- •Федеральное агентство по образованию
- •Высшего профессионального образования российский химико-технологический университет им. Д.И.Менделеева
- •Учебно-методический
- •Требования к уровню освоения содержания дисциплины
- •3. Объем дисциплины и виды учебной работы
- •Содержание курса
- •Биофизическая химия I
- •4.1.1. Термодинамика биотехнологических и микробиологических процессов
- •4.1.2. Основы биоэнергетики
- •Биофизическая химия II
- •4.2.1. Ферментативная кинетика и катализ
- •Распределение часов
- •Лабораторный практикум
- •6. Учебно-методическое обеспечение дисциплины
- •6.1. Основная литература
- •6.2. Дополнительная литература
- •7. Материально-техническое обеспечение дисциплины
- •Методические рекомендации по организации изучения дисциплины
- •9. Положение о рейтинговом контроле знаний
- •10. Педагогические измерительные материалы
- •10.1. Биофизическая химия I
- •Контрольная работа № 1
- •Контрольная работа № 2
- •Перечень вопросов к зачету
- •Методические рекомендации преподавателям
- •Билет зачета
- •10.2. Биофизическая химия II
- •Контрольная работа № 1
- •Контрольная работа № 2
- •Перечень вопросов к зачету
- •Методические рекомендации преподавателям
- •Билет зачета
Перечень вопросов к зачету
Строение и классификация ферментов.
Коферменты, кофакторы.
Сравнение ферментов с катализаторами.
Молекулярные механизмы ферментативного катализа.
Теория Михаэлиса-Ментен (вывод дефференциальной формы уравнения).
Вывод уравнения Бригса-Холдейна.
Решение уравнения Михаэлиса-Ментен в классических координатах.
Решение уравнения Михаэлиса-Ментен матодом Диксона.
Решение уравнения Михаэлиса-Ментен в координатах Иди-Хофсти.
Решение уравнения Михаэлиса-Ментен в координатах де Мигуэл Марино и Тамари.
Решение уравнения Михаэлиса-Ментен в координатах Лайнуивера-Берка.
Понятие об ингибиторах/активаторах.
Однокомпонентное ингибирование.
Вывод и анализ уравнения для обратимого однокомпонентного полностью неконкурентного ингибирования.
Вывод и анализ уравнения для обратимого однокомпонентного полностью конкурентного ингибирования.
Двухкомпонентное полностью конкурентное ингибирование.
Вывод и анализ уравнения для случая двухкомпонентного полностью конкурентного взаимонезависимого ингибирования.
Вывод и анализ уравнения для случая двухкомпонентного полностью конкурентного взаимозависимого ингибирования.
Двухкомпонентное полностью неконкурентное ингибирование.
Вывод и анализ уравнения для случая двухкомпонентного полностью неконкурентного взаимозависимого ингибирования.
Вывод и анализ уравнения для случая двухкомпонентного полностью неконкурентного взаимонезависимого ингибирования.
Случаи выходящие за рамки теории Михаэлиса-Ментен.
Вывод и анализ уравнения ингибирования субстратом.
Вывод и анализ уравнения обратимой изомеризации фермента в неактивную форму.
Вывод и анализ уравнения активации фермента.
Вывод интегральной формы уравнения Михаэлиса-Ментен.
Применение интегральной формы уравнения Михаэлиса-Ментен к случаю ингибирования продуктом, вывод и анализ уравнения.
Влияние рН на скорость ферментативных реакций, вывод и анализ уравнения.
Влияние температуры на скорость ферментативных реакций.
Применение интегральной формы уравнения Михаэлиса-Ментен к случаю необратимой инактивации фермента.
Нестационарная кинетика, классификация.
Достоинства и недостатки методов нестационарной кинетики.
Стационарная кинетика.
Иммобилизация ферментов, классификация.
Достоинства и недостатки вариантов иммобилизации ферментов.
Модуль Тиле.
Методические рекомендации преподавателям
Домашние работы № 1 и 2
Организация самостоятельной работы студентов должна быть направлена на максимальное развитие у них навыков использования специальной литературы, в том числе и электронных баз данных российских и зарубежных библиотек, а также патентной документации. Ответы на домашние задания должны быть краткими. Критерием оценки домашней работы является развитие технологического инженерного мышления у студента.
Курсовая работа
Курсовая работа составляется из трех задач.
Пример решения задачи приведен ниже.
Задача. Определите значения rmaxиk2гидролиза бутирилхолина, катализируемого холинэстеразой исходя из данных таблицы. [E]0=5,0*10-6моль/л
[S]0, моль/л |
r0, усл.ед. |
10,00*10-4 |
5,55 |
2,50*10-4 |
4,45 |
0,91*10-4 |
2,94 |
0,50*10-4 |
2,09 |
Решение:
Для решения в координатах Лайнуивера-Берка следует построить график в координатах 1/r=f(1/[S]).
Точка пересечения прямой с осью ОYсоответствует 1/rmax..
Таким образом 1/rmax= 0,1638, следовательноrmax = 6,105.
Поскольку rmax=k2*[E]0, тоk2=rmax/[E]0 = 6,105/5,0*10-6= 1,22*106.
Контрольная работа № 1
Работа посвящена теоретическим вопросам ферментативной кинетики. Работа состоит из двух теоретических вопросов.
Контрольная работа № 2
Работа состоит из одного теоретического вопроса и двух задач. Пример решения задач приведен ниже.
Задача.
При изучении влияния н-бутанола на кинетику гидролиза сложных эфиров при [E]0=6,05*10-5мг/л получены следующие результаты:
-
[S]0, моль/л
r0, моль/л*мин
[бутанол]=0,05 моль/л
[бутанол]=0,10 моль/л
1,00*10-4
16,7*10-5
13,5*10-5
0,5*10-4
12,5*10-5
10,0*10-5
0,33*10-4
10,5*10-5
7,7*10-5
0,25*10-4
8,8*10-5
6,1*10-5
0,20*10-4
7,7*10-5
5,3*10-5
Определите все возможные кинетические параметры.
Решение:
Построим график ингибирования в координатах Лайнуивера-Берка 1/r=f(1[S]).
Полученные результаты свидетельствуют о том, что бутанол ингибирует фермент по полностью конкурентному типу ингибирования, так как прямые ингибирования пересекаются на оси OY, что соответствует 1/rmax.
Уравнение однокомпонентного полностью конкурентного ингибирования:
. В координатах Лайнуивера-Берка:
.
Таким образом графически можно определить 1/rmax, которое составляет 4350, т.е.rmax=1/4350=2,3*10-4, следовательно
k2=rmax/[E]0=2,3*10-4/6,05*10-5=3,8. Определим графически значения 1/КМ1и 1/КМ2:
,
. Решая эти два уравнения совместно определим значения КSи КJ.
КS =1,2*10-5, KJ=2,14*10-2.
Ответ: rmax = 2,3*10-4,k2 = 3,8, КS = 1,2*10-5,KJ=2,14*10-2.