- •Воробьёв Микробиология
- •Глава 1.
- •Глава 2.
- •2.1. Систематика и номенклатура микроорганизмов
- •2.2. Строение бактериальной клетки. Формы бактерий.
- •2.3. Морфология грибов, особенности классификации
- •2.4. Морфология простейших, особенности классификации
- •2.5. Морфология вирусов, особенности классификации
- •Глава 3
- •3.1. Химический состав бактерий
- •3.2. Питание бактерий
- •3.3. Дыхание бактерий
- •3.4. Рост и размножение бактерий
- •3.5. Взаимодействие вируса с клеткой
- •3.5.1. Продуктивный тип взаимодействия (репродукция вирусов)
- •3.5.2. Интегративный тип взаимодействия (вирогения)
- •3.6. Культивирование и индикация вирусов
- •3.7. Бактериофаги
- •Глава 4.
- •4.1. Микрофлора почвы
- •4.2. Микрофлора воды
- •4.3. Микрофлора воздуха
- •4.4. Роль микроорганизмов в круговороте веществ в природе
- •4.5. Микрофлора тела человека
- •4.6. Влияние факторов окружающей среды на микроорганизмы
- •4.7. Микрофлора растительного лекарственного сырья, фитопатогенные микроорганизмы, микробиологический контроль лекарственных средств
- •4.8. Цель, задачи и методы санитарной микробиологии
- •Глава 5.
- •5.1. Рекомбинации у бактерий
- •5.1.1. Трансформация
- •5.1-2. Трансдукция
- •5.1.3. Конъюгация
- •5.2. Плазмиды
- •5.3. Мутации
- •5.4. Особенности генетики вирусов
- •Глава 6.
- •6.1. Понятие о биотехнологии, цели и задачи
- •6.2. Краткая история развития биотехнологии
- •6.3. Микроорганизмы, клетки и процессы, применяемые в биотехнологии
- •6.4. Генетическая инженерия и область ее применения в биотехнологии
- •6.5. Биологические препараты, полученные методом генетической инженерии
- •Глава 7
- •7.1. Понятие о химиотерапии и антибиотиках
- •7.1.1. Классификация антибиотиков
- •7.1-2. Способы получения антибиотиков
- •7.1.3. Спектр и механизм действия антибиотиков
- •7.1.4. Побочное действие антибиотиков
- •7.1.5. Принципы рациональной антибиотикотерапии
- •Глава 8.
- •8.1. Характеристика инфекционного процесса
- •8.2. Основные эпидемиологические понятия
- •Глава 9.
- •9.1. Сущность и роль иммунитета
- •9.2. Иммунология и ее задачи
- •9.3. Краткая история развития иммунологии
- •9.4. Иммунная система. Иммунокомпетентные клетки
- •9.5. Виды иммунитета
- •9.6. Реакции и механизмы иммунитета
- •9.7. Факторы неспецифической защиты организма
- •9.7.1 Фагоцитоз
- •9.7.2. Комплемент
- •9.7.3. Интерферон
- •9.8. Антигены
- •9.9. Антителообразование
- •9.10. Иммунологическая память
- •9.11. Иммунологическая толерантность
- •9.12. Аллергия (гиперчувствительность немедленного и замедленного типов)
- •9.12.1. Реакции IgE-опосредованные и аналогичные (тип I)
- •9.12.1.1. Анафилаксия
- •9.12.1-2. Атопии
- •9.12.2. Цитотоксические реакции (тип II)
- •9.12.3. Реакции иммунных комплексов (тип III)
- •9.12.3.1. Сывороточная болезнь
- •9.12.4. Реакции, опосредованные т-клетками (тип IV)
- •9.13. Особенности иммунитета при некоторых инфекционных и неинфекционных болезнях
- •9.13.1. Противовирусный иммунитет
- •9.13.2. Противоопухолевый иммунитет
- •9.13.3. Трансплантационный иммунитет
- •9.14. Теории иммунитета
- •9.15. Понятие об иммунном статусе. Иммунологическая недостаточность
- •9.16. Реакции иммунитета
- •9.17. Иммунобиологические медицинские препараты
- •9.17.1. Вакцины
- •9.17.1.1. Живые вакцины
- •9.17.1-2. Неживые (инактивированные) вакцины
- •9.17.1.3. Синтетические и полусинтетические вакцины
- •9.17.1.4. Ассоциированные вакцины
- •9.17.1.5. Массовые способы вакцинации
- •9.17.1.6. Эффективность вакцин
- •9.17.2. Эубиотики
- •9.17.3. Фаги
- •9.17.4. Сывороточные иммунные препараты
- •9.17.5. Иммуномодуляторы
- •9.17.6. Диагностические препараты
- •Глава 10
- •10.1. Возбудители бактериальных кишечных инфекций
- •10.1.1. Возбудители эшерихиозов
- •10.1-2. Возбудители дизентерии
- •10.1.3. Возбудители брюшного тифа и паратифов
- •10.1.4. Возбудители сальмонеллезов
- •10.1.5. Возбудитель кишечного иерсиниоза
- •10.1.6. Возбудитель холеры
- •10.1.7. Возбудители бруцеллеза
- •10.1.8. Возбудитель лептоспироза
- •10.1.9. Возбудители нампилобактериозов
- •10.1.10. Возбудители пищевых токсикоинфекций и интоксикаций
- •10.1.11. Возбудитель ботулизма
- •10.1.12. Возбудитель листериоза
- •10.2. Возбудители вирусных кишечных инфекций
- •10.2.1. Энтеровирусы
- •10.2.1.1. Вирусы полиомиелита
- •10.2.1-2. Вирусы Коксаки, echo и энтеровирусы типов 68-71
- •10.2.1.3. Вирус гепатита а
- •10.2.1.4. Вирус гепатита е
- •10.2.2. Ротавирусы
- •10.3. Возбудители протозойных кишечных инфекций
- •10.3.1. Возбудитель амебиаза
- •10.3.2. Возбудитель токсоплазмоза
- •10.3.3. Возбудитель лямблиоза
- •10.3.4. Возбудитель балантидиоза
- •Глава 11
- •11.1. Возбудители бактериальных инфекций дыхательных путей
- •11.1.1. Возбудители дифтерии
- •11.1-2. Возбудитель скарлатины
- •11.1.3. Возбудитель коклюша
- •11.1.4. Возбудитель менингококковой инфекции
- •11.1.5. Возбудители туберкулеза
- •11.1.6. Возбудители легионеллеза
- •11.1.7. Возбудители орнитоза
- •11.1.8. Возбудитель микоплазмоза
- •11.2. Возбудители вирусных инфекций дыхательных путей
- •11.2.1. Вирусы гриппа и других острых респираторных заболеваний
- •11.2.1.1. Вирусы гриппа
- •11.2.1.2. Вирусы парагриппа
- •11.2.1.3. Респираторно-синцитиальный вирус (pc-вирус)
- •11.2.1.4. Риновирусы
- •11.2.1.5. Коронавирусы
- •11.2.1.6. Реовирусы
- •11.2.1.7. Аденовирусы
- •11.2.2. Вирус натуральной оспы
- •11.2.3. Вирус оспы обезьян
- •11.2.4. Вирус кори
- •11.2.5. Вирус эпидемического паротита
- •11.2.6. Вирус краснухи
- •11.2.7. Вирус ветряной оспы и опоясывающего герпеса
- •Глава 12
- •12.1. Возбудители бактериальных кровяных инфекций
- •12.1.1. Возбудитель чумы
- •12.1.2. Возбудитель туляремии
- •12.1.3. Возбудитель эпидемического возвратного тифа
- •12.1.4. Возбудитель эпидемического сыпного тифа
- •12.1.5. Возбудитель эндемического сыпного тифа
- •12.1.6. Возбудитель клещевого сыпного тифа
- •12.1.7. Возбудитель марсельской лихорадки
- •12.1.8. Возбудитель цуцугамуши
- •12.1.9. Возбудитель Ку-лихорадки
- •12.2. Возбудители вирусных кровяных инфекций
- •12.2.1. Вирус иммунодефицита человека
- •12.2.2. Вирусы гепатитов в, d, с и g
- •12.2.2.1. Вирус гепатита в
- •12.2.2.2. Вирус гепатита d
- •12.2.2.3. Вирус гепатитов с и g
- •12.2.3. Арбовирусы
- •12.2.3.1. Вирус клещевого энцефалита
- •12.2.3.2. Вирус японского энцефалита
- •12.2.3.3. Вирус омской геморрагической лихорадки
- •12.2.3.4. Вирус крымской геморрагической лихорадки
- •12.2.3.5. Вирус желтой лихорадки
- •12.2.3.6. Вирус лихорадки денге
- •12.2.3.7. Вирус москитной лихорадки
- •12.3. Возбудители протозойных кровяных инфекций
- •12.3.1. Возбудители малярии
- •12.3.2. Возбудители лейшманиозов
- •12.3.3. Возбудители трипаносомозов
- •Глава 13
- •13.1. Возбудители бактериальных инфекций наружных покровов
- •13.1.1. Возбудитель сибирской язвы
- •13.1-2. Возбудитель сапа
- •13.1.3. Возбудитель столбняка
- •13.1.4. Возбудители анаэробной инфекции
- •13.1.4. Неспорообразующие анаэробы
- •13.1.5. Возбудитель сифилиса
- •13.1.6. Возбудитель гонореи
- •13.1.7. Условно-патогенные микроорганизмы – возбудители гнойно-воспалительных болезней
- •13.1.8. Возбудитель трахомы
- •13.1.9. Возбудители урогенитального хламидиоза и венерической лимфогранулемы
- •13.1.9.1. Урогенитальный хламидиоз
- •13.1.9.2. Венерическая лимфогранулема
- •13.2. Возбудители вирусных инфекций наружных покровов
- •13.2.1. Вирус бешенства
- •13.2.2. Вирус простого герпеса
- •13.2.3. Вирус цитомегалии
- •13.2.4. Вирус ящура
- •13.3. Возбудители протозойных инфекций наружных покровов
- •13.3.1. Возбудитель трихомоноза
- •Глава 14.
- •14.1. Характеристика микозов
- •14.2. Диагностика микозов
- •Глава 15
3.3. Дыхание бактерий
Дыхание, или биологическое окисление, основано на окислительно-восстановительных реакциях, идущих с образованием АТФ-универсального аккумулятора химической энергии. Энергия необходима микробной клетке для ее жизнедеятельности. При дыхании происходят процессы окисления и восстановления: окисление – отдача донорами (молекулами или атомами) водорода или электронов; восстановление – присоединение водорода или электронов к акцептору. Акцептором водорода или электронов может быть молекулярный кислород (такое дыхание называется аэробным) или нитрат, сульфат, фумарат (такое дыхание называется анаэробным – нитратным, сульфатным, фумаратным). Анаэробиоз (от греч. аег – воздух + bios – жизнь) – жизнедеятельность, протекающая при отсутствии свободного кислорода. Если донорами и акцепторами водорода являются органические соединения, то такой процесс называется брожением. При брожении происходит ферментативное расщепление органических соединений, преимущественно углеводов, в анаэробных условиях. С учетом конечного продукта расщепления углеводов различают спиртовое, молочнокислое, уксуснокислое и другие виды брожения.
По отношению к молекулярному кислороду бактерии можно разделить на три основные группы: облигатные, т.е. обязательные, аэробы, облигатные анаэробы и факультативные анаэробы.
Облигатные аэробы могут расти только при наличии кислорода. Облигатные анаэробы (клостридии ботулизма, газовой гангрены, столбняка, бактероиды и др.) растут только на среде без кислорода, который для них токсичен. При наличии кислорода бактерии образуют перекисные радикалы кислорода, в том числе перекись водорода и супероксид-анион кислорода, токсичные для облигатных анаробных бактерий, поскольку они не образуют соответствующие инактивирующие ферменты. Аэробные бактерии инактивируют перекись водорода и супероксид-анион соответствующими ферментами (каталазой, пероксидазой и супероксиддисмутазой). Факультативные анаэробы могут расти как при наличии, так и при отсутствии кислорода, поскольку они способны переключаться с дыхания в присутствии молекулярного кислорода на брожение в его отсутствие. Факультативные анаэробы способны осуществлять анаэробное дыхание, называемое нитратным: нитрат, являющийся акцептором водорода, восстанавливается до молекулярного азота и аммиака.Среди облигатных анаэробов различают аэротолерантные бактерии, которые сохраняются при наличии молекулярного кислорода, но не используют его.
Для выращивания анаэробов в бактериологических лабораториях применяют анаэростаты – специальные емкости, в которых воздух заменяется смесью газов, не содержащих кислорода. Воздух можно удалять из питательных сред путем кипячения, с помощью химических адсорбентов кислорода, помещаемых в анаэростаты или другие емкости с посевами.
3.4. Рост и размножение бактерий
Жизнедеятельность бактерий характеризуется ростом – формированием структурно-функциональных компонентов клетки и увеличением самой бактериальной клетки, а также размножением – самовоспроизведением, приводящим к увеличению количества бактериальных клеток в популяции.
Бактерии размножаются путем бинарного деления пополам, Реже путем почкования.
Актиномицеты, как и грибы, могут размножаться спорами. Актиномицеты, являясь ветвящимися бактернями, размножаются путем фрагментации нитевидных клеток. Грамположительные бактерии делятся путем врастания синтезирующихся перегородок деления внутрь клетки, а грамотрицательные – путем перетяжки, в результате образования гантелевид-ных фигур, из которых образуются две одинаковые клетки.
Делению клеток предшествует репликация бактериальной хромосомы по полуконсервативному типу (двуспиральная цепь ДНК раскрывается и каждая нить достраивается комплементарной нитью), приводящая к удвоению молекул ДНК бактериального ядра – нуклеоида. Репликация хромосомной ДНК осуществляется от начальной точки огі (от англ, origin – начало).
Хромосома бактериальной клетки связана в области огі с цитоплазматической мембраной. Репликация ДНК катализируется ДНК-полимеразами. Сначала происходит раскручивание (деспирализация) двойной цепи ДНК, в результате чего образуется репликативная вилка (разветвленные цепи); одна из цепей, достраиваясь, связывает нуклеоти-ды от 5'- к З'-концу, другая – достраивается посегментно.
Репликация ДНК происходит в три этапа: инициация, элонгация, или рост цепи, и терминация. Образовавшиеся в результате репликации две хромосомы расходятся, чему способствует увеличение размеров растущей клетки: прикрепленные к цитоплазматической мембране или ее производным (например, мезосомам) хромосомы по мере увеличения объема клетки удаляются друг от друга. Окончательное их обособление завершается образованием перетяжки или перегородки деления. Клетки с перегородкой деления расходятся в результате действия аутоли-тических ферментов, разрушающих сердцевину перегородки деления. Аутолиз при этом может проходить неравномерно: делящиеся клетки в одном участке остаются связанными частью клеточной стенки в области перегородки деления. Такие клетки располагаются под углом друг к другу, что характерно для дифтерийных коринебактерий.
Размножение бактерий в жидкой питательной среде. Бактерии, засеянные в определенный, не изменяющийся объем питательной среды, размножаясь, потребляют питательные элементы, что приводит в дальнейшем к истощению питательной среды и прекращению роста бактерий. Культивирование бактерий в такой системе называют периодическим культивированием, а культуру – периодической. Если же условия культивирования поддерживаются путем непрерывной подачи свежей питательной среды и оттока такого же объема культуральной жидкости, то такое культивирование называется непрерывным, а культура – непрерывной.
При выращивании бактерий на жидкой питательной среде наблюдается придонный, диффузный или поверхностный (в виде пленки) рост культуры. Рост периодической культуры бактерий, выращиваемых на жидкой питательной среде, подразделяют на несколько фаз, или периодов:
лаг-фаза;
фаза логарифмического роста;
фаза стационарного роста, или максимальной концентрации
бактерий;
фаза гибели бактерий.
Эти фазы можно изобразить графически в виде отрезков кривой размножения бактерий, отражающей зависимость логарифма числа живых клеток от времени их культивирования. Лаг-фаза (от англ, lag – запаздывание) – период между посевом бактерий и началом размножения. Продолжительность лаг-Фазы в среднем 4.5 ч. Бактерии при этом увеличиваются в размерах и готовятся к делению; нарастает количество нуклеиновых кислот, белка и других компонентов. Фаза логарифмического (экспоненциального) роста является периодом интенсивного деления бактерий.
Продолжительность ее около 5. 6 ч. При оптимальных условиях роста бактерии могут делиться каждые 20-40 мин. Во время этой фазы бактерии наиболее ранимы, что объясняется высокой чувствительностью компонентов метаболизма интенсивно растущей клетки к ингибиторам синтеза белка, нуклеиновых кислот и др. Затем наступает фаза стационарного роста, при которой количество жизнеспособных клеток остается без изменений, составляя максимальный уровень (М-концентрация). Ее продолжительность выражается в часах и колеблется в зависимости от вида бактерий, их особенностей и культивирования. Завершает процесс роста бактерий фаза гибели, характеризующаяся отмиранием бактерий в условиях истощения источников питательной среды и накопления в ней продуктов метаболизма бактерий. Продолжительность ее колеблется от 10 ч до нескольких недель. Интенсивность роста и размножения бактерий зависит от многих факторов, в том числе оптимального состава питательной среды, окислительно-восстановительного потенциала, рН, температуры и др.
Размножение бактерий на плотной питательной среде. Бактерии, растущие на плотных питательных средах, образуют изолированные колонии округлой формы с ровными или неровными краями (S- и R-формы; см. главу 5), различной консистенции и цвета, зависящего от пигмента бактерий.
Пигменты, растворимые в воде, диффундируют в питательную среду и окрашивают ее, например синегнойная палочка (Pseudomonas aeruginosa) окрашивает среду в синий цвет. Другая группа пигментов нерастворима в воде, но растворима в органических растворителях. Так, колонии «чудесной палочки» имеют кроваво-красный пигмент, растворимый в спирте. И, наконец, существуют пигменты, не растворимые ни в воде, ни в органических соединениях.
Наиболее распространены среди микроорганизмов такие пигменты, как каротины, ксантофиллы и меланины. Меланины являются нерастворимыми пигментами черного, коричневого или красного цвета, синтезирующимися из фенольных соединений. Меланины наряду с каталазой, супероксидцисмутазой и перок-сидазами защищают микроорганизмы от воздействия токсичных перекисных радикалов кислорода. Многие пигменты обладают антимикробным, антибиотикоподобным действием.
Вид, форма, цвет и другие особенности колоний на плотной питательной среде могут учитываться при идентификации бактерий, а также отборе колоний для получения чистых культур.
В промышленных условиях при получении биомассы микроорганизмов с целью приготовления антибиотиков, вакцин, диагностических препаратов, эубиотиков культивирование бактерий и грибов осуществляют в ферментерах при строгом соблюдении оптимальных параметров для роста и размножения культур (см. главу 6).