Новиков Д.К. Медицинская микробиология
.pdfМИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РЕСПУБЛИКИ БЕЛАРУСЬ УО «ВИТЕБСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКОЙ УНИВЕРСИТЕТ»
Медицинская микробиология
Новиков Д.К., Генералов И.И., Данющенкова Н.М. и др.
Витебск, 2010
Кафедра клинической микробиологии
Версия неполная и неофициальная. Права на текст принадлежат его авторам.
2
ОГЛАВЛЕНИЕ |
|
ПЕРЕЧЕНЬ УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ |
12 |
РАЗДЕЛ I. ОБЩАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ |
13 |
I. МИКРОБИОЛОГИЯ И ЕЕ РАЗВИТИЕ |
|
(Н.В. Железняк) |
13 |
II. МОРФОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ |
|
(Н.М. Данющенкова, И.И. Генералов) |
21 |
2.1. Систематика и номенклатура микроорганизмов |
21 |
2.2. Структура бактериальной клетки и химический состав мик- |
|
роорганизмов |
27 |
2.3. Формы бактерий |
34 |
2.4. Морфология спирохет, риккетсий, хламидий, микоплазм, |
|
грибов, актиномицетов |
36 |
III. ФИЗИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ |
|
(Н.М. Данющенкова) |
42 |
3.1. Метаболизм |
42 |
3.2. Источники углерода и типы питания |
42 |
3.3. Источники энергии и доноры электронов |
43 |
3.4. Факторы роста |
43 |
3.5. Транспорт питательных веществ и механизм питания |
43 |
3.6. Ферменты бактерий |
44 |
3.7. Дыхание микроорганизмов |
45 |
3.8. Рост и размножение бактерий |
48 |
3.9. Питательные среды, их классификация |
50 |
IV. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВИРУСОВ |
|
(Н.М. Данющенкова) |
51 |
4.1. Классификация вирусов |
52 |
4.2. Строение вирусов |
55 |
4.3. Взаимодействие вируса с клеткой |
|
4.4. Культивирование и индикация вирусов |
61 |
4.5. Бактериофаги |
63 |
V. ГЕНЕТИКА МИКРООРГАНИЗМОВ |
|
(И.И. Генералов) |
68 |
5.1. Особенности генетики микроорганизмов |
68 |
5.2. Организация генетического аппарата микроорганизмов |
69 |
5.3. Внехромосомные факторы наследственности (плазмиды и |
|
эписомы) |
72 |
5.4. Инсерционные (Is) последовательности и транспозоны |
76 |
5.5. Изменчивость микроорганизмов |
77 |
5.6. Фенотипическая изменчивость |
77 |
5.7. Генотипическая изменчивость |
78 |
3
5.7.1. Мутации |
78 |
5.7.2. Диссоциация |
81 |
5.7.3. Репарации |
81 |
5.8. Рекомбинационная (комбинативная) изменчивость |
83 |
5.8.1. Трансформация |
84 |
5.8.2. Трансдукция |
86 |
5.8.3. Конъюгация |
87 |
5.9. Генетические основы патогенности микроорганизмов |
88 |
5.10. Генетика вирусов |
90 |
5.11. Методы молекулярно-генетического анализа |
93 |
5.12. Генная инженерия |
95 |
5.13. Взаимоотношения геномики человека и геномики микро- |
|
организмов |
97 |
VI. ОСНОВЫ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ МИКРОБИОЛОГИИ |
|
(Н.М. Данющенкова) |
101 |
6.1. Экология микроорганизмов |
101 |
6.2. Экологические связи в микробиоценозах |
102 |
6.3. Микрофлора почвы |
103 |
6.4. Микрофлора воды |
104 |
6.5. Микрофлора воздуха |
105 |
6.6. Нормальная микрофлора организма человека |
105 |
6.7. Дисбактериоз |
110 |
6.8. Действие физических и химических факторов окружающей |
|
среды на микроорганизмы |
112 |
6.9. Микробиологические основы стерилизации, дезинфекции, |
|
антисептики и асептики. Противомикробные мероприятия |
114 |
6.10. Санитарная микробиология |
118 |
6.10.1. Санитарно-показательные микроорганизмы |
118 |
6.10.2. Санитарно-бактериологическое исследование воды, воз- |
|
духа, почвы |
119 |
VII. АНТИМИКРОБНАЯ ТЕРАПИЯ |
|
(В.К. Окулич) |
123 |
7.1. Антимикробные средства |
123 |
7.2. Микробиологические основы химиотерапии |
124 |
7.3. Антибиотики |
125 |
7.4. Классификация антибиотиков |
125 |
7.5. Противогрибковые препараты |
130 |
7.6. Побочное действие антибактериальных средств |
130 |
7.7. Определение чувствительности микроорганизмов к анти- |
|
биотикам |
131 |
7.7.1. Общие положения |
133 |
7.7.2. Диффузионные методы |
133 |
7.7.3. Методы серийных разведений |
134 |
7.7.4. Ускоренные методы |
136 |
4
7.7.5. Определение антибиотиков в сыворотке крови, моче и |
|
других биологических жидкостях |
136 |
7.8. Ограничение развития устойчивости к антибактериальным |
|
препаратам |
137 |
VIII. ОСНОВЫ УЧЕНИЯ ОБ ИНФЕКЦИИ |
|
(А.Г. Генералова) |
138 |
8.1. Инфекция (инфекционный процесс) |
138 |
8.2. Динамика инфекционного процесса |
139 |
8.3. Формы инфекционного процесса |
140 |
8.4. Особенности эпидемического процесса |
142 |
8.5. Патогенность и вирулентность |
144 |
8.6. Изменение патогенности и вирулентности |
147 |
8.7. Экзотоксины, эндотоксины |
147 |
РАЗДЕЛ II. ЧАСТНАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ |
154 |
A. ЧАСТНАЯ БАКТЕРИОЛОГИЯ |
154 |
IX. ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ КОККИ |
|
(Н.М. Данющенкова) |
154 |
9.1. Семейство Micrococcaceae |
154 |
9.1.1. Род Staphylococcus |
154 |
9.1.2. Род Stomatococcus |
160 |
9.2. Семейство Streptococcaceae |
160 |
9.2.1. Род Streptococcus |
161 |
9.3. Семейство Leuconostaceae |
|
9.3.1. Бактерии рода Leuconostoc |
167 |
9.4. Семейство Enterococcaceae |
|
9.4.1. Род Enterococcus |
168 |
X. ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ КОККИ |
|
(Г.А. Кардович) |
169 |
10.1. Семейство Neisseriaceae |
169 |
10.1.1. Менингококки |
169 |
10.2. Гонококки |
171 |
XI. АЭРОБНЫЕ НЕФЕРМЕНТИРУЮЩИЕ |
|
ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ ПАЛОЧКИ И |
|
КОККОБАЦИЛЛЫ (Н.М. Данющенкова) |
174 |
11.1. Псевдомонады |
174 |
XII. АНАЭРОБНЫЕ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ И |
|
ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ (Н.М. Данющенкова) |
178 |
12.1. Спорообразующие бактерии рода Clostridium |
178 |
12.1.1. Клостридии столбняка |
178 |
12.1.2. Возбудители газовой гангрены |
182 |
12.1.3. Возбудитель псевдомембранозного энтероколита |
186 |
5
12.1.4. Возбудитель ботулизма |
187 |
12.2. Грамотрицательные не образующие спор анаэробные бак- |
|
терии |
189 |
12.2.1. Бактероиды |
189 |
12.2.2. Фузобактерии |
191 |
XIII. ПАЛОЧКИ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ |
|
НЕСПОРООБРАЗУЮЩИЕ |
|
(Н.В. Железняк, Г.А. Кардович, Н.М. Данющенкова, И.И. Генералов) |
194 |
13.1. Энтеробактерии |
194 |
13.1.1. Эшерихии |
194 |
13.1.2. Шигеллы |
199 |
13.1.3. Сальмонеллы |
203 |
13.1.4. Клебсиеллы |
211 |
13.1.5. Протеи |
214 |
13.1.6. Иерсинии |
215 |
13.1.6.1. Иерсинии псевдотуберкулеза |
215 |
13.1.6.2. Y.enterocolitica |
218 |
13.1.6.3. Возбудители чумы |
220 |
13.2. Гемофильные бактерии |
224 |
13.3. Гарднереллы |
226 |
13.4. Бордетеллы |
229 |
13.5. Бруцеллы |
232 |
13.6. Возбудитель туляремии |
235 |
13.7. Патогенные вибрионы |
237 |
13.7.1. Род Vibrio |
238 |
13.7.1.1. Возбудители холеры |
238 |
13.7.1.2. Другие патогенные вибрионы |
244 |
XIV. ПАЛОЧКИ ГРАМПОЛОЖИТЕЛЬНЫЕ АЭРОБНЫЕ |
|
(Г.А. Кардович) |
246 |
14.1. Возбудитель сибирской язвы |
246 |
14.2. Коринебактерии |
249 |
14.3. Патогенные микобактерии |
254 |
14.4. Патогенные актиномицеты |
261 |
14.5. Листерии |
264 |
XV. ПАТОГЕННЫЕ СПИРОХЕТЫ |
|
(Г.А. Кардович, Н.М. Данющенкова, И.И. Генералов, Н.В. Железняк) |
267 |
15.1. Трепонемы |
267 |
15.1.1. Возбудитель сифилиса |
267 |
15.1.2. Возбудители бытовых трепонематозов |
271 |
15.2. Боррелии |
273 |
15.3. Лептоспиры |
277 |
15.4. Патогенные спириллы |
280 |
15.4.1. Кампилобактерии |
280 |
15.4.2. Хеликобактерии |
282 |
6
XVI. ЛЕГИОНЕЛЛЫ (Н.М. Данющенкова) |
284 |
XVII. ПАТОГЕННЫЕ РИККЕТСИИ |
|
(И.И. Генералов, Г.А. Кардович) |
287 |
XVIII. ХЛАМИДИИ (Г.А. Кардович) |
294 |
XIX. МИКОПЛАЗМЫ (Г.А. Кардович) |
298 |
B. ЧАСТНАЯ ВИРУСОЛОГИЯ |
301 |
XX. ВОЗБУДИТЕЛИ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ |
|
ЧЕЛОВЕКА |
301 |
20.1. РНК-геномные вирусы |
|
(Н.М. Данющенкова, Д.К. Новиков, И.И. Генералов) |
301 |
20.1.1. Семейство ортомиксовирусов |
301 |
20.1.2. Семейство парамиксовирусов |
305 |
20.1.2.1. Вирусы парагриппа человека |
305 |
20.1.2.2. Вирус паротита |
307 |
20.1.2.3. Вирус кори |
308 |
20.1.2.4. Респираторно-синтициальный вирус |
310 |
20.1.3. Семейство коронавирусов |
311 |
20.1.3.1. Общая характеристика |
311 |
20.1.3.2. Возбудитель тяжелого острого респираторного син- |
|
дрома (ТОРС-ассоциированный коронавирус) |
312 |
20.1.4. Семейство пикорнавирусов |
315 |
20.1.4.1. Энтеровирусы |
316 |
20.1.4.2. Вирус гепатита А |
321 |
20.1.4.3. Риновирусы |
322 |
20.1.4.4. Вирус ящура |
323 |
20.1.5. Семейство реовирусов |
323 |
20.1.5.1. Ротавирусы |
323 |
20.1.6. Семейство рабдовирусов |
325 |
20.1.6.1. Вирус бешенства |
325 |
20.1.6.2. Вирус везикулярного стоматита |
328 |
20.1.7. Семейство тогавирусов |
328 |
20.1.7.1. Альфавирусы |
329 |
20.1.7.2. Вирус краснухи |
329 |
20.1.8. Семейство флавивирусов |
331 |
20.1.8.1. Вирус клещевого энцефалита |
331 |
20.1.8.2. Вирус лихорадки Денге |
332 |
20.1.8.3. Вирус желтой лихорадки |
333 |
20.1.9 Семейство буньявирусов |
333 |
20.1.9.1. Хантавирусы |
334 |
20.1.10. Семейство филовирусов |
334 |
20.1.11. Семейство аренавирусов |
335 |
20.1.12. Семейство ретровирусов |
336 |
7
20.1.12.1. Вирус иммунодефицита человека |
336 |
20.2. ДНК-геномные вирусы |
|
(Н.В. Железняк, Г.А. Кардович, Н.М. Данющенкова, И.И. Генералов) |
341 |
20.2.1. Семейство аденовирусов |
341 |
20.2.2. Семейство герпесвирусов |
344 |
20.2.2.1. Герпесвирусы 1 и 2 типа |
344 |
20.2.2.2. Вирус ветряной оспы и опоясывающего лишая |
347 |
20.2.2.3. Цитомегаловирус |
348 |
20.2.2.4. Вирус Эпштейна-Барр |
350 |
20.2.3. Семейство поксвирусов |
351 |
20.2.4. Гепатотропные вирусы |
354 |
20.2.4.1. Гепаднавирусы. Вирус гепатита В |
354 |
20.2.4.2. Вирусы гепатита С, дельта, Е, G |
357 |
XXI. ОНКОГЕННЫЕ ВИРУСЫ И РАКОВАЯ |
|
ТРАНСФОРМАЦИЯ КЛЕТОК |
|
(Д.К. Новиков) |
361 |
XXII. ПРИОНЫ И ПРИОНОВЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ |
|
ЧЕЛОВЕКА |
|
(А.Г. Генералова) |
364 |
C. ПАТОГЕННЫЕ ПРОСТЕЙШИЕ |
368 |
(Н.В. Железняк) |
|
XIII. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА |
368 |
XXIV. ПРИНЦИПЫ ДИАГНОСТИКИ ПРОТОЗОЙНЫХ |
|
ИНФЕКЦИЙ |
368 |
XXV. ЧАСТНАЯ ПРОТОЗООЛОГИЯ |
370 |
25.1. Класс I – Flagellata (жгутиковые) |
370 |
25.1.1. Род Trichomonas |
370 |
25.1.2. Род Giardia |
372 |
25.1.3. Род Leishmania |
373 |
25.2. Класс II – Sporozoa (споровики) |
375 |
25.2.1. Род Plasmodium |
375 |
25.2.2. Род Toxoplasma |
378 |
25.2.3. Род Cryptosporidium |
380 |
25.3. Класс III – Sarcodina (саркодовые) |
381 |
25.3.1. Род Entamoeba |
381 |
25.4. Класс IV – Infusoria (инфузории) |
383 |
D. ОСНОВЫ МЕДИЦИНСКОЙ МИКОЛОГИИ |
|
(Ю.В. Сергеев, А.Ю. Сергеев) |
384 |
XXVI. ВВЕДЕНИЕ |
384 |
XXVII. ОБЩИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ГРИБОВ |
386 |
8
27.1. Таксономическое положение и систематика грибов |
386 |
27.2. Культуральные свойства грибов |
387 |
27.3. Морфологические свойства |
388 |
27.4. Размножение грибов |
388 |
27.5. Ультраструктура грибов |
389 |
27.6. Физиология грибов |
390 |
XXVIII. ВОЗБУДИТЕЛИ ПОВЕРХНОСТНЫХ МИКОЗОВ |
391 |
28.1. Дерматофиты |
391 |
28.2. Возбудители разноцветного лишая и других поверхност- |
|
ных микозов |
393 |
28.3. Возбудители подкожных микозов |
394 |
28.3.1. Возбудители хромомикоза |
394 |
28.3.2. Возбудитель споротрихоза. |
394 |
28.3.3. Возбудители эумицетомы |
395 |
28.3.4. Возбудители феогифомикоза |
395 |
28.4. Лечение и профилактика подкожных микозов |
395 |
XXIX. ВОЗБУДИТЕЛИ ГЛУБОКИХ МИКОЗОВ |
396 |
29.1. Возбудители респираторных эндемических микозов |
396 |
29.2. Возбудитель гистоплазмоза |
397 |
29.3. Возбудитель бластомикоза |
397 |
29.4. Возбудитель паракокцидиоидоза |
398 |
29.5. Возбудитель кокцидиоидоза |
399 |
29.6. Возбудитель эндемического пенициллиоза |
400 |
29.7. Лечение и профилактика респираторных эндемических |
|
микозов |
400 |
29.8. Лабораторная диагностика респираторных эндемических |
|
микозов |
401 |
XXX. ВОЗБУДИТЕЛИ ОППОРТУНИСТИЧЕСКИХ |
|
МИКОЗОВ |
402 |
30.1. Общая характеристика |
402 |
30.2. Возбудители кандидоза |
402 |
30.3. Возбудители аспергиллеза |
406 |
30.4. Возбудители мукороза. |
408 |
30.5. Возбудитель криптококкоза |
409 |
30.6. Возбудитель пневмоцистоза |
412 |
XXXI. МИКРОБИОЛОГИЯ РОТОВОЙ ПОЛОСТИ |
|
(И.И. Генералов, Н.М. Данющенкова, Н.В. Железняк, В.К. Окулич) |
415 |
31.1. Нормальная микрофлора полости рта |
415 |
31.1.1. Общая характеристика микрофлоры ротовой полости |
415 |
31.1.2. Онтогенез нормальной микрофлоры |
418 |
31.1.3. Микрофлора слюны, спинки языка, зубного налета (зуб- |
|
ной бляшки), зубодесневого кармана |
419 |
31.1.4. Значение нормальной микрофлоры, обитающей в поло- |
|
9
сти рта |
423 |
31.1.5. Дисбактериоз полости рта |
423 |
31.2. Иммунные и неиммунные механизмы защиты в ротовой |
|
полости |
424 |
31.2.1. Неспецифические механизмы защиты |
425 |
31.2.2 Специфические механизмы иммунной защиты |
428 |
31.3. Инфекционные патологические процессы в полости рта |
430 |
31.3.1. Общая характеристика инфекций челюстно-лицевой об- |
|
ласти |
430 |
31.3.2. Патогенез инфекционных поражений ротовой полости |
431 |
31.3.3. Кариес |
432 |
31.3.4. Пульпит |
434 |
31.3.5. Заболевания периодонта |
435 |
31.3.6. Пародонтоз |
439 |
31.3.7. Периостит и остеомиелит челюстей |
439 |
31.3.8. Одонтогенный верхнечелюстной синусит |
440 |
31.3.9. Гнойная инфекция мягких тканей лица и шеи |
440 |
31.3.10. Лимфаденит лица и шеи |
441 |
31.3.11. Одонтогенные бронхолегочные заболевания |
441 |
31.3.12. Бактериологический метод исследования в стоматоло- |
|
гии |
442 |
31.3.13. Одонтогенный сепсис |
443 |
31.4. Специфические инфекционные заболевания, протекающие |
|
с поражением ротовой полости |
445 |
31.4.1. Туберкулез |
445 |
31.4.2. Актиномикоз |
446 |
31.4.3. Дифтерия |
447 |
31.4.4. Скарлатина |
448 |
31.4.5. Сибирская язва |
449 |
31.4.6. Сифилис |
449 |
31.4.7. Гонококковая инфекция |
450 |
31.4.8. Кандидоз полости рта |
450 |
31.4.9. Вирусные заболевания, поражающие полость рта |
451 |
РАЗДЕЛ III. ПРАКТИЧЕСКИЕ НАВЫКИ ПО |
|
МЕДИЦИНСКОЙ МИКРОБИОЛОГИИ |
457 |
РАЗДЕЛ IV. СИТУАЦИОННЫЕ ЗАДАЧИ |
469 |
РАЗДЕЛ V. КОНТРОЛЬНЫЕ ТЕСТОВЫЕ ЗАДАНИЯ ПО |
|
МЕДИЦИНСКОЙ БАКТЕРИОЛОГИИ, ВИРУСОЛОГИИ, |
|
ИММУНОЛОГИИ |
493 |
РАЗДЕЛ VI. ИЛЛЮСТРАЦИИ: РИСУНКИ И СХЕМЫ |
584 |
10