- •1. Введение
- •2. Основные термины и определения
- •3. Роль регуляторных механизмов в поддержании клеточного гомеостаза
- •4. Типы регуляции
- •5. Практическое использование знаний об основах регуляции метаболизма у микроорганизмов
- •1. Способ регуляции метаболических процессов, основанный на избирательном синтезе ферментов
- •2. Регуляция репликации днк
- •3. Регуляция процесса транскрипции. Механизмы индукции и репрессии
- •4. Другие механизмы регуляции транскрипции у микроорганизмов
- •1. Избирательный синтез ферментов за счет регуляции процесса трансляции у микроорганизмов
- •2. Биосинтез и сборка компонентов аппарата трансляции
- •3. Регуляция функционирования аппарата трансляции
- •4. Способы регуляции биосинтеза и круговорота белков у микроорганизмов путем посттрансляционной модификации и избирательного протеолиза
- •1. Способ регуляции метаболических процессов у микроорганизмов, основанный на изменении активности ферментов
- •2. Простые и регуляторные ферменты
- •3. Аллостерические ферменты и эффекторы
- •4. Гомотропная и гетеротропная кооперативность
- •5. Обратимая ковалентная модификация
- •1. Специфические механизмы регуляции активности ферментов у микроорганизмов. Регуляция путей биосинтеза и промежуточного обмена
- •2. Роль энергетического заряда в регуляции клеточного метаболизма
- •3. Регуляторные эффекты Пастера и Крэбтри
- •4. Регуляция метаболической активности за счёт компартментализации ферментов и их взаимодействия с клеточными мембранами
- •1. Пассивная проницаемость и транспортные функции цитоплазматической мембраны бактерий
- •2. Энергетика транспортных процессов у микроорганизмов
- •3. Организация и регуляция транспортных процессов на уровне биосинтеза. Сборка и функционирование компонентов транспортных систем
- •1. Общая характеристика процесса клеточного деления
- •2. Накопление критической клеточной массы и репликация днк генома
- •3. Построение клеточной оболочки и перегородки
- •4. Взаимоотношение репликации днк и сборки клеточной перегородки
- •1. Скорость метаболизма в процессе клеточного деления
- •2. Выявление «узких мест» в метаболизме микробной клетки
- •3. Связь скорости роста микроорганизмов с биосинтезом стабильных форм рнк
- •4. Взаимосвязь регуляторных механизмов и их реализация в развивающихся микробных клетках
- •5. Регуляция межклеточных взаимодействий
- •1. Общая характеристика методологических подходов к решению научных проблем регуляции метаболизма микробных клеток
- •2. Классификация методов изучения регуляции метаболической активности
- •3. Методические особенности изучения скорости роста и активности транспортных систем у микроорганизмов
- •4. Методы изучения регуляции клеточного метаболизма с использованием мутантных микроорганизмов
- •Практика
- •Вводная часть
- •Основные термины и определения
- •1 Подготовка бактериальных клеток к анализу
- •1.1 Интактные клетки
- •1.1.1 Растущие клетки
- •1.1.2 Покоящиеся клетки
- •1.1.3 Голодающие покоящиеся клетки
- •1.2 Проницаемость клеток
- •1.2.1 Обработка растворителями
- •1.2.2 Обработка хелатообразующими агентами
- •1.3 Препараты дезинтегрированных клеток
- •1.3.1 Разрушение клеток под действием осмотических сил
- •1.3.2 Дезинтеграция
- •2 Изучение метаболической активности микроорганизмов. Общая характеристика условий эксперимента
Лекция № 1
ВВЕДЕНИЕ. ОСНОВНЫЕ ТЕРМИНЫ И ОПРЕДЕЛЕНИЯ. РОЛЬ РЕГУЛЯТОРНЫХ МЕХАНИЗМОВ В ПОДДЕРЖАНИИ КЛЕТОЧНОГО ГОМЕОСТАЗА. ТИПЫ РЕГУЛЯЦИИ. ВКЛАД ОТЕЧЕСТВЕННЫХ И ЗАРУБЕЖНЫХ ИССЛЕДОВАТЕЛЕЙ В ИЗУЧЕНИЕ МЕХАНИЗМОВ РЕГУЛЯЦИИ МЕТАБОЛИЗМА. ПРАКТИЧЕСКОЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ЗНАНИЙ ОБ ОСНОВАХ РЕГУЛЯЦИИ МЕТАБОЛИЗМА У МИКРООРГАНИЗМОВ
1. Введение
Основная черта всех биохимических и биологических механизмов – их способность их к саморегулированию. В интактной микробной клетке практически все протекающие метаболические процессы регулируются. Высокая эффективность клеточных регуляторных механизмов обеспечивает:
максимально экономичное использование питательных веществ среды, оптимальное количество и соотношение синтезируемых промежуточных и конечных метаболитов;
быструю адаптацию клетки к меняющимся условиям среды за счёт уменьшения или увеличения скорости синтеза определенных метаболитов или скорости образования клеточной энергии.
Если параметры системы отклонены от значений, которые обеспечивают оптимальные условия существования, в организме начинается процесс, направленный на выравнивание значений параметров: будь то содержание сахара в крови, температура тела, концентрация кислорода в тканях и т. п. Следовательно, биологические системы — это не просто машины, а скорее автоматы, приспособленные к сохранению устойчивости в данной среде, которая сама по себе является источником постоянных возмущений. Если в неизменной среде устойчивой является равновесная система, то в изменяющейся среде устойчивость достигается формированием регулирующих механизмов.
Н. Винером (1958г) было отмечено глубокое сходство между системами управления связи в технике и системами, обеспечивающими регулирование в живых организмах. Эта концепция получила название «применением кибернетики к биологии», в ней устанавливает взгляд на организм именно как на машину, а не как на собрание статистических единиц с весьма проблематичными перспективами самоорганизации. Но по-прежнему остается неясным, почему хаотизированная и открытая среда породила столь сложные машины (недостаток данной концепции), но по крайней мере внимание направляется на свойства самих систем (плюс), что дает надежду на отыскание законов, которые описывали бы не только среду или организм в отдельности, но и среду и организм как целое.
Т.о. по Винеру организм с точки зрения теории регулирования – не собрание слабо связанных друг с другом и тождественных частиц, а скорее механизм, в котором все части находятся во взаимодействии, достаточно тесном, чтобы обеспечить функционирование аппаратов обратной связи.
Теория автоматического регулирования явилась слишком примитивной для анализа биологических систем, так как она выделяет небольшое число связанных и регулируемых параметров и базируется на использовании линейных систем дифференциальных уравнений, в то время как биологические системы нелинейны. Но тем не менее в целом эта теория оказалась более пригодной для изучения и моделирования феноменов жизни, чем классическая статистика и термодинамика необратимых процессов. Понятие «системы» в теории регулирования несколько другое. Оно включает указание на то, что система содержит определенным образом связанные между собой элементы и характеризуется наличием так называемого «входа», т. е. в общем случае некоторого воздействия на систему, и «выхода», т. е. ответной реакции системы. Это определение сближает объект исследования с биологическими системами, т.е. это наличие «определенным образом» связанных элементов, а также введение представлений о входе и выходе для характеристики отношений организма и среды.
Т. о., исследования механизмов регуляции метаболизма у микроорганизмов базируются на фундаментальных понятиях и представлениях теории управления и проблемы биогенеза.