- •Реферат
- •Введение
- •Обзор и анализ научно технической и патентной информации.
- •Нейтрофины.
- •Общая характеристика.
- •1.2 Нейротрофины в цнс
- •2. Рецепторы нейтрофинов.
- •2.1Высокоаффинный рецептор к нейротрофинам pl40 prototrk
- •2.2 Низкоаффинный рецептор к нейротрофинам p75lntr.
- •Фактор роста нервов.
- •История открытия
- •3.2 Молекулярная характеристика.
- •Третичная структура.
- •3.4 Механизм взаимодействия ngf с рецепторами.
- •3.5 Захват и ретроградный транспорт ngf.
- •3.6 Функции ngf в организме.
- •3.6.1 Действие ngf на нервные клетки.
- •3.6.2 Значение ngf в метаболизме.
- •3.6.3 Участие ngf в патологических состояниях.
- •4. Современные достижения в получении рекомбинантного ngf для фармацевтической индустрии.
- •5 Экспрессия рекомбинантных генов.
- •5.1 Вводная часть.
- •5.2 Конструирование экспрессионных векторов и их функционирование.
- •5.3 Факторы, оказывающие влияние на эффективность экспрессии рекомбинантных генов.
- •6 Выводы по разделу
- •Основная часть
- •1. Материалы, методы и оборудование
- •1.1 Оборудование
- •1.2 Программное обеспечение
- •1.3 Лабораторные посуда и расходные материалы.
- •1.4 Штаммы e.Coli
- •1.5 Среды для выращивания бактерий
- •1.6 Препараты днк
- •1.7 Ферменты
- •1.7 Реактивы и наборы реактивов
- •Приготовление рвs буфера (х10):
- •10% Уксусная кислота
- •1.9.1 Рестрикция
- •1.9.2 Электрофоретичское разделение днк в агарозном геле.
- •1.9.3 Выделение днк из агарозного геля.
- •1.9.4. Полимеразная цепная реакция (пцр).
- •1.9.5 Лигирование.
- •1.9.6 Pipes трансформация клеток e. Coli плазмидной днк
- •1.9.7 Культивирование, выделение и очистка плазмидной днк из клеток e. Coli
- •1.9.8 Проведение пцр-скрининга.
- •1.9.9 Секвенированиеплазмидной днк.
- •1.9.10 Быстрая трансформация.
- •1.9.11 Анализ экспрессии целевого гена.
- •1.9.12 Выделение суммарного (общего) белка из клеток e. Сoli.
- •1.9.14 Фракционирование белков из клеток e. Сoli.
- •1.9.15 Денатурирующий белковый электрофорез в sds-пааг.
- •1.9.16 Отмывка телец включения
- •1.9.17 Растворение телец включения
- •1.9.18 Выделение SumoNgf при помощи металло-хелат-аффинной хроматографии
- •1.9.19 Рефолдинг белка
- •1.9.20 Расщепление гибридного белка SumoNgf
- •2. Экспериментальные исследования
- •2.1 Получение векторных конструкций.
- •2.1.1 Сборка гена ngf методом пцр.
- •2.1.2 Получение векторной конструкции pTngf
- •2.1.3 Получение гибридной последовательности SumoNgf.
- •2.1.4 Получение векторной конструкции pTSumoNgf.
- •2.2 Биосинтез целевого и гибридного белка. Подбор условий культивирования.
- •2.2.1 Биосинтез белка ngf.
- •2.2.1 Биосинтез гибридного белка SumoNgf.
- •2.3 Выделение и очистка рекомбинантного фактора роста нервов человека.
- •2.3.1 Отмывка и растворение телец включения
- •2.3.2 Металло-хелатная аффинная хроматография
- •2.3.3 Масс-спектрометрия гибридного белка ngf
- •2.3.4 Рефолдинг гибридного белка SumoNgf
- •2.3.5 Ферментативное расщепление гибридного белка SumoNgf
- •2.3.5 Очистка ngf на катионобменной хроматографии.
- •2.3.5 Разработка обобщённой схемы производства рекомбинантного ngf
- •Организационно – экономический раздел
- •Технико-экономическое обоснование нир
- •2. Расчёт затрат на научно-исследовательскую работу
- •2.1. Расчет материальных затрат (Cм)
- •2.2. Энергетические затраты.
- •4.2.3. Расчет затрат на заработную плату.
- •2.4. Расчет затрат на стеклянную посуду, стеклянные приборы и пластик.
- •4.2.5. Амортизационные отчисления (Сам.).
- •2.6. Накладные расходы.
- •3 Выводы по разделу
- •Безопасность жизнедеятельности
- •1 Краткая характеристика выполняемой работы.
- •2 Опасные и вредные производственные факторы на основных стадиях выполнения дипломной работы.
- •3 Перечень наиболее опасных мест на стадиях выполнения дипломной работы.
- •Основные физико-химические, токсические и пожаровзрывоопасные свойства используемых в работе веществ.
- •5 Обеспечение безопасности труда в лаборатории.
- •6 Производственная санитария.
- •6.1 Установление категории лабораторного помещения.
- •6.2 Разработка мероприятий по работе с вредными веществами.
- •6.3 Метеорологические условия.
- •6.4 Вентиляция.
- •6.5 Освещение.
- •6.7 Отопление.
- •7 Техника безопасности.
- •7.1 Электробезопасность.
- •7.2 Пожарная профилактика.
- •8. Выводы по разделу.
Обзор и анализ научно технической и патентной информации.
Нейтрофины.
Общая характеристика.
Наиболее сильное трофическое влияние на все основные процессы жизнедеятельности нейронов оказывают нейротрофины - регуляторные белки нервной ткани, которые синтезируются в ее клетках. Они действуют локально в месте высвобождения и особенно интенсивно индуцируют ветвление дендритов (арборизацию) и рост аксонов (спрутинг) в направлении клеток-мишеней. Синаптический спрутинг, обеспечивающий "реусиление" существующих нейрональных токов и образование новых полисинаптических связей, обусловливает пластичность нейрональной ткани и формирует механизмы, участвующие в восстановлении нарушенных неврологических функций [1,2].
В результате направленного поиска нейротрофных факторов был выделен и очищен до гомогенного состояния первый представитель этого класса белковых молекул - фактор роста нервов. Это открытие, впоследствии отмеченное присуждением Нобелевской премии, повлекло бурное развитие данного направления и открытие других нейротрофных факторов. Все они играют важную роль в процессах развития и функционирования нервной системы, а также, что особо важно для практической медицины, в регенерации поврежденных нейрональных структур [3].
NGF явился первым известным нейротрофным фактором, и родоначальником особой и наиболее специфической по своей биологической активности группы факторов, получившей название семейства нейротрофинов. Это семейство объединяет белки, сходные по структуре с NGF, - небольшие положительно заряженные молекулы членов этого семейства имеют высоко гомологичные аминокислотные последовательности и способны образовывать гомодимеры. Димеризация является непременным условием для осуществления биологических функций нейротрофинов [4].
Наиболее изучены нейротрофины, близких друг к другу по структуре: фактор роста нервов (NGF) , фактор роста, выделенный из головного мозга (BDNF) , и нейротрофин-3 (NT-3), а также NT-6 и NT-4/5. В развивающемся организме они синтезируются клеткой-мишенью (например, мышечным веретеном), диффундируют по направлению к нейрону, связываются с молекулами рецепторов на его поверхности, что приводит к активному росту аксона. В результате аксон достигает клетки-мишени, устанавливая с ней синаптический контакт. Факторы роста поддерживают жизнь нейронов , которые в их отсутствие не могут существовать [5].
Нейротрофины синтезируются в клетке вформепрепробелков, которые, кроме участка,соответствующего зрелому фактору, содержатсигнальный пептид и пропептид размером 105–120 аминокислотных остатков (а.к.о.). Последовательности зрелыхнейротрофиновчеловека,состоящие из 119–121 а.к.о., высокогомологичны и имеют около 55% идентичных а.к.о.[7]. Все зрелые белки выделены из природныхисточников в виде негликозилированныхгомодимеров. По своей пространственной структуре
нейротрофины относятся к семейству белков,пространственная укладка которых известна как«цистиновый узел». Основу этой укладки составляет образованный двумя дисульфиднымисвязями мегацикл, пронизанный еще однойдисульфидной связью [8].
Процессинг молекулы предшественникапроисходит в консервативном для всех членовсемействанейротрофинов сайте после последовательности Arg-Xaa-Arg/Lys-Arg. Этот процесс осуществляют субтилизин/кексин-подобные пробелок-конвертазы: фурин, PACE4 иPC5/6-B [9]. Функциональная роль пропептидовнейротрофинов до настоящего времени не установлена. Высказано предположение, что онимогут выполнять функции фолдинг-ассистентов, определяя формирование пространственной структуры нейротрофических факторов.
Становится все более очевидным, что наряду с нейротрофинами почти все известные классические и вновь открываемые факторы роста в определенных условиях могут оказывать трофическую поддержку определенных групп нейронов. По всей вероятности, это связано с тем, что в нервной системе присутствуют рецепторы большинства трофических факторов, а внутриклеточные системы передачи сигналов в ядро, используемые различными рецепторами, взаимно перекрываются. Однако роль других нейротрофных факторов в развитии и функционировании нервной системы несоизмерима с масштабами влияния нейротрофинов. Хотя число последних невелико, их биологическая активность, направленная на установление четкой комплексной сети связей в нервной системе, необычайно сложна и многогранна. К настоящему времени стало очевидно, что функциональное разнообразие осуществляется не с помощью огромного набора разнообразных нейротрофинов, как казалось вначале, а путем сложного взаимодействия небольшого их числа [6].
Основным методическим подходом, позволившим углубить наши знания о функциях нейротрофинов, стало изучение способности нейронов выживать в первичных диссоциированных культурах в присутствии рекомбинантных нейротрофинов .
Большая часть выводов, сделанных на основании экспериментов с первичными культурами нейронов, получила подтверждение при анализе нейронных популяций у животных с направленно инактивированными генами нейротрофинов и их рецепторов. Было установлено, что те нейротрофины, которые необходимы для определенных групп нейронов invivо, способны поддерживать выживаемость первичных культур этих же самых нейронов invitro. Эксперименты с культурами нейронов показали, что разные типы нейронов требуют разных нейротрофинов и что некоторые клетки на определенном этапе индивидуального развития чувствительны сразу к нескольким факторам, а другие ни к одному из известных [7].
Развитие нервной системы сопровождается сложным последовательным переключением чувствительности к нейротрофинам в определенных популяциях нейронов. Очевидно, что такая сложная система требует регуляции не только, и даже не столько на уровне индукции сигнала (т.е. продукции нейротрофинов), но и на уровне восприятия нейронами этого сигнала (т.е. продукции рецепторов) .
Нейротрофины взаимодействуют с двумя известными типами специфических рецепторов cнизкоафинным рецептором p75NTR и высокоафииными протеин-тирозинкиназными (Trk) рецепторами TrkA, TrkB и TrkC. При этомNGF является предпочтительным лигандомдляTrkA, BDNF и NT-4/5 – для TrkB, а NT-3 – дляTrkC. При определенных условиях NT-3 способен взаимодействовать с TrkA и TrkB, но сболее низкой аффинностью, чем с TrkC.Рецептор р75 связывает как зрелые, так и про-формы нейротрофинов. При этом он способенсвязывать все типы нейротрофинов (NGF,BDNF, NT-3 и NT-4/5) с примерно равнойаффинностью [8].
Кроме детально изученных эффектов нейротрофинов на нервную систему, в последнее время появились новые работы, демонстрирующие более широкий спектр регуляторных влияний этих факторов роста, и в частности их эффекты на иммунную систему. Kannanetal. (1994, 1996) установили, что NGF принимает участие в симпатической иннервации лимфоидных органов, в которых была также выявлена экспрессия нейротрофиновых рецепторов: тимуса, селезенки, сумки Фабрициуса, лимфоузлов и пейеровых бляшек [9].