- •ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ БЕЛКА
- •ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •БЕЛКИ – БИОПОЛИМЕРЫ, МОНОМЕРАМИ КОТОРЫХ ЯВЛЯЮТСЯ АМИНОКИСЛОТЫ.
- •АМИНОКИСЛОТЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ БЕЛКА
- •АМИНОКИСЛОТЫ, ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ БЕЛКА
- •ОБРАЗОВАНИЕ ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИ
- •ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •ОДИНАРНАЯ СВЯЗЬ
- •ПЛОСКАЯ ФОРМА ПЕПТИДНОЙ ГРУППЫ
- •ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ -ЭЛЕКТРОНОВ В
- •ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ -ЭЛЕКТРОНОВ
- •ПРИ ДЕЛОКАЛИЗАЦИИ ЭНЕРГИЯ ЭЛЕКТРОНОВ
- •ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ
- •ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ В ПЕПТИДНОЙ ГРУППЕ
- •ВАЛЕНТНЫЕ УГЛЫ СОСТАВЛЯЮТ ОКОЛО
- •ПРИ КОМНАТНОЙ ТЕМПЕРАТУРЕ ВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ
- •ГИБКОСТЬ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ, А, ЗНАЧИТ, И ЕЕ СПОСОБНОСТЬ ОБРАЗОВЫВАТЬ СПИРАЛИ И ГЛОБУЛЫ ОБЕСПЕЧИВАЕТ
- •Отсчет величины угла поворота:
- •ПОВОРОТ ВОКРУГ СВЯЗИ С-N (УГОЛ ) МАЛОВЕРОЯТЕН ИЗ-ЗА ЕЕ ЧАСТИЧНО ДВОЙНОГО ХАРАКТЕРА.
- •ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •ГЛОБУЛА
- •НАИБОЛЕЕ ВАЖНЫМИ ДЛЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА ЯВЛЯЮТСЯ ВОДОРОДНЫЕ
- •ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ В БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЕ
- •ПРАВЫЕ
- •Правая -спираль.
- •Водородные связи в спирали
- •ПАРАМЕТРЫ -СПИРАЛИ
- •ПОСТУЛАТЫ ПОЛИНГА –
- •Некоторые остатки аминокислот могут нарушать формирование -спирали.
- •участки, где последовательно расположены несколько одинаково заряженных радикалов, между которыми возникают электростатические силы
- •-складчатые структуры
- •-складчатые
- •АНТИПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ И ПАРАЛЛЕЛЬНЫЕ -СКЛАДЧАТЫЕ СТРУКТУРЫ
- •-СКЛАДЧАТАЯ СТРУКТУРА
- •ИМЕЮТСЯ СПИРАЛИ И БЕЗ ВОДОРОДНЫХ СВЯЗЕЙ,
- •Нерегулярные вторичные структуры
- •ДРУГИЕ СПИРАЛЬНЫЕ КОНФОРМАЦИИ
- •СВЕРХВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ
- •СВЕРХВТОРИЧНЫЕ СТРУКТУРЫ –
- •1.Белки, в структуре которых обнаружены только -спирали.
- •Примеры суперспиралей
- •СУПЕРСПИРАЛЬ, СОСТОЯЩАЯ ИЗ НЕСКОЛЬКИХ -СПИРАЛЕЙ
- •Взаимодействие -спиралей в двойной (а) и тройной (б) суперспирали (вид с торца спирали).
- •2. Белки с -спиралями и -структурами
- •3. Белки, имеющие только -структуры.
- •4.Белки, имеющие в своём составе лишь незначительное количество регулярных вторичных структур.
ПЛОСКАЯ ФОРМА ПЕПТИДНОЙ ГРУППЫ
ОБЕСПЕЧИВАЕТСЯ SP2- ГИБРИДИЗАЦИЕЙ ЭЛЕКТРОНОВ N И C
SP2- ОРБИТЫ ВОВЛЕКАЮТ АТОМ В ТРИ КОВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ, ЛЕЖАЩИЕ В ОДНОЙ ПЛОСКОСТИ
ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ -ЭЛЕКТРОНОВ В
ПЕПТИДНОЙ СВЯЗИ
ЭЛЕКТРОНЫ АТОМОВ С И
N СОЗДАЮТ
«ДЕЛОКАЛИЗОВАННОЕ »
ЭЛЕКТРОННОЕ ОБЛАКО, КОТОРОЕ ОХВАТЫВАЕТ ОБА ЭТИ АТОМА И РАСПРОСТРАНЯЮЩЕЕСЯ
НА АТОМ О ЧЕРЕЗ СВЯЗЬ
С=О.
ОБОБЩЕСТВЛЕННЫЕ
ЭЛЕКТРОНЫ
ПРЕПЯТСТВУЮТ
ВРАЩЕНИЮ ВОКРУГ C-N СВЯЗИ
ДЕЛОКАЛИЗАЦИЯ -ЭЛЕКТРОНОВ
ПРИ ДЕЛОКАЛИЗАЦИИ ЭНЕРГИЯ ЭЛЕКТРОНОВ
ПАДАЕТ И ОНИ ПЕРЕХОДЯТ В БОЛЕЕ
СТАБИЛЬНОЕ СОСТОЯНИЕ
ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ
N – C (ПЕПТИДНАЯ СВЯЗЬ) 0,132
N – C (ОДИНОЧНАЯ) |
0,147 |
N = C (ДВОЙНАЯ) |
0,125 |
0,147 < 0,132 < 0,125
НМ
НМ
НМ
ПЕПТИДНАЯ СВЯЗЬ ЗАНИМАЕТ ПРОМЕЖУТОЧНОЕ ПОЛОЖЕНИЕ
ДЛИНЫ СВЯЗЕЙ В ПЕПТИДНОЙ ГРУППЕ
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,132 нм |
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
0,147 нм |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N+ |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
С |
|
|
|
:N |
|
|
|
|
С |
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0,124 нм |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
0,121 нм |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O- |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ВАЛЕНТНЫЕ УГЛЫ СОСТАВЛЯЮТ ОКОЛО
120о И 109о
120о - ПРИ SP2-ГИБРИДИЗИРОВАННЫХ
ОРБИТАЛЯХ -С<, -N<, ГДЕ ТРИ СВЯЗИ НАПРАВЛЕНЫ ИЗ ЦЕНТРА К ВЕРШИНАМ ПЛОСКОГО ТРЕУГОЛЬНИКА
109о - ПРИ SP3-ГИБРИДИЗИРОВАННЫХ
АТОМАХ >С < , ГДЕ ЧЕТЫРЕ СВЯЗИ НАПРАВЛЕНЫ ИЗ ЦЕНТРА К ВЕРШИНАМ ТЕТРАЭДРА.
ПРИ КОМНАТНОЙ ТЕМПЕРАТУРЕ ВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ
НЕ ФЛУКТУИРУЮТ:
ЧАСТОТА КОЛЕБАНИЙ ЭТИХ СВЯЗЕЙ 2х1013 сек –1
ЧАСТОТА ТЕПЛОВЫХ КОЛЕБАНИЙ 7х1012 сек –1
АМПЛИТУДА ТЕПЛОВЫХ КОЛЕБАНИЙ ВАЛЕНТНЫХ УГЛОВ НЕВЕЛИКА И СОСТАВЛЯЕТ ОКОЛО 5о.
ТАКИМ ОБРАЗОМ, ГИБКОСТЬ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ ОБЕСПЕЧИВАЕТСЯ ДРУГИМИ ФАКТОРАМИ.
ГИБКОСТЬ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПИ, А, ЗНАЧИТ, И ЕЕ СПОСОБНОСТЬ ОБРАЗОВЫВАТЬ СПИРАЛИ И ГЛОБУЛЫ ОБЕСПЕЧИВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ ВАЛЕНТНЫХ СВЯЗЕЙ.
Отсчет величины угла поворота:
вид поперек (слева) и вдоль (справа) оси вращения.
Дальняя от нас валентная связь 0''— c — "ось координатного круга",
центральная связь 0'— 0'' — "ось вращения",
ближняя к нам связь 0'— a — "стрелка на координатном круге".
УГОЛ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ N – C
УГОЛ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ C – C
УГОЛ ОПИСЫВАЕТ ВРАЩЕНИЕ ВОКРУГ СВЯЗИ C - N
- УГОЛ ВРАЩЕНИЯ В БОКОВОЙ ЦЕПИ