- •Общая микробиология
- •2. Основные группы микроорганизмов. Эукариоты и прокариоты. Особенности структурной организации прокариот. Генетический аппарат бактерий, его особенности, примеры автономных репликонов бактерий.
- •3. Понятие о подвижных генетических элементах. Гены-вставки, транспозоны, их функции. Инсерционный мутагенез.
- •6. Типы генетических рекомбинаций (гомологичная, негомологичная, сайтспецифическая). Механизмы мобилизации бактериальных генов: трансформация, трансдукция и конъюгация. Фаговая конверсия.
- •7. Принцип фенотипической классификации бактерий. Основные морфологические формы бактерий. Работы а. Левенгука.
- •8. Структурные компоненты бактериальной клетки: цитоплазматическая мембрана, внутриклеточные включения, жгутики, их структура и функции. Методы обнаружения включений и жгутиков.
- •9. Экологически зависимые структуры бактериальной клетки. Строение и функции бактериальной эндоспоры и капсулы, методы их обнаружения.
- •10. Тинкториальные свойства бактерий. Связь с особенностями строения трех основных типов клеточной стенки. Принцип окраски по методу Грама.
- •11. Актиномицеты, спирохеты как нетипичные бактерии. Особенности строения и физиологии.
- •12. Риккетсии, хламидии, микоплазмы как нетипичные бактерии. Особенности строения, метаболизма, экологии.
- •15. Принципы и методы культивирования бактерий. Условия, влияющие на рост и размножение бактерий. Ростовые факторы. Питательные среды и их классификация. Работы р. Коха.
- •17. Культуральные свойства бактерий. Характеристика колоний. Методы изучения культуральных свойств бактерий. Понятие о биотипе (биоваре).
- •18. Стерилизация и дезинфекция. Понятие о дезинфектантах и антисептиках. Основные методы стерилизации при проведении микробиологических исследований.
- •20. Антибиотикорезистентность бактерий. Генетические механизмы лекарственной устойчивости бактерий, пути преодоления. Методы определения чувствительности бактерий к антибиотикам.
- •21. Вирусы как особая форма жизни. Экология вирусов. Строения и химический состав вириона. Принципы классификации вирусов. Значение вирусов в патологии человека. Работы д. Ивановского.
- •24. Бактериофаги: строение, взаимодействие с бактериальной клеткой. Умеренные и вирулентные фаги. Лизогения. Практическое использование фагов. Понятие о фаговаре
- •25. Микробиологический анализ как основа лабораторной диагностики инфекционных заболеваний. Принципы и основные направления. Культурально-зависимые и культуральнонезависимые методы диагностики.
- •26. Культуральный метод (бактериологический анализ) в диагностике инфекционных заболеваний. Правила забора материала и основные этапы анализа. Принципы идентификации бактерий.
- •27. Принципы и методы экспресс-диагностики инфекционных заболеваний. Молекулярногенетические методы. Понятие о полимеразной цепной реакции (пцр), преимущества и ограничения метода.
- •28. Иммунохимический анализ. Задачи иммунохимического анализа. Серотипирование и серодиагностика. Реакции биологической нейтрализации.
- •Нейтрализация бактериального токсина.
- •Реакция торможения гемагглютинации.
- •Нейтрализация цитопатического действия вирусов.
- •29. Иммунохимический анализ: реакции агглютинации, преципитации. Варианты постановки реакций.
- •Реакция агглютинации на стекле.
- •Развернутая реакция агглютинации.
- •Рп в жидкой фазе (кольцепреципитация).
- •Рп в твердой среде (пример, двойная иммунодиффузия по Оухтерлони).
- •30. Иммунохимические реакции на основе меченых антител. Иммуноферментный анализ. Иммуноблотинг.
- •Иммуноферментный анализ.
- •Иммуноблотинг.
- •31. Серологическая диагностика. Титр антител. Принципы изучения качественной и количественной сероконверсии.
- •Генетические основы патогенности бактерий.
- •36. Патогенность и вирулентность бактерий: факторы и механизмы, способствующие адгезии, колонизации, инвазии, персистенции. Антифагоцитарные факторы бактерий.
- •37. Бактериальные экзотоксины, их характеристика, принцип действия. Классификация экзотоксинов. Молекулярное строение и функция бинарных токсинов. Суперантигены, механизм их токсического эффекта.
- •38. Эндотоксины бактерий, их характеристика. Патогенез лпс-зависимой интоксикации. Понятие о модулинах. Контактные токсины, механизм их действия.
20. Антибиотикорезистентность бактерий. Генетические механизмы лекарственной устойчивости бактерий, пути преодоления. Методы определения чувствительности бактерий к антибиотикам.
Антибиотикорезистентность бактерий - феномен устойчивости штамма возбудителей инфекции к действию одного или нескольких антибактериальных препаратов.
Генетические механизмы лекарственной устойчивости бактерий:
Мутации (изменение структурных белков);
Рекомбинации (R-гены в плазмидах);
Пути преодоления антибиотикорезистентности:
1) применение больших доз антибиотиков;
2) изыскание новых антибактериальных препаратов, в том числе и антибиотиков;
3) комбинация антибактериальных препаратов и антибиотиков с различным механизмом действия на микробную клетку, а также сочетание антибиотиков с другими лекарственными препаратами, обладающими специфическим воздействием на антибиотикорезистентность;
4) применение АБ только строго по показаниям врача;
Механизмы формирования резистентности:
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Методы определения чувствительности к АБ: Диско-диффузионный метод ( если диаметр зоны задержки роста менее 10 мм, то микроб НЕ чувствителен (т.е. резистентен к АБ) ; если от 10 до 15 - средняя чувствительность , а есть больше 15 мм - высокая);
21. Вирусы как особая форма жизни. Экология вирусов. Строения и химический состав вириона. Принципы классификации вирусов. Значение вирусов в патологии человека. Работы д. Ивановского.
Вирусы:
неклеточная форма;
отсутствие мишени для АБ (невосприимчивость);
имеют 1 тип нуклеиновой кислоты: либо ДНК (HBV HEPADNAVIRIDAE), либо РНК (HAV – PICORNAVIRIDAE);
облигатные внутриклеточные паразиты: не реплицируются вне клетки, поэтому не растут на питательных средах (используются для размножения куриные эмбрионы или культуры клеток) - нет белоксинтезирующего и энергосинтезирующего аппарата;
дизъюнктивный способ репликации (нуклеиновая кислота и капсид создаются в разных местах, а потом собираются в вирион);
генетические паразиты ( могут встраиваться в геном);
минимальные размеры (нМ);
проходят через бактериальные фильтры;
Вирусы, не будучи организмами, тем не менее, являются своеобразной формой жизни, которой присущи все основные ее проявления, вплоть до способности эволюционировать, приспособляться к меняющимся условиям среды. Лишенные собственных белоксинтезирующих систем, они являются автономными генетическими структурами, навсегда привязанными к внутренней среде организма — от простейшей прокариотической клетки до высшего многоклеточного организма. Эти организмы и являются экологической нишей вирусов.
Формы существования: 1. ВИРУС – для размножения, внутри клетки; 2. ВИРИОН – полноценная вирусная частица, состоящая из нуклеиновой кислоты и капсида (нуклеокапсид), служит для инфицирования, находится вне клетки;
Строение вириона:
Нуклеиновая кислота (функция генетического аппарата);
Капсид – белковая оболочка, состоящая из капсомеров (защитная, каталитическая функция, антигенные свойства);
Суперкапсид – поверхностная липидная (липопротеиновая) оболочка (из ЦПМ клетки хозяина);
Принципы классификации вирусов:
Тип нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК), ее структура, количество нитей (1 или 2), особенности воспроизводства вирусного генома;
Размеры, морфология, количество капсомером;
По месту размножения в клетке (ядро, цитоплазма);
По антигенным свойствам;
Наличие суперкапсида (простые (нет), сложные (есть));
Тип симметрии:
Значение вирусов в патологии человека
Широко распространены вирусы гепатита, герпеса, иммунодефицита человека, гриппа и острых респираторных заболеваний человека (ОРЗ). Среди всей инфекционной патологии, с которой приходится встречаться врачу, 80% приходится на заболевания вирусной природы. Доказана роль вирусов в возникновении некоторых онкологических заболеваний, установлена связь вирусов герпеса с развитием атеросклероза сосудов.
Работы Ивановского:
Открыл вирусы. В 1892 г. биолог Дмитрий Иосифович Ивановский доложил на заседании Российской Академии наук о том, что он обнаружил удивительную закономерность. Сок, полученный из растений табака, больных мозаичной болезнью, и пропущенный через задерживающий бактерии фарфоровый фильтр, сохранял способность заражать здоровые растения. Исходя из этого факта, ученый предположил, что данный фильтрат содержит либо мельчайшие бактерии, либо выделенные ими ядовитые вещества - токсины. Спустя 6 лет нидерландский микробиолог Мартин Виллем Бейеринк получил сходные результаты и ввел понятие "фильтрующийся вирус". Сам Бейеринк предполагал, что фильтрующийся вирус - это жидкое "заразное начало". Д.И.Ивановский придерживался мнения, что оно твердое. Только в 1939 г., вскоре после изобретения электронного микроскопа, исследователи смогли, наконец, рассмотреть невидимый вирус. Интересно, что первым был сфотографирован вирус табачной мозаики.
22. Молекулярные основы репродукции вирусов. Репродукция ДНК-содержащих вирусов, варианты репродукции РНК-содержащих вирусов. Принципы этиотропной терапии вирусных инфекций. Возможные мишени для противовирусных препаратов.
Молекулярные основы репродукции (повторного воспроизведения себе подобных) Стратегия вируса - переключить работу клеточных систем обеспечения жизнедеятельности на себя, т.к. вирус не имеет белоксинтезирующего аппарата и энергетических систем. Условия данного процесса: 1. Полное или частичное подавление генов клетки - хозяина (ибо под их контролем совершается работа клетки); 2. Встроить собственные гены для синтеза нуклеиновой кислоты и белков вируса; РЕПРОДУКЦИЯ ДНК-СОДЕРАЩИХ ВИРУСОВ В ЯДРЕ: герпесвирус
первая фаза – АДСОРБЦИЯ (прикрепление) вируса на поверхности клетки, чувствительной к данному вирусу;
вторая фаза – ПЕНЕТРАЦИЯ (проникновение путем слияния мембран у сложных вирусов и путем пиноцитоза у простых);
третья фаза – ДЕПРОТЕИНИЗАЦИЯ («раздевание» вирионов, освобождение нуклеиновой кислоты вируса от суперкапсида и капсида);
Ранняя транскрипция с образованием ранних иРНК
Ранняя трансляция с образованием ранних белков (регуляторных)
Репликация ДНК (синтез дочерних нуклеиновых кислот)
Поздняя транскрипция дочерних нуклеиновых кислот с образованием поздних иРНК
Поздняя трансляция с образованием поздних белков
Сборка вирионов (самосборка) (при дизъюнкции для образования вириона необходимо взаимное узнавание вирусных белков и геномных молекул, которое ведет к самосборке вирусных частиц. Сначала собираются капсиды из капсомеров. Готовый капсид заполняется геномной нуклеиновой кислотой и вирусспецифическими ферментами с образованием нуклеокапсида.)
Выход из клетки (у сложного вируса-почкованием, чтобы был суперкапсид; у простого вируса путём лизиса (гибель клетки));
Репродукция РНК- содержащих вирусов.
У
иРНК
(-)нить
РНК вирусов дело обстоит сложнее. У односпиральных РНК генетическая программа реализуется в ЦИТОПЛАЗМЕ инфицированных клеток. Простейший способ наблюдается у пикорнавирусов.
Другая группа РНК-вирусов имеют вирионную МИНУС-РНК (ортомиксовирусы, парамиксовирусы). Для ее репликации и транскрипции необходима РНК-зависимая РНК-ПОЛИМЕРАЗА. Поскольку клетки не имеют такого фермент, вирус обязан иметь его в составе своего вириона, внося в инфицированную клетку. Еще одной разновидность РНК-вирусов являются РЕТРОВИРУСЫ (например, ВИЧ). Их название происходит от необычного направления репликации – обратная транскрипция. Также имеются ферменты интеграза (проникновение в ядро), протеаза (перенос белка обратно в ядро).
23. Результаты взаимодействия вируса с клеткой (для вируса и для клетки). Персистенция вирусов: экологическое значение и клинические проявления. Молекулярные механизмы персистенции (вирогения), ее разновидности.
Формы взаимодействия вируса с клеткой. Различают три типа взаимодействия вируса с клеткой: продуктивный, абортивный и интегративный.
Продуктивный тип |
Абортивный тип |
Интегративный тип, или вирогения |
завершается образованием нового поколения вирионов и гибелью (лизисом) зараженных клеток (цитолитическая форма). Некоторые вирусы выходят из клеток, не разрушая их (нецитолитическая форма). |
не завершается образованием новых вирионов, поскольку инфекционный процесс в клетке прерывается на одном из этапов. |
характеризуется встраиванием (интеграцией) вирусной ДНК в виде провируса в хромосому клетки и их совместным сосуществованием (совместная репликация). |
Персистенция вирусов - длительное присутствие возбудителя в организме.
Экологическое значение персистенции: длительное пребывание в клетке обуславливает сохранение вида.
Клинические проявления: обычно нет никаких проявлений, они появляются только при рецидиве.
Механизмы персистенции:
Интеграция генома вируса в хромосому клетки-хозяина (интегративная вирогения);
Нахождение вируса в клетке в виде свободной нуклеиновой кислоты (неинтегративная вирогения);
Постоянные мутации в геноме вируса и «ускользание» от иммунитета;