- •Введение
- •1.1. Аминокислоты Протеиногенные аминокислоты
- •1.2. Строение белков
- •1.3. Свойства белков
- •Классификация белков в организме
- •1.4. Обмен белков
- •Распад белков
- •Метаболизм аминокислот
- •1.5. Основные термины темы
- •Вопросы и задания
- •Углеводы. Обмен углеводов
- •Классификация углеводов
- •Альдозы
- •Альдозы
- •2.2. Обмен углеводов Катаболизм углеводов
- •Катаболизм гликогена
- •Распад глюкозы
- •2.3. Основные понятия и термины темы
- •Вопросы и задания
- •Липиды. Обмен липидов
- •Наиболее распространенные природные жирные кислоты
- •Классификация липидов
- •Простые липиды
- •Сложные липиды
- •Обмен липидов
- •Катаболизм липидов
- •Основные понятия и термины темы
- •Вопросы и задания
- •Цикл трикарбоновых кислот
- •4.1. Общая схема цикла трикарбоновых кислот
- •4.2. Стехиометрия цикла трикарбоновых кислот
- •4.3. Пируват – дегидрогеназный комплекс – организованная система ферментов
- •5. Ферменты - специфические белки
- •5.1. Свойства ферментов
- •Строение ферментов
- •5.3. Номенклатура ферментов
- •5.4. Классификация ферментов и характеристика некоторых групп
- •5.5. Методы выделения и очистки ферментов
- •6. Гормоны
- •6.1. Механизм действия гормонов
- •6.2. Основные гормоны человека
- •. Гормоноиды
- •6.4. Применение гормонов
- •7.Витамины
- •7.1. Общие представления о витаминах
- •7.2. Методы определения витаминов
- •7.3. Классификация витаминов
- •7.4. Антивитамины
- •7.5. Значение витаминов
- •8. Нервная система
- •9. Обмен веществ и энергии в живых организмах
- •9.1. Превращение химической энергии в организме
- •9.2. Некоторые аспекты биоэнергетики
- •9.3. Метаболизм
- •9.4. Методы изучения обмена веществ
- •9.5. Регуляция обмена веществ
- •10. Гемоглобин
- •10.1. Строение гемоглобина
- •10.2. Функциональные свойства гемоглобина
- •10.3. Метаболизм гемоглобина
- •10.4. Методы определения концентрации гемоглобина
- •10.5. Генетика гемоглобина
- •Заключение
- •Библиографический список
- •Оглавление
- •6.1. Механизм действия гормонов……………………124
- •9.2. Некоторые аспекты биоэнергетики………………199
- •3 94026 Воронеж, Московский просп., 14
Основные понятия и термины темы
Гликолипиды – сложные эфиры ВЖК и сфингозина, в состав которых входит углеводная компонента.
Жиры (триглицериды) - сложные эфиры ВЖК и трехатомного спирта глицерина.
Кетонемия – состояние организма, при котором происходит избыточное накопление кетоновых тел.
Кетоновые тела – продукты обмена ацетил-КоА; к ним относятся ацетоуксусная и β-оксимасляная кислоты, ацетон.
Кетонурия – состояние организма, при котором происходит выделение кетоновых тел с мочой.
Липиды – природные неполярные соединения, нерастворимые в воде, но растворимые в неполярных растворителях.
Липолиз – гидролитическое расщепление жиров.
Стериды – сложные эфиры ВЖК и полициклических спиртов.
Сфингофосфолипиды - сложные эфиры ВЖК и сфингозина, содержащие остаток фосфорной кислоты и связанное с ней добавочное соединение.
Фосфатиды - сложные эфиры ВЖК и глицерин, содержащие остаток фосфорной кислоты и связанное с ней добавочное соединение.
Вопросы и задания
Какие органические вещества называются липидами?
Какие химические компоненты входят в состав фосфатидов?
Напишите структурные формулы трипальмитина, пальмитодилаурина, пальмитостеароолеина. Какие триглицериды входят в группу простых, а какие – смешанных триглицеридов?
Приведите схему гидролиза триолеина.
Напишите структурную формулу лецитина и схему гидролиза его при участии фосфолипаз А1, А2 и D.
Напишите схемы реакций с использованием структурных формул субстратов и продуктов, а также ферментов, ускоряющих данные реакции:
а) Глицерин + АТФ → Фосфоглицерин + АДФ;
б) Пальмитиновая кислота + АТФ + КоАSH Пальмитил-КоА + АМФ + Н4Р2О7;
в) β-Оксилаурил- КоА + НАД+ → β-Кетолаурил-КоА +
+ НАДН + Н+.
Цикл трикарбоновых кислот
Окислительное декарбоксилирование пирувата с образованием ацетил СоА, протекающее в митохондриальном матриксе, служит связывающим звеном между гликолизом и циклом трикарбоновых кислот:
Пируват + СоА + NAD Ацетил- СоА + СО2 + NADH.
Это необходимое включение продукта гликолиза в цикл трикарбоновых кислот катализируется пируват-дегидрогеназным комплексом, представляющий собой очень большой мультиферментный комплекс – высоко интегрированную систему трех видов ферментов.
4.1. Общая схема цикла трикарбоновых кислот
Четырехуглеводородное соединение (оксалоацетат) конденсирует с двухуглеродным ацетиловым компонентом с образованием шестиуглеродной трикарбоновой кислоты (цитрата). Далее изомер цитрата подвергается окислительному декарбоксилированию. Образующееся при этом пятиуглеродное соединение ( -оксоглутарата) в результате окислительного декарбокилирования превращается в четырехуглеродное соединение (сукцинат). Дальнейшие превращения сукцината приводят к регенерованию оксалоацетата. Два атома углерода включается в цикл в виде ацетильного компонента, а два атома углерода покидают цикл в виде двух молекул СО2. Поскольку ацетильная группа восстановлена в большей степени, чем СО2, то в цикле трикарбоновых кислот должны иметь место окислительно-восстановительные реакции. Действительно, насчитываются четыре таких реакции. Три гидрид-иона (т.е. шесть электронов) переносится на три молекулы NAD+, а одна пара атомов водорода (два электрона) переносится на молекулу флавинадениндинуклетида (FAD). При окислении этих переносчиков электронов за счет О2 в цепи переноса электронов образуется 11 молекул аденозинтрифосфата (АТР). Кроме того, одна высокоэнергетическая связь генерирует при каждом обороте самого цикла трикарбоновых кислот.
Цикл начинается с конденсации четырехуглеродного компонента, оксалоацетата, и двухуглеродного компонента, ацетильной группы ацетил-СоА. Оксалоацетат реагирует с ацетил-СоА и Н2О, давая цитрат и СоА.
О СН2-СОО-
О=С-СОО- +С–СН3 + Н2О НО-С-СОО-+HS-СоА+Н+
Н2С-СОО- S-СоА СН2-СОО-
Оксалоацетат Ацетил-СоА Цитрат
Эта реакция, представляющая собой альдольную конденсацию с последующим гидролизом, катализируется цитрат – синтазой (первоначально именовавшейся конденси-рующим ферментом). Оксалоацетат вначале конденсируется с ацетил-СоА, образуя цитрил-СоА. Гидролиз цитрил-СоА приводит к тому, что суммарная реакция оказывается сдвинутой в направлении синтеза цитрата.
О
СН2 С S CoA
H O C COO-
CH2 COO-
Цитрил-СоА
Для того чтобы стало возможным окислительное декарбоксилирование шестиуглеродного соединения, цитрат должен быть изомеризирован в изоцитрат. Изомеризация цитрата осуществляется путем дегидратации с последующей гидратацией. В результате происходит взаимоперемещение Н и ОН. Фермент, катализирующий обе реакции, назван аконитазой, поскольку предполагаемый промежуточный продукт представляет собою цис-аконитат.
СОО- СОО- СОО-
Н-С-Н Н2О Н-С Н2О Н-С-ОН
- ООС-С-ОН- -ООС - С -ООС-С-Н
СН2 СН2 СН2
СОО- СОО- СОО-
Цитрат цис-Аконит Изоцитрат
Это первая из четырех окислительно-восстановительных реакций цикла трикарбоновых кислот. Окислительное декарбоксилирование изоцитрата катализирует изоцитрат-дегидрогеназой:
Изоцитрат + NAD - Оксоглутарат + СО2 + NADH.
Промежуточный продукт этой реакции – оксалосукцинат, который быстро теряет СО2 при связывании с ферментом и образовании - оксоглутарата.
Скорость образования - оксоглутарата играет важную роль в регуляции общей скорости цикла. Следует также отметить, что имеются два вида изоцитрат – дегидрогеназ: одна зависимая от NAD+, вторая – от никотина – миддинуклеатидфосфата (NADP+). NAD+ - зависимый фермент, локализованный в митохондриях, имеет важное значение для цикла трикарбоновых кислот, NADP+ - зависимый фермент, присущий и в митохондриях, и в цитоплазме, играет иную метаболическую роль.
За превращением изоцитрата в - оксоглутарат следует вторая реакция окислительного декарбоксилирования – образование сукцинил – СоА из - оксоглутарата:
- оксоглутарат + NAD+ + CoA Сукцинил – СоА +
+ СО2 + NADH.
Реакция катализируется - оксоглутарат – дегидрогеназным комплексом, организованным ансамблем, состоящим из трех видов ферментов. Механизм этой реакции очень сходен с механизмом превращения пирувата в Ацетил – СоА. В обоих случаях используются одни и те же кофакторы: NAD+, СоА, тиаминпирофосфат, липоамид и FAD. Пируват – дегидрогеназный комплекс и - оксоглутарат – дегидрогеназный комплекс имеют в действительности ряд общих структурных особенностей.
В сукцинильном тиоэфире СоА имеется связь, богатая энергией. G0 для гидролиза сукцинил – СоА около
– 8 ккал/ моль, что сравнимо с этой величиной для АТР (-7,3 ккал/моль.). Расщепление тиоэфирной связи сукцинил – СоА сопряжено с фосфорилированием гуанозиндифосфата (GDP):
Сукцинат – СоА + Рi + GDP Сукционат + GTP + CoA.
С ОО-
СОО-
СН2
СН2
СН2
СН2
С==О
СОО-
Сукцинат
S-CоА
Сукцинил-СоА
Эта легкообратимая реакция катализируется сукцинил-СоА – синтетазой. Фосфорильная группа гуанозинтрифосфата в ходе реакции, катализируемой нуклеозиддифосфокиназой, легко переносится на аденозиндифосфат с образованием АТР.
Образование высокоэнергетической фосфатной связи из сукцинил-СоА представляет собою пример субстратного фосфорилирования. В самом деле, эта единственная реакция цикла трикарбоновых кислот, непосредственно приводящая к образованию высокоэнергетической фосфатной связи. По контрасту с нею, в процессе фосфорилирования, связанного с дыхательной цепью (называемого также окислительным фосфорилированием), образование АТР сопряжено с окислением или под действием О2.
Реакции соединений, содержащих четыре атома углерода, составляют последнюю стадию цикла трикарбоновых кислот. Сукцинат превращается в оксалоацетат в три этапа: окисление, присоединение молекулы воды (гидратации) и вторая реакция окисления. Таким образом, при каждом обороте цикла происходит регенерирование одной молекулы оксалоацетата и одновременно улавливание энергии в форме FADH2 и NADH. Сукцинат окисляется в фумарат сукцинат – дегидрогеназной. Акцептором водорода в этой реакции служит FAD, а не NAD+, который используется в трех других окислительных реакциях цикла. Роль акцептора водорода в этой реакции выполняется FAD, потому что изменение свободной энергии оказывается недостаточным для восстановления NAD+. В реакциях такого типа функцию акцептора электронов почти всегда несет FAD. В молекуле сукцинат - дегидрогеназы изоаллоксазиновое кольцо FAD ковалентно связано с боковой цепью гистидина, входящего в состав фермента (Е - FAD).
E – FAD + Сукцинат E – FADH2 + Фумарат.
Молекулу сукцинат – дегидрогеназы содержат кроме флавина четыре атома железа и четыре неорганических сульфида. Гем в состав этого фермента не входит. Атомы железа связаны с неорганическими сульфидами. Белки такого типа известны как железосеропротеины (Fe-S-белки), или белки, содержащие негемовое железо. Железосеропротеины играют важную роль в электронтранспортных системах митохондрий и хлоропластов. Сукцинат–дегидрогиназа сос-тоит из компонента 70 кДа, включающего FAD и два кластера Fe- S- белков, и компонента 27 кДа, содержащего единичный кластер белков. Этот фермент в отличие от других ферментов цикла трикарбоновых кислот является интегральным белком внутренней мембраны митохондрий. Сукцинат - дегидрогеназа непосредственно связана с цепью переноса электронов. FADH2, образовавшийся при окислении сукцината, не отделяется от фермента (в противоположность NADH). Два электрона FADH2 прямо переносятся на атомы Fe3+ фермента. Конечным акцептором этих электронов служит молекулярный кислород.
Следующий этап цикла – гидратация фурамата с образованием L - малата. Фумараза катализирует стереоспецифическое трансприсоединение Н и ОН. Поскольку ОН – группа присоединяется только с одной стороны двойной связи фумарата, образуется исключительно L – изомер малата.
В конце концов малат окисляется, образуя оксалоацетат. Эта реакция катализируется малат – дегидрогеназой, и роль акцептора электронов в ней опять выполняется NAD+ .
Малат + NAD+ Оксалоацетат + NADH + H+ .