Вирусология общая Горячкиной
.pdf10 Общая м едицинская вирусология
Таким способом проникают в клетку простые вирусы и многие слож ные вирусы .
Второй способ проникновения заключается в слиянии суперкапсидной оболочки вируса с клеточной мембраной, осуществляемой белками слияния, в результате чего внут ренняя часть вируса (его нуклеокапсид, сердцевина) оказы вается в цитоплазме клетки. Такой способ проникновения характерен для слож ных вирусов, обладающих F-белка- ми-слияния или другими гликопротеинами, выполняю щими их функции (например, гемагглютинин у вируса гриппа).
3.Д епрот еинизация ( «р а здева н и е») вирусов с цель
освобож дения его нуклеиновой кислоты такж е отличает ся у вирусов, проникающ их в клетку разными способами.
Вирусы, проникш ие в клетку путем рецепторного эндоцитоза и находящ иеся в рецептосоме, покидают ее путем слияния мембран, если это сложные вирусы, и, возможно, при участии капсидных поверхностных белков, если это простые вирусы, при этом происходит частичная депротеинизация вирусов под действием ферментов, находящихся в мембране рецептосомы , и лизосомальных ферментов. Частично дезинтегрированные вирусы поступают в цитоп лазму, где продолжается их «раздевание» протеазами внут риклеточных мембран и другими ферментами клетки.
При способе проникновения вирусов путем слияния мембран депротеинизация вирионов начинается уж е при их проникновении с помощ ью ферментов клеточной мем браны и продолжается внутри клетки, как указано выше.
В результате депротеинизации происходит дезинтегра ция вириона. Освобожденная геномная нуклеиновая кис лота приобретает способность индуцировать репродукцию вирусов. У некоторы х вирусов освобож дение нуклеино вой кислоты бывает полным, но обычно в ассоциации с нуклеиновой кислотой остаются геномные (внутренние) белки, например, полимеразы и иногда — капсидные бел ки. В дальнейшем эти белки участвуют в процессе репро дукции и защите нуклеиновой кислоты от действия кле точных нуклеаз.
1 ЛАВА 1 . 1*С£Д£лИл U
4. Экспрессия ви русн ого геном а становится возм ож ной после высвобож дения вирусной нуклеиновой кисло ты, иногда требуется ее транспортировка в ядро клетки и взаимодействие с клеточным геномом.
Реализация генетической программы вируса начина ется с процесса транскрипции с последующ ей трансляци ей и репликацией вирусного генома, в результате чего образуются компоненты вируса — копии вирусного гено ма и структурные белки вируса.
Транскрипция — образование на матрице геномной нук леиновой кислоты комплементарных информационных РНК (и-РН К), необходимы х для последующ ей трансля ции и синтеза вирусных белков на рибосомах клетки.
Трансляция — процесс перевода генетической инфор мации, заложенной в и-РН К, на специфическую последо вательность аминокислот. Трансляция осущ ествляется и- РНК на клеточных рибосомах, на которы х синтез клеточ ных белков подавляется и транслируются вирусные белки.
Существует два способа формирования вирусных бел ков в зависимости от длины и-РНК. Короткие, моноцистронные и Р Н К кодирую т отдельный, обычно зрелый, ви русный белок. Длинные полицист ронные и-РНК, кото рые могут содержать всю информацию вирусного генома или ее часть, поступают на полирибосомы , на которы х транслируется один гигантский полипротеин-предшествен ник. Этот полипептид нарезается вирусными и клеточны ми протеазами на отдельные зрелые вирусные белки как неструктурные (обслуж иваю щ ие процесс репродукции ферменты и регуляторные белки), так и структурные. У не которых вирусов эти два способа формирования белков могут сочетаться.
Транскрипция и трансляция имеют свои особенности в зависимости от типа и строения вирусных нуклеиновых кислот.
1.
Геномная ДНК > транскрипция > и-РНК > трансля ция > белок.
12 |
Общ ая м едицинская вирусология |
Если транскрипция происходит в ядре, как у больш ин ства ДНК-вирусов, то она осущ ествляется клеточной ДНКзависимой РН К -полимеразой (транскриптазой), если в цитоплазме, то транскрипцию выполняет вирусная транскриптаза, входящ ая в состав вириона. У ДНК -вирусов последовательно считы ваю тся участки генома, кодирую щие отдельные белки, образую тся короткие и-РН К, сна чала ранние и-РНК, затем поздние и-РНК. Соответствен но происходит трансляция на рибосомах сначала ранних неструктурны х, а затем поздних — структурных белков вируса.
2.У плюс-РН К вирусов геномная РНК одновременно является информационной РНК, поэтому стадия
транскрипции отсутствует и схема укорочена:
Геномная плюс-РНК > трансляция > белок.
П лю с-РН К, выполняющ ая функцию и-РН К, поступает на полирибосомы и полностью транслируется с образова нием гигантского полипептида-предшественника, который нарезается протеазами на отдельные белки — неструктур ные и структурные.
3. У м инус-РН К вирусов (с однонитевой и двунитевой РНК) синтез белка происходит по следующ ей схеме:
Геномная минус-РНК > транскрипция > и-РНК > транс ляция > белок.
Транскрипция осущ ествляется собственны ми транскриптазами вирусов, при этом возмож но образование как коротких, так и длинных и-РНК с последующ ей трансля цией индивидуальных зрелых белков или полипептидапредшественника.
Сущ ествуют и другие типы транскрипции и трансля ции, например у ретровирусов.
4.Рет ровирусы (возбудитель ВИЧ-инфекции, онкогенные вирусы) имеют диплоидный геном, состоя щий из двух идентичных молекул однонитевых плюс-РНК, и фермент РН К -зависимую ДНК-поли- меразу, называемую такж е обратной транскрипта зой или ревертазой.
Г лава 1. Ос новные с ведения о вирусах |
13 |
Ретровирусам свойственен уникальный, очень редко встречающийся у вирусов путь передачи генетической информации с РНК на ДНК. Подобный путь обнаружен также у вируса гепатита В и, предполож ительно, у виру са клещевого энцефалита.
Схема синтеза белка у ретровирусов следующ ая:
Геномная РНК > комплементарная ДНК (провирус) > транскрипция> и-РНК > трансляция > белок.
На матрице геномной плюс-РНК с помощ ью обратной транскриптазы синтезируется комплементарная ДНК (ми нус-нить). Затем вирусная РНК разрушается нуклеопротеазой и вместо нее достраивается вторая нить ДНК (плюснить) с участием клеточной ДНК -полимеразы . Образует ся двунитевая ДНК (несущ аяя генетическую информацию ретровируса), которая, приняв кольцевидную форму, ин тегрирует в хром осом у клетки в виде провируса. С этой провирусной ДНК происходит транскрипция и-РН К и далее трансляция белков.
Репликация вирусного генома заключается в синтезе на матрице исходной геномной нуклеиновой кислоты вируса множества копий — будущ их вирусных геномов. У боль шинства вирусов репликация происходит в ядре клетки, у некоторых — в цитоплазме. .Процесс начинается после накопления неструктурны х ранних белков, необходимых для обслуживания репликации.
Репликация вирусного генома имеет сходство с транс крибированием и-РН К, осущ ествляется вирусными или клеточными полимеразами (возмож но несколько модифи цированными). Главное отличие состоит в том, что при репликации вирусный геном всегда считывается полно стью и образующ иеся копии идентичны матричному ге ному. Как нам известно, при транскрипции и-РНК часто считываются отдельные гены или небольшие участки ви русного генома. Существует регуляция переключения про цессов репликации на транскрипцию и обратно, однако механизм такого переключения не вполне ясен.
Репликация имеет отличия у вирусов с различным ти пом генома.
14 |
Общ ая медицинская вирусология |
1.Репликация двунитевых ДНК-геномов осущ еств ляется с помощ ью клеточной ДНК-зависимой ДНКполимеразы (репликазы) по полуконсервативному типу, подобно клеточным ДНК.
2.Однонитевые плюс-РНК геномы реплицируются с помощ ью вирусиндуцированной РНК-полимера- зы. На исходной нити плюс-РН К синтезируется комплементарная минус-нить, образуется промежу точный репликативный комплекс, состоящ ий из двух нитей. На отделяющ ихся минус-РН К форми руются нити плюс-РНК, идентичные исходной ге номной плюс-РН К, происходит накопление многих копий генома.
3.Однонитевые минус-РНК геномы реплицируют ся с помощ ью входящ ей в состав вириона РНКзависимой РНК-полимеразы по тому же принци пу, что и плюс-РН К вирусы, т.е. через промеж у точный репликативный комплекс. В результате образуется множ ество копий минус-РН К геномов, идентичных исходному.
4.У ретровирусов для осущ ествления репликации геномной РНК необходимо прохождение тех же ста дий, что при транскрипции с обязательной интег рацией ДНК -провируса в хром осом у клетки. На матрице провирусной ДНК с помощ ью клеточной ДНК -зависимой РНК-полимеразы реплицируются копии однонитевых плюс-РНК — будущ их гено мов дочерней популяции ретровирусов.
Для ретровирусов характерно сочетание интегративной и продуктивной инфекции клеток. Если преобладает ин тегративная инфекция, провирус длительно сохраняется в зараженной клетке и при ее делении в составе хром осо мы переходит в дочерние клетки (наблюдается персистенция вируса).
Таким образом, в результате экспрессиии вирусного генома в инфицированной клетке накапливаются компо ненты вируса — копии генома и структурные белки. Син тез нуклеиновых кислот и белков вируса обычно проис
Г лава 1. Основные с ведени я о вирусах |
15 |
ходит в разных частях клетки и не одновременно, поэто му такой способ репродукции вирусов называет ся дизъ юнктивным или разобщ енным .
5. Ф орм ирование вирионов из отдельных компонен тов вируса у больш инства вирусов осущ ествляется в цитоплазме.
Простые вирусы образуются путем самосборки при вза имодействии нуклеиновой кислоты вируса и капсидных белков, при этом капсид формируется по спиральному или кубическому типу симметрии. Получаемая структура ста
бильна и называется нуклеокапсидом.
Сложные вирусы ф орм ирую тся в несколько этапов. Сначала образуются нуклеокапсиды, которы е взаимодей ствуют с модифицированными мембранами клетки (на ружными или внутренними, в том числе ядерной), одева ются суперкапсидной оболочкой, у некоторых вирусов под суперкапсидом формируется матриксный слой (М -белок).
6. В ы ход вирионов из клет ки происходит или при разрушении, лизисе клетки, или путем почкования.
Первый способ характерен для просты х вирусов — вы ход по «взры вному» типу.
Второй способ наблюдается у слож ны х вирусов, кото рые, почкуясь через мембраны клетки, одновременно при обретают суперкапсидную оболочку клеточного происхож дения со встроенными вирусными белками — гликопро теинами. При этом клетка, как правило, погибает не сразу, продолжая выделять новые поколения вирионов вплоть до истощения ее ресурсов.
1.2. Таксономия и классификация вирусов
Современная классиф икация вирусов является уни версальной и включает вирусы , поражающ ие человека и позвоночных ж ивотных, беспозвоночных, простейш их, ра стения, грибы, бактерии. Как уже указывалось, вирусы выделены в отдельное царство — Vira.
К лассиф икация |
и |
так сон ом и я вы р усов п остоян н о |
соверш енствуется |
по |
мере получения н овы х данны х. |
16 Общ ая м едицинская вирусология
Направляющим и координирующим центром, ведущим ра боту в этой области, является Интернациональный ком и тет по так сон ом и и ви русов — И КТВ (In tern a tion a l Committee on Taxonom y of Viruses — ICTV), который имеет тесные контакты с ВОЗ.
В настоящее время ИКТВ составлен реестр с описани ем свойств 1550 различных вирусов, создана база дан ных — ICTVdB.
Современная система таксономии вирусов базируется на принципах классификации Линнея и содерж ит следу ющ ие таксономические категории: порядок, семейство,
подсемейство, род, вид.
П оря док — разработка порядков еще не завершена, предлагается осущ ествлять объединение семейств виру
сов в порядки в зависимости от типа их генома и обозна чать порядки в их латинском наименовании окончанием
«-virales», например M ononegavirales (однонитевой минус- РНК-геном).
С ем ейст во — состоит из групп (родов) вирусов, имею щих общее эволюционное происхож дение. Для обозначе ния семейства применяют окончание «-virid a e», напри мер O rthom yxoviridae.
П одсем ей ст во — этот таксон используют в тех случа ях, когда новые данные, полученные при изучении виру сов, входящ их в одно семейство, противоречат представ
лению об их общ ем эволюционном |
происхож дении. |
Та |
кие сем ей ств а п од р а зд ел я ю т на |
п од сем ей ств а |
или |
разделяют на новые семейства. Подсемейства имеют окон чание «-virin a e», например семейство H erpesviridae под разделяется на 3 подсемейства: а-, (3- и у-H erpesvirinae.
Р од — состоит |
из вирусов с общ ностью эволюционного |
происхож дения и |
со многими сходными свойствами. Наи |
менование рода |
имеет окончание «-v ir u s », например |
E nterovirus. |
|
Вид (т и п ) — |
подразделение вирусов внутри рода. |
Вид — это совокупность однородных вирусов, имеющих сходный нуклеотидный состав и занимающ их определен
Г лава 1. Основные с ведения о вирусах |
17 |
ную экологическую ниш у. Они обозначаются окончанием «-virus», например Poliovirus.
ИКТВ разрабатывает видовые наименования вирусов, в которых указаны вызываемые ими заболевания или симптомы, иногда географические названия и др. Н апри мер: Papillom avirus, H ep atitis В virus, M arburg virus, Epstein-Barr virus.
Видовые наименования вирусов не уклады ваю тся в бинарную номенклатуру видов Линнея, но выполняют свою основную функцию — унификацию этих наименований.
Виды (типы) вирусов имеют дальнейшее подразделе ние на подт ипы (подвиды), серовариант ы , ген ет и ч ес кие вариант ы, ш т ам м ы , которы е формально еще не оп ределены.
Основными крит ериям и для определения порядка, се мейства, подсемейст ва и рода вирусов являются:
-тип и организация вирусного генома;
-стратегия репликации вируса;
-строение вириона.
С целью дифференциации видов внутри рода исполь зуют следующие критерии:
-сходство в нуклеотидном составе генома;
-круг естественных хозяев (экологическая ниша);
-тропизм к клеткам и тканям;
-патогенность и цитопатология;
-способ передачи инфекции;
-физико-химические свойства вириона;
-антигенные свойства вирусны х белков.
Согласно современной классиф икации, вирусы , пат о генные для человека, входят в 22 сем ейст ва (рис. 1, табл. 1), из них 8 сем ейст в сост авляют Д Н К -геном ные вирусы и 14 сем ейст в — РН К -геном ны е. Еще недавно насчитывалось 19 семейств. В последние годы созданы новые семейства: A stroviridae, Filoviridae, Circinoviridae. Семейство Papovaviridae разделено на два: Papillomaviridae
и Poliomaviridae. Есть изменения и в других таксоном и ческих категориях. Таким образом, классификация ви русов продолжает дополняться и соверш енствоваться.
Таблица I
Сводная таблица характерны х свойств вирусов, пораж аю щ их человека
Семейство
1
Poxviridae
Herpesviridae
Adenoviridae
Papilloinaviridae
Polyomaviridae
Особенность вирусного генома
2
ДН К линейная двунитевая
ДН К линейная двунитевая
ДН К линейная двунитевая
ДН К кольцевая двунитевая
ДН К кольцевая двунитевая
Тип |
Наличие |
Форма вириона |
Вызываемые заболевания |
симметрии |
супер- |
и размер в нм |
|
капсида |
кансида |
|
|
|
|
||
3 |
4 |
5 |
6 |
Д Н К двунитевая
Комплексный Есть
Кубический Есть
Кубический Нет
Кубический Нет
Кубический Нет
Форма кирпича,
250x200x200
Сферическая,
150-200
Многогранник,
70-110
Многогранник,
55
Многогранник,
40-45
Натуральная оспа, оспа обезьян, оспа коров, контагиозный моллюск Герпес, ветряная оспа и опоясывающий лишай, цитомегалия, инфекци онный мононуклеоз
О РВИ, гастроэнтериты
Бородавки (папилломы), рак шейки матки и др. Лейкоэнцефалопатия многоочаговая прогрессирующая