- •Сходство и отличие биологических катализаторов от неорганических
- •Регенерация ферментативных систем, применяемых в биотехнологии
- •Реактивация инактивированных ферментов
- •1. Использование сопряженных субстратов.
- •2. Использование сопряженных ферментативных реакций.
- •Стабилизация ферментов в биотехнологических системах
- •Ферментативные реакции в системах с органическими растворителями
- •Использование в микроанализе ферментных электродов Принцип действия и устройство ферментных электродов
- •Ферменты как компоненты моющих средств
- •Получение полусинтетических ферментов их использование в качестве индустриальных биокатализаторов
- •Абзимы Черты структурно-функционального сходства антител и ферментов
- •Экспериментальные подходы к усовершенствованию Каталитических свойств абзимов
- •Экспериментальный анализ пространственной структуры ферментов Кристаллография Двумерная ямр-спектроскопия
Экспериментальные подходы к усовершенствованию Каталитических свойств абзимов
Каталитические свойства антител могут быть усовершенствованы с помощью следующих экспериментальных подходов.
- Введение в активный центр абзимов функциональных групп, присутствующих в активных центрах соответствующих ферментов:
Прямые подходы (иммунологические):
1) "bait and switch" (приманить и включить) - иммунизация животных гаптеном - аналогом переходного состояния, несущим
дополнительный заряд. Например, если заряд положительный, возможно образование антител, содержащих в участке связывания отрицательно заряженные группы. При удачном расположении таких групп, например, карбоксильных, в активном центре абзима они могут принимать участие в каталитическом акте, повышая его эффективность.
2) иммунизация животных ферментом, обладающим нужной каталитической активностью.
Рис. 6. Получение
абзимов на базе модели антиидиотипической
сети Эрне АГ1 - фермент
АТ1 - идиотипические
антитела АТ2 - антиидиотипические
антитела
ф
"Доработка " свойств абзимов:
Направленная модификация антигенсвязывающего участка абзи- мов на уровне кодирующих их генов путем сайт-направленного мутагенеза.
Селективная химическая модификация активного центра абзимов (введение функциональных групп, молекул кофакторов, ионов металлов).
Сочетание самых разных подходов может обеспечить существенное изменение каталитических свойств абзима, приближая их по эффективности катализа к естественному ферменту.
Практическое значение абзимов
Перспективность практического использования каталитических антител прежде всего связана с тем, что они могут быть выработаны для катализа почти всех химических реакций. Эта уникальная особенность выгодно отличает абзимы от других биологических катализаторов. Потенциальное число таких химических превращений несравненно выше, чем число реакций, имеющих место в живых системах и катализируемых соответствующими ферментами. Абзимы могут найти самое широкое применение:
1. В органическом синтезе: • увеличение специфичности катализа
разделение энантиомеров
катализ трудно идущих химических превращений 2. В медицине:
"улучшение" иммунной системы (антитела, способные не только связывать, но и катализировать разрушение токсинов, бактерий, раковых клеток и т.д.), благодаря введению в организм либо готового абзима, либо безвредного гаптена, обеспечивающего выработку абзимов с нужной каталитической активностью.
РИБОЗИМЫ
В начале 1980-х годов прошлого столетия произошло одно из самых неожиданных открытий в биохимии. Было обнаружено, что у живых организмов существуют катализаторы небелковой природы, которые состоят только из РНК. Гены эукариот имеют мозаичную структуру с чередующимися последовательностями экзонов и интронов. В ходе созревания РНК экзоны должны войти в конечную структуру программируемой РНК, а интроны должны быть удалены. Первоначально предполагалось, что существуют специальные ферменты, катализирующие этот процесс. Однако поиски соответствующих белков успехом не увенчались. Оказалось, что РНК сама по себе обладает способностью вырезать интроны и соединять после этого концы двух соседних экзонов. Формально этот процесс не является каталитическим, так как осуществляется всего лишь один раз. Тем не менее в нем можно вычленить все основные черты ферментативного катализа. Так, данный процесс происходит с достаточно большой скоростью и характеризуется высокой селективностью. Учитывая все это, был введен термин рибозим, то есть фермент, состоящий из молекулы РНК.
Таким образом, рибозим это молекула РНК, содержащая каталитический активный центр. В настоящее время достаточно широко эксплуатируется идея возможного применения рибозимов в качестве терапевтических агентов. Предполагается, что рибозимы могли бы инактивировать молекулы РНК, ассоциированные с различными заболеваниями. Успех подобной терапии зависит от специфичности рибозимов, которые должны избирательно вычленять молекулы РНК- мишени из огромной популяции РНК, присутствующей в клетках.