- •Реферат
- •Введение
- •Обзор и анализ научно технической и патентной информации.
- •Нейтрофины.
- •Общая характеристика.
- •1.2 Нейротрофины в цнс
- •2. Рецепторы нейтрофинов.
- •2.1Высокоаффинный рецептор к нейротрофинам pl40 prototrk
- •2.2 Низкоаффинный рецептор к нейротрофинам p75lntr.
- •Фактор роста нервов.
- •История открытия
- •3.2 Молекулярная характеристика.
- •Третичная структура.
- •3.4 Механизм взаимодействия ngf с рецепторами.
- •3.5 Захват и ретроградный транспорт ngf.
- •3.6 Функции ngf в организме.
- •3.6.1 Действие ngf на нервные клетки.
- •3.6.2 Значение ngf в метаболизме.
- •3.6.3 Участие ngf в патологических состояниях.
- •4. Современные достижения в получении рекомбинантного ngf для фармацевтической индустрии.
- •5 Экспрессия рекомбинантных генов.
- •5.1 Вводная часть.
- •5.2 Конструирование экспрессионных векторов и их функционирование.
- •5.3 Факторы, оказывающие влияние на эффективность экспрессии рекомбинантных генов.
- •6 Выводы по разделу
- •Основная часть
- •1. Материалы, методы и оборудование
- •1.1 Оборудование
- •1.2 Программное обеспечение
- •1.3 Лабораторные посуда и расходные материалы.
- •1.4 Штаммы e.Coli
- •1.5 Среды для выращивания бактерий
- •1.6 Препараты днк
- •1.7 Ферменты
- •1.7 Реактивы и наборы реактивов
- •Приготовление рвs буфера (х10):
- •10% Уксусная кислота
- •1.9.1 Рестрикция
- •1.9.2 Электрофоретичское разделение днк в агарозном геле.
- •1.9.3 Выделение днк из агарозного геля.
- •1.9.4. Полимеразная цепная реакция (пцр).
- •1.9.5 Лигирование.
- •1.9.6 Pipes трансформация клеток e. Coli плазмидной днк
- •1.9.7 Культивирование, выделение и очистка плазмидной днк из клеток e. Coli
- •1.9.8 Проведение пцр-скрининга.
- •1.9.9 Секвенированиеплазмидной днк.
- •1.9.10 Быстрая трансформация.
- •1.9.11 Анализ экспрессии целевого гена.
- •1.9.12 Выделение суммарного (общего) белка из клеток e. Сoli.
- •1.9.14 Фракционирование белков из клеток e. Сoli.
- •1.9.15 Денатурирующий белковый электрофорез в sds-пааг.
- •1.9.16 Отмывка телец включения
- •1.9.17 Растворение телец включения
- •1.9.18 Выделение SumoNgf при помощи металло-хелат-аффинной хроматографии
- •1.9.19 Рефолдинг белка
- •1.9.20 Расщепление гибридного белка SumoNgf
- •2. Экспериментальные исследования
- •2.1 Получение векторных конструкций.
- •2.1.1 Сборка гена ngf методом пцр.
- •2.1.2 Получение векторной конструкции pTngf
- •2.1.3 Получение гибридной последовательности SumoNgf.
- •2.1.4 Получение векторной конструкции pTSumoNgf.
- •2.2 Биосинтез целевого и гибридного белка. Подбор условий культивирования.
- •2.2.1 Биосинтез белка ngf.
- •2.2.1 Биосинтез гибридного белка SumoNgf.
- •2.3 Выделение и очистка рекомбинантного фактора роста нервов человека.
- •2.3.1 Отмывка и растворение телец включения
- •2.3.2 Металло-хелатная аффинная хроматография
- •2.3.3 Масс-спектрометрия гибридного белка ngf
- •2.3.4 Рефолдинг гибридного белка SumoNgf
- •2.3.5 Ферментативное расщепление гибридного белка SumoNgf
- •2.3.5 Очистка ngf на катионобменной хроматографии.
- •2.3.5 Разработка обобщённой схемы производства рекомбинантного ngf
- •Организационно – экономический раздел
- •Технико-экономическое обоснование нир
- •2. Расчёт затрат на научно-исследовательскую работу
- •2.1. Расчет материальных затрат (Cм)
- •2.2. Энергетические затраты.
- •4.2.3. Расчет затрат на заработную плату.
- •2.4. Расчет затрат на стеклянную посуду, стеклянные приборы и пластик.
- •4.2.5. Амортизационные отчисления (Сам.).
- •2.6. Накладные расходы.
- •3 Выводы по разделу
- •Безопасность жизнедеятельности
- •1 Краткая характеристика выполняемой работы.
- •2 Опасные и вредные производственные факторы на основных стадиях выполнения дипломной работы.
- •3 Перечень наиболее опасных мест на стадиях выполнения дипломной работы.
- •Основные физико-химические, токсические и пожаровзрывоопасные свойства используемых в работе веществ.
- •5 Обеспечение безопасности труда в лаборатории.
- •6 Производственная санитария.
- •6.1 Установление категории лабораторного помещения.
- •6.2 Разработка мероприятий по работе с вредными веществами.
- •6.3 Метеорологические условия.
- •6.4 Вентиляция.
- •6.5 Освещение.
- •6.7 Отопление.
- •7 Техника безопасности.
- •7.1 Электробезопасность.
- •7.2 Пожарная профилактика.
- •8. Выводы по разделу.
3.4 Механизм взаимодействия ngf с рецепторами.
Кристаллическая структура NGF–TrkA–d5 комплекса показала, что димерNGFсвязывается через центральную область β слоя с 5 доменом TrkA. Ориентация комплекса по отношению к мембране, определяется положением Cтерминального конца TrkA – d5.При взаимодействии C конца TrkA с NGF происходит поворот L2 и L4 петель, что способствует связыванию NGFс рецептором.При этом цистеиновый узел и N, а также C конец располагаются в верхней части молекулы NGF.Связывание p75NTR происходит в нескольких местах. Наиболее важным участком для связывания p75NTR является L3 петляиCконцецNGF, которые ориентированы в одном направлении. Этот домен находится сверху молекулы и состоит в основном из положительно заряженных остатков. Данная конструкция комплекса NGF–TrkA–d5 согласуется с идеей, что фактор роста нервов может одновременно связываться с TrkA и p75NTR. Вторым участком для связывания низкоаффиного рецептора являются положительно заряженные остатки петель L1 и L4, находящиеся в нижней части молекулы[] .
Рисунок 5 – Схема кристаллической структуры NGF–TrkA–d5 комплекса (слева) и тройного комплекса NGF–TrkA–d5 - p75NTR (справа)
Связывание димера фактора роста нервов с двумя молекулами рецептора TrkA приводит к тому, что домен внутриклеточного белка тирозинкиназы каждого из TrkA рецепторов фосфорилирует остатки тирозина другого TrkAрецептора. Это запускает четыре внутриклеточных сигнальных каскада, которые приводят к росту и дифференцировке. Активация фосфоинозитол-3-киназы (PI 3-kinase) способствует удлинению отростков и их выживанию. Фосфорилирование тирозина SNT приводит к дифференцировке. Активация фосфолипазы C-γ (PLC-τ) стимулирует MAP киназы, которые индуцируют экспрессию генов, дифференцировку и рост как непосредственно, так и через фосфорилирование RSK. MAP киназа также активируется через сигнальный каскад, который включает связывание белков SHC, Grb-2, SOS и Ras, а также киназRaf и МЕК. — S— Р04 — фосфорилированиесерина; — Т — Р04 — фосфорилированиетреонина; — Y — Р04 — фосфорилирование тирозина [].
Рисунок 6 - Механизм взаимодействия NGF с TrkA
Механизмы действия низкоаффинного рецептора, который не имеет внутриклеточных доменов, в настоящее время не изучены. В некоторых клетках он может взаимодействовать с высокоаффинным рецептором во время связывания нейротрофинов. В других клетках, особенно в тех, в которых нет высокоаффинных рецепторов, он может управлять гибелью клеток или обеспечивать механизм ограниченной диффузии для установления высокой локальной концентрации нейтротрофинов, что необходимо для регенерации периферического нерва.
3.5 Захват и ретроградный транспорт ngf.
То, что от NGF зависит выживание нейрона, говорит о том, что его действие происходит в теле клетки. Это было доказано при выращивании симпатических нейронов в специальных камерах, состоящих из трех отсеков. В центральном отсеке, куда помешаются нейроны, находился NGF, при его отсутствии нейроны гибнут. Однако, после того, как отростки нейрона достигают боковых отсеков камеры, NGF может быть удален из центрального отсека и клетки остаются живыми, при условии, что в боковых отсеках NGF остается. Это дает основания полагать, что трофические эффекты NGF на развивающиеся нейроны могут передаваться в виде ретроградного транспорта NGF от нервных терминалей в тела клеток. Исследования, проведенные на взрослых животных с радиоактивно меченым NGF, показали, что он активно захватывается в нервные терминали и активно транспортируется ретроградно в сому. Взрослым нейронам NGF не нужен для выживания, однако он регулирует, среди всего прочего, синтез адреналина, индуцируя образование двух ферментов, необходимых для его синтеза: тирозингидроксилазу и дофамингидроксилазу. При повреждении транспорта NGF взрослого нейрона уровень этих ферментов падает[].
Рисунок 7 - Фактор роста нерва и выживание веточек аксонов клеток симпатических ганглиев, растущих в культуре клеток.
(А) Нейроны, полученные из неонатального симпатического ганглия и помещенные в центральную секцию, посылают свои отростки под тефлоновым разделителем и в соседние секции; все секции содержат NGF.
(В) После начального роста отростков удаление NGF из центральной секции в течение 20 дней не приводит ни к какому эффекту; нейроны в центральной секции используют NGF, который ретроградно транспортируется из их терминалей, расположенных в боковых секциях.
(С) После начального роста отростков удаление NGF из левой секции вызывает дегенерацию нервных отростков в этой области,а те, которые находились в секции, содержащей NGF, остаются интактными.