СтрБ3_4

Функциональные домены

Домены в структуре протеолитического фермента папайи - папаина

Прерывистыми линиями намечено направление впадины между двумя доменами, в которой связывается субстрат и размещен каталитический центр. S-S- связи заштрихованы.

Несколько определений!

•Конфигурация полимера – это такое расположение атомов в полимерной молекуле, изменить которое можно только разорвав ковалентные связи;

•Конформация – такое расположение

полимерной молекулы в пространстве, которое обусловлено вращением атомов или групп атомов вокруг ковалентной связи;

• Конформационная лабильность белков: – это

способность белков к небольшим изменениям конформации за счет разрыва одних и образования других слабых связей;

• Кооперативность мономеров в полимере: если в

одном участке полимера происходит изменение пространственного расположения атомов, то это приводит к изменению пространственного расположения атомов и во всех других участках полимерной молекулы

ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА –

расположение в пространстве всей полипептидной цепи, отдельные участки которой имеют локальную конформацию, т.е. сохраняют α-спиральную или β- структурную форму

ПРИЧИНЫ ФОРМИРОВАНИЯ ТРЕТИЧНОЙ СТРУКТУРЫ БЕЛКА

•Влияние окружающей среды

•Взаимодействия между радикалами

аминокислот, расположенных рядом друг с другом

•Повороты полипептидной цепи в местах

расположения пролина

СВЯЗИ, СТАБИЛИЗИРУЮЩИЕ ТРЕТИЧНУЮ СТРУКТУРУ (взаимодействие между радикалами аминокислот)

•Гидрофобные – определяющие (главные) взаимодействия!

•Ионные

•Электростатические

•Дисульфидные

•Водородные

Третичная структура обеспечивает

проявление белком функциональной активности

ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА – объединение нескольких полипептидных цепей, имеющих третичную структуру, приводящее к

возникновению молекулы с новыми функциональными свойствами

Подобные белки называются олигомерными, а составляющие их индивидуальные полипептидные цепи — протомерами или субъединицами.

2 субъединицы — димеры

4 субъединицы — тетрамеры > 4 субъединиц — олигомеры

Связи, стабилизирующие четвертичную структуру:

•Водородные

•Электростатические

Но!!! Не дисульфидные и не пептидные

ПРЕИМУЩЕСТВА белков с четвертичной структурой

1.Экономия генетического материала

2.Уменьшение числа ошибок при синтезе белка

3.Качественное разнообразие белков. Кооперативный эффект субъединиц.