1) Меры Петра I, ограничивавшие былые привилегии Церкви, предприняты для борьбы не против религии как таковой, а против духовенства, как сословия, находившегося до реформ в особом положении.

Упразднение чина патриарха и превращение Церкви в одну из коллегий свидетельствует о том, что царь вел борьбу прежде всего с полномочиями Церкви и ее служителей в государственной жизни. Против сути христианского учения Петр I никаких заявлений не делал, не посягал на духовную составляющую христианского учения. Даже несмотря на то, что духовентсво и Церковь претерпевали различные лишения в экономической составляющей (запрет на строительство новых монастырей без разрешения государства, на владение монахами вотчинами и угодьями), в то же время предпринимались меры по распространении христианских истин среди простого народа, по увеличению паствы церквей (через устранение у богатых граждан личных священников).

2) Мероприятия, урезавшие права духовенства, были предприняты для ускорения в продвижении реформ петровской эпохи.

Главной сдерживающей силой реформ Петра Великого были привелегированные сословия – бояре, священнослужители, стрельцы. Именно с мероприятий против данных слоев населения он и начал свои преобразования. После упразднения Боярской Думы, расформирования стрелецких полков и переноса столицы в Санкт-Петербург (верхушки данных сословий преимущественно проживали в Москве) царь принял меры и по сокращению привилегий духовенства, члены которого, как известно, даже готовили заговор против царя-реформатора во главе с его сыном – царевичем Алексеем. После раскрытия заговора в 1716 г. Петром было принято решение о реформе церковного управления с целью предотвращения подобных инцидентов.

3) В основе управления Церковью единоначальный принцип сменяется коллегиальным. Новая система обеспечивала невозможность сосредоточения власти и ресурсов Церкви в одних руках.

Несмотря на то, что в Духовной коллегии все-таки присутствовало разделение на чины (президент, два вице-президента, четыре советника и четыре ассессора), президент не обладал властью выше остальных должностей (это специально подтверждается в последней части манифеста). Благодаря этому, полномочия, раннее сосредоточенные в руках патриарха, теперь разделялись как минимум между 11 людьми.

4) Церковь окончательно формируется как институт, подвластный государству и служащий ему.

Важным доказательством данного положения является то, что из некого обособленного института при Петре I  Церковь становится официально оформленной коллегией на службе у государства. Каждой должности приписываются определенные полномочия, в Духовном регламенте перечислены дела, попадающие под юрисдикцию коллегии.

5) От личности патриарха Церковь переходит на подчинение личности царя.

В тексте регламента заявлено, что Духовная коллегия “под державным монархом есть и от монарха установлена”. Кроме того, присягу служители Духовной коллегии отныне дают именно царю (не патриарху и даже не Богу).

6) Создается первая система школ (духовных Семинариумов).

В тексте регламента довольно подробно описывается система воспитания учеников в Семинариумах, официально заявляется о заимствовании подобной системы образования у европейских стран (дети живут и учатся вместе. Потом становятся церковнослужителями). Кроме того, в регламенте четко устанавливается список предметов, обязательных к изучению в подобных школах.