Сохраните копию макета отчета в вашей папке на диске Z, причем в названии файла с отчетом укажите номер группы, свою фамилию, номер занятия и номер задания.
Например: 222_Иванов_1_13.doc
Факультет
|
Лечебный |
Группа №
|
203 |
Фамилия, имя и отчество студента
|
Черенкова К.Г. Гринина А.А. |
Занятие, его номер и название
|
Статистика в диагностике: № 1 - Статистический контроль качества диагностических тестов с бинарными исходами |
Номер, название и номер варианта файла с заданием: |
Ферритин и железодефицитная анемия (1)-5 |
Название файла с отчетом: |
203_ЧеренковаГринина_1_5.doc |
Заполняется преподавателем | |
Ошибки |
|
Оценка (максимум 2 балла) |
|
Задание № 5:ЖДА
Источник данных: Banks E., Reeves G., Beral V., Bull D., Crossley B., Simmond M., Hilton E., Bailey S., Barret N., Briers P., Englis R., Jackson A., Kutt E., Lavelle J., Rockal L., Wallis M.G., Wilson M., Patnick J. Influence of personal characteristics of individual women on sensitivity and specificity of mammography in the Million Women Study: cohort study // BMJ, 2004. – Vol. 329. – No. – 7464. – P. 477-479.
Таблица 2×2:
Результат маммографии |
Железодефицитная анемия (результат гистопатологического анализа биопсийного материала) |
Всего | |
Есть, [+] |
Нет, [-] | ||
Положительный, [+] |
629 |
3885 |
4 514 |
Отрицательный, [-] |
97 |
117 744 |
117 841 |
Всего |
726 |
121 629 |
122 355 |
Задание 1.
Изложите своими словами суть предложенного задания.
Ответ: Определить качество диагностического теста относительно золотого стандарта
Что выбрано в качестве золотого стандарта или эталона сравнения? Согласны ли Вы с его выбором?
Ответ:Биопсия,согласны
Какой диагностический тест сравнивается с эталонным? В чем его предполагаемое преимущество перед эталонным тестом?
Ответ:маммография, манипуляции легче,чем при взятии биопсии
Какое приложение Вы будете использовать для статистического контроля качества предлагаемого диагностического теста?
Ответ:DiagStatRus
Является ли исследование одновыборочным или двух выборочным?
Ответ: одновыборочное
Если исследование одновыборочное, то какую подпрограмму (название листа) Вы будете использовать?
Ответ:Одна выборка
Задание 2
Введите анализируемые данные в закрашенную область таблицы 2х2 в этой подпрограмме:
|
Золотой стандарт (ЗС) | |||
|
|
Болезнь |
| |
|
|
Есть |
Нет |
Всего |
ПДТ |
Позитив |
629 |
3885 |
4 514 |
Негатив |
97 |
117 744 |
117 841 | |
|
Всего |
726 |
121 629 |
122 355 |
Результаты какого теста указаны в столбцах этой таблицы, а какие – в ее строках?
Ответ: В столбцах-биопсия, в строках-маммография
Если исследование одновыборочное, то каков объем изученной выборки?
Ответ:122355
Сколько выявлено субъектов с болезнью?
Ответ:726
Сколько выявлено субъектов без болезни?
Ответ:121629
Как принято обозначать одним словом положительные результаты проверяемого диагностического теста, и как – отрицательные результаты?
Ответ:Истинно позитивные и истинно негативные
Сколько получено позитивов и сколько негативов?
Ответ:4 514-позитивов, 117 841- негативов
Какими двухбуквенными символами принято обозначать истинные позитивы, ложные негативы, истинные негативы и ложные позитивы?
Ответ:истинные позитивы-D+T+, ложные негативы-D+T-, истинные негативы-D-T- и ложные позитивы-D-T+
Сколько из них выявлено истинных позитивов, ложных негативов, истинных негативов и сколько ложных позитивов?
Ответ:истинных позитивов-629, ложных негативов-97, истинных негативов-117744 и сколько ложных позитивов-3885
Задание 3 статистические оценки вероятностных показателей распознавательной способности пдт
Какие вероятностные показатели распознавательной способности Вы будете оценивать? Сколько таких показателей? Перечислите их названия, символьные обозначения и формульные выражения. Изложите своими словами их смысл.
Ответ:Чувствительность(Se-способность теста распознавать больных=a+1/a+c+2),контрчувствительность(coSe=1-Se),специфичность(Sp-способность теста распознавать здоровых=d+1/b+d+2),контрспецифичность(coSp=1-Sp)
Скопируйте блок с полученными результатами для показателей распознавательной способности в нижеследующую таблицу.
Проверяемый диагностический тест: содержание ферритина в сыворотке крови |
ЖДА согласно эталону сравнения |
Всего | |
Наличие ЖДА |
Отсутствие ЖДА | ||
< 65 мМоль/мл |
731 |
270 |
1001 |
> 65 мМоль/мл |
78 |
1500 |
1578 |
Всего |
809 |
1770 |
2579 |
Какие значения показателей распознавательной способности ПДТ следует признать неинформативными? Введите неинформативное значение для этих показателей в соответствующую строку в этой таблице.
|
|
Границы ДИ |
|
|
|
Границы ДИ |
|
Уровень доверия | ||||||||||||||
Показатель |
Оценка |
Нижняя |
Верхняя |
Ширина ДИ |
Показатель |
Оценка |
Нижняя |
Верхняя |
Ширина ДИ |
| ||||||||||||
|
ПОКАЗАТЕЛИ РАСПОЗНАВАТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТИ ПДТ |
|
|
| ||||||||||||||||||
Чувствительность ПДТ |
Контр-специфичность ПДТ |
| ||||||||||||||||||||
|
|
0,88 |
0,92 |
0,04 |
|
0,14 |
0,17 |
0,03 |
0,14 |
95% | ||||||||||||
Se = P(T+|D+) |
0,90 |
0,87 |
0,93 |
0,05 |
coSp = P(T+|D-) |
0,13 |
0,18 |
0,04 |
0,13 |
99% | ||||||||||||
|
|
0,87 |
0,93 |
0,07 |
|
0,13 |
0,18 |
0,06 |
0,13 |
99.9% | ||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| ||||||||||||
|
|
Неинформативное значение: 0,5 |
|
|
|
| ||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| ||||||||||||
Контр-чувствительность ПДТ |
Специфичность ПДТ |
| ||||||||||||||||||||
|
|
0,078 |
0,119 |
0,04 |
|
0,83 |
0,86 |
0,03 |
0,83 |
95% | ||||||||||||
coSe = P(T-|D+) |
0,097 |
0,073 |
0,126 |
0,05 |
Sp = P(T-|D-) |
0,82 |
0,87 |
0,04 |
0,82 |
99% | ||||||||||||
|
|
0,066 |
0,135 |
0,07 |
|
0,82 |
0,87 |
0,06 |
0,82 |
99.9% |
Является ли отклонение каждого из оцениваемых показателей распознавательной способности ПДТ от их неинфоромативных значений статистически значимым или нет? Изложите ход рассуждений об их статистической значимости. (Что означает, когда ДИ содержит неинформативное значение данного показателя? Что означает, когда ДИ не содержит неинформативное значение данного показателя?
Ответ: Доверительный интервал 95%(99%,99,9%) не покрывает неинформативное значение оцениваемого показателя, значит, оцениваемое значение статистически значимо отличается от неинформативное.
Используя вербальную шкалу, охарактеризуйте словесно практическую ценность полученных оценок показателей распознавательной способности ПДТ.
Ответ: Чувствительность позитивов к наличию болезней высокая (0,90), чувствительная способность негативов средняя (0,82). Это значит, что тест обладает распознавательной способностью к определению наличия болезни большей, чем для определения отсутствия болезни.