- •Введение
- •Глава 1. Общая характеристика биоплёнок. Основные принципы строения биоплёнок.
- •1.1. Биоплёнки как форма существования микроорганизмов и их сообществ
- •1.2. История исследования биоплёнок
- •1.3. Составные компоненты биоплёнки
- •1.4. Матрикс
- •1.4.1. Полисахариды матрикса биоплёнки.
- •1.4.2. Белки матрикса биоплёнки.
- •1.4.3. Нуклеиновые кислоты в матрикса биоплёнки
- •1.4.4. Липиды и сурфоктанты матрикса биоплёнки.
- •1.4.5. Вода, как компонент матрикса биоплёнки
- •1.4.6. Матрикс и механические свойства биоплёнки.
- •Глава 2. Процесс формирования биоплёнки.
- •2.1. Основные стадии процесса формирования биоплёнки.
- •1) Адгезия; 2) Монослой; 3) Микроколонии; 4) Зрелая биоплёнка; 5) Распад биоплёнки.
- •2.2. Адгезия
- •Механизмы клеточной коаггрегации
- •2.4. Зрелые биоплёнки.
- •2.5. Распад биоплёнок
- •Глава 3. Биохимия и физиология биоплёнок
- •Глава 4. Регуляция процесса формирования биоплёнки. Межклеточная коммуникация
- •4.1. Система quorum sensing
- •4.2. Сигнальные молекулы системы quorum sensing
- •4.3. Типы систем quorum sensing
- •4.4. Система мессенджеров
- •Фоторецептор бактерий
- •Глава 5. Экология биоплёнок.
Фоторецептор бактерий
Описанная выше система регуляции, основанная на использовании уровня цикло-ди-ГМФ, является достаточно тонкой и позволяет успешно регулировать многие процессы в бактериальных клетках. Компоненты этой системы входят в состав значительного количества мультиферментных комплексов. Одним из самых причудливых примеров таких комплексов является так называемый бактериофитохром, который выполняет роль фоторецептора. Эта структура была впервые описана у Rhodobacter phaeroides под названием BphG1 [78].
Бактериофитохром (рис. 30) функционирует в качестве рецептора к свету в области «красный\далний красный» и регулирует подвижность и синтез пигментов у R. phaeroides. BphG1 состоит из двух основных модулей: PAS-GAF-PHY фотосенсорного и GGDEF-EAL терминального. Было показано, что BphG1может функционировать в качестве фотозависимой дигуанилатциклазы, а так же в качестве фотонезависимой фосфодиэстеразы [78]. Переключение между двумя разными типами активности осуществляется путём расщепления С-терминального EAL домена. Считается, что димеризация EAL домена предупреждает демеризацию домена GGDEF, что делает последний функционально неактивным. Расщепление EAL домена приводит к тому, что GGDEF домен подвергается конформационным изменениям, которые активируются красным светом и приводят к проявлению дигуанилатциклазной активности. Однако не у всех бактерий терминальным является GGDEF-EAL домен. У некоторых видов С-терминальный домен фоторецептора представлен гистидин киназой [78].
Рис. 30 Структура и принципы функционирования бактериофитохрома с GGDEF-EAL С-терминальным доменом [78].
Интересным является то, что в качестве кофермента в фоторецепторе бактерий используется билливирдин IX. Данное соединение является продуктом метаболизма гемина, который играет огромную роль в жизнедеятельности микроорганизмов. Билливирдин IX образуется путём расшепления молекулы гемина по мезоположениям с помощью гемоксигеназ. Большенство этих ферментов способно разрывать молекулу гемина по α-мезо-положению с образованием билливирдин IX α. Однако, у P. aeruginosa описана гемоксигеназа PigA, которая, разрывая макроцикл гемина в других положениях приводит к образованию билливирдин IX β и билливирдин IX δ [81]. Причины таких различий, а так же, как различные биливердины влияют на функционирование фоторецептора, окончательно не выяснены. Так же окончательно не ясны функции самого бактериофитохрома, не смотря на то, что, эти соединения как с GGDEF-EAL так и с киназным С-терминальным доменом обнаружено у значительного количества бактерий, а так же у некоторых грибов.
Литература
Aldridge P. Role of the GGDEF regulator PleD in polar development of Caulobacter crescentus. / Aldridge P., Paul R., Goymer P., Rainey P., Jenal U. // Mol. Microbiol. – 2003. –V. 47. – P. 1695–1708.
Andres F. Autoinducer 2 Controls Biofilm Formation in Escherichia coli through a Novel Motility Quorum-Sensing Regulator (MqsR, B3022) / Andres F. Gonzalez Barrios, Rongjun Zuo, et al. // Journal of Bacteriology. –2006. – V. 188. – No. 1. – P. 305–316.
Bassler B. L. How bacteria talk to each other: regulation of gene expression by quorum sensing. / Bassler B. L. // Cur Opin Microbiol. – 1999. – V. 2. – P. 582-587.
Bassler B. L. Multiple signalling systems controlling expression of luminescence in Vibrio harveyi: sequence and function of genes encoding a second sensory pathway. / Bassler B. L., Wright M., Silverman M. R. // Mol Microbiol. – 1994. – V. 13. – P. 273-286
Benito Y. Probing the structure of RNAIII, the Staphylococcus aureus agr regulatory RNA, and identification of the RNA domain involved in repression of protein A expression. / Benito Y, Kolb FA, Romby P, Lina G, Etienne J, Vandenesch F. // RNA. – 2000. – V. 6. – P. 668–679
Boisset S, Geissmann T, Huntzinger E, Fechter P, Bendridi N, et al. 2007. Staphylococcus aureus RNAIII coordinately represses the synthesis of virulence factors and the transcription regulator Rot by an antisense mechanism. / Boisset S, Geissmann T, Huntzinger E, Fechter P, Bendridi N, et al. // Genes Dev. – 2007. – V. 21 – P. 1353–1366
Boles, B. R. Vibrio parahaemolyticus scrABC,a novel operon affecting swarming and capsular polysaccharide regulation. / Boles B. R., L. L. McCarter. // J. Bacteriol. – 2002. – V. 184. – P. 5946–5954
Bredenbruch Florian. Biosynthetic Pathway of Pseudomonas aeruginosa 4-Hydroxy-2-Alkylquinolines. / Florian Bredenbruch, Manfred Nimtz, Victor Wray, Michael Morr, Rolf Müller, Susanne Häussler. // Journal of Bacteriology. – 2005. – V. 187. – P. 3630-3635.
Brown Sam P. Cooperation in the dark: signalling and collective action in quorum-sensing bacteria. / Sam P. Brown, Rufus A. Johnstone. //Proc. R. Soc. Lond. B. – 2001. – V. 268. – P. 961-965.
Burke, Y. D. Inhibition of pancreatic cancer growth by the dietary isoprenoids farnesol and geraniol. / Burke Y. D., M. J. Stark S. L. Roach, S. E. Sen, P. L. Crowell. // Lipids. – 1997. – V. 32. – P. 151–156.
Cai S. J. Spontaneous subunit exchange and biochemical evidence for trans-autophosphorylation in a dimer of Escherichia coli histidine kinase (EnvZ). / Cai S. J., Inouye M. // J. Mol. Biol. – 2003. – V.329. – P. 495–503
Camilli A.Bacterial small-molecule signaling pathways. / Camilli A, Bassler B L. // Science. – 2006. – V. 311. – P. 1113-1116.
Cao, Jie-Gang Purification and structural identification of an autoinducer for the luminescence system of Vibrio harveyi. / Cao Jie-Gang, Meighen Edward A. // Journal of Biological Chemistry. – 1989. – V. 264. – P. 21670–21676
Chang A. L. Phosphodiesterase A1, a regulator of cellulose synthesis in Acetobacter xylinum, is a heme-based sensor. / Chang A. L., Tuckerman J. R., Gonzalez G., Mayer R., Weinhouse H., Volman G., Amikam D., Benziman M., Gilles-Gonzalez M. A. // Biochemistry. – 2001. – V. 40. – P. 3420–3426.
Cheung A. L. 2004. Regulation of virulence determinants in vitro and in vivo in Staphylococcus aureus. / Cheung A. L., Bayer A. S., Zhang G. , Gresham H., Xiong Y. Q. // FEMS Immunol. Med. Microbiol. – 2004. V. 40. – P.1–9
Chhabra S. R. Autoregulation of carbapenem biosynthesis in Erwinia carotovora by analogs of N-(3-oxohexanoyl)-L-homoserine lactone. / Chhabra, S. R., P. Stead, N. J. Bainton, et al. // J. Antibiot. – 1993. – V. 46 – P. 441-454.
Chugani S. A. QscR, a modulator of quorum-sensing signal synthesis and virulence in Pseudomonas aeruginosa. / Chugani S. A., M. Whiteley K. M. Lee, et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2001. – V. 98. – P. 2752-2757.
Cotter P. A. С-di-GMP-mediated regulation of virulence and biofilm formation. / Cotter P. A., Stibitz S. // Curr. Opin. Microbiol. – 2007. – V. 10. – P. 17-23.
Deziel E. Analysis of Pseudomonas aeruginosa 4-hydroxy-2-alkylquinolines (HAQs) reveals a role for 4-hydroxy-2-heptylquinoline in cell-to-cell communication. / Deziel E, Lepine F, Milot S, et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 2004. – V. 101. – P. 1339-1344.
Diep D. B. Inducible bacteriocin production in Lactobacillus is regulated by differential expression of the pln operons and by two antagonizing response regulators, the activity of which is enhanced upon phosphorylation. / Diep D. B., Myhre R., Johnsborg O., Aakra A., Nes I. F. // Mol. Microbiol. – 2003. – V. 47. – P. 483–494
Diggle Stephen P. The Pseudomonas aeruginosa 4-Quinolone Signal Molecules HHQ and PQS Play Multifunctional Roles in Quorum Sensing and Iron Entrapment. / Stephen P. Diggle, Sandra Matthijs, Victoria J. Wright, et al. // Chemistry & Biology. – 2006 – V. 14. – P. 87-96.
Diggle S. P. Advancing the quorum in Pseudomonas aeruginosa: MvaT and the regulation of N-acylhomoserine lactone production and virulence gene expression. / Diggle, S. P., K. Winzer, A. Lazdunski, P. Williams, M. Camara. // Journal of Bacteriology. – 2002. – V. 184. – № 10. – P. 2576–2586.
Eefjan Breukink . Lipid II as a target for antibiotics. / Eefjan Breukink, Ben de Kruijff. // Nature Reviews Drug Discovery. – 2006. – V. 5. – P. 321-323
Ferreira R. B. R Vibrio parahaemolyticus ScrC modulates cyclic dimeric GMP regulation of gene expression relevant to growth on surfaces. / Ferreira R. B. R., Antunes L. C. M., Greenberg E. P., McCarter L. L. // J. Bacteriol. – 2008. – V. 190. –P. 851-860.
Fitnat H. Yildiz. Cyclic Dimeric GMP Signaling and Regulation of Surface-Associated Developmental Programs / Fitnat H. Yildiz. // J. Bacteriol. – 2008. – V. 190. – P. 781–783.
Fujii Toshio. Two Homologous Agr-Like Quorum-Sensing Systems Cooperatively Control Adherence, Cell Morphology, and Cell Viability Properties in Lactobacillus plantarum WCFS1. / Toshio Fujii, Colin Ingham, Jiro Nakayama, et al. // Journal of bacteriology. – 2008. – V. 190. – № 23. – P. 7655-7665.
Galperin M. Y. Novel domains of the prokaryotic two-component signal transduction systems. / Galperin M. Y., Nikolskaya A. N., Koonin E. V. // FEMS Microbiol Lett. – 2001. – V. 203. – P. 11–21.
Geisinger E. Inhibition of rot translation by RNAIII, a key feature of agr function. / Geisinger E, Adhikari R, Jin R, Ross H, Novick R. // Mol. Microbiol. – 2006. – V. 61. – P. 1038–1048
Givskov M. Eukaryotic interference with homoserine lactone-mediated prokaryotic signalling. / Givskov M., de Nys R., Manefield M., et al. // Journal of Bacteriology. – 1996. – V.178. – P. 6618-6622.
Grebe T. W. The histidine protein kinase superfamily. / Grebe T. W., Stock J. B. // Adv. Microb. Physiol. – 1999. – V. 41. – P. 139–227
Hecht G. B. Identification of a novel response regulator required for the swarmer-to-stalked-cell transition in Caulobacter crescentus. / Hecht G. B., Newton A. // J. Bacteriol. – V. 177. – P. 6223–6229.
Hiroaki Sugay. Smithy Molecular mechanisms of bacterial quorum sensing as a new drug target. / Hiroaki Sugay, Kristina M Smithy. // Current Opinion in Chemical Biology. – 2003. – V. 7. – P. 586-591.
Hoa Ngo T. The Bacillus subtilis Signaling Protein SpoIVB Defines a New Family of Serine Peptidases. / Ngo T. Hoa, James A. Brannigan, Simon M. Cutting // Journal of Bacteriology. – 2002. – V. 184. – № 1. – P. 191-199.
Hoang Tung T. b-Ketoacyl acyl carrier protein reductase (FabG) activity of the fatty acid biosynthetic pathway is a determining factor of 3-oxo-homoserine lactone acyl chain lengths. / Tung T. Hoang,. Sarah A. Sullivan,. John K. Cusick and Herbert P. Schweizer. // Mcrobiology. – 2002. – V. 148. – P. 3849-3856.
Hooi Doreen S. W. Differential Immune Modulatory Activity of Pseudomonas aeruginosa Quorum-Sensing Signal Molecules. / Doreen S. W. Hooi, Barrie W. Bycroft, Siri Ram Chhabra, et al. // Infection and immunity. – 2004. – V. 72. – № 11. – P. 6463-6470.
Huang L.L. Utilization of acyl-homoserine lactone quorum signals for growth by a soil pseudomonas and Pseudomonas aeruginosa PA01. / Huang L.L., Han J. I., Zhang L. H., Leadbetter J. R. // Applied and Environmental Microbiology. – V. 69. – P. 5941-5949.
Janzon L. The role of the delta-lysin gene (hld) in the regulation of virulence genes by the accessory gene regulator (agr) in Staphylococcus aureus. / Janzon L, Arvidson S. // EMBO J. – 1990. – V. 9. – P. 1391–1399
Jenal U. Mechanisms of cyclic-di-GMP signaling in bacteria. / Jenal U., Malone J. // Annu. Rev. Genet. – 2006. – V. 40. – P. 385-407.
Kadurugamuwa J.L. Natural release of virulence factors in membrane vesicles by Pseudomonas aeruginosa and the effect of aminoglycoside antibiotics on their release / Kadurugamuwa J.L, Beveridge T.J. // J. Antimicrob. Chemother. – 1997. – V. 40. – P. 615-621.
Kavanaugh J. S. A role for type I signal peptidase in Staphylococcus aureus quorum sensing. / Kavanaugh J. S., Thoendel M., Horswill A. R. // Mol. Microbiol. – 2007. – V. 65. – P. 780–798
Kim Y. K. ScrG, a GGDEF-EAL protein, participates in regulating swarming and sticking in Vibrio parahaemolyticus. / Kim Y. K., L. L. McCarter. // J. Bacteriol. – 2007. – V. 189. – P. 4094–4107.
Kimura S. Localization of c-di-GMP-binding protein with the linear terminal complexes of Acetobacter xylinum. / Kimura S., Chen H. P., Saxena I. M., Brown R. M. Jr, Itoh T. // J. Bacteriol. – 2001. – V.183. – P. 5668–5674.
Koenig R. L. Staphylococcus aureus AgrA binding to the RNAIII-agr regulatory region. / Koenig R. L., Ray J. L., Maleki S. J., Smeltzer M. S., Hurlburt B. K. // J. Bacteriol. – 2004. – V. 186. – P. 7549–7555
Kuchm S. L. BifA, a cyclic-di-GMP phosphodiesterase, inversely regulates biofilm formation and swarming motility by Pseudomonas aeruginosa PA14 / Kuchm S. L., Brothers K. Merritt M., J. H., Liberati N. T., Ausubel F. M., O’Toole G. A.// J. Bacteriol. – 2007. – V. 189. – P. 8165-8178.
Lars E. P. Dietrich. The phenazine pyocyanin is a terminal signaling factor in the quorum sensing network of Pseudomonas aeruginosa / Lars E. P. Dietrich, Alexa Price-Whelan, Ashley Petersen, Marvin Whiteley, Dianne K. Newman. // Molecular Microbiology. – 2006. – V. 61. – P. 1308–132
Lina G. Transmembrane topology and histidine protein kinase activity of AgrC, the agr signal receptor in Staphylococcus aureus. / Lina G., Jarraud S., Ji G., Greenland T., Pedraza A., et al. // Mol.Microbiol. – 1998. – V. 28. – P. 655–662,
Masahiro Okada. Structure of the Bacillus subtilis quorum-sensing peptide pheromone ComX. / Masahiro Okada, Isao Sato, Soo Jeong Cho, Hidehisa Iwata, Toshihiko Nishio, David Dubnau, Youji Sakagami. // Nature Chemical Biology. – 2005. – V. 1. – P. 23 - 24
Mayville P. Structure-activity analysis of synthetic autoinducing thiolactone peptides from Staphylococcus aureus responsible for virulence. / Mayville P., Ji G., Beavis R., Yang H., Goger M., et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 1999. – V. 96. – P. 1218–1223
McKnight, S. L. The Pseudomonas quinolone signal regulates rhl quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa. / McKnight, S. L., B. H. Iglewski, E. C. Pesci. // Journal of Bacteriology. – 2000. – V. 182. – P. 2702–2708.
Michiel Kleerebezem. Quorum sensing by peptide pheromones and two-component signal-transduction systems in Gram-positive bacteria. / Michiel Kleerebezem, Luis E. N. Quadri, Oscar P. Kuipers, Willem M. de Vos. // Mololecular Microbiology. – 1997. – V. 24. – P. 895-904
More M.I. Enzymatic synthesis of a quorum-sensing autoinducer through use of defined substrates. / More M.I., Finger D.L., Stryker J.L, et al. // Science. – 1996. – V. 272. – P. 1655-1658.
Morfeldt E. Activation of alpha-toxin translation in Staphylococcus aureus by the trans-encoded antisense RNA, RNAIII. / Morfeldt E, Taylor D, von Gabain A, Arvidson S. // EMBO J. – 1995. – V. 14. – P. 4569–4577
Morfeldt E. Transcriptional control of the agr-dependent virulence gene regulator, RNAIII, in Staphylococcus aureus. / Morfeldt E, Tegmark K, Arvidson S. // Mol. Microbiol. – 1996. – V. 21. P. 1227–1237
Nealson, K.H., Platt T., Hastings J.W. CeIlular control of the synthesis and activity of the bacterial luminescence system. / Nealson, K..H.,Platt, T., Hastings, J.W. // Journal of Bacteriology. – 1970. – V. 104. – P. 313-322.
Novick R. P. Synthesis of staphylococcal virulence factors is controlled by a regulatory RNA molecule. / Novick R. P., Ross H. F., Projan S. J., Kornblum J., Kreiswirth B., Moghazeh S. // EMBO J. – 1993. – V. 12. – P. 3967–3975
Parsek M. R. Acyl homoserine-Iactone quorum-sensing signal generation. / Parsek M.R., VaI D.L., Hanzelka B.L., et al // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 1999. –V. 96. – P. 4360-4365.
Pearson J. P. Early Activation of Quorum Sensing. / James P. Pearson. // Journal of Bacteriology. – 2002. – V. 184. – № 10. – P. 2569-2571.
Pei J. GGDEF domain is homologous to adenylyl cyclase. / Pei J., Grishin N. V. // Proteins. – 2001. – V. 42. – P. 210–216
Pesci E. C. The chain of command in Pseudomonas aeruginosa quorum sensing. / Pesci, E. C., B. H. Iglewski. // Trends Microbiol. – 1997. – Vol. 5. – P. 132-134.
Pessi G. The global posttranscriptional regulator RsmA modulates production of virulence determinants and N-acylhomoserine lactones in Pseudomonas aeruginosa. / Pessi G., F. Williams, Z. Hindle, et al. // Journal of bacteriology. – 2001. – V. 183. – P. 6676–6683.
Price-Whelan A. Rethinking ‘secondary’ metabolism: physiological roles for phenazine antibiotics. / Price-Whelan A., Dietrich L. E., Newman, D. K. // Nat Chem Biol. – 2006. – V. 2. –P. 71–78.
Qiu R, Pei W, Zhang L, Lin J, Ji G. 2005. Identification of the putative staphylococcal AgrB catalytic residues involving the proteolytic cleavage of AgrD to generate autoinducing peptide. / Qiu R, Pei W, Zhang L, Lin J, Ji G. // J. Biol. Chem. – 2005. – V. 280. – P. 16695–16704
Rechtin T. M. Characterization of the SarA virulence gene regulator of Staphylococcus aureus. / Rechtin T. M., Gillaspy A. F., Schumacher M. A., Brennan R. G., Smeltzer M. S., Hurlburt B. K. // Mol. Microbiol. – 1999. – V. 33. – P. 307–316
Reverchon S. New syntheticanalogues of N-acyl homoserine lactones as agonists or antagonistsof transcriptionalregulators involved in bacterial quorum sensing. / Reverchon S., Chantegrel R, Deshayes C., et al. // Bioorg. Med. Chem. Lett. – 2002. – V. 12. – P. 1153-1157.
Richard P. Novick Quorum Sensing in Staphylococci. / Richard P. Novick, Edward Geisinge. // Annu. Rev. Genet. – 2008. – V. 42. – P. 541-564
Risoen P. A. Functional analysis of promoters involved in quorum sensing-based regulation of bacteriocin production in Lactobacillus. / Risoen P. A., Brurberg M. B., Eijsink V. G., Nes I. F. // Mol. Microbiol. – 2000. – V. 37. – P. 619–628
Römling U. C-di-GMP: the dawning of a novel bacterial signalling system / Römling U., Gomelsky M., Galperin M. Y. // Molecular Microbiology. – 2005. – V. 57, № 3. – P. 629-639.
Ross P. Cellulose biosynthesis and function in bacteria. / Ross P., Mayer R., Benziman M. // Microbiol Rev. – 1991. – V. 55. – P. 35–58
Ross P. Regulation of cellulose synthesis in Acetobacter xylinum by cyclic diguanylic acid. / Ross P., Weinhouse H., Alon Y., Michaeli D., Weinberger-Ohana P., Mayer R., Braun S., de Vroom E., van der Marel G. A., van Boom J. H., Benziman M. // Nature. – 1987. – V. 325. – P. 279-281.
Said-Salim B. Global regulation of Staphylococcus aureus genes by Rot. / Said-Salim B., Dunman P. M., McAleese F. M., Macapagal D., Murphy E., et al. // J. Bacteriol. – 2003. – V. 185. – P. 610–619
Sato T. Farnesol, a morphogenetic autoregulatory substance in the dimorphic fungus Candida albicans, inhibits hyphae growth through suppression of a mitogen-activated protein kinase cascade. / Sato T., T. Watanabe, T. Mikami, T. Matsumoto. // Biol. Pharm. Bull. – 2004. – V. 27. – P. 751–752
Shiner Erin K. Interkingdom signaling: Deciphering the language of acyl-homoserine lactones / Erin K. Shiner, Kendra P. Rumbaugh, Simon C. Williams. // FEMS Microbiology Reviews. – 2005. – V. 29. – P. 935-947.
Sio Charles F. Quorum Quenching by an N-Acyl-Homoserine Lactone Acylase from Pseudomonas aeruginosa PA01. / Charles F. Sio, Linda G. Otten, Robbert H. Cool, et al. // Infection and Immunity. – 2006. – V. 74. – № 3. – P. 1673-1682.
Sun Jibin Sun. Is autoinducer-2 a universal signal for interspecies communication: a comparative genomic and phylogenetic analysis of the synthesis and signal transduction pathways. / Jibin Sun, Rolf Daniel, Irene Wagner-Döbler, An-Ping Zeng. // BMC Evolutionary Biology. – 2004. – V. 4. – P. 1-11.
Syvitski Raymond T. Structure-Activity Analysis of Quorum-Sensing Signaling Peptides from Streptococcus mutans. /Raymond T. Syvitski, Xiao-Lin Tian, Kamal Sampara, et al. // Journal of Bacteriology. – 2007. – V. 189. – № 4. – P. 1441-1450.
Taga M. E. The LuxS-dependent autoinducer AI-2 controls the expression of an ABC transporter that functions in AI-2 uptake in Salmonella typhimurium. / Taga M. E., Semmelhack J. L., Bassler B. L. // Mol Microbiol. – 2001. – V. 42. – P. 777-793.
Tal R. Three cdg operons control cellular turnover of cyclic di-GMP in Acetobacter xylinum: genetic organization and occurrence of conserved domains in isoenzymes. / Tal R., Wong H. C., CalhoonR. // J. Bacteriol. – 1998. – V. 180. – P. 4416–4425.
Tarutina M. An unorthodox bacteriophytochrome from Rhodobacter sphaeroides involved in turnover of the second messenger c-di-GMP. / Tarutina M., D. A. Ryjenkov, M. Gomelsky. // J. Biol. Chem. – 2006. – V. 281. – P. 34751–34758
Tegmark K. Regulation of agr-dependent virulence genes in Staphylococcus aureus by RNAIII from coagulase-negative staphylococci. / Tegmark K., Morfeldt E., Arvidson S. // J. Bacteriol. – V. 180. – P.3181–3186
van Delden C. Stringent response activates quorum sensing and modulates cell density-dependent gene expression in Pseudomonas aeruginosa. / van Delden, C., R. Comte, and A. M. Bally. // Journal of Bacteriology. – 2001. – V. 183. – P. 5376–5384.
Wegele R. The Heme Oxygenase(s)-Phytochrome System of Pseudomonas aeruginosa. / R. Wegele, R. Tasler, Y. Zeng, M. Rivera, N. Frankenberg-Dinkel // J. Biol. Chem. – 2004. – V. 279. – P. 45791-45802
Whiteley M. Regulation of quorum sensing by RpoS in Pseudomonas aeruginosa. / Whiteley M, Parsek M. R., Greenberg E. P. // Journal of bacteriology. – 2000. – V. 182. – P. 4356-4360.
Winson Michael K. Multiple N-acyl-L-homoserine lactone signal molecules regulate production of virulence determinants and secondary metabolites in Pseudomonas aeruginosa (autoinducers/quorum sensing/gene regulation) / Michael K. Winson, Miguel Camara, Amel Layifi, et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. – 1995. – V. 92. – P. 9427-9431
Winzer K. Quorum sensing and the regulation of virulence gene expression in pathogenic bacteria. / Winzer, K., P. Williams. // Int. J. Med. Microbiol. – 2001. – V. 291. – P. 131-143.
Wright J. S. III. Hydrophobic interactions drive ligand-receptor recognition for activation and inhibition of staphylococcal quorum sensing. / Wright J. S. III, Lyon G. J. , George E. A., Muir T. W., Novick R. P. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA - 2004. – V.101. – P. 16168–16173
Xavier K.B., Bassler B.L. LuxS quorum sensing: more than just a numbers game. / Xavier K.B., Bassler B.L. // Curr.Opin. Microbiol. – 2003. – V. 6. – P. 191-197.
Zhang L. Identification of a staphylococcal AgrB segment(s) responsible for group-specific processing of AgrD by gene swapping. / Zhang L., Ji G. // J. Bacteriol. – 2004. – V.186. – P. 6706–6713