Белки

Вторичная структура белка

Правая альфа-спираль

Вторичная структура белка

Бетта-спираль

Третичная структура белка

Разные способы изображения трёхмерной структуры белка на примере фермента триозофосфатизомеразы. Слева —

«палочковая» модель, с изображением всех атомов и связей между ними; цветами показаны элементы. В середине

изображены структурные мотивы, α-спирали и β-листы. Справа изображена контактная поверхность белка,

построенная с учётом ван-дер-ваальсовых радиусов атомов; цветами показаны особенности активности участков

Под третичной структурой понимают порядок пространственной укладки элементов вторичной структуры в глобулу.

Данная структура стабилизируется гидрофобными взаимодействиями боковых радикалов аминокислот. Другие

взаимодействия в том числе ковалентные ( дисульфидные связи) и водородные носят вспомогательный характер. Их

вклад в энергетику третичной структуры минимальный.

Небольшие гидрофобные радикалы могут растворяться в воде за счет упаковки в пустотах структуры воды

(элементарная структура воды представляет собой додекаэдр, составленный из молекул воды, соединенных

водородными связями). В полости додекаэдра диаметром 5 Å может поместиться небольшой неполярный радикал, не

вызывая перестроек в структуре воды. Тогда как большие гидрофобные радикалы, для уменьшения влияния на

структуру воды должны агрегировать по принципу образования “масляной капли”

Четвертичная структура белка

Под четвертичной структурой понимают объединение белковых субъединиц (глобул),

образованных отдельными полипептидными цепями, в многомерные структуры (димеры,

тримеры, тетрамеры и др