Особенности уплаты в тк еаэс закреплено:

Таможенные пошлины, налоги подлежат уплате по общему правилу в государстве-члене, таможенным органом которого производится выпуск товаров (за некоторым исключением).

Ввозные	Вывозные
уплачиваются в валюте государства-члена, в котором подлежат уплате, если иное не установлено Договором о Союзе. уплачиваются на счета, определяемые в соответствии с Договором о Союзе.	уплачиваются в валюте государства-члена, в котором подлежат уплате, если иное не установлено МД в рамках Союза, двусторонними МД государств-членов и (или) законодательством государств-членов. уплачиваются на счета, определяемые в соответствии с законодательством государства-члена, если иное не установлено МД в рамках Союза и (или) двусторонними МД государств-членов.
Таможенная декларация подается до истечения срока временного хранения товаров	Таможенная декларация подается до убытия товаров с таможенной территории Союза

Формы и способы уплаты таможенных пошлин, налогов, а также момент исполнения обязанности по их уплате (дата уплаты) устанавливаются законодательством государства-члена, в котором подлежат уплате таможенные пошлины, налоги



В национальном законодательстве закреплен порядок уплаты таможенных пошлин, а в отношении сборов сказано, что они уплачиваются в таком же порядке (ФЗ О таможенном регулировании):

Ввозные	Вывозные + сборы^1
Ввозные таможенные пошлины (за исключением ввозных таможенных пошлин в отношении товаров для личного пользования) уплачиваются на счет, определенный международным договором государств - членов Таможенного союза. Не могут быть зачтены в счет уплаты иных платежей.	Уплачиваются на счет ФК. Уплата ФЛ таможенных сборов и пошлин в отношении товаров для личного пользования может осуществляться в кассу таможенного органа.

Пошлины уплачиваются не позднее дня подачи таможенной декларации.

Таможенные сборы уплачиваются:

За таможенные операции	За таможенное сопровождение	За хранение
при декларировании товаров	при сопровождении транспортных средств, перевозящих товары в соответствии с таможенной процедурой таможенного транзита	при хранении товаров на складе временного хранения таможенного органа

Возможна уплата с использованием электронных терминалов, платежных терминалов и банкоматов.

Особенности зачисления

Уплаченные (взысканные) суммы ввозных таможенных пошлин и сборов подлежат зачислению и распределению между государствами-членами в соответствии с п. 26 Договора о Евразийском экономическом союзе от 2014 года:

Зачисление и распределение сумм ввозных таможенных пошлин (иных эквивалентных сборов), их перечисление в доход бюджетов государств-членов осуществляются в порядке согласно приложению N 5 к настоящему Договору:

Суммы ввозных таможенных пошлин подлежат зачислению в национальной валюте на единый счет уполномоченного органа того государства-члена, в котором они подлежат уплате в соответствии с регулирующими таможенные правоотношения международными договорами и актами, составляющими право Союза, в том числе при взыскании ввозных таможенных пошлин.

Распределение сумм уполномоченным органом Республики Казахстан между государствами-членами осуществляется в отчетный день зачисления сумм на единый счет уполномоченного органа.

Нормативы распределения сумм ввозных таможенных пошлин (сборов) для каждого государства-члена устанавливаются в следующих размерах:

Республика Армения - 1,220 процента;

Республика Беларусь - 4,560 процента;

Республика Казахстан - 7,055 процента;

Кыргызская Республика - 1,900 процента;

Российская Федерация - 85,265 процента.

[там достаточно большой протокол, можете полистать его]