- •Биофизическая химия Сборник примеров и задач
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Термодинамическое описание биохимических реакций
- •1.1. Расчёт изменения свободной энергии химических реакций
- •1.2. Практические расчёты при описании биохимических реакций
- •Примеры решения задач
- •Теоретические вопросы для самоподготовки
- •2. Стехиометрические расчёты биотехнологических процессов
- •2.1. Стехиометрия и материальный баланс микробиологических процессов
- •2.2. Расчёт выхода биомассы на субстрат (источник углерода)
- •Значения γs и максимальные теоретические значения выхода биомассы для различных субстратов
- •Оценка теплового эффекта и свободной энергии некоторых процессов биосинтеза
- •Задачи для самостоятельного решения
- •Данные для решения задачи 1
- •Данные для решения задачи 2
- •Теоретические вопросы для самоподготовки
- •3. Ферментативная кинетика и катализ
- •3.1. Общая характеристика ферментов
- •3.2. Кинетическое описание ферментативных процессов
- •3.3. Различные типы координат, используемые для графического решения уравнения Михаэлиса–Ментен
- •3.4. Интегральная форма уравнения Михаэлиса–Ментен
- •3.5. Ингибирование ферментативных реакций
- •Кинетические схемы, основные формулы различных ферментативных процессов
- •Примеры решения задач
- •Задачи для самостоятельного решения
- •Теоретические вопросы для самоподготовки
- •Заключение
- •Приложение 1
- •Приложение 2 Константы диссоциации аминокислот, органических кислот и оснований
- •Константы диссоциации различных соединений при 25 °с
- •Приложение 3 Элементарный состав сухой биомассы микроорганизмов
- •Элементарный состав сухой биомассы микроорганизмов
- •Элементарный состав и восстановленность сухой биомассы микроорганизмов, выращенных в условиях непрерывного культивирования
- •Элементный состав и восстановленность сухой биомассы микроорганизмов различных типов дрожжей, выращенных в условиях непрерывного культивирования при лимитировании роста субстратом
- •Список литературы
- •Суясов Николай Александрович
Введение
Биофизическая химия как учебная дисциплина для подготовки специалистов естественно-научного профиля преподается уже более 40 лет. Усвоение дисциплины базируется на знаниях в области физики, физической химии, общей биологии, биохимии и др.
Биофизическая химия, являясь преимущественно биологической наукой, поскольку основной объект исследования представляет собой живой организм, в полной мере использует универсальный характер основных физических и химических законов, строгость математических подходов при изучении процессов жизнедеятельности биологических систем. С учётом этого биофизическая химия может быть определена как наука о фундаментальных закономерностях, лежащих в основе биологических явлений, и их практическом приложении для описания биопроцессов.
В своё время основатель квантовой механики Э. Шредингер в своей знаменитой книге «Что такое жизнь? С точки зрения физика» неоднократно подчёркивал, что с позиций физики живой организм относится к открытым термодинамическим системам с непрерывным обменом веществом и энергией с окружающей средой. Во многом именно благодаря этому, биологические науки в большинстве своём носят исключительно описательный характер, в то время как использование современных методов и подходов физики и физической химии при изучении биохимических реакций и биологических систем позволяет выявить научные закономерности процессов, протекающих как на молекулярном уровне в отдельных клетках, так и на уровне популяций живых организмов.
Особый интерес для биотехнологов представляет приложение термодинамики необратимых процессов к живым системам. Кроме важных теоретических выводов о существовании и свойствах сопряжённых реакций, такой подход позволяет на строго научной основе давать стехиометрическое описание не только отдельных биохимических реакций, но и микробиологических процессов в целом, а также трактовать энергетические показатели потребления различных субстратов микробными клетками.
Исключительно
важное значение имеет чительно
важное значение имеет
Принимая во внимание современные требования и подходы к изучению процессов, протекающих в живых системах, и их практическому применению в промышленности, биофизическая химия играет существенную роль при подготовке специалистов в области биологических технологий.
1. Термодинамическое описание биохимических реакций
Термодинамическое описание биохимических реакций имеет важное значение для теоретического и практического изучения биологических процессов. Такой подход к ферментативным превращениям в биологических объектах позволяет не только учитывать тепловой эффект биохимических реакций, но и оценивать направление отдельных стадий по данным о свободной энергии Гиббса в тех реальных условиях, в которых реакции протекают.
Применение химической термодинамики к биохимическим превращениям имеет ряд особенностей, связанных с их протеканием в водных растворах при низких концентрациях реагентов и в присутствии ферментов.