- •Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования
- •Содержание
- •Список сокращений
- •Введение
- •І. Тема: белки
- •1. Строение и биологическая роль аминокислот, пептидов, белков
- •Аспарагиновая кислота (асп)
- •Лизин (лиз)
- •Серин (сер)
- •1.1. Первичная структура белка
- •1.2. Варианты вторичной структуры белка
- •1.3. Третичная структура белка
- •1.4. Четвертичная структура белка – высший уровень организации
- •Свойства протеинов
- •2.1. Физико - химические свойства биополимеров
- •2.2. Особенности биологических свойств белков
- •3. Методы очистки и выделения белков
- •4. Классификация белков
- •4.1. Простые белки
- •4.1.1. Глобулярные белки
- •4.1. 2. Фибриллярные белки
- •4.2. Сложные белки
- •Характеристика липопротеиновых частиц
- •5. Биологическая роль протеинов
- •Вопросы для самоконтроля:
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний:
- •Ситуационные задачи
- •II. Тема: ферменты
- •1. Особенности строения ферментов
- •1.1. Энзим – сложный белок
- •1.1.1. Природа и роль кофермента
- •Витамины – компоненты коферментов
- •1.1.2. Апофермент и его значение
- •1.2. Функциональные центры фермента
- •1.2. Механизм действия ферментов
- •I стадия. Образование es-комплекса
- •II стадия. Активация es-комплекса
- •III стадия. Образование eр-комплекса
- •IV стадия. Распад eр-комплекса
- •1.3. Специфичность действия ферментов
- •1.4. Кинетика ферментативных реакций
- •1.4.1. Зависимость скорости реакции от концентрации субстрата
- •1.4.2. Зависимость скорости реакции от концентрации фермента
- •1.4.3. Зависимость скорости реакции от температуры
- •1.4.4. Зависимость скорости реакции от величины рН среды
- •2. Классификация, номенклатура и регуляция ферментов
- •2.1. Классификация и номенклатура ферментов
- •2.1.1. Характеристика отдельных классов ферментов
- •2.2. Регуляция работы фермента
- •2.2.1. Активация энзима
- •1. Аллостерическая регуляция
- •2.2.2. Особенности строения и функционирования аллостерических ферментов:
- •2.2.4. Регуляция путём ковалентной модификации
- •2.2.5. Частичный протеолиз – как способ активации энзима (активация зимогена)
- •2.3. Ингибирование ферментов
- •2.4. Использование ферментов в медицине.
- •Энзимопатии
- •Энзимодиагностика
- •Энзимотерапия
- •Вопросы для самоконтроля:
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний:
- •Ситуационные задачи
IV стадия. Распад eр-комплекса
Так как получившееся новое вещество, отличается от субстрата, то оно не комплементарно ферменту и комплекс распадается на составляющие.
1.3. Специфичность действия ферментов
Специфичность действия ферментов по отношению к субстрату обусловлена их строением и биологической особенностью – лигандностью. Различают следующие виды специфичности энзимов:
Стереохимическая специфичность проявляется в тех условиях, когда энзим катализирует превращение только одного из возможных стереоизомеров субстрата. Например, фумаратгидратаза реагирует с транс-изомером фумаровой кислотой, но не взаимодействует с её цис-изомером малеиновой кислотой:
Имея абсолютную субстратную специфичность, биокатализатор работает лишь с одним веществом. Наблюдающееся явление и пытался объяснить Э.Фишер, который считал, что конформация активного центра жёстко запрограммирована, - поэтому фермент узнаёт только один свой субстрат. Аргиназа разрушает связи только в аргинине.
Уреаза гидролизует только мочевину:
Относительная (групповая) специфичность свидетельствует о том, что фермент может повреждать связи в различных субстратах. Имея первый вариант специфичности, энзим способен производить одну реакцию, но с субстратами, есколько отличающимися по химическому строению. Цитохром Р450 может гидроксилировать (присоединение группы -ОН) около 7000 соединений как природных, так и ксенобиотиков. Большинство протеаз, осуществляющих гидролиз белков, как животного, так и растительного происхождения, находит и расщепляет пептидные связи. Панкреатическая липаза разрушает молекулу любого жира.
Но как понять факт относительной специфичности? Кошланд как раз и предложил свою теорию «индуцированного контакта». По его мнению, как отмечено выше, пространственная укладка активного центра свободного энзима только намечена, а по мере приближения к нему субстрата группировки последнего несколько меняют расположение участков контактной площадки, приспосабливая её для будущей своей работы. Отсюда различные, но сходные по строению вещества способны преобразовываться одним и тем же ферментом.
1.4. Кинетика ферментативных реакций
Кинетика ферментативных реакций – раздел энзимологии, изучающий зависимость скорости химических процессов, катализируемых энзимами, от химической природы реагирующих веществ, а также факторов окружающей среды. Чтобы понять и правильно оценить результаты определения биокаталитической активности, нужно совершенно отчётливо представлять себе, от каких факторов зависит скорость реакции, какие условия оказывают влияние на неё. Таких причин много. Прежде всего - это соотношение концентраций взамодействующих веществ: фермента и субстрата. Также важны условия, в которых протекает реакция: температура, кислотность, присутствие регуляторных молекул (активаторов и ингибиторов), солей и других примесей, способных как ускорить, так и замедлить ферментативный процесс, и т.д.
Одним из наиболее существенных факторов, определяющих эффективность реакции, являются величины субстрата (или субстратов) и продукта (продуктов).