- •Белки, их строение и биологическая роль
- •Строение белков. Первичная структура.
- •Вторичная структура
- •Третичная структура
- •Понятие о нативном белке
- •Классификация. Биологические и химические свойства белков
- •Физико-химические свойства белков
- •Биохимия сложных белков
- •Некоторые особенности строения миоглобина и гемоглобина
- •Гемаглобинопатии
- •Ферменты
- •Механизм действия ферментов. Основные черты ферментативного катализа, его этапы.
- •1. Частичный протеолиз (Трипсиноген------ Трипсин)
- •Факторы, оказывающие влияние на активность ферментов.
- •Конкурентное ингибирование.
- •Неконкурентное ингибирование.
- •Биохимия нуклеотидов и нуклеиновых кислот. Матричные биосинтезы.
- •Характеристика репликации.
- •Транскрипция. Трансляция.
- •1).Инициация
- •1. Обмен веществ включает в себя 3 этапа:
- •Организация цпэ (по рис.1)
- •Функции дыхательной цепи:
- •Дыхательный контроль.
- •Токсичное действие кислорода. Защита от токсичного действия кислорода.
- •Обмен углеводов.
- •Функции углеводов.
- •Всасывание углеводов в кишечнике.
- •Метаболизм глюкозы.
- •Гликолиз (дихотомический процесс).
- •Биомедицинское значение ферментативных реакций гликолиза.
- •Суммарная реакция и выход энергии при гликолизе.
- •Пентофозофосфатный путь ( пфп).
- •Биомедицинское значение.
- •Общая схема биохимических реакций пфп.
- •Медицинское значение.
- •Глюконеогенез.
- •Биомедицинское значение.
- •Биомедицинское значение.
- •Биосинтез гликогена.
- •Обмен фруктозы и галактозы.
- •Обмен липидов.
- •Функции липидов в организме.
- •Переваривание и всасывание жиров.
- •Желчные кислоты.
- •Всасывание продуктов гидролиза.
- •Биосинтез кетоновых тел.
- •Распад кетоновых тел.
- •Биосинтез высших жк.
- •Синтез жиров (таг).
- •Отличие действия инсулина в жировой ткани и печени:
- •Синтез холестерина.
- •Биосинтез Хс.
- •Ферменты.
- •Регуляция синтеза нуклеотидов.
- •Синтез пиримидиновых нуклеотидов.
- •Регуляция.
- •Катаболизм.
- •Катаболизм пуриновых нуклеотидов.
- •Регуляция обмена веществ. Гормоны (химические посредники).
- •1. По химической структуре:
- •2. По механизму действия;
- •3. По влиянию на организм:
- •Синтез и секреция гормонов.
- •Механизм действия гормонов белково-пептидной природы через вторичных посредников.
- •Эффекты, осуществляемые через ц амф.
- •Кальций как вторичный посредник.
- •Биохимия печени
- •Обезвреживающая функция печени
- •Обезвреживание веществ
- •Отличие этих цепей от цпэ
- •Удф-глюкуронилтрансферазы
- •Биохимия крови
- •Белки плазмы крови
- •Сывороточный альбумин
- •Глобулины
- •Конверсия метгемоглобина
- •Биосинтез тема и его регуляция
- •Гемостаз
- •1 Фаза: первичный гемостаз.
- •2 Фаза: гемокоагуляция
- •Фибрина
- •Противосвертывающая система
- •Биохимический_анализ
- •Гормоны
- •Липотропины
1. Обмен веществ включает в себя 3 этапа:
1 .поступление веществ в организм и расщепление основных веществ: белков, жиров, углеводов до мономеров
2.метаболизм или промежуточный обмен
3.выделение продуктов обмена.
Метаболизм состоит из двух фаз: катаболизма (расщепление сложных органических молекул до СО2 , Н2О и мочевины, сопровождается выделением энергии) -экзорганические реакции и анаболизма (синтез сложных веществ (полимеров) из более простых с использованием энергии, выделяющейся при катаболизме) - эндорганические реакции.
Центральная роль в энергетическом обмене принадлежит АТФ, в макроэргических связях которой запасается энергия, выделяемая в процессе катаболизма. АТФ используется в реакциях анаболизма, для поддержания температуры тела, работы организма.
За сутки образуется ~ 60кг АТФ, запасов АТФ в клетке хватает на несколько секунд. Необходимое количество АТФ получается за счет цикла.
Таким образом, синтез АТФ тесно связан с процессами катаболизма. Это превращение и есть сущность энергетического обмена. В организме вещества: белки, жиры, углеводы распадаются в три стадии (рис.1)
внеклеточная. Протекает в ЖКТ, где белки, жиры, углеводы распадаются до мономеров или составных частей;
внутриклеточная. В результате нее полученные мономеры распадаются либо до пирувата, либо до ацетилкоа. 1 и 2 стадия являются специфическими.
общий конечный путь катаболизма. Для всех трех классов веществ - цикл трикарбоновых кислот, т.к. ПВК превращается в ацетилКоА, то у нас есть 2 общих пути катаболизма - окислительное декарбоксилирование пирувата(ПВК—>ацетилкоА) и цикл трикарбоновых кислот (ЦТК). В результате ЦТК происходит отщепление двух атомов Н 4 раза (окисление субстратов, участие коферментов) и выделяется СО2. СО2 выделяется с выдыхаемым воздухом, а 2 Н, отщеплённые от субстрата поступают в ЦПЭ или митохондриальную дыхательную цепь, где в результате переноса Н образуется Н2О. Таким образом, исходя из рис.1, конечными продуктами катаболизма являются СОд, и HjO. Общие пути катаболизма протекают в митохондриях. Конечные продукты: СО2 и Н2 О термодинамически стабильны, содержание кислорода в них больше, чем в начальных продуктах, т.е. реакции катаболизма связаны с реакциями окисления и потреблением О2. Распад органических веществ в живых тканях, сопровождающийся потреблением (\ и выделением СО2 и Цр, называется тканевым дыханием. В результате окисления веществ или субстратов углерод окисляемых веществ включается в СО2, а потребляемый кислород включается в молекулу H2О(за счет Н окисляемых субстратов).
Если субстрат окисляется, то это означает отщепление от него Н (дегидрирование), если субстрат восстанавливается к нему присоединяется 2 атома Н (гидрирование).
Ферменты, осуществляющие эту реакцию относятся к 1 классу и называют дегидрогеназами (участвуют коферменты НАД и ФАД, т.к. они являются переносчиками двух атомов водорода).
Рис.1
Название фермента при окислении — субстрат + дегидрогеназа, при восстанови продукт+дегидрогеназа. Энергия окисляющихся веществ используется для синтеза АТФ из АДФ и фосфора (неорганического). Существует 2 основных пути синтеза АТФ
1. путем окислительного фосфорилирования - синтез АТФ с участием ЦПЭ митохондриях).
2. субстратное фосфорилирование - синтез АТФ на уровне субстратов за счет энергии разрыва макроэрической связи субстрата (не требует присутствия мембран митохондрий):гликолиз, ЦТК.
Цикл трикарбоновых кислот (цикл лимонной кислоты или цикл Кребса). Значение ЦТК:
общий конечный путь катаболизма белков, жиров, углеводов
основной, но не единственный постановщик атомов Н, отщепляемых от субстратов вЦПЭ
выполняет не только катаболическую роль, но и анаболическую: метаболиты ЦТК служат предшественниками для синтеза многих веществ, например, глюкозы и аминокислот. Протекает в митохондриях, все ферменты, кроме сукцинатдегидрогеназы находятся в матриксе, СДГ связан с внутренней мембраной митохондрий, АЦ его выступает в матрикс.
Сущность ЦТК.
Двухуглеродная молекула ацетилКоА взаимодействует с четырехуглеродной молекулой оксалоацетата образуется шестиуглеродная молекула лимонной кислоты (цитрата), от которой в ходе дальнейших реакций отщепляется 2С в виде СО и 4 раза протекает реакция окисления субстратов (дегидрирование или отщепление 2Н). В конечном итоге молекула оксалоацетата регинирирует и может вступать в следующий цикл, а 2 Н, отщепленные от субстрата, поступают в ЦПЭ и в сопряженном с этим процессом образуется АТФ.
Ключевая реакция (регулируется (катализируется) аллостерическим центром) – это реакция скорость лимитирующая.
Таким образом, в результате одного цикла 1 молекула ацетилкоА сгорает до СO2 и Н2О
(ЦПЭ)—»ЦТК и ЦПЭ - единый процесс.
Окислительное декарбоксилирование ПВК - ОДПВК - общий путь катаболизма белков,
жиров, углеводов, протекает в митохондриях, в результате образуется ацетилкоА,
который вступает в ЦТК, восстановленный кофермент НАД и CO2
Катализирует это превращение мультиферментный комплекс, состоящий из трех
ферментов и пяти коферментов.
Ферменты:
Е1 - пируватдекарбоксилаза,
Е 2 - ацетилтрансфераза дегидролипоевой кислоты, Е 3 - дегидрогиназа дигидролипоевой кислоты. 5 коферментов: НАД (витамин РР)
ФАД (витамин В )
тиаминопирофосфат (ТПФ - витамин В )
КоА (витамин пантотеновая кислота)
липоевая кислота
Все ферменты объединены в пируватдегидрогеназный комплекс, аналогичный комплекс функционирует в ЦТК, при превращении а-кетоглутаровой кислоты в сукцинилКоА. В его состав входит около трех десятков ферментов Е1 , около десятка (8) ЕЗ и 1 молекула Е2 . Они соединены с собой таким образом, что серусодержащая часть липоевой кислоты, соединенная с Е2, способна перемещаться последовательно к АЦ Е1 и Е2 —> промежуточные продукты не успевают выходить в раствор.
При недостатке витамина В нарушается процесс ОДПВК - это приводит к накоплению лактата. Наблюдается у алкоголиков с нарушенным режимом питания или при синдроме Вернике-Корсакова. Выделяют 3 реакции:
1 реакция осуществляется с помощью Е1 - пируватдекарбоксилаза КоЕ - производное витамина В - тиаминпирофосфат.
Происходит отщепление карбоксильной группы от пирувата и перенос оставшегося ацильного остатка. СН3СОО на дегидролипоевую кислоту. Дегидролипоевая кислота является коферментом второго фермента - ацетилтрансфераза, она содержит дисульфидную группу в составе и боковую цепь, которая амидной связью соединена с Е2 (рис.1). Рис.1
Во второй реакции ацетильный остаток переносится на КоА при помощи фермента Е2 , т.е. фермент Е2 отщепляет ацетильный остаток от собственного кофермента.
В третьей реакции происходит окисление дигидролипоата Е2 третьим ферментом -дигидролипоат Е2 дегидрогеназа.