При нагревании:

рвутся слабые связи в молекуле фермента (гидрофобные, ионные и водородные)  меняется конформация E  нарушается структура активного центра E  уменьшается активность E.

III. Зависимость скорости реакции от pH среды:

Оптимум pH – это такое значение pH, при котором E проявляет максимальную активность.

Для каждого E характерен довольно узкий интервал pH, при котором он активен:

При изменении pH среды в сторону от оптимума активность E уменьшается:

Причины:

изменяется ионизация ионогенных групп  рвутся ионные и некоторые водородные связи в молекуле фермента  меняется конформация E  нарушается структура активного центра E  уменьшается активность E.

Кофакторы ферментов и их роль в катализе.

Если фермент является сложным белком, то в его состав всегда входит небелковый компонент, который называется: Кофактор.

Белковая часть такого фермента называется: Апофермент.

А комплекс апофермента с кофактором получил название: Холофермент:

Апофермент + Кофактор Холофермент

Каталитическую активность в этом случае проявляет только Холофермент.

Кофакторы

Коферменты Ионы металлов

Роль ионов металлов в катализе:

1) участвует в присоединении субстрата (Mg²⁺, Mn²⁺, Zn²⁺)

2) принимают участие в катализе (Zn²⁺, Cu²⁺, Fe²⁺)

3) принимают участие в стабилизации третичной и четвертичной структуры фермента (K⁺, Ca²⁺, Zn²⁺)

4) активаторы ферментов (Ca²⁺)

Коферменты:

1. Органические вещества, предшественниками которых, как правило, являются витамины;

2. Принимают непосредственное участие в катализе, наряду с радикалами аминокислот.

Некоторые коферменты непрочно связаны с апоферментом (NAD⁺, NADP⁺, HS-KoA, H₄-фолат).

Есть коферменты, прочно связанные с апоферментом, т.е. представляют с собой простетическую группу (гем, FAD, FMN, биотин).

Примеры коферментов

Тиаминдифосфат (ТДФ):

Биотин (витамин H):

Кофермент A:

Классификация ферментов.

В основе классификации ферментов лежит тип катализируемой ими реакции.

Все ферменты делятся на 6 классов:

I. Оксидоредуктазы – катализируют окислительно-восстановительные реакции.

Основные подклассы:

1. Оксидазы

2. Гидроксилазы

3. Дегидрогеназы – катализируют реакции присоединения / отщепления атомов водорода (дегидрирования).

По типу кофермента различают:

1. NAD⁺ и NADP⁺ – зависимые дегидрогеназы (предшественник: витамин PP);

2. FAD и FMN – зависимые дегидрогеназы (предшественник: витамин B₂)

Коферменты NAD⁺, NADP⁺, FAD и FMN выполняют роль акцепторов атомов водорода.

Строение коферментов NAD⁺ и NADP⁺:

+

+

Активная часть коферментов

NAD⁺ и NADP⁺:

Витамин PP:

1) Роль коферментов NAD⁺ и NADP⁺ в реакциях дегидрирования:

.

Д H₂ + NAD⁺ Д + NADH + H⁺

(или NADP⁺) (или NADPH + H⁺)

Пример реакции с участием NAD⁺:

Строение флавиновых коферментов (FMN и FAD):

2) Роль коферментов FAD и FMN в реакциях дегидрирования: