Тектоническое районирование.
В геотектоническом отношении в бассейне довольно четко выделяются две части: южная, представленная Западно – Кубанским (Керченско – Западно – Кубанским) прогибом и северная - платформенная, представленная западной частью Скифской эпигерцинской платформы.
Западно – Кубанский прогиб, ограниченный с севера и юга глубинными разломами, имеет субширотное простирание и асимметричное строение. Он начинается в Крыму и протягивается до Адыгейского выступа.
В разрезе здесь выделяются два структурных этажа. Нижний – нижний палеоген и мел сильно дислоцирован; верхний – средний майкоп и выше на значительной части прогиба представлен моноклиналью, осложненный особенно на западе диапировыми структурами.
В плане в Западно – Кубанском прогибе выделяется пологий и широкий северный борт, осложненный небольшими малоамплитудными поднятиями (по неогену). Мz структурный план изучен здесь слабо.
Южнее выделяется осевая часть прогиба, прижатая к его южному борту. Эта часть прогиба характеризуется мощной олигоцен-неогеновой молассой (6-7км). Диапировые и криптодиапировые структуры протягиваются от Тамани, где отмечается максимум проявления диапиризма в центральную часть прогиба, образуя здесь Анастасиевско – Краснодарскую антиклинальную зону.
Южный складчатый борт прогиба расположенный на альпийском складчатом основании, имеет сложное строение. В пределах Кубанской части этого борта под моноклинально залегающими отложениями олигоцена и неогена развиты многочисленные в различной степени дислоцированные линейные складки, образующие антиклинальные зоны: на крайнем юге Абинскую (Нижнебаканская, Южно – Абинская, г. Медвежья и другие складки), Азовскую (Украинская, Ахтырско – Бугундырская, Глубокоярская, Азовская, и др.), севернее и восточнее Азовской расположена Калужская зона (с. Крымская, Ахтырская, Ново-Дмитриевская, Калужская и др.). Крайняя восточная часть складчатого борта прогиба представляет собой Нефтегорско – Хадыженскую моноклиналь, сложенную олигоцен-неогеновыми отложениями, под которыми сейсмическими исследованиями выявлено несколько локальных поднятий.
На западе складчатый борт прогиба представлен Керченско-Таманской зоной диапировых и криптодиапировых поднятий, сильно нарушенных протяженными разрывами. Диапиризм вызывается майкопской глинистой толщей и часто сопровождается грязевыми вулканами.
Севернее Западно-Кубанского прогиба в Кубанской части бассейна выделяется Тимашевская ступень – моноклиналь, отделяющая предгорный прогиб от северной части бассейна.
В разрезе северной платформенной части бассейна выделяют фундамент (от докембрия до верхнего палеозоя), промежуточный структурный этаж (Р – Т) который не имеет повсеместного распространения, а заполняет узкие прогибы и грабены в герцинском фундаменте (Манычский прогиб, Ейский, Ставропольский грабены и т.д.) и платформенный чехол - М z - Кz. В составе последнего выделяют юрский, меловой, палеогеновый и неогеновый структурные этажи. Наибольшие различия в структуре отмечаются между неогеновым и более древними этажами. По неогену в пределах бассейна выделяются Азово – Кубанская наложенная впадина, ограниченная на востоке Ставропольским сводом.
По палеогеновым, Мz отложениям и фундаменту строение более сложное. В осадочном чехле северной части бассейна разными исследователями выделяются порою под разными названиями следующие крупные структурные элементы: Ростовский (Азовский свод), Азово-Ейский мегавал Восточно-Кубанская впадина, Адыгейский выступ, Тимашевская ступень, западная часть Манычского прогиба, западная часть Кряжа Карпинского.
В пределах Тимашевской ступени фундамент погружается к югу в сторону краевого прогиба от 2,5 км до 6 км. Ступень осложнена небольшими локальными поднятиями (по неогену).