- •Оглавление
- •РАЗДЕЛ 1. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИНЖЕНЕРИЯ НИЗШИХ ОРГАНИЗМОВ
- •Задание 1.1.1. Выделение плазмидной ДНК
- •Задание 1.2.2. Трансформация клеток E. сoli электропорацией
- •Задание 1.5.1. Приготовление смесей дНТФ/Cy5 ддНТФ
- •Задание 1.5.2. Постановка реакции
- •Задание 1.5.3. Осаждение и нанесение образцов на гель
- •Задание 1.5.4. Заливка геля и постановка электрофореза
- •Задание 1.5.5. Анализ сиквенсов
- •Задание 1.6.1. Выделение ДНК из биомассы водорослей
- •Задание 1.6.3. Проведение секвенирования
- •Задание 1.6.4. Анализ полученных данных
- •РАЗДЕЛ 2. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ ВЫСШИХ РАСТЕНИЙ
- •Задание 2.2.1. Проведение электрофореза выделенной ДНК в агарозном геле
- •Задание 2.2.4. Определение концентрации ДНК с помощью спектрофотометра
- •Задание 2.3.2. Разделение амплифицированных фрагментов ДНК с помощью электрофореза
- •Порядок выполнения работы
- •РАЗДЕЛ 3. БИОЛОГИЯ КЛЕТКИ В КУЛЬТУРЕ. МАТЕРИАЛЫ И ОБОРУДОВАНИЕ ДЛЯ КЛЕТОЧНЫХ ТЕХНОЛОГИЙ И ТКАНЕВОЙ ИНЖЕНЕРИИ
- •Задание 3.5.1 Приготовление питательной среды
- •Задание 3.6.3. Посев клеток на материалах
- •Задание 3.6.5. Подсчет клеток
- •Задание 3.6.6. Процесс трипсинизации клеток
- •Задание 3.8.1. Освоение техники субкультивирования клеток
- •Задание 3.8.2. Замораживание прикрепленных клеток
- •РАЗДЕЛ 4. КУЛЬТУРА РАСТИТЕЛЬНЫХ КЛЕТОК И ТКАНЕЙ. Технология микроклонального размножения растений
- •Задание 4.3.1. Выделение и культивирование апикальных меристем картофеля
- •РАЗДЕЛ 5. МЕТОДЫ И АППАРАТУРА ДЛЯ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ
- •Задание 5.6.1. Определение показателей роста и спорообразования грибных культур поверхностным и глубинным способом
- •Задание 5.8.1. Освоить методы культивирования микроводорослей
- •РАЗДЕЛ 6. СОВРЕМЕННЫЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ МАКРОМОЛЕКУЛ И МЕТАБОЛИТОВ
- •Задание 6.10.1. Снятие ИК-спектра полигидроксибутирата
- •РАЗДЕЛ 7. ОПТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ СТРУКТУРЫ БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБЪЕКТОВ
- •Задание 7.1.1. Приготовление образцов для исследования.
- •Задание 7.2.1. Приготовление образцов для исследования.
- •Задание 7.2.3. Проверка светорассеяния в исследуемых образцах
- •Составление отчета
- •4. Составление отчета.
- •Задание 7.4.1. Приготовление образцов для исследования.
- •Задание 7.4.2. Исследование спектров люминесценции.
- •Задание 7.5.1. Оценить численность микроорганизмов в водных образцах
- •РАЗДЕЛ 8. ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ФОТОСИТЕЗИРУЮЩИХ ОРГАНИЗМОВ
- •РАЗДЕЛ 9. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ КИНЕТИКИ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ
- •Задание 9.1.3. Определение константы Михаэлиса. Специфичность
- •Задание 9.2.2. Определение типов взаимодействия эффекторов с ферментом по отношению к субстрату
- •РАЗДЕЛ 10. СОВРЕМЕННЫЕ МЕТОДЫ КЛИНИЧЕСКОЙ ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКИ
- •Задание 10.3.1. Выделение ДНК из биопроб
- •Задание 10.5.1. Построение абсолютного калибровочного графика зависимости концентрации глюкозы в пробе от изменений оптической плотности
- •Задание 10.7.1. Исследование образца крови на анализаторе МЕК-6400J/К
- •РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
- •Задание 11.4.1. Ознакомление с метордом автоматической фотоколориметрии
- •РЕКОМЕНДОВАННАЯ ЛИТЕРАТУРА
- •РАЗДЕЛ 1
- •РАЗДЕЛ 2
- •РАЗДЕЛ 3
- •РАЗДЕЛ 4
- •РАЗДЕЛ 5
- •РАЗДЕЛ 6
- •РАЗДЕЛ 7
- •РАЗДЕЛ 8
- •РАЗДЕЛ 9
- •РАЗДЕЛ 10
- •РАЗДЕЛ 11
- •Приложение. Перечень научного оборудования, использованного в лабораторном практикуме
РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
РАБОТА 11.4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ NH4+ и PO43ИОНОВ В ПРИРОДНЫХ ВОДАХ
Реактивы для определения ионов ортофосфатов: додецилсульфат натрия, (SDS), гипохлорита натрия раствор, антимонилтартрат калия, молибдат аммония, серная кислота, концентрированная, аскорбиновая кислота, ацетон,дигидрофосфат калия, KH2PO4.
Лабораторная стеклянная посуда для приготовления и хранения растворов реактивов: колбы, банки, мерные цилиндры и колбы, пипетки, фильтровальная бумага.
Рис. 11.14. Анализатор водных растворов AutoAnalyzer 3 System 2-Chanel (Германия)
Задания на выполнение лабораторной работы
Задание 11.4.1. Ознакомление с метордом автоматической фотоколориметрии
Порядок выполнения работы
1.Приготовить реактивы для определения ортофосфатов:
•500 мл раствора SDS с концентрацией 8 г/л,
•1:5 (по объему) раствор гипохлорита натрия,
•100 мл маточного раствора калия антимонилтартрата, С – 2,3 г/л,
•реагент №1: 6Ю4 мл концентрированной серной кислоты, 0,6 г молибдата аммония, 2,2 мл маточного раствора калия антимо-
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
539 |
РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
РАБОТА 11.4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ NH4+ и PO43ИОНОВ В ПРИРОДНЫХ ВОДАХ
нилтартрата последовательно растворить в 100 мл дистиллированной воды,
•реагент №2: 0,8 г аскорбиновой кислоты, 4,5 мл ацетона и 0,8 г SDS последовательно растворить в 100 мл дистиллированной воды,
•100 мл маточного раствора KH2PO4, С – 2,197 г/л,
•реагенты хранить в темных стеклянных бутылях в холодильнике.
2.Приготовить реактивы для определения аммонийных ионов:
•500 мл раствора Бриджи-35, 30 %-го, с концентрацией 2 мл/л,
•реагент №1: 1,5 г ЭДТА, 12 г цитрата натрия, 0,05 г натрия нитропруссидного, 0,3 мл 30 %-го раствора Бриджи-35 последовательно растворить в 100 мл дистиллированной воды,
•реагент №2: 1 г ДХИ растворить в 100 мл дистиллированной воды,
•реагент №3: 5 г фенола и 3,6 г гидроксида натрия растворить в 100 дистиллированной воды.
•100 мл маточного раствора аммония сульфата, С – 0,4717 г/л.
3.Подготовка автоанализатора к работе:
•поместить все входные трубки (3 шт.) канала 1 (для определения ортофосфатов) в промывочный раствор SDS,
•поместить все входные трубки (4 шт.) канала 2 (для определения аммония) в промывочный раствор Бриджи-35,
•поместить входную трубку автосамплера в колбу с дистиллированной водой,
•включить блоки прибора: насос, автосамплер,
•промыть систему промывочными растворами в течение 15 мин,
•запустить управляющую программу, включить блок фотоколориметра, включить режим “Chart”,
•поместить входные трубки обоих каналов в бутыли с соответствующими пронумерованными реагентами, промыть систему данными реактивами в течение 5 мин.
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
540 |
РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
РАБОТА 11.4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ NH4+ и PO43ИОНОВ В ПРИРОДНЫХ ВОДАХ
4.Приготовление калибрантов и калибровка фотоколориметра:
•приготовить 3 калибранта на определение ортофосфатных ионов
следующим образом: из 1 мл маточного раствора КН2РО4 добавить в 100-миллитровую мерную колбу, довести объем до метки дист.водой, из полученного раствора отобрать по 1, 8 и 15 мл, добавить в мерные колбы, довести объем до 100 мл. Концентрация калибровочных растворов составляет 0,05, 0,4 и 0,75 мг Р/л.
•приготовить 3 калибранта на определение ионов аммония сле-
дующим образом: из 1 мл маточного раствора (NН4)2SО4 добавить в 100-миллитровую мерную колбу, довести объем до метки дистиллированной водой, из полученного раствора отобрать по 1, 8 и 14 мл, добавить в мерные колбы, довести объем до 100 мл. Концентрация калибровочных растворов составляет 0,01, 0,08 и 0,14 мг N/л,
•заполнить чашки растворами максимальных калибрантов, поместить их в поддон автосамплера, вручную поместить зонд поочередно в эти чашки и ввести растворы в систему,
•выполнить калибровку каждого из каналов фотоколориметра, состоящую из трех последовательных операций: юстировка лампы – выбор в меню программы “Autolamp”, при достижении оптимального состояния нулевой линии установить нулевое значение – выбор в меню программы “Set Base”, при достижении пика максимальных калибрантов кюветы колориметра установить максимальное значение измеряемого диапазона – выбор в меню программы «Set Gain»,
•прибор и необходимые реактивы готовы к работе.
5.Загрузка автосамплера, запуск анализа:
•создать файл, соответствующий данному анализу с расширением
.run, в меню «Tray Protocol» расположить чашки в такой последовательности: 1 чашка для праймера, 2 чашки для дрифта, по три чашки для калибрантов каждого из каналов, чашки с описанием проб (от 1 до 15),
•загрузить поддон автосамплера чашками в соответствии с протоколом файла, чашки праймера и дрифтов заполнить смесью растворов максимальных калибрантов 1:1, растворы калибрантов
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
541 |
РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
РАБОТА 11.4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ NH4+ и PO43ИОНОВ В ПРИРОДНЫХ ВОДАХ
всегда размещать, начиная от максимальной концентрации к минимальной, первоначально калибранты 1-го канала, затем 2- го, далее пробы,
•установить поддон в нужное положение в автосамплер, запустить анализ из программы,
•по окончании анализа дождаться выдачи результатов и автоматического закрытия созданного файла, просмотреть записанные ленты для проверки правильности размещения точек измерения и расчета. При необходимости пересчета результатов создать новый файл и передвинуть вручную точки измерения.
6.Выключение прибора:
•поместить все входные трубки обоих каналов в соответствующие промывочные растворы (канал 1 – раствор SDS, канал 2 – раствор Бриджи), промыть систему в быстром режиме в течении 10 мин,
•выйти из программы, выключить компьютер, фотоколориметр, насос, автосамплер.
•перевернуть платформу насоса в нерабочее положение во избежание порчи силиконовых трубок, слить жидкость из приемных колб,
•освободить поддон автосамплера от чашек с растворами и пробами, вымыть использованную посуду.
Контрольные вопросы
1.Почему аналитическое определение концентраций ионов, содержащих азот и фосфор, в воде основывается на фотоколориметрии?
2.В чем состоят преимущества и недостатки метода «цветных» реакций перед другими распространенными аналитическими методами, например хроматографическими?
3.Каковы преимущества автоматического анализа проб на содержание ионов, какой тип анализа реализован в приборе Autoanalyzer 3 фирмы BranLuebbe, Германия?
4.Как часто необходимо готовить растворы реагентов и калибрантов при анализе ортофосфатных и аммонийных ионов?
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
542 |
РАЗДЕЛ 11. БИОФИЗИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ СОСТОЯНИЯ ОБЪЕКТОВ ПРИРОДНОЙ СРЕДЫ
РАБОТА 11.4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ СОДЕРЖАНИЯ NH4+ и PO43ИОНОВ В ПРИРОДНЫХ ВОДАХ
5.Для чего в растворы реагентов при автоматическом анализе добавляют детергенты?
6.Возможен ли пересчет результатов содержания ионов в пробах после завершения анализа?
|
Современные аппаратура и методы исследования биологических систем. Большой практикум. Учебебное пособие |
543 |