- •БиооргаНическая химия
- •Содержание
- •1. Строение и номенклатура органических соединений. Химическая связь. Электронные эффекты
- •1.1 Введение
- •1.2 Теории строения органических соединений
- •Основные положения теории строения органических соединений а.М. Бутлерова
- •Алкены Алкадиены Алкины
- •1.4 Номенклатура органических соединений
- •1.5 Изомерия органических соединений
- •1.6 Электронное строение атома углерода, гибридизация
- •1.7 Сопряженные системы
- •1.8 Электронные эффекты (индуктивный и мезомерный)
- •1.9 Кислотность и основность органических соединений
- •2. Общая характеристика реакций органических соединений.
- •2.1 Общая характеристика химических реакций
- •2.2 Радикальные реакции
- •2.3 Реакции электрофильного присоединения
- •2.5 Нуклеофильные реакции
- •2.6 Окислительно-восстановительные реакции (овр)
- •3. Поли- и гетерофункциональные соединения, участвующие в процессах жизнедеятельности
- •3.5. Классы гетерофункциональных соединений
- •3.6 Гетерофункциональные производные бензола как лекарственные средства
- •4. Биологически важные гетероциклические соединения
- •5. Аминокислоты, пептиды, белки
- •5.3 Пептиды.
- •5.5 Пространственное строение полипептидов и белков
- •6. Углеводы: моно, ди- и полисахариды
- •6.4 Олиго- и полисахариды
- •7. Нуклеотиды и нуклеиновые кислоты
- •7.1. Нуклеозиды.
- •7.2. Нуклеотиды.
- •8. Липиды и низкомолекулярные биорегуляторы
- •8. 1 Простые омыляемые липиды
- •8.2. Сложные омыляемые липиды
- •8.3 Неомыляемые липиды или низкомолекулярные биорегуляторы
- •9. Практикум лабораторный
- •9.1. Правила техники безопасности при работе в химической лаборатории
- •9.2. Общие закономерности реакционной способности органических соединений
- •3. Строение и свойства биополимеров
- •Литература
- •Биоорганическая химия Учебное пособие
5. Аминокислоты, пептиды, белки
5.1 Строение аминокислот.
Аминокислоты — соединения, в молекулах которых одновременно присутствуют амино- и карбоксильные группы.
Все -аминокислоты можно рассматривать как результат замены атома водорода в простейшей -аминокислоте — глицине — на тот или иной радикал R. Таким образом, в соответствии со строением радикала R - аминокислоты подразделяют на алифатические, ароматичекие и гетероциклические. В зависимости от наличия в радикале функциональных групп, аминокислоты подразделяют на полярные и неполярные (см. Приложение 1).
Все природные a-аминокислоты делят на незаменимые, которые поступают в организм только из внешней среды, и заменимые, синтез которых происходит в организме.
Незаменимые a-аминокислоты: валин, лейцин, изолейцин, лизин, метионин, треонин, триптофан, фенилаланин.
Заменимые a-аминокислоты: глицин, аланин, пролин, серин, цистеин, аргинин, гистидин, аспарагин, глутамин, аспарагиновая и глутаминовая кислоты.
Некоторые аминокислоты можно отнести к условно заменимым. Например, тирозин может синтезироваться в организме из незаменимой кислоты фенилаланина.
Стереохимия природных -аминокислот характеризуется тем, что все они, кроме глицина, имеют асимметрический атом углеродa (атом, связанный и с амино-, и с карбоксильной группой), конфигурация которого может быть отождествлена с конфигурацией L-глицеринового альдегида. Следовательно, все природные -аминокислоты являются L-энантиомерами.
Конфигурация асимметрического центра аминокислот определяет биологические свойства, как самих аминокислот, так и полимерных соединений, мономерами которых служат остатки аминокислот (пептиды, белки).
5.2 Свойства аминокислот.
А минокислоты представляют собой бесцветные кристаллические вещества с довольно высокими температурами плавления (более 230 °С). Большинство кислот хорошо растворимы в воде и практически не растворимы в спирте и диэтиловом эфире, что указывает на солеобразный характер этих веществ. Специфическая растворимость аминокислот обусловлена наличием в молекуле одновременно аминогруппы (основный характер) и карбоксильной группы (кислотные свойства), благодаря чему аминокислоты принадлежат к амфотерным электролитам (амфолитам).
В водных растворах и твердом состоянии аминокислоты существуют только в виде внутренних солей — цвиттер-ионов.
Кислотно-основное равновесие для аминокислоты может быть описано:
Если к раствору аминокислоты приложено электрическое поле, то в зависимости от показателя рН раствора ионы аминокислоты будут перемещаться по-разному: в кислой среде при рН < 7 аммонийные ионы аминокислот перемещаются к отрицательному полюсу (катоду), а в щелочной среде при рН > 7 карбоксилат-ионы — к положительному полюсу (аноду). Значение рН, при котором молекула аминокислоты электронейтральна, называют изоэлектрической точкой и обозначают рI. При значении рН, равном показателю рI, молекула аминокислоты в электрическом поле не перемещается.
Наличие в молекуле одновременно амино- и карбоксильной группы отражается и на поведении аминокислот в тех реакциях, в которых участвует только одна из двух функциональных групп.
С участием карбоксильной группы могут протекать все реакции, характерные для карбоновых кислот с образованием соответствующих производных карбоновых кислот (сложных эфиров, ангидридов, амидов и т.п.).
П ри этом надо помнить о том, что аминогруппа легко окисляется, поэтому, например, для получения галогенангидридов аминокислот требуется предварительное ацилирование аминогруппы. После получения галогенангидрида ацильная защита гидролизуется.
О дна из важнейших реакций в организме — декарбоксилирование аминокислот. Отщепление СО2 происходит под действием особых ферментов — декарбоксилаз:
Образование оснований Шиффа (как типичная реакция аминов) свойственно и аминокислотам; наиболее часто используют реакции аминокислот с бензальдегидом. На образовании оснований Шиффа основана реакция идентификации аминокислот, известная как «нингидриновая проба», широко применяемая для визуализации зон аминокислот (возникает интенсивное сине-фиолетовое окрашивание) при их хроматографическом и электрофоретическом разделении, а также для количественного определения содержания аминокислот в растворах:
Дезаминирование аминокислот, как и всякого первичного амина, протекает при действии на аминокислоты азотистой кислоты. Эта реакция лежит в основе метода определения содержания азота и количества аминогрупп в аминокислотах (метод Ван-Слайка).
В организме протекает реакция окислительного дезаминирования, продуктом которого является не гидрокси, а оксокислота.
Биосинтез -аминокислот может происходить на основе кетокислот, по реакции восстановления. В качестве исходных веществ при биосинтезе аминокислот могут выступать и другие аминокислоты. Например, реакция транс-аминирования (переаминирования) является основной при синтезе -аминокислот в организме.
Катализаторами и участниками этого процесса являются ферменты (аминотрансферазы) и кофермент пиридоксальфосфат, который служит переносчиком аминогруппы.