- •2. Вводная часть
- •2.1. Цель и задачи освоения дисциплины
- •2.2. Место учебной дисциплины в структуре ооп академии
- •2.3. Требования к результатам освоения учебной дисциплины «Микробиология»
- •3. Основная часть
- •3.1.1. Объем учебной дисциплины «Микробиология» и виды учебной работы
- •3.2.1. Разделы учебной дисциплины и компетенции, которые должны быть освоены при их изучении
- •3.2.2. Разделы учебной дисциплины «Микробиология», виды учебной деятельности и формы контроля
- •3.2.3. Название тем лекций и количество часов по семестрам изучения учебной дисциплины
- •3.2.4. Лабораторный практикум
- •3.3. Самостоятельная работа студентов
- •3.3.1. Виды срс
- •3.4. Оценочные средства для контроля успеваемости и результатов освоения учебной дисциплины
- •3.4.1. Виды контроля и аттестации, формы оценочных средств
- •3.4.2. Примеры оценочных средств
- •3.5. Учебно-методическое и информационное обеспечение учебной дисциплины
- •3.5.1. Основная литература
- •3.5.2. Дополнительная литература
- •3.6. Материально-техническое обеспечение учебной дисциплины
- •3.7. Образовательные технологии
- •3.8. Разделы учебной дисциплины и междисциплинарные связи с последующими дисциплинами
- •4.Методические рекомендации по организации изучения дисциплины:
3. Основная часть
3.1.1. Объем учебной дисциплины «Микробиология» и виды учебной работы
Вид учебной работы |
Всего часов/ зачетных единиц |
Семестры |
||
№ 2 |
№ 3 |
|||
часов |
часов |
|||
1 |
2 |
3 |
4 |
|
Аудиторные занятия (всего), в том числе: |
120 |
60 |
60 |
|
Лекции (Л) |
36 |
18 |
18 |
|
Лабораторные работы (ЛР) |
84 |
42 |
42 |
|
Самостоятельная работа студента (СРС), в том числе |
60 |
30 |
30 |
|
Подготовка к занятиям (ЛР) |
20 |
10 |
10 |
|
Подготовка к текущему контролю (ПТК) |
20 |
10 |
10 |
|
Подготовка к промежуточному контролю (ППК) |
20 |
10 |
10 |
|
Вид промежуточной аттестации (экзамен) |
|
|
36 |
|
ИТОГО: Общая трудоемкость |
Час. |
216 |
|
|
Зач.ед. |
6 |
|
|
3.2.1. Разделы учебной дисциплины и компетенции, которые должны быть освоены при их изучении
п/ № |
№ компе- тенции |
Наименование раздела учебной дисциплины |
Содержание раздела в дидактических единицах (темы разделов) |
1 |
ОК-1, ОК-2, ПК-48, ПК-49 |
Общая микробиология. Морфология и физиология микробов |
Положение микробов в системе живого мира. Прокариоты (бактерии), их отличия от микробов-эукариотов (простейшие, грибы). Неклеточные формы микробов (вирусы, вироиды, прионы). Таксономические и внутривидовые категории: биовар, серовар, фаговар. Бинарная номенклатура. Современные классификации бактерий, грибов, простейших и вирусов человека. Морфология бактерий, грибов, простейших и вирусов (в т.ч. бактериофагов). Основные структуры, химический состав и функциональное значение отдельных структурных компонентов. Основные методы исследования морфологии микробов. Особенности метаболизма бактерий: интенсивность обмена веществ, разнообразие типов метаболизма, метаболическая пластичность. Роль бактерий в круговороте веществ в природе. Питание бактерий. Транспорт веществ в бактериальную клетку: энергонезависимый и энергозависимый. Особенности биосинтеза белков, нуклеиновых кислот, углеводов, липидов бактериальной клеткой. Классификация бактерий по типам питания. Понятие об аутотрофах, гетеротрофах, сапрофитах, абсолютных и факультативных паразитах, прототрофах, ауксотрофах. Требования, предъявляемые к питательным средам. Классификация питательных сред: основные (простые), специальные, дифференциально-диагностические, элективные. Рост и размножение бактерий. Влияние температуры на размножение бактерий. Понятие о мезофилах, термофилах, психрофилах. Механизм и скорость размножения микробов в жидкой питательной среде в стационарных условиях. Колонии, особенности их формирования у различных видов бактерий. Пигменты бактерий. Ферменты бактерий. Классы ферментов. Экзо- и эндоферменты, их значение в метаболизме клетки. Конститутивные и индуцибельные ферменты. Методы изучения ферментативной активности бактерий и использование ее для идентификации бактерий. Классификация бактерий по способам получения энергии. Понятие о фототрофах, хемолито- и хемоорганотрофах. Взаимоотношение бактерий с кислородом. Строгие анаэробы, микроаэрофилы, факультативные анаэробы, строгие аэробы, аэротолерантные бактерии: защитные системы от токсического действия свободных кислородных радикалов, методы их культивирования. Бродильный метаболизм. Брожение как способ получения энергии. Продукты брожения. Их использование в диагностике и биотехнологических процессах. Принципы и методы выделения чистых культур аэробных и анаэробных бактерий. Этапы выделения чистых культур бактерий, их идентификация. Внутривидовая идентификация бактерий. Понятие о сероваре, морфоваре, биоваре, фаговаре. Особенности размножения хламидий, спирохет, актиномицет. Особенности культивирования грибов; их питание, дыхание и способы размножения. Питание, дыхание, размножение, жизненные циклы простейших; особенности их культивирования. Типы взаимодействия вируса с клеткой: продуктивный, абортивный, интегративный. Вирогения и лизогения. Репродукция вирусов. Основные стадии взаимодействия вирусов с клеткой: адсорбция, характеристика вирусных лигандов и клеточных рецепторов; проникновение в клетку, механизмы; депротеинизация; синтез вирусных макромолекул; сборка вирионов; выход из клетки, пути выхода. Модели для культивирования вирусов: клеточные культуры, эмбрионы птиц, организм лабораторных животных, их преимущества и недостатки. Классификация клеточных культур, применяемых в вирусологии. |
2 |
ОК-1, ОК-2, ПК-27, ПК-31-37.
|
Экология микробов. Нормальная микрофлора организма человека. Микрофлора лекарственных растений, лекарственного сырья и объектов окружающей среды |
Природные микробиоценозы. Экологические связи в микробиоценозах. Симбиоз, мутуализм, комменсализм, конкуренция, антагонизм, паразитизм. Микрофлора почвы, воды, воздуха. Роль микробов в круговороте веществ в природе. Источники и пути попадания паразитических микробов в почву, воду и воздух; условия и сроки выживания. Эпифитная микрофлора. Роль микробов ризосферы в жизни растений. Болезни лекарственных растений, вызываемые фитопатогенными бактериями, грибами и вирусами. Роль микрофлоры в порче растительного лекарственного сырья и лекарственных средств. Источники и пути микробного загрязнения (контаминации) растительного лекарственного сырья и готовых лекарственных средств. Нормальная микрофлора организма человека. Аутохтонная и аллохтонная микрофлора. Понятие об экотопах (стерильные и нестерильные экотопы организма). Функции нормальной микрофлоры: морфокинетическая, детоксикационная, иммуногенная, метаболическая, регуляторная, антиинфекционная. Роль в развитии эндогенных инфекций и распространении генов среди микробов. Роль колонизационной резистентности в предупреждении и развитии экзогенных и эндогенных инфекционных заболеваний. Селективная и тотальная деконтаминация. Факторы, оказывающие влияние на количественный и видовой состав микрофлоры организма человека. Понятия: эубиоз, дисбиоз и дисбактериоз; условия возникновения дизбиоза, клинические проявления, принципы микробиологической диагностики. Медицинские иммунобиологические препараты для коррекции дисбиоза (пре-, про- и синбиотики). Санитарно-бактериологическое исследовние смывов с рук аптечных работников, посуды и оборудования. Понятие о санитарно-показательных микроорганизмах. Принципы санитарно-микробиологических исследований почвы, воды, воздуха. Значение санитарно-микробиологических исследований в оценке санитарного состояния аптечных помещений, производственных цехов в соответствии с требованиями нормативных документов. |
3 |
ОК-1, ОК-2, ПК-48, ПК-49 |
Основы генетики микробов. Основы генетической инженерии и медицинской биотехнологии |
Определение генетики бактерий как науки. Организация генетического материала у бактерий. Понятие о генотипе и фенотипе. Бактериальная хромосома. Строение, размеры, особенности функционирования, отличительные особенности от хромосомы эукариотических клеток. Функции хромосомы. Принципы функционирования бактериальных генов. Плазмиды бактерий. Строение, особенности репликации. Разновидности плазмид: трансмиссивные, нетрансмиссивные, интегративные. Неинтегративные. Понятие о совместимости плазмид. Определение наличия плазмид в бактериальной клетке. Плазмидный профиль. Его применение в эпидемическом маркировании бактерий. Плазмиды вирулентности. Их значение в экспрессии факторов патогенности. Использование плазмид в генно-инженерных исследованиях. Подвижные генетические элементы: вставочные последовательности и транспозоны. Их строение. Функции подвижных генетических элементов и их роль в эволюции бактерий. Типы генетических рекомбинаций у бактерий: гомологичная, сайтспецифическая, незаконная. Применение генетических и молекулярно-биологических методов в диагностике инфекционных заболеваний: ПЦР, метод молекулярных зондов. Виды изменчивости у бактерий. Модификационная изменчивость, ее механизмы и формы проявления. Генотипическая изменчивость. Мутации у бактерий, их разновидности: спонтанные и индуцированные, точковые и хромосомные аберрации: прямые, обратные, супрессорные. Причины и механизм возникновения мутаций. Понятие о мутагенах. Механизмы передачи генетической информации у бактерий: конъюгация, трансдукция, трансформация, их использование для получения рекомбинантных штаммов бактерий с заданными свойствами и картирование бактериального генома. Принципы создания генетически модифицированных штаммов микробов и их использование в качестве вакцинных штаммов и штаммов – продуцентов биологически активных веществ. Использование достижений генетики в разработке новых лечебно-профилактических средств и диагностических препаратов. Биопрепараты, получаемые методом генной инженерии (вакцины, моноклональные антитела, гормоны, диагностикумы). |
4 |
ОК-1, ОК-2, ПК-27, ПК-31-37. |
Влияние факторов окружающей среды на жизнедеятельность микробов. Противомикробные препараты |
Действие физических факторов на микроорганизмы. Влияние температуры, высушивания, излучений, ультразвука. Механизмы повреждающего действия указанных факторов. Лиофильное высушивание. Стерилизация. Методы стерилизации, аппаратура. Контроль качества стерилизации. Стерилизация различных лекарственных средств в зависимости от их природы, формы, лабильности к физическим факторам. Влияние на микроорганизмы химических факторов (показателя кислотности среды, химических веществ разных классов: окислителей, поверхностно-активных веществ, ионов различных металлов, табельных дезинфектантов). Понятие об асептике, антисептике и дезинфекции. Антисептики и дезинфектанты. Принципы контролирования качества дезинфекции. Понятие о химиотерапии. Происхождение антибиотиков, биологическая роль в природе. Противомикробные химиотерапевтические средства, источники и способы получения; классификация по химической структуре, спектру, типам и механизмам действия. Механизмы лекарственной устойчивости бактерий. Методы определения чувствительности бактерий к противомикробным химиопрепаратам. Методы и единицы измерения антимикробной активности. Противовирусные химиотерапевтические препараты. Побочное действие антибиотиков и синтетических противомикробных лекарственных средств. |
5 |
ПК-47 |
Учение об инфекции. |
Определение понятия «инфекция», «инфекционный процесс», «инфекционная болезнь». Условия возникновения инфекционного процесса. Характерные особенности и фазы развития инфекционного процесса. Виды инфекций. Источники инфекции. Понятие об антропонозах, зоонозах, сапронозах. Понятие о механизмах (фекально-оральный, аэрогенный, кровяной, контактный) и путях передачи инфекций. Входные ворота возбудителей. Динамика развития инфекционной болезни. Эпидемиологическое значение носительства патогенных микробов. Патогенность микроорганизмов, определение. Понятие об облигатно-патогенных, условно-патогенных, непатогенных микроорганизмах. Вирулентность, определение, единицы измерения. Факторы патогенности микроорганизмов, их характеристика. Токсины бактерий. Белковые токсины, классификация основные свойства и механизм действия. Эндотоксины, химический состав, свойства, механизм действия. Патогенные свойства риккетсий, хламидий, микоплазм, грибов, простейших. Облигатный внутриклеточный паразитизм вирусов. Патогенетические особенности вирусных инфекций. |
6 |
ОК-1, ПК-31, ПК-32, ПК-47-49. |
Медицинская иммунология. Медицинские иммунобиологические препараты |
Задачи и история развития иммунологии. Основные направления современной иммунологии. Современное определение понятия «иммунитет». Виды иммунитета. Факторы врожденного иммунитета. Понятие о механических, физико-химических и биологических барьерах. Фагоцитоз. Методы определения фагоцитарной активности. Естественные киллеры. Гуморальные и клеточные факторы защиты организма. Антигены. Определение. Понятие об антигенности, иммуногенности, специфичности. Антигены микробов, их роль в инфекционном процессе и развитии иммунного ответа. Главный комплекс гистосовместимости. Иммунная система организма и ее основные функции. Клетки иммунной системы. Распознавание антигена и индукция иммунного ответа. Роль цитокинов. Формы иммунного ответа. Гуморальный и клеточный иммунный ответ. Регуляция иммунного ответа. Иммуноглобулины; классы, структурные и функциональные особенности. Антитела, свойства и функции антител, динамика антителообразования, первичный и вторичный иммунный ответ. Иммунный фагоцитоз и киллерная функция клеток. Виды иммунных реакций клеточного типа. Понятие об иммунологическом надзоре. Иммунологическая толерантность. Иммунологическая память. Понятие об аллергии. Гиперчувствительность замедленного типа. Гиперчувствительность немедленного типа. Классификация аллергических реакций по Джелу и Кумбсу. Аллергены, применение в аллергодиагностике. Особенности антибактериального, противовирусного, противогрибкового, антипротозойного, противогельминтного, противоопухолевого, трансплантационного иммунитета. Понятие об иммунном статусе человека. Принципы формирования и возрастная динамика. Факторы, влияющие на иммунный статус. Методы оценки иммунного статуса. Иммунопатология. Первичные и вторичные иммунодефициты. Недостаточность гуморального, клеточного иммунитета, комбинированные нарушения иммунитета. Роль инфекции в развитии иммунодефицитов человека. Роль факторов окружающей среды в индукции первичных и вторичных иммунодефицитов. Иммунопролиферативные заболевания. Иммунопрофилактика, иммунотерапия и иммунокоррекция. Иммуностимулирующая, иммунозаместительная, иммуносупрессивная терапия. Иммунотерапевтические препараты. Иммунологические реакции в диагностике инфекционных и неинфекционных заболеваний. Понятие о серологических реакциях. Механизм реакций антиген-антитело. Практическое использование серологических реакций: идентификация антигена, диагностическое выявление антител. Основные компоненты серологических реакций. Диагностические иммунные сыворотки, диагностикумы. Моноклональные антитела, их применение. Реакции, основанные на феномене агглютинации, преципитации, с участием комплемента, с использованием меченых антигенов и антител. Иммуноэлектронная микроскопия. Иммунобиологические препараты, их основные группы: вакцины и другие препараты микробного происхождения, иммуноглобулины и иммунные сыворотки, иммуномодуляторы, диагностические препараты, адаптогены. Современная классификация вакцин: живые (аттенуированные, дивергентные, рекомбинантные), неживые - цельноклеточные (цельновирионные), субклеточные (субвирионные), молекулярные (в том числе анатоксины), рекомбинантные, синтетические. Ассоциированные и комбинированные вакцины. Адъюванты. Аутовакцины, вакцинотерапия. Принцип и механизм действия вакцин. Препараты для серопрофилактики и серотерапии. |
7 |
ПК-47 |
Бактерии-возбудители инфекционных заболеваний человека |
Бактерии – возбудители кишечных инфекций (возбудители кишечного эшерихиоза, брюшного тифа, сальмонеллезов, шигеллеза, кишечного иерсиниоза, холеры, бруцеллеза, ботулизма, лептоспироза). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. Бактерии – возбудители респираторных инфекций (возбудители туберкулеза, дифтерии, коклюша, эпидемического цереброспинального менингита, скарлатины). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. Бактерии – возбудители контактных инфекций (возбудитель сибирской язвы; возбудители инфекций, передающихся половым путем: сифилиса, гонореи, урогенитального хламидиоза; возбудители раневых инфекций: столбняка, газовой гангрены; условно-патогенные бактерии – возбудители гнойно-воспалительных инфекций: стафилококки, стрептококки, синегнойная палочка, неспорообразующие анаэробы, протей, клебсиеллы, эшерихии). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. Бактерии – возбудители кровяных инфекций (возбудители сыпного тифа, чумы). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. |
8 |
ПК-47 |
Грибы-возбудители инфекционных заболеваний человека |
Таксономия возбудителей глубоких и поверхностных микозов и микотоксикозов; их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии (антибиотики). Дрожжеподобные грибы рода Кандида. Экология. Роль в патологии человека. Факторы, способствующие возникновению кандидоза (дисбактериоз, иммунодефициты). Принципы микробиологической диагностики. Препараты для этиотропного лечения. |
9 |
ПК-47 |
Простейшие-возбудители инфекционных заболеваний человека |
Таксономия возбудителей протозойных инфекций (токсоплазмоза, малярии, амебиаза) и их основные биологические свойства, циклы развития, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии, иммунотерапии и иммунопрофилактики. |
10 |
ПК-47 |
Вирусы-возбудители инфекционных заболеваний человека |
Вирусы – возбудители кишечных инфекций (возбудители гепатитов А и Е, полиомиелита. Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. Вирусы – возбудители респираторных инфекций (возбудители гриппа, ОРВИ, кори, краснухи, ветряной оспы, эпидемического паротита). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. Вирусы – возбудители контактных инфекций (возбудители бешенства, вирусы герпеса). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. Вирусы – возбудители кровяных инфекций (возбудители гепатитов В, С, D, G, ВИЧ-инфекции, возбудители клещевого энцефалита и других арбовирусных инфекций). Таксономия возбудителей и их основные биологические свойства, характер вызываемых заболеваний с элементами эпидемиологии и патогенеза, иммунитет, принципы микробиологической диагностики, препараты для этиотропной терапии и специфической профилактики. |
11 |
ОК-1, ОК-2, ПК-27, ПК-31-37. |
Фармацевтическая микробиология |
Источники и пути микробного загрязнения готовых лекарственных средств. Основные методы микробиологического контроля различных форм стерильных и нестерильных готовых лекарственных средств: испытание микробной чистоты нестерильных готовых лекарственных форм, испытание стерильности стерильных готовых лекарственных форм, исследование общей микробной обсемененности дистиллированной воды, используемой для приготовления инъекционных растворов в соответствии с требованиями Фармакопеи. Допустимые нормы микробной обсемененности различных форм нестерильных готовых лекарственных средств в соответствии с нормативными документами. |