- •Содержание
- •Введение
- •Глава 1. Обзор литературы
- •1.1. Клетки крови
- •1.2. Экспериментальные методы
- •1.3. Моделирование светорассеяния
- •1.4. Обратная задача светорассеяния
- •Глава 2. Метод дискретных диполей
- •2.1. Обзор МДД
- •2.1.1. Введение
- •2.1.2. Общая формулировка
- •2.1.3. Разновидности МДД
- •2.1.3.1. Теоретические основы МДД
- •2.1.3.2. Точность МДД вычислений
- •2.1.3.3. МДД для кластеров шаров
- •2.1.3.4. Модификации и расширения МДД
- •2.1.4. Численные соображения
- •2.1.4.1. Прямые и итерационные методы
- •2.1.4.2. Разложение по порядкам рассеяния
- •2.1.4.3. Блочно-топлицева структура
- •2.1.4.4. Быстрое преобразование Фурье
- •2.1.4.5. Быстрый метод мультиполей
- •2.1.4.6. Усреднение по ориентации и повторные вычисления
- •2.1.5. Сравнение МДД с другими методами
- •2.1.6. Заключительные замечания
- •2.2. Сходимость МДД
- •2.2.1. Введение
- •2.2.2. Теоретический анализ
- •2.2.2.1. Дополнительные определения
- •2.2.2.2. Анализ ошибок
- •2.2.2.3. Ошибки формы
- •2.2.2.4. Различные формулировки МДД
- •2.2.3. Численное моделирование
- •2.2.4. Обсуждение
- •2.2.5. Выводы
- •2.3. Методика экстраполяции для улучшения точности МДД
- •2.3.1. Введение
- •2.3.2. Экстраполяция
- •2.3.3. Численное моделирование
- •2.3.4. Обсуждение
- •2.3.5. Выводы
- •2.4. Текущие возможности МДД для очень больших частиц
- •2.4.1. Введение
- •2.4.2. Компьютерная программа ADDA
- •2.4.3. Численное моделирование
- •2.4.3.1. Параметры моделирования
- •2.4.3.2. Результаты
- •2.4.4. Обсуждение
- •2.4.5. Выводы
- •2.5. Сравнение компьютерных программ на основе МДД
- •2.5.1. Введение
- •2.5.2. Программы МДД
- •2.5.2.1. SIRRI
- •2.5.2.2. DDSCAT
- •2.5.2.4. ADDA
- •2.5.3. Сравнение программ
- •2.5.3.1. Формы объектов и параметры
- •2.5.3.2. Точные методы
- •2.5.3.3. Точность
- •2.5.3.4. Скорость
- •2.5.4. Обсуждение
- •2.6. Сравнение МДД с методом конечных разностей во временной области
- •2.6.1. Введение
- •2.6.2. Параметры моделирования
- •2.6.3. Результаты для шаров
- •2.6.4. Пример применения к биологическим клеткам
- •2.6.5. Выводы
- •Глава 3. Эритроциты
- •3.1. Введение в эритроциты
- •3.1.1. Морфология
- •3.1.2. Светорассеяние эритроцитами
- •3.2. Решение обратной задачи светорассеяния для эритроцитов, используя простую форму и постоянный показатель преломления
- •3.2.1. Методология моделирования
- •3.2.2. Экспериментальный метод и процедура обращения
- •3.2.3. Эффект формы и ориентации
- •3.2.4. Характеризация эритроцитов
- •3.2.5. Приближённые формы
- •3.2.6. Выводы
- •3.3. Характеризация морфологии нативных эритроцитов с помощью сканирующего проточного цитометра
- •3.3.1. Расширенная модель формы эритроцита
- •3.3.2. Методология моделирования
- •3.3.3. Экспериментальный метод и процедура обращения
- •3.3.4. Результаты и обсуждение
- •3.3.5. Эмпирическая процедура определения диаметра эритроцитов
- •3.3.6. Выводы
- •Глава 4. Гранулоциты
- •4.1. Введение в гранулоциты
- •4.1.1. Нейтрофилы
- •4.1.2. Эозинофилы
- •4.1.3. Базофилы
- •4.1.4. Оптическая характеризация гранулоцитов
- •4.2. Теоретическое исследование светорассеяния простой моделью гранулоцита – зернистым шаром
- •4.2.1. Введение
- •4.2.2. Простая модель гранулоцита
- •4.2.3. Ортогональное светорассеяние
- •4.2.4. Результаты и обсуждение
- •4.2.5. Выводы
- •4.3. Экспериментальное исследование нейтрофилов сканирующим проточным цитометром
- •4.3.1. Экспериментальная процедура
- •4.3.2. Дополнительное МДД моделирование
- •4.3.3. Результаты и обсуждение
- •4.3.4. Выводы
- •Заключение
- •Развитие метода дискретных диполей
- •Характеризация эритроцитов с помощью сканирующего проточного цитометра
- •Теоретическое и экспериментальное исследование гранулоцитов
- •Основные результаты
- •Литература
- •Приложение
- •A1. Описание сокращений и символов
- •A2. Свойства симметрии матрицы Мюллера
- •A3. Расчёт бокового рассеяния зернистым шаром в рамках приближения Релея-Дебая-Ганса
- •A4. Расчёт деполяризованного бокового рассеяния зернистым шаром в рамках второго борновского приближения
практически постоянна при уменьшении ϕ и постоянном θ для обоих подтипов гранулоцитов. Тем самым деполяризационные сигналы гранулоцитов являются неотъемлемыми, в отличие от апертурной деполяризации, например, однородного шара, которая вызвана конечной апертурой вокруг точного направления вбок и стремится к нулю при уменьшении ϕ.
В приложениях A3 и A4 мы применили приближённые теории (РДГ и его второй порядок соответственно) к той же задаче зернистого шара. Здесь мы только приводим итоговые выражения для ISS и I , усреднённым по всем возможным положениям гранул, и их отношения:
|
2 |
|
3 |
, xg |
<<1; |
|
|
ISS ~ xc3 |
[1 |
+ O( f )]xg |
(198) |
||||
f mg − mc |
× |
|
x |
|
>>1, |
||
|
|
O(x-1 ), |
g |
|
|||
|
|
|
g |
|
|
|
I |
|
~ x3 |
f 2 |
m |
− m |
|
c |
|
g |
c |
DSS ~ f mg − mc
4
2
|
3 |
|
|
|
|
3 |
|
|
|
<<1; |
|
xg [1+ O( f ) + O(xc xg )], xg |
|||||||||||
× |
|
O(x-2 |
ln x |
|
), |
|
|
x |
|
>>1, |
|
x |
g |
|
|
g |
|||||||
|
c |
g |
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
|
|
1 |
+ O( f ) + O(xc xg ), xg <<1; |
||||||||||
× |
|
O(x-1 |
ln x |
|
|
), |
x |
|
>>1, |
||
x |
g |
g |
|||||||||
|
c |
g |
|
|
|
|
|
|
(199)
(200)
которые получены из формул (A23), (A26), (A43) и (A48)−(A50). xg и xc это размерные параметры одной гранулы и всей клетки соответственно.
4.2.4. Результаты и обсуждение
Результаты МДД моделирования бокового рассеяния зернистым шаром (с набором параметров по умолчанию) при различных диаметрах гранул приведены на рис. 52. Для каждого dg показаны средние значения ISS и I и величины погрешностей, соответствующие двум СО, подписи около некоторых точек указывают значения dg. Видно, что диапазоны dg от 0.1 до 0.25 мкм и от 0.4 до 2 мкм соответствуют непересекающимся областям на рис. 52, а диапазон от 0.25 до 0.4 мкм является промежуточным, где ISS и I сильно, но по-разному зависят от dg. Эти две области на рис. 52 качественно соответствуют нейтрофилам и эозинофилам на графиках де Грота и др. [264]. Принимая во внимание морфологические характеристики гранул нейтрофилов и эозинофилов (см. раздел 4.1), можно объяснить разные I исключительно различием в dg. Важно отметить, однако, что модель значительно упрощает морфологию гранулоцитов: помимо пренебрежения ядром, все гранулы предполагаются одинаковыми, в то время как гранулы реального гранулоцита гетерогенны как по размеру, так и по показателю преломления.
177
|
12 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
|
|
рассеяние |
10 |
|
|
|
0.4 |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
0.5 |
|
|
боковое |
8 |
|
|
|
|
|
|
6 |
|
|
1 |
|
|
0.3 |
|
|
|
|
|
|
|||
Деполяризованное |
|
1.6 |
|
0.2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
4 |
|
2 |
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
0 |
0 |
0.1 |
|
|
|
|
|
50 |
100 |
150 |
200 |
250 |
||
|
0 |
|
|||||
|
|
|
|
Полное боковое рассеяние ISS |
|
|
Рис. 52. Интенсивности полного и деполяризованного бокового рассеяния для нескольких диаметров гранул от 0 до 2 мкм, которые указаны рядом с некоторыми точками. Использовался набор параметров по умолчанию (см. текст), показаны средние значения ± 2×СО.
Результаты для нескольких объёмных долей гранул представлены на рис. 53,
отдельно для ISS, I и их отношения. Создаётся впечатление, что результаты ТЭС
(dg = 0) для DSS отличаются от предела результатов МДД [рис. 53(в)]. Это объясняется тем, что даже для наименьшего использованного dg = 0.075 мкм ISS и I определяются, в основном, гранулами, но для намного меньших гранул они являются сигналами для однородного шара, для которого деполяризационный механизм другой (см. рис. 55 и
приложение A4). Поэтому и ISS, и I монотонно уменьшается с dg, а DSS “переключается” из режима малых гранул в режим однородного шара, которые принципиально разные.
Помимо этой особенности общее поведение ISS, I и DSS в зависимости от dg
согласуется с предсказаниями формул (198)−(200): и ISS, и I резко увеличиваются с dg при малых dg и медленно спадают при больших dg. Поведение DSS имеет характер ступени – она переходит из одного плато для малых dg в другое – для больших. На рис. 53(в) показаны литературные данные по средним значениям DSS для нейтрофилов и эозинофилов [264]. Значение для нейтрофилов примерно соответствует пределу малых dg для f = 0.1, в то время как DSS для эозинофилов лежит между пределами малых и больших dg для той же f. Последнее можно объяснить наличием у эозинофилов больших (> 0.4 мкм), малых (< 0.25 мкм) и промежуточных гранул, при этом f = 0.1 это типичная суммарная объёмна доля (см. подраздел 4.1.2). Следует подчеркнуть, что это только качественное объяснение, поскольку сигналы светорассеяния для клетки с гранулами разного размера нельзя получить усреднением сигналов для разных клеток с
178
|
500 |
(а) |
f = 0.02 |
ISS |
|
|
f = 0.05 |
рассеяние |
400 |
|
f = 0.1 |
|
f = 0.2 |
||
|
|
||
300 |
|
f = 0.3 |
|
|
|
||
боковое |
|
|
|
200 |
|
|
|
Полное |
100 |
|
|
|
(б) |
|
|
|
|
|
I |
35 |
|
|
|
|
|
рассеяние |
|
|
|
|
||
30 |
|
|
|
|
|
|
25 |
|
|
|
|
|
|
боковое |
|
|
|
|
|
|
20 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Деполяризованное |
15 |
|
|
|
|
|
10 |
|
|
|
|
|
|
5 |
|
|
|
|
|
|
0 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0.12 |
(в) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
SS |
|
|
|
|
|
|
D |
0.10 |
|
|
|
|
|
деполяризации |
|
|
|
|
|
|
0.08 |
|
|
|
|
|
|
0.06 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Степень |
0.04 |
эозинофил |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
0.02 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
нейтрофил |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
0.00 |
0.0 |
0.5 |
1.0 |
1.5 |
2.0 |
|
|
|||||
|
|
|
|
Диаметр гранул dg, мкм |
|
|
Рис. 53. Интенсивности (а) полного и (б) деполяризованного бокового рассеяния и (в) их отношение в зависимости от диаметра гранул для нескольких объёмных долей. Другие параметры равны значениям по умолчанию (см. текст). Показаны средние значения ± 2×СО. Для сравнения в части (в) показаны экспериментальные средние значения DSS для нейтрофилов и эозинофилов.
одинаковыми гранулами. Численное сравнение результатов МДД с экспериментом также затрудняется неопределённостью mg.
Для того чтобы показать зависимость сигналов бокового рассеяния от f мы отложили I и ISS по осям на рис. 54, нормировав на f 2 и f соответственно [согласно
179
|
20 |
|
|
|
|
|
|
|
|
18 |
|
|
|
|
|
|
f = 0.02 |
|
|
|
|
|
|
|
f = 0.05 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
16 |
|
|
|
|
|
|
f = 0.1 |
|
|
|
|
|
|
|
f = 0.2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
14 |
|
|
|
|
|
|
f = 0.3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
2 |
12 |
|
|
|
|
|
|
|
f ) |
10 |
|
|
|
|
|
|
|
×(0.1/ |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
8 |
|
|
|
|
|
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
6 |
|
|
|
|
|
|
|
|
4 |
|
|
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
0 |
50 |
100 |
150 |
|
200 |
250 |
|
|
0 |
|
||||||
|
|
|
|
|
ISS × 0.1/ f |
|
|
|
Рис. 54. То же, что и рис. 52, но для нескольких объёмных долей гранул. I и ISS нормированы |
||||||||
на f 2 и f соответственно к случаю f = 0.1. |
|
|
|
|
|
|||
|
0.10 |
|
|
|
|
|
|
|
|
0.09 |
|
|
|
|
|
|
|
SS |
0.08 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
D |
0.07 |
|
|
|
|
|
|
|
деполяризации |
|
|
|
|
|
|
|
|
0.06 |
|
|
|
|
|
|
|
|
0.05 |
|
|
|
|
|
|
|
|
0.04 |
|
0.030 |
|
|
|
|
|
|
|
0.025 |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Степень |
0.03 |
|
0.020 |
|
|
|
|
ϕ = 0° |
|
0.015 |
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
ϕ = 2.5° |
||
0.02 |
|
0.010 |
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
ϕ = 7.5° |
|||
|
0.005 |
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
||
|
0.01 |
|
|
|
|
|
ϕ = 15° |
|
|
|
0.000 |
|
|
|
|
||
|
|
0.05 |
0.10 0.15 0.20 |
0.25 |
0.30 |
ϕ = 25° |
||
|
|
|
0.00 |
|||||
|
0.00 |
|
0.5 |
|
1.0 |
|
1.5 |
2.0 |
|
0.0 |
|
|
|
||||
|
|
|
Диаметр гранул dg, мкм |
|
Рис. 55. Средние значения степени деполяризации в зависимости от диаметра гранул для нескольких ϕ. Другие параметры, включая θ, равны значениям по умолчанию (см. текст). На врезке показана увеличенная область вблизи начала координат.
формулам (198) и (199)]. Мы опускаем величины ошибок на рис. 54−57, чтобы не загромождать рисунки, – во всех случаях они примерно такие же, как показанные на рис. 52 и 53, за исключением рис. 55, где СО существенно увеличиваются при уменьшении ϕ (данные не приведены). Последнее естественно, принимая во внимание колебательную зависимость всех элементов матрицы Мюллера от обоих углов θ и ϕ.
На рис. 53 и 54 видно, что I и ISS увеличиваются с f медленнее чем f 2 и f соответственно, т.е. важны поправки более высокого порядка по f. Хотя наши выкладки на основе приближённых методов предоставляют такие поправки, последние не точны и поэтому дальше не обсуждаются (см. приложения A3 и A4). Наклон кривых на
180
12
Dc = 4 мкм
10 Dc = 8 мкм
Dc = 14 мкм
8
I × (8 μm/D )4c
6
4
2
0
0 |
50 |
100 |
150 |
200 |
250 |
ISS × (8 μm/Dc)3
Рис. 56. То же, что и рис. 52, но для нескольких диаметров клетки. I и ISS нормированы на Dc4 и Dc3 соответственно к случаю Dc = 8 мкм.
12
|
10 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
4 |
8 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
c |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
m |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
× [0.185/|m − g
6
4
I
|
|
|
|
|
mg=1.1 |
|
2 |
|
|
|
|
mg=1.15 |
|
|
|
|
|
|
mg=1.2 |
|
0 |
|
|
|
|
mc=1 |
|
50 |
100 |
150 |
200 |
250 |
||
0 |
ISS × [0.185/|mg − mc|]2
Рис. 57. То же, что и рис. 52, но для нескольких mg при mc = 1.015 и для mg = 1.2, mc = 1. I и ISS нормированы на |mg − mc|4 и |mg − mc|2 соответственно к случаю mg = 1.2, mc = 1.015.
рис. 54 практически не зависит от f для малых dg, следовательно в этом случае DSS
пропорциональна f, причём с большей точностью чем соотношения для I или ISS.
Результаты для нескольких апертур приведены на рис. 55. Мы изменяем ϕ от 0°
до 25° при постоянном θ . Степень деполяризации зависит от |
ϕ во всё диапазоне dg, |
но эта зависимость равномерна в том смысле, что изменение |
ϕ не влияет на общий |
характер зависимости DSS от dg. Другими словами, апертурная часть деполяризации зернистого шара значительна, особенно для больших dg, но она всегда меньше чем неотъемлемая часть. Имеется одно естественное исключение – результаты ТЭС для dg = 0, которые примерно пропорционален ϕ2 [264].
181
3.0 |
|
|
|
|
|
|
|
|
f = 0.02 |
|
|
|
|
f = 0.05 |
|
|
|
|
f = 0.1 |
2.5 |
|
|
|
f = 0.2 |
ext |
|
|
|
f = 0.3 |
|
|
|
|
|
Q |
|
|
|
|
2.0 |
|
|
|
|
1.5 |
|
|
|
|
(а) |
|
|
|
|
1.00 |
|
|
|
|
0.95 |
|
|
|
|
<cosθ > |
|
|
|
|
0.90 |
|
|
|
|
0.85 |
|
|
|
|
(б) |
|
|
|
|
0.80 |
0.5 |
1.0 |
1.5 |
2.0 |
0.0 |
||||
|
|
Диаметр гранул dg, мкм |
|
|
Рис. 58. То же, что и рис. 53, но для (а) эффективности экстинкции и (б) параметра асимметрии.
График I в зависимости от ISS для нескольких Dc приведён на рис. 56,
нормированный на Dc4 и Dc3 соответственно [согласно формулам (198) и (199)].
Кривые практически совпадают для малых dg и близки для больших dg, следовательно зависимость сигналов бокового рассеяния от Dc описывается приближёнными теориями удовлетворительно, а для DSS точность ещё лучше. Результаты для нескольких mg и mc, показанные на рис. 57, приводят к аналогичным выводам:
зависимость от показателей преломления, описываемая формулами (198)−(200) работает хорошо, особенно для DSS, за исключением «резонансного» промежуточного диапазоне dg. В частности, можно использовать эти выражения для оценки влияния неопределённости в mg и mc на итоговые результаты моделирования.
Все вышеописанные результаты были для сигналов бокового рассеяния, а на рис. 58 приведены результаты для других характеристик рассеяния, а именно Qext и
<cosθ >. Эти интегральные величины только немного зависят от конкретного положения гранул, что отражается на относительно малых СО, но они нетривиально
зависят от dg и f. При малых dg Qext близко к значению для однородного шара с
182