические инфекции
- •HLA-типирование
- •Ветеринария
- •ПЦР в ветеринарии
- •ГМО - генетически модифицированные организмы
- •Организация контроля за ГМИ
- •Пострегистрационный мониторинг
- •Современные тенденции развития ПЦР
- •Количественный анализ: ДТ- 322
- •Принципы количественного анализа в real-time ПЦР
Изобретение
•1955 г. - открытие ДНК-полимеразы
•Принцип ПЦР сформулировал Гобинд Корана в 1971
•1975 г. - открытие Thermus aquaticus
•В 1983 Кэри Мюллису удалось провести
•ПЦР 1985 г. - амплификация
бета-глобина
•В 1993 за изобретение
ПЦР Кэри Мюллису вручена Нобелевская премия по химии
Механизм ПЦР
Основные компоненты:
Праймеры
Tag - полимераза
Смесь дезоксинуклеотидтрифосфатов
Буфер
Анализируемый образец Дополнительные компоненты:
Внутренние контролиДНК - зонды
Стадии постановки ПЦР
Подготовка пробы биологического материала
Амплификация
Детекция в агарозном геле
Пробоподготовка (подготовка пробы биологического материала)
Упрощенные методики (кипячение, протеолиз)
Классическая методика (получение чистого препарата ДНК/РНК)
Сорбция ДНК (GSCN + сорбция ДНК на носителе)
Использование ионообменников
(Chilex)
На чем основана амплификация
•Использование термостабильной полимеразы (Taq-полимераза)
•Полимераза достраивает
специфические затравки (праймеры)
• Процесс состоит из
повторяющихся температурных циклов
Механизм ПЦР
Температурный цикл амплификации состоит из трех этапов:
Денатурация
Отжиг
Элонгация (синтез)
Детекция
Использование интеркаляторов
-Электрофорез
-Real-time машины
Использование праймеров и ДНК- зондов, меченных флуоресцентными
метками
-гибридизация после амплификации
-гибридизация во время амплификации
Стадии
постановки
«классической»
ПЦР
Как все происходит
Экспоненциальная
амплификация