- •1.Предмет изучения и основное содержание биофизики.
- •2. Общие принципы описания кинетического поведения биологических систем, принцип узкого места, понятие фазовой траектории.
- •3. Качественное исследование простейших моделей биопроцессов. Поведение переменных на фазовой плоскости вблизи состояния равновесия.
- •4. Биологические триггеры. Фазовый портрет тригерной системы. Способы переключения стационарных состояний тригерной системы.
- •5. Колебательные процессы в биологии. Фазовый портрет автоколебательной системы.
- •6. Термодинамика систем вблизи равновесия. Первый и второй закон термодинамики. Живые системы.
- •Термодинамика живых систем
- •7. Второй закон термодинамики в открытых системах. Поддержание неравновесных состояний в бисистемах.
- •8. Теорема Пригожина
- •9. Термодинамика систем вдали от равновесия.
- •10. Энтропия, информация и биологическая упорядоченность.
- •11.Пространственная организация макромолекул.
- •Слабые невалентные взаимодействия в биологических системах.
- •13. Электронно-конформационные взаимодействия в макромолекулах
- •14. Спин электрона.
- •18. Механизмы переноса электрона и миграции энергии в биоструктурах.
- •19. Механизмы ферментативного катализа. Конформационные перестройки и высота барьера активации реакции
- •20. Молекулярная организация биологических мембран. Жидкомазаичная модель мембраны. Межмолекулярные взаимодействия в мембранах.
- •21. Механические и конформационные свойства мембран. Фазовые переходы биомембран.
6. Термодинамика систем вблизи равновесия. Первый и второй закон термодинамики. Живые системы.
Предмет термодинамики – рассмотрение общих закономерностей превращения энергии при ее переносе в форме теплоты и работы между телами.
В зависимости от характера обмена веществом и энергией со средой выделяют три группы систем.
1. Изолированные – не обмениваются со средой ни веществом, ни энергией.
2. Закрытые системы - обмениваются только энергией.
3. Открытые системы - обмениваются со средой и веществом и энергией.
Всякая система характеризуется определенными термодинамическими показателями, изменение одного из них ведет к изменению термодинамического состояния в целом.
Процессы, протекающие в системе, могут быть равновесными и неравновесными:
Равновесные или обратимые – вызванные ими изменения могут произойти в обратной последовательности без изменений в окружающей среде.
Неравновесные или необратимые – их протекание в обратном направлении сопровождается остаточными изменениями в окружающей среде. Таковы реальные превращения в природе.
В классической термодинамике рассматриваются равновесные состояния системы, при которых ее параметры сохраняют свое значение во всех точках системы и не изменяются самопроизвольно во времени.
Первый закон термодинамики.
Закон сохранения энергии:
δQ = dU + δA, теплота δQ, поглощенная системой из внешней среды, идет на увеличение внутренней энергии dU системы и совершения работы δA против внешних сил.
В общем случае δA включает работу против сил внешнего давления pdv и максимально полезную работу δAmax, сопровождающую химические превращения.
Калориметрические исследования показали, что потребление одного литра О2 и выделение одного литра СО2 при прямом сжигании или окислении в организме продуктов сопровождается выделением 21,2 кДж теплоты. Т.е. процессы эквивалентны с точки зрения суммарных тепловых эффектов.
Это подтверждает справедливость для организмов первого закона термодинамики.
Тепловой эффект химич. Реакции развивается через ряд последовательных стадий, не зависит от пути перехода, а определяется разницей теплосодержания конечных продуктов и исходных веществ в реакции. Используется для вычисления каллорийности пищевых продуктов.
Второй закон термодинамики.
Состояние системы может быть описано особой функцией – энтропией S. Изменение энтропии dS определяется суммарным значением поглощенных системой приведенных теплот Q/T. При бесконечно малом изменении системы изменение энтропии δS равно или больше значения поглощенной системой элементарной приведенной теплоты δQ/T:
dS = > δQ/T, если система не совершает теплообмен со средой δQ=0, то dS > 0.
Следовательно, в изолированной системе энтропия остается неизменной или возрастает в неравновесных процессах.
Протекающий в изолированной системе самопроизвольный процесс всегда вызывает увеличение энтропии до ее максимальных значений при окончании процесса и установлении термодинамического равновесия.
По второму закону термодинамики:
Свободная энергия F = U – TS (U – внутренняя энергия системы).
Полный термодинамический потенциал системы G = U + pv – TS (p и v – объем и давление).
В биохимических превращениях изменения объема и давления, как правило, не значительны, поэтому ∆ F ≈ ∆ G.
По известным в физхимии формулам рассчитывают изменения термодинамических потенциалов в различных биохимических превращениях.