- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Противотуберкулезным препаратам микобактерий туберкулеза в Гомельской области
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Примечание: Данные представлены в виде (Ме; 25%–75%; Min-Max)
- •Литература
- •Литература
- •За период с 1980 по 2010 гг.
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •1. Дооперационные:
- •2. Интраоперационные:
- •3. Послеоперационные:
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •По административным районам г. Минска (шкала определена по принципу равноделенного ряда)
- •Районам г. Минска в показателях на 100 тыс. Населения
- •Литература
- •От четырех физиологических показателей для девочек
- •От четырех физиологических показателей для мальчиков
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Литература
- •Содержание
- •Проблемы и перспективы развития современной медицины
- •IV Республиканской научно-практической конференции
Литература
1. Баевский, Р. М. Анализ вариабельности сердечного ритма при использовании различных электрокардиографических систем: метод. рекомендации / Р. М. Баевский, Г. Г. Иванов // Вестник аритмологии. — 2001. — Т. 24. — С. 65–87.
2. Баевский, P. M. Кибернетический анализ процессов управления сердечным ритмом. Актуальные проблемы физиологии и патологии кровообращения / P. M. Баевский. — М.: Медицина, 1976. — С. 161–175.
3. Реброва, О. Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение прикладных программ STATISTICA / О. Ю. Реброва. — М.: МедиаСфера, 2002. — С. 312.
4. West, John F. Respiratory physiology: the essentials. Hagerstown, MD: Lippincott, 2002.
УДК 616.995.1-098
ЗАВИСИМОСТЬ КОЭВОЛЮЦИОННЫХ ИЗМЕНЕНИЙ
ОТ ЛОКАЛИЗАЦИИ ГЕЛЬМИНТОВ В ОРГАНИЗМЕ ЧЕЛОВЕКА
Кузьмин Д. С., Дедик С. Ю.
Научный руководитель: ассистент Е. А. Черноус
Учреждение образования
«Белорусский государственный медицинский университет»
г. Минск, Республика Беларусь
Для ряда паразитов человека характерна молекулярная мимикрия [1]. Она характеризуется присутствием сходных с «хозяином» последовательностей нуклеиновых кислот и соответствующих им белков, что помогает паразиту адаптироваться к организму хозяина, а именно, к иммунной системе. Вероятно, степень контакта с иммунной системой (полость кишечника, где иммуноглобулинов минимально, или паренхима печени, хороша снабжаемая кровью) влияет на выраженность молекулярной мимикрии. В свою очередь, выраженность молекулярной мимикрии у паразита указывает на степень коэволюционных изменений в системе «паразит – хозяин».
В настоящее время существует множество методов, позволяющих анализировать последовательности нуклеиновых кислот. Однако на данный момент не разработаны методы, дающие возможность оперировать динуклеотидным составом [2]. На основе программы Openoffice Calc нами был разработан метод анализа динуклеотидного состава генома паразитических червей.
Цель исследования
С помощью данного метода изучить зависимость коэволюционных изменений от степени контакта паразита с организмом хозяина.
Материалы и методы исследования
Проанализированы нуклеотидные последовательности 6 митохондриальных генов (NADH1, NADH6, Cox1, Cox2, Cox3, Cob) человека, 3-х паразитических плоских червей (Fasciola hepatica, Echinococcus granulosus и Taenia solium) и двух паразитических круглых червей (Trichinella spiralis и Enterobius vermicularis), имеющих различную степень контакта с тканями организма хозяина [3]. В качестве контроля были выбраны аналогичные нуклеотидные последовательности свободноживущих плоского червя Paratomella rubra и круглого червя Caenorhabditis elegans. Использовались самостоятельно секвенированные последовательности Trichinella spiralis, а также материалы сайта ncbi.nlm.nih.gov [4]. Статистическая обработка данных проводилась с помощью непараметрических методов в программе R: A Language and Environment for Statistical Computing.
Результаты и обсуждения
По полученным данным с помощью программы Openoffice Calc было вычислено абсолютные значения количества динуклеотидов(16) для каждого гена. Так как длина одинаковых генов у различных организмов разная, следовательно количество динуклеотидов будет различное, поэтому абсолютные значения были переведены в процентные. Затем вычислена разность процентного содержания динуклеотидов в парах «человек-паразит» и «человек-контроль» (взятая по модулю) для определения сходства по определенному динуклеотиду (нулевое значение указывает на абсолютное сходство). Для оценки динамики коэволюционных изменений вычислена разность «человек-паразит» - «человек-контроль». Отрицательные значения указывают на динамику увеличения сходства по данному динуклеотиду. Чем больше количество отрицательных значений, тем более выражена коэволюция паразита с организмом хозяина по исследуемой нуклеотидной последовательности.
Разработанная методика анализа была применена к исследуемым плоским червям. В таблице 1 приведены результаты для всех генов, рассчитанные по разработанному алгоритму, описанному выше.
Таблица 1 — Процент отрицательных значений для плоских червей
|
F. hepatica, % |
E. granulosus, % |
T. solium, % |
НАДН-дегидрогеназа 1 |
37,50 |
25 |
18,75 |
НАДН-дегидрогеназа 6 |
75,00 |
43,75 |
43,75 |
Цитохром-с-оксидаза 1 |
31,25 |
18,75 |
18,75 |
Цитохром-с-оксидаза 2 |
56,25 |
43,75 |
43,75 |
Цитохром-с-оксидаза 3 |
62,50 |
37,5 |
31,25 |
Цитохром b |
37,50 |
37,5 |
31,25 |
Чтобы оценить значимость различий, полученные данные были обработаны с помощью критерия Манна-Уитни (статистический непараметрический метод анализа двух независимых групп). Статистически значимые различия выявлены в паре «T. solium — F. hepatica» (р < 0,05). В парах «E. granulosus — T. solium», «E. granulosus — F. hepatica» статистически значимых различий не выявлено.
Разработанная методика анализа была применена для паразитических круглых червей. В таблице 2 представлены значения для Trichinella spiralis и Enterobius vermicularis.
Таблица 2 — Процент отрицательных значений для круглых червей
|
T. spiralis, % |
E. vermicularis, % |
НАДН-дегидрогеназа 1 |
81,25 |
25,00 |
НАДН-дегидрогеназа 6 |
87,50 |
43,75 |
Цитохром-с-оксидаза 1 |
87,50 |
12,50 |
Цитохром-с-оксидаза 2 |
81,25 |
37,50 |
Цитохром-с-оксидаза 3 |
75,00 |
25,00 |
Цитохром b |
81,25 |
37,50 |
С помощью критерия Манна-Уитни выявлены статистически значимые различия (р < 0,01).
Выводы
1. Разработанная нами методика позволяет оценить зависимость коэволюционных изменений от степени контакта паразита с тканями организма хозяина.
2. Данная методика, оперирующая с динуклеотидным составом, может быть использована в качестве нового экспресс-метода в области исследований молекулярной
эволюции, в частности, в области эволюции макромолекул.
3. У гельминтов, имеющих более тесный контакт с тканями организма хозяина наблюдаются более выраженные коэволюционные изменения.
4. Эхинококк занимает промежуточное положение между печёночным сосальщиком и свиным цепнем.