Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Основы биологии_Лекция-5_Макеев (2013)

.pdf
Скачиваний:
36
Добавлен:
03.06.2015
Размер:
1.16 Mб
Скачать

( (

>FSNUZ3W02HQEOD length=204 xy=3054_0315 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_GCTATAACAATTGCTTGCCAATTGCCATCTGCCAACCGCCAACCAAGAATACCTGAGATGATCGGCGGCGTTGTCCAGGGA ACCATAACACCGGTCAATAAGGCAGCACATGAATCTGAATTAAGACATATGTGGCACACATCGACAGAGCTGGCATCAAAATAACGGCAATGCCAGCAAAGGATTAA GCACGATTGGCAATCC

>FSNUZ3W02F2102 length=51 xy=2378_0116 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_AGTGTAGACTGATATTCGTGGTACTAACAAGACAAACTAAGGTCATCGTTG >FSNUZ3W02GQ4AX length=61 xy=2652_0503 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_GTTGATCGGTTACTAGCGAATGGTCAAGTGGAATTATGACGATACAGACATTTTGTAAACT >FSNUZ3W02F7SRL length=69 xy=2432_0207 region=2

run=R_2009_03_16_10_49_05_ATTAATACGTTCTGGACAAGGCGGCAAGGCCATTTGTTCAGTCATCTTGGCCGTGTGAAAGGACTGAGG >FSNUZ3W02HAVCE length=119 xy=2877_0412 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_TACAACTGCATGAAGAGCTTATTGAACTGATCTCGATCTTGAATGTTCTCTTTAGTCGTTAACGTGATAAACTTGTTTCAA TCAAAGTTGGTATCGATCAATCTTAGCAGCCGCCATTT

>FSNUZ3W02IXID1 length=115 xy=3545_0199 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_GTCATTGGACTTATCTGTATCGTGCAATTGATAGCAACGGTCTGACGCTCGACTTCGAACTGCGAAAGCATCGTGATTATG CGGCAGCCTATCACTTTNTTAAGGACGTTNTTGA

>FSNUZ3W02JPB42 length=50 xy=3862_0036 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_ATGGTTGGTTTGGCACATTGATTGCTACTGTAGTCAAGGTTTATACACCA >FSNUZ3W02HQXNR length=171 xy=3060_0341 region=2

run=R_2009_03_16_10_49_05_ATTGCAGGATTTGCAAGTCCAAGAATTCGAATTTGTCTGTTGTGCGTAAGACTGATAAGACCGTTACAGGCAATTAATAAT TAGTTGAAATTAGAGTGAAATAGCTTGCTCAATTTTCTTCCTACATAGATAATAAAGAAGACTTATGACTGATACTAACCTGATCGAAAT

>FSNUZ3W02ILT54 length=78 xy=3412_0362 region=2 run=R_2009_03_16_10_49_05_TAATATTAACTTGTTCGGATGCTTAGCTCAGCTGGCAGAGCAACGGACTCTTAATCCGTGGGTCCAGGGTTCGGATCC

1 Roche 454 – " ( ( 70-800 . .

, 5, 2010

 

2

0 %

(

(

, 5, 2010

 

. ( % – $ (overlap-layout)

(-. % " 1 (-. % " . 1

$

( )

«.» ( $ )

$% % (

( ( "

Atlas, ARACHNE, Celera.

PCAP, Phusion.

, 5, 2010

 

. $(

( – Solexa (% ), 454 ($ ), Saenger – (

)

( GenBank (www.ncbi.nlm.nih.gov)

$ $% + ( 17 %#

30 .

3 % # % – 15-20 $ $

( ( % 2 (10 )% ( (, + % 1018 . % $ " #.

, 5, 2010

 

(resequencing)

$$

( $ $$ %

$( . +

" ( ( .

!$+ – ( $( # =

(

# ( =

( " #

(, 0 %. !

% 0 ( %, (

%. + % /

(.

, 5, 2010

 

$( %

$( ( (~1/1000) = SNP

( ( ( = VNTR

& ( (# ) = CNV

SNP – (% %-% (

" – $+ % $ ( % %

%

CNV – + ( % (- "

*$

VNTR – +$( $

(: ZOOM, MOM . http://www.oxfordjournals.org/our_journals/bioinformatics/nextg enerationsequencing.html

, 5, 2010

 

2 $+?

* ( ( $( # (dbSNP)

* ( ( ( , % (

$0 % ( (OMIM)

(, # (

( $% #)

$% #

, 5, 2010

 

) (

Illumina HiSeq 2000

• $650,000 $

• $10,000 (

• 2 x 100 ( " (

200Gb

4$% ( ( % 100Tb

+ $ $ $

Human genomes as email attachments, Bioinformatics, 2009

, 5, 2010

 

(

& ( (-% ( /- .

+ $ $ $

Human genomes as email attachments, Bioinformatics, 2009

, 5, 2010

 

, / / %

( 10 – #$ $%

$ 0 ($+)

# #$

% # – +

( %

# % ( –

, 5, 2010