- •1. Предмет и задачи санитарной микробиологии
- •2. Классификация микроорганизмов по группам патогенности (опасности)
- •3. Регламент работы с патогенными микроорганизмами
- •4. Понятие дезинфекция, асептика, антисептика, стерилизация.
- •5. Санитарно-показательные микроорганизмы, предъявляемые к ним требования и их роль в оценке объектов внешней среды.
- •6. Санитарно-показательные микроорганизмы группы А, методы их количественного определения
- •7. Санитарно-показательные микроорганизмы группы А: Escherichia coli. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, методы микробиологической диагностики
- •8. Санитарно-показательные микроорганизмы группы А: Enterococcus faecalis. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, методы микробиологической диагностики.
- •10. Санитарно-показательные микроорганизмы группы А: Clostridium. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, методы микробиологической диагностики.
- •11. Санитарно-показательные микроорганизмы группы Б, методы их количественного определения.
- •12. Санитарно-показательные микроорганизмы группы Б: Staphylococcus. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, методы микробиологической диагностики.
- •13. Санитарно-показательные микроорганизмы группы Б: Streptococcus. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, методы микробиологической диагностики.
- •14. Возбудители особо опасных инфекций (ООИ). Возбудитель чумы. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, патогенез заболевания, методы микробиологической диагностики.
- •15. Возбудители особо опасных инфекций (ООИ). Возбудитель холеры. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, патогенез заболевания, методы микробиологической диагностики.
- •16. Возбудители особо опасных инфекций (ООИ). Возбудитель сибирской язвы. Систематическое положение, морфо-биологическая характеристика, патогенез заболевания, методы микробиологической диагностики.
- •17. Методы санитарно-микробиологических исследований воды.
- •18. Методы санитарно-микробиологических исследований почвы.
- •19. Методы санитарно-микробиологических исследований воздуха.
- •20. Методы санитарно-микробиологических исследований объектов внешней среды.
- •21. Способы адаптации бактерий к условиям существования. Приспособления микроорганизмов к экстремальным местообитаниям (температура, рН, концентрация солей).
- •22. Особенности паразитизма микроорганизмов. Концепции паразитизма. Роль паразитизма в эволюции паразита и хозяина. Стратегии паразитизма.
- •23. Характеристика основных факторов патогенности (вирулентности) бактерий.
- •24. Определение экологии и ее основные понятия: аутэкология, демэкология, синэкология. Особенности микробной экологии.
- •25. Влияние физических факторов на рост микроорганизмов: температура, влажность, излучения.
- •26. Влияние химических факторов на рост микроорганизмов: реакция среды (рН), окислительно-восстановительные условия (концентрация кислорода), питательные и токсичные вещества.
- •27. Статические характеристики микробных популяций.
- •28. Динамические характеристики микробных популяций.
- •29. Механизмы генетической гетерогенности микробных популяций. Мутации, диссоциации, генетический обмен.
- •30. Особенности роста микробных популяций в открытых и закрытых системах.
- •31. Типы симбиотических взаимодействий микроорганизмов с животными.
- •32. Микробно-растительные взаимодействия
- •33. Микроорганизмы в защите растений от болезней и вредителей.
- •Классификация биопрепараты для защиты растений
- •34. Трофические связи в микробных сообществах.
- •35. Типы антагонистических взаимодействий между популяциями микроорганизмов
- •36. Распределение микроорганизмов в почвенном профиле. Перемещение микроорганизмов в почве, динамика численности популяций.
- •37. Функциональные группы микроорганизмов в почве. Эколого-трофические группы микроорганизмов и их сукцессии.
- •38. Значение биологической рекультивации техногенных земель. Этапы рекультивационных мероприятий.
- •39. Биоремедиация загрязненных почв с участием микроорганизмов. Этапы биоремедиационных мероприятий.
- •40. Участие микроорганизмов в деградации атмосферных загрязнений.
- •42. Роль микроорганизмов в глобальных циклах элементов: круговорот азота. Группы микроорганизмов, участвующих в круговороте.
- •43. Вертикальное распределение бактерий в водоемах. Колонка Виноградского.
- •44. Микроорганизмы аэробной, микроаэрофильной и анаэробной зон водоемов.
- •45. Особенности микрофлоры морей и океанов. Микрофлора афотической зоны, её значение для трофических цепей глубоководных зон.
- •46. Методы аэробной биологической очистки сточных вод: поля фильтрации, поля орошения.
- •47. Методы аэробной биологической очистки сточных вод: аэротенки, биофильтры.
- •48. Методы анаэробной переработки органических отходов: метантенки. Метаногенная и не метаногенная микрофлора.
- •49. Методы определения численности и биомассы микроорганизмов в природных
- •образцах.
- •50. Методы исследования некультивируемых форм бактерий.(НФБ)
- •51. Генетически модифицированные микроорганизмы и проблема их распространения в природе.
Конечными продуктами обмена первичных анаэробов являются несбраживаемые продукты: Н2, ацетат, ЛЖК. Соответственно используемым субстратам выделяют гидрогенотрофные и ацетотрофные организмы. Разложение иных продуктов брожения, в том числе спиртов, суммарно обозначаемых как ЛЖК, включает два варианта: прямое окисление при достаточном окислительном потенциале акцептора или конверсию в водород и ацетат особой группой синтрофных организмов.
Вторичные анаэробы используют лишь ограниченное число простых органических соединений - лактат, этанол, Н2 и др. Ключевым процессом при разложении несбраживаемых веществ служит межвидовой перенос Н2 и сопряженный с ним ацетогенез. Межвидовой перенос Н2 обуславливает термодинамическую возможность разложения несбраживаемых веществ, если Н2 удаляется из системы. За счет межвидового переноса Н2 существует группа синтрофных организмов. Внутренним акцептором Н2 в системе может служить только СО2.
Пространственная организация тесно связана с трофической и отчетливо проявляется в бентосных сообществах, приобретающих аналогию с тканью. Принцип кооперативной трофической связи между функциональными различными группами бактерий состоит в том, что, продукты обмена одних групп организмов являются субстратом для других.
Питание бактерий осуществляется исключительно путем молекулярной диффузии, движущей силой которой служит градиент концентрации вещества вокруг клетки. Перенос вещества от одного организма к другому пропорционально квадрату расстояния. Чем ближе клетки бактерий от источника питания, тем эффективнее поступление вещества в клетку. Поскольку в бентосных сообществах действуют функциональные группы бактерий, то для взаимодействующих организмов важно сближение на минимальное диффузионное расстояние.
35. Типы антагонистических взаимодействий между популяциями микроорганизмов
Антагонизм — термин, применяемый к таким взаимоотношениям между микроорганизмами, когда один вид задерживает или полностью подавляет рост другого. Если угнетение взаимно, говорят об аменсализме.
В конкурентной борьбе организмы могут следовать r-стратегии (r—показатель скорости логарифмического роста популяции в нелимитирующей среде) или К - стратегии (К—показатель верхнего предела численности популяции). При обилии пищи r-стратегии быстро размножаются и получают преимущество, но в неблагоприятных условиях быстро отмирают. К-стратегии расходуют больше ресурсов на поддержание жизнеспособности, размножаются медленнее, но зато лучше сохраняются в неблагоприятных условиях. В зависимости от условий получают преимущество организмы, следующие той или иной стратегии, причем имеют значение изменения среды как в пространстве, так и во времени.
Взаимосвязь между микроорганизмами проявляется и при различных инфекционных болезнях животных и человека. Так, гемофильные бактерии проявляют свое патогенное действие в организме в сообществе с различными сапрофитами – стафилококками, кишечной палочкой, что используется в лабораторной диагностике. Тяжесть течения злокачественного отека зависит от присутствия
совместно с патогенными клостридиями сапрофитов. Наиболее широко используется человеком антогонистические взаимоотношения между микроорганизмами (антибиотики, пробиотики).
Жизнь организма в сообществе зависит не только от абиотических условий, но и от того, в какие взаимоотношения он вступает с другими организмами.
36. Распределение микроорганизмов в почвенном профиле. Перемещение микроорганизмов в почве, динамика численности популяций.
На распределение микроорганизмов в почвенном профиле оказывает влияние, в первую очередь, запас органического вещества. Как правило, профильное распределение микроорганизмов соответствует содержанию гумуса по горизонтам почвы: наибольшая их численность обнаруживается в верхних органогенных слоях, а с глубиной она убывает более или менее резко в зависимости от типа почвы.
При сильном летнем иссушении почвы максимум численности может быть обнаружен не в верхнем слое, а на некоторой глубине, где сохраняется влага. Высокая численность микроорганизмов характерна для иллювиального горизонта, погребенных или надмерзлотных горизонтов в почвах тундры.
Водоросли обычно сосредоточены в верхних 5 см почвы и особенно на поверхности. Грибы очень четко связаны с распределением органического вещества. В глубоких минеральных горизонтах почвы преобладают олиготрофные группировки бактерий и обычны дрожжи рода Lipomyces. Распределение простейших следует за общей численностью микроорганизмов, и, как правило, их больше в верхних горизонтах почв.
Большое влияние на распределение и перемещение организмов в почвенных слоях оказывают корни растений. Они служат источником органических веществ и на их поверхности обитает гораздо больше микроорганизмов, чем в окружающей почве.
Перемещение организмов в почве может быть активное и пассивное. Активно передвигаются все животные и растущие корни растений. Микроскопические животные, простейшие, передвигаются по почве во влажной среде, по системе капилляров, заполненных водным раствором. Многие бактерии, обладающие жгутиками, также активно передвигаются в системе водных пленок, пор и капилляров.
Динамика численности популяции изменяется в зависимости от условий окружающей среды, подобные связи могут иметь связанный характер, так, например, при снижении уровня влаги в почве, рост одних микроорганизмов может замедлятся, в то время как другие, более устойчивые виды получают приемущество.
37. Функциональные группы микроорганизмов в почве. Эколого-трофические группы микроорганизмов и их сукцессии.
Основные группы:
Сапрофаги (в т.ч. целлюлозо-разрушающие грибы или бактерии): микроорганизмы, обладающие ферментами, разлагающими полимеры, которые влияют на большую часть энергетических потоков в пищевых сетях
Микросимбионты (в т.ч. микоризные грибы, ризобии): микроорганизмы, связанные с корнями, деятельность которых усиливает прием питательных веществ растениями;
Вредители и возбудители болезней (в т.ч. патогенные грибы, беспозвоночные животные - вредители растений), виды, используемые в биологическом контроле (в т.ч хищники, паразиты и сверхпаразиты вредителей и возбудителей болезней);
Бактериальные трансформеры: бактерии, преобразующие углерод (в т.ч. метанотрофы) или питательные элементы, такие как азот, сера или фосфор (в т.ч. нитрифицирующие бактерии).
Микрорегуляторы регулируют потоки питательных веществ в результате питания растениями и других взаимодействий с организмами;
Химические инженеры/микробные сапрофаги. Химические инженеры отвечают за протекание химических процессов и способны разлагать органическое вещество в ходе реакций анаболизма и катаболизма. Эти процессы регулируют в основном микроорганизмы (микробы), представленные бактериями и грибами, поскольку более 90% потока энергии в почвенной экосистеме опосредуется микробами.
Бактерии – водные организмы, которые живут в почвенных порах, заполненных водой. Большинство бактерий имеют ограниченные способности к передвижению и налипают на поверхность минеральных и органических частиц, образуя плотные скопления (маты) из клеток, которые называют биопленками. Их расселение зависит от движения воды, роста корней или активности почвенных организмов.
Движения бактерий весьма ограничены и более 90% бактерий в почве неактивны, поскольку они не способны перемещаться в поисках органического субстрата. В природе большую часть времени бактерии неактивны, вероятно, из-за голодания. При помещении в лабораторные условия и при предоставлении им пищи, они начинают быстро размножаться и рост биомассы может быть в 1 -10 тыс. раз выше, чем в природе.
Бактерии могут выполнять огромное количество метаболических функций, в т.ч. ускорять значительное количество химических превращений, включая распад органического вещества, а также подавлять развитие болезней и стимулировать перемещение питательных веществ по корням.
38. Значение биологической рекультивации техногенных земель. Этапы рекультивационных мероприятий.
Учебник по рекультивации.
39. Биоремедиация загрязненных почв с участием микроорганизмов. Этапы биоремедиационных мероприятий.
Биоремедиация — комплекс методов очистки вод, грунтов и атмосферы с использованием метаболического потенциала биологических объектов.
Возможно три основных подхода к Биоремедиации почв с помощью микроорганизмов
биостимуляция - стимулирование развития аборигенной микрофлоры на территории подвергшейся загрязнению.
биодополнение - внесение в почву биопрепаратов микроорганизмов способных к деградации загрязнителя.
фитостимуляция - использование растений для стимуляции развития ризосферных микроорганизмов.
Главную роль в деградации загрязнений играют микроорганизмы. Растение является своего рода биофильтром, создавая для них среду обитания (обеспечение доступа кислорода, разрыхление грунта. В связи с этим, процесс очистки происходит также вне периода вегетации (в нелетний период) с несколько сниженной активностью.
40. Участие микроорганизмов в деградации атмосферных загрязнений.
При попадании в атмосферу и водные источники, на почву и растительность, а также на поверхности зданий, сооружений и других объектов жизнедеятельности человека оксиды азота, растворяясь в воде, образуют азотную и азотистую кислоту, вредное действие которых сказывается и на организме человека, вызывая заболевания сердечнососудистой, дыхательной, нервной систем и желудочнокишечного тракта.
Биологические методы подразумевают использование углеводородокисляющих и других микроорганизмов (УОМ), которые способны разлагать продукты сгорания до безопасных минеральных соединений. В различных источниках имеется описание 22 родов бактерий, 31 рода микроскопических грибов и в том числе 19 родов дрожжей выделенных из почвенных экосистем. Из морской среды обитания выделено 25 родов бактерий и 27 родов микроскопических грибов. В их числе: бактерии (Bacillus, Clostridium, Escherichia и др.), мицелиальные грибы (Aspergillus, Penicillium, Mucor и др.), дрожжи (Candida, Saccharomyces, Trichosporon и др.), цианобактерии (Microcoleus, Oscillatoriam, Plectonema и др)
Верхние слои атмосферы в малой степени очищаются микроорганизмами, поскольку большинство из них гибнет в атмосфере из-за ультрафиолетовых лучей, высыхания, отсутствия питательных веществ. Основная часть микроорганизмов обитает в верхних слоях почвы и очищает приземный слой атмосферы, используя в качестве субстратов роста окись углерода (CO), сероводород (H2S), углеводороды (CH) и окислы азота (NOx). При этом главным источником загрязнения воздушной среды является почва. Частично микроорганизмы попадают в воздух с открытых водоемов с капельками воды, от человека, животных, растений.
Применение методов биологической очистки при загрязнении продуктами сгорания углеводородных топлив в большей степени подходит для очистки почвы и воды, поскольку многие микроорганизмы, ненадолго попадающие в атмосферу, являются патогенными и условно патогенными, а также вызывающими образование опасных соединений, в том числе азотной и серной кислоты. Для предотвращения загрязнения атмосферы предлагается использование альтернативных топлив, каталитических нейтрализаторов и каталитических покрытий поршня, что в свою очередь также уменьшит уровень загрязнения почвы и воды.
41. Роль микроорганизмов в глобальных циклах элементов: круговорот углерода и кислорода. Группы микроорганизмов, участвующих в круговороте.
По отношению к источникам углерода микроорганизмы делят на две группы – автотрофы и гетеротрофы. Автотрофы превращают CO2 в органические соединения за счет внешних источников энергии. Обычно автотрофы делят на две группы: хемолитоавтотрофы для ассимиляции углерода СО2 используют энергию окисления минеральных веществ, фотоавтотрофы для этой цели используют солнечную энергию. Гетеротрофы нуждаются в готовых органических соединениях, которые используются ими и как источник энергии, и как источник углерода.