- •Общая микробиология
- •2. Основные группы микроорганизмов. Эукариоты и прокариоты. Особенности структурной организации прокариот. Генетический аппарат бактерий, его особенности, примеры автономных репликонов бактерий.
- •3. Понятие о подвижных генетических элементах. Гены-вставки, транспозоны, их функции. Инсерционный мутагенез.
- •6. Типы генетических рекомбинаций (гомологичная, негомологичная, сайтспецифическая). Механизмы мобилизации бактериальных генов: трансформация, трансдукция и конъюгация. Фаговая конверсия.
- •7. Принцип фенотипической классификации бактерий. Основные морфологические формы бактерий. Работы а. Левенгука.
- •8. Структурные компоненты бактериальной клетки: цитоплазматическая мембрана, внутриклеточные включения, жгутики, их структура и функции. Методы обнаружения включений и жгутиков.
- •9. Экологически зависимые структуры бактериальной клетки. Строение и функции бактериальной эндоспоры и капсулы, методы их обнаружения.
- •10. Тинкториальные свойства бактерий. Связь с особенностями строения трех основных типов клеточной стенки. Принцип окраски по методу Грама.
- •11. Актиномицеты, спирохеты как нетипичные бактерии. Особенности строения и физиологии.
- •12. Риккетсии, хламидии, микоплазмы как нетипичные бактерии. Особенности строения, метаболизма, экологии.
- •15. Принципы и методы культивирования бактерий. Условия, влияющие на рост и размножение бактерий. Ростовые факторы. Питательные среды и их классификация. Работы р. Коха.
- •17. Культуральные свойства бактерий. Характеристика колоний. Методы изучения культуральных свойств бактерий. Понятие о биотипе (биоваре).
- •18. Стерилизация и дезинфекция. Понятие о дезинфектантах и антисептиках. Основные методы стерилизации при проведении микробиологических исследований.
- •20. Антибиотикорезистентность бактерий. Генетические механизмы лекарственной устойчивости бактерий, пути преодоления. Методы определения чувствительности бактерий к антибиотикам.
- •21. Вирусы как особая форма жизни. Экология вирусов. Строения и химический состав вириона. Принципы классификации вирусов. Значение вирусов в патологии человека. Работы д. Ивановского.
- •24. Бактериофаги: строение, взаимодействие с бактериальной клеткой. Умеренные и вирулентные фаги. Лизогения. Практическое использование фагов. Понятие о фаговаре
- •25. Микробиологический анализ как основа лабораторной диагностики инфекционных заболеваний. Принципы и основные направления. Культурально-зависимые и культуральнонезависимые методы диагностики.
- •26. Культуральный метод (бактериологический анализ) в диагностике инфекционных заболеваний. Правила забора материала и основные этапы анализа. Принципы идентификации бактерий.
- •27. Принципы и методы экспресс-диагностики инфекционных заболеваний. Молекулярногенетические методы. Понятие о полимеразной цепной реакции (пцр), преимущества и ограничения метода.
- •28. Иммунохимический анализ. Задачи иммунохимического анализа. Серотипирование и серодиагностика. Реакции биологической нейтрализации.
- •Нейтрализация бактериального токсина.
- •Реакция торможения гемагглютинации.
- •Нейтрализация цитопатического действия вирусов.
- •29. Иммунохимический анализ: реакции агглютинации, преципитации. Варианты постановки реакций.
- •Реакция агглютинации на стекле.
- •Развернутая реакция агглютинации.
- •Рп в жидкой фазе (кольцепреципитация).
- •Рп в твердой среде (пример, двойная иммунодиффузия по Оухтерлони).
- •30. Иммунохимические реакции на основе меченых антител. Иммуноферментный анализ. Иммуноблотинг.
- •Иммуноферментный анализ.
- •Иммуноблотинг.
- •31. Серологическая диагностика. Титр антител. Принципы изучения качественной и количественной сероконверсии.
- •Генетические основы патогенности бактерий.
- •36. Патогенность и вирулентность бактерий: факторы и механизмы, способствующие адгезии, колонизации, инвазии, персистенции. Антифагоцитарные факторы бактерий.
- •37. Бактериальные экзотоксины, их характеристика, принцип действия. Классификация экзотоксинов. Молекулярное строение и функция бинарных токсинов. Суперантигены, механизм их токсического эффекта.
- •38. Эндотоксины бактерий, их характеристика. Патогенез лпс-зависимой интоксикации. Понятие о модулинах. Контактные токсины, механизм их действия.
3. Понятие о подвижных генетических элементах. Гены-вставки, транспозоны, их функции. Инсерционный мутагенез.
Подвижные генетические элементы – это вставочные последовательности и транспозоны. Они входят в состав бактериального генома (т.е это хромосома и плазмиды).
Гены – вставки (=инсерционные последовательности) –это участки ДНК, способные как целое перемещаться из одного участка репликлона (хромосомы,плазмиды) в другой. Они содержат только те гены, которые необходимы для их перемещения : 1)ген, кодирующий фермент транспозазу 2) ген, определяющий синтез репрессора ( ингибитор экспресссии генов);
Отличительная особенность : наличие на концах вставочной последовательности (=инвертированные повторы). Эти вставочные последовательности узнаёт фермент Транспозаза. Она осуществляет одноцепочные разрывы ДНК. Происходит репликация и оригинальный ген-вставка остается на месте, а его копия перемещается на новый участок (=репликативная комбинация).
Транспозоны- мигрирующие элементы, имеют гены для переноса внутри клеток и одновременно содержат гены резистентности к АБ , ионам тяжелых металлов. Транспозон содержит структурные гены и повторяющиеся участки.
Функции генов-вставок и транспозонов: 1)Координация взаимодействия внехромосомных факторов наследственности между собой и с бактериальной хромосомой для обеспечения их рекомбинации;
2) регуляция транскрипции генов путем их «включения/выключения»; 3) индукция мутаций (инверсия – изменение чередования генов за счет поворота участка на 180 градусов, дупликация – удвоение участка хромосомы, делеция – утрата участка хромосомы);
Инсерционный мутагенез – мутационное изменение генома вследствие вставок последовательностей нуклеотидов;
4. Плазмиды бактерий: функции и их разновидности. Значение в экологии бактерий. Фенотипические признаки бактерий, определяемые плазмидами. Система «бактерии – плазмиды» в генной инженерии; рекомбинантные белки.
Плазмиды – внехромосомные мобильные гененетические структуры бактерии. Необязательный компонент микроба. По размерам примерно 5% от ДНК – хромосомы.
Значение:
Контроль у бактерий обмена генетическим материалом;
Контроль синтеза факторов патогенности;
Биологические средства самозащиты бактерий от химических и других факторов окружающей среды;
Функции: 1. Регуляторная (компенсирует нарушение функций нуклеоида);
2. Кодирующая (вносит в генотип новую информацию);
Плазмиды могут быть: 1)Трансмиссивные (могут передаваться из одной бактерии в другую); 2)Нетрансмиссивные;
Фенотипические признаки бактерий, определяемые плазмидами: 1) устойчивость к АБ (R-плазмиды ); 2) продукция факторов патогенности (Ent-плазмиды); 3) расщепление сложных органических веществ; 4) образование бактериоцинов; 5) образование ферментов рестрикции и модификации;
6) способность к синтезу АБ;
Система «бактерии – плазмиды» в генной инженерии.
Функция плазмид при использовании их человеком заключается в способе создания клонированной копии ДНК. Сами плазмиды выступают в роли вектора. Репликационная способность плазмидов позволяет воссоздавать рекомбинантную ДНК в клетке-носителе. Широкое использование они нашли в генной инженерии. В этой отрасли науки плазмиды создаются искусственным путем для переноса информации генетического типа или каких-либо манипуляционных действий с генетическим материалом.
Встроенная в хромосому F-плазмида обеспечивает высокую частоту рекомбинации бактерий данного типа. R-плазмиды кодируют устойчивость к лекарственным препаратам, а также к тяжёлым металлам. R-плазмиды включают все гены, ответственные за перенос факторов устойчивости из клетки в клетку. Плазмиды бактериоциногении кодируют синтез бактериоцинов - белковых продуктов, вызывающих гибель бактерий того же или близких видов. Многие плазмиды, кодирующие образование бактериоцинов, также содержат набор генов, ответственных за конъюгацию и перенос плазмид. Плазмиды патогенности контролируют вирулентные свойства многих видов.
Рекомбинантные белки – белки экспрессируемые генами в составе рекомбинантной ДНК.
5. Фенотипическая и генотипическая изменчивость бактерий. Механизмы и примеры фенотипической изменчивости. Регуляция экспрессии генов. Экологически зависимая коэкспрессия генов, регулон. Понятие о спонтанных и индуцированных мутациях.
Фенотипическая |
Генотипическая |
||
Модификации - изменения, которые поддерживаются пока действует фактор окружающей среды. - не затрагивают генотип - не передаются по наследству - возникают под воздействием факторов окружающей среды (например, изменение окраска, размера, формы, наличие спор и капсулы и т.д.) Механизмы: 1. Морфологическая – изменение формы, величины (при добавлении пенициллина в питательную среду некоторые бактерии удлиняются); 2. Культуральная – изменение культуральных свойств при изменении состава питательной среды (недостаток кислорода заставляет стафилакокк утрачивать пигмент); 3. Биохимическая (при посеве эшерихии коли на среду с лактозой, она начинает синтезировать фермент, ее расщепляющий);
|
-мутации и рекомбинации Мутации бывают: - спонтанные ( вызванные природой ( биологические, химические, физические)); - индуцированные ( человеком , под действием мутагенов (УФО, гамма лучи));
Регуляция экспрессии генов на уровне транскрипции:
|
Регулон – это ген – регулятор + оперон . Ген-реугулятор – кодирует белок –репрессор и отвечает за регуляцию процесса транскрипции структурных генов.