Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Дертингер Г. Молекулярная радиобиология. Действие ионизирующих излучений на элементарные биологические объекты

.pdf
Скачиваний:
9
Добавлен:
24.10.2023
Размер:
10.88 Mб
Скачать

растает, с тем чтобы уменьшиться при дальнейшем росте ЛПЭ . Это дает возможность к асимптотическим наклонам этих кривых, служащим мерой радиочувствительности, при действии высоких доз применить рассуждения, приведенные в разд. 5.3. При по­

мощи способа, применяющегося для экспоненциальных

кривых

доза — эффект,

в

выражение для S-образных

кривых

вводится

величина l/D'3V

являющаяся количественной

мерой радиочувст­

вительности. D'37

 

находят,

проводя прямую

через

начало коор­

 

 

 

 

 

динат, параллельную

асимпто­

 

 

 

 

 

тической

части

кривой

доза—

 

 

 

 

 

эффект. Далее D'^

определяют

 

 

 

 

 

так же, как в случаях с одно-

 

 

 

 

 

ударными

кривыми. Эти

фак­

 

 

 

 

 

торы следует принять во вни­

 

 

 

 

 

мание, когда

кривые

инактива­

 

 

 

 

 

ции бактерий анализируются

с

 

 

 

 

 

помощью

 

теории

попадания

и

 

 

 

 

 

теории мишени. По-видимому,

 

 

 

 

 

правильнее

всего

S-образные

 

 

 

 

 

кривые рассматривать как од-

 

 

 

 

 

иоудариые

и

многом пшенные

 

 

 

 

 

кривые. Этот тип кривой под­

 

 

 

 

 

робно проанализирован

в гл. 2

 

 

 

 

 

[см. уравнение

(2.6)

и

рис. 5.]

 

 

 

 

 

Для них

характерны

асимпто­

 

 

 

 

 

тическая

экспоненциальная

за­

О

20

 

40

 

висимость

и

конечное

экстра-

 

доза,

крад

 

поляциоиное

число, равное

чи­

Рис. 101. Инактивация

различных

му­ слу мишений

(см. рис.

5).

 

 

тантов Е. coli

рентгеновским излуче­

Мансон

и

Бриджес

[29]

из­

нием (150 кв)

[13].

 

 

 

 

 

 

 

 

брали это

объяснение,

иденти­

фицировав

экстраполяционное число с числом хроматидных нитей

на бактерию. Это не лишено смысла, так как в зависимости от стадии роста бактерии могут иметь несколько ядер (хромосом). У- Е. соИу как известно, каждая хромосома реплицируется в те­ чение 90% времени клеточного цикла. Следовательно, среднее число хроматидных нитей на хромосому составляет пример­ но 1,44, а не 1. Таким образом, экстраполяционное число прирав­ нивается числу хромосом на бактерию, умноженному на 1,44.

В опытах с некоторыми мутантами Е. coli В/г Мансон и Бриджес [29] подтвердили, что эти величины в целом справед­ ливы, однако полученные результаты все же недостаточно адек­ ватны, чтобы служить доказательством для всей концепции. Такая простая интерпретация во многих случаях представляется неоправданной, поскольку часто получают чисто экспоненциаль­ ные кривые инактиваций. На рис. 101 приведены экспоненци­ альные кривые доза — эффект для дикого штамма Е. coli В и

210

двух

его

мутантов

 

В/г

и

Bs-i,

обладающих различной

радио­

чувствительностью.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Несмотря

на

то,

что

все три

штамма

содержат

одинаковое

количество ДНК,

кривые

доза — эффект

имеют

неодинаковый

наклон. Особенно четко в этом отношении

различаются

штаммы

В/г и Bs-i. Эти различия

 

 

 

 

 

обусловлены

их

неодима-

/,

 

 

 

 

ковой

способностью

к ре­

 

 

 

 

 

парации.

 

Нерешенным

 

 

 

 

 

остается

вопрос, не лучше

 

 

 

 

 

ли

для

описания

 

радиа­

 

 

 

 

 

ционных

 

кривых

инакти­

 

 

 

 

 

вации

использовать

соот­

 

 

 

 

 

ветствующее

стохастиче­

 

 

 

 

 

ское

выражение,

учиты­

 

 

 

 

 

вающее

особенности

об­

 

 

 

 

 

разования

колоний

(см.

 

 

 

 

 

разд.

3.5).

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

УФ-и з л у ч е н и е.

Со­

 

 

 

 

 

вершенно

. другое

 

поло­

 

 

 

 

 

жение, по-видцмому, на­

 

 

 

 

 

блюдается при УФ-облу-

 

 

 

 

 

чении

бактерий,

так

как

 

 

 

 

 

в

данном

случае

 

полу­

 

 

 

 

 

чают

различные

 

виды

 

 

 

 

 

кривых

инактиваций. Об

 

 

 

 

 

этом

свидетельствует

 

и

 

 

 

 

 

рис. 102, на котором при­

 

 

 

 

 

ведены

кривые

выживае­

 

 

 

 

'мм*

мости штаммов кишечной

Рис. 102. Инактивация различных мутантов

палочки

 

В,

В/г

и

Bs-i.

Е. coli УФ-светом с Х=254 нм [13] (По оси

Наряду

с отчетливо

 

выра­

абсцисс — доза УФ-излучения).

 

женной S-образной кри­

 

 

 

 

 

вой для

В/г обращает на себя внимание высокая УФ-чувствитель-

ность

Bs-i, которая, правда, с увеличением дозы снижается. До­

вольно своеобразна

 

кривая доза—эффект дикого штамма Е. coli

В. Несмотря

на заметные

различия в форме кривых, создается

впечатление, что все три кривые асимптотически приобретают одинаковый наклон. Эти три штамма Е. coli различаются только лишь способностью репарировать лучевые повреждения, у дико­ го штамма Е. coli В, очевидно, какую-то роль играет филаментообразоваиие. Для объяснения инактивации кривых в области малых и средних, но не высоких доз можно было бы привлечь интерпретацию, согласно которой форма кривых определяется репарационной способностью клетки. По этому пути пошел Хейнс [14], описавший кривую выживаемости следующим об­ щим уравнением:

N/Na.

(13.1)

211

тде F(D)—число

потенциальных летальных

повреждений

при

дозе D и R{D)—число

репарированных повреждений. Так

как

образование

радиационных повреждений

пропорционально

.дозе, то

 

 

 

 

 

 

F (£>) = kD.

(13.2)

Хейнс [14] предположил, что с дозой число репарабельных по­ вреждений R{D) возрастает, чтобы затем при более высоких

.дозах достигнуть постоянного уровня насыщения. Наиболее простое математическое выражение, отражающее это предпо­ ложение, следующее:

Я ( 0 ) = а ( 1 - е р ' 0 ) .

(13.3)

Отсюда следует, что кривая инактивации

(13.1) в полуло­

гарифмическом масштабе будет иметь начальный наклон k—а(3

лри £ > а р \ Наклон

этой кривой возрастает с дозой,

асимптоти­

чески достигая k.

В этой модели репарационная

способность

не влияет на конечный наклон S-образной кривой, а размер пле­ ча служит мерилом репарации УФ-повреждений. Плечо харак­ теризуется экстраполяционным числом а, которое отражает максимальное число репарированных повреждений. Для рези­ стентного штамма В/г, согласно рис. 102 [14], экстраполяцион-

ное

число а = 466.

Другими словами, у

Е. coii В/г, в соответст­

вии

с

развитой

здесь схемой,

может

репарнроваться до

46'6

УФ-индуцированных повреждений ДНК.

 

 

 

 

Физико-химическое подтверждение репарационной гипотезы

Хейнса получено в опытах Ханавальта

и Хеннса (цит. по [15]),

показывающих,

что включение меченого тимина при репарации

УФ-облученной

бактериальной Д Н К

подчиняется дозной зависи­

мости, сходной

с уравнением

(13.3). Этим инактивационная

мо­

дель

приобретает

значительную долю

вероятности, что также

будет

продемонстрировано в связи

с обсуждением

эффекта

БУ

в следующем разделе. Правда, эти

рассуждения

неприменимы

к случаю с ионизирующим излучением, поскольку

здесь репара­

ционная способность отражается на наклоне

кривой доза — эф­

фект

(см. рис.

101). Прежде

чем перейти к

подробному разбо­

ру репарации радиационных повреждений, мы попытаемся по­ казать, что Д Н К является критической мишенью инактивации, так как от этого в значительной мере будет зависеть достовер­ ность дальнейшей аргументации.

13.3.Бактериальная ДНК как критическая мишень

Вэтом разделе мы ограничимся двумя типами исследова­ ний, одно из которых касается влияния состава оснований на радиочувствительность, а второе — эффекта включения бромурацила в ДНК.

В л и я н и е

с о с т а в а

о с н о в а н и й . Показано, что у мно­

гих бактерий

существует

зависимость между радиочувствитель-

212

ностыо и составом оснований ДНК, выраженным в виде содер­ жания аденина-тимина (А-Т) в процентах. На рис. 103 видна эта корреляция для некоторых видов бактерий при воздействии

как УФ-, так и рентгеновского

излучения.

При этом

чувстви­

тельность для 50% А-Т (Е. coli)

принята

за единицу. Любо­

пытно, что по отношению

к ионизи-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

• рующему

излучению

 

чувствитель­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ность бактерий снижается при уве­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

личении содержания'А-Т, в то вре­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

мя как при действии

УФ-облучения

 

 

 

 

 

 

 

 

 

наблюдается

отчетливо

выраженное

 

 

 

 

 

 

 

 

 

увеличение чувствительности. Одна­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ко интерпретация

этих

 

интересных

 

 

 

 

 

 

 

 

 

результатов,

среди

которых,

 

впро­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

чем, часто

встречаются

исключения,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

требует

 

большой

осторожности.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Нельзя забывать, что радиочувстви­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

тельность

зависит

не только

от со­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

става оснований, но и от множества

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

других параметров и, в частности,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

от репарационной

способности

раз­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

личных

штаммов. Это

убедительно

О

 

 

25

50

75

 

доказывается

сравнением

радиочув­

 

 

 

ствительности

различных

мутантов

 

 

Содержание А-Т, X

 

Е. coli

(см. рис.

101

и

102),

кото­

 

Рис. 103. Влияние состава ос­

рые при идентичном составе осно­

нований

ДН К

на

чувствитель­

ваний существенно различаются по

ность

 

(отн.

ед.)

 

бактерий

чувствительности.

Строго

говоря,

(ось

ординат)

к

УФ- (2)

и

такого рода

анализ

радиочувстви­

ионизирующему

(/)

излучени­

тельности

бактерий

следует

начать

ям. В

обоих случаях

содержа­

ние

аденина-тимина

(А.-Т)

в

с подразделения их на группы, не

бактериях:

 

 

 

 

 

различающиеся

в

отношении

ос­

 

Ps.

fluorescens — 40%;

S. marces-

тальных

параметров. Поэтому

это

cens—42%; E . coli—50%; B . sub-

tilis—57%;

M . p y o g e n e s — 6 6 % г и

В .

наблюдение само по себе не дает

 

cereus—67%

[12,23[ .

 

 

 

достаточных

оснований

для

утвер­

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ждения, что ДН К и есть первичная

мишень действия

излучения.

Увеличение чувствительности к УФ-облучению с возраста­ нием содержания А-Т можно объяснить тем, что димеры тимина являются важнейшими из индуцируемых летальных поврежде­ ний при УФ-облучении и что частота их образования несомнен­ но возрастает с увеличением содержания А-Т. Не совсем ясно, почему при ионизирующем облучении наблюдается обратный эффект. Однако возможное объяснение причины этой корреля­ ции, очевидно, лежит в природе индуцированных излучением из­ менений оснований. В табл. 12 приводились некоторые иденти­ фицированные радикалы компонентов ДНК, обнаруженные с помощью ЭПР. Оказалось, что у цитозина, в отличие от всех остальных оснований, воздействие на карбонильную группу

213

сопровождается образованием

радикала СОН'

[7], что,

возмож­

но, ведет к разрыву водородной связи. Образование

радикала

может привести к локальной

денатурации ДНК, объясняющей

увеличение чувствительности

к ионизирующему

излучению при

возрастающем содержании Г-Ц. В этой связи следует напом­ нить, что при ионизирующем излучении эффект БУ, возможно,

объясняется

образованием радикала СОН- (см. разд. 12.5) и что

 

 

радиочувствительность

возрастает

с

 

 

увеличением содержания БУ в составе

 

 

ДНК.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Э ф ф е к т

БУ.

Включение

галоге-

 

 

низированного

аналога

оснований

в

 

 

состав

бактериальной

ДНК

 

служит

 

 

убедительным

доказательством

роли

 

 

ДНК как первичной мишени радиаци­

 

 

онного

воздействия. Особенно

важное

 

 

значение

имеет БУ, который

может

 

 

быть включен в Д Н К

вместо

тимина.

 

 

О

его

сенсибилизирующем

действии

 

 

на

ДНК. вирусов

уже говорилось

в

 

 

разд. 12.5, так что в этом

 

разделе

 

 

будут

рассмотрены

только

эффекты,

 

 

касающиеся Д Н К бактерий. У

бакте­

 

 

рий, как и у бактериофагов,

 

наблю­

 

 

дается

увеличение

чувствительности,

 

 

если в Д Н К встраивается галогенизи-

 

 

рованное

основание.

Сенсибилизация

Рис. 104. УФ-инактивация

с возрастанием степени замены

увели­

Е. coli В Т - с

нормальной и

чивается

даже

и в тех

случаях, когда

замещенной

бромураци.юм

аналог

содержится

только в

одной

из

Д Н К [22f:

 

нитей

ДНК [22]. На

рис. 104

показано

/ — тимин: 2 — БУ.

влияние максимальной замены БУ на

 

 

 

 

кривую УФ-инактивации безтиминово-

го мутанта

Е. coli В Т - ,

в который

БУ включается относительно

легко. Несмотря на то, что включение БУ существенно умень­

шает

плечо кривой

УФ-инактивации,

асимптотический

наклон

ее практически остается без изменений.

Попытка интерпретиро­

вать

этот результат

только с помощью

инактивационной

гипо­

тезы Хейнса, объясняющей наличие плеча на кривой выживае­

мости репарацией УФ-повреждений, приведет

нас

к выводу,

что включение БУ в ДНК препятствует правильной

репарации,

как это наблюдалось в случае

с вирусами

(см.

разд. 12.5).

Этот вывод подтверждается исследованиями Аоки

с сотр. [1].

Иначе обстоит дело при ионизирующем облучении, когда

после включения БУ возрастает

наклон кривой инактивации

(рис. 105). Как показал Каплан [21], увеличение чувствитель­ ности бактерий, содержащих БУ-ДНК, коррелирует с нараста­ нием числа двойных разрывов нитей Д Н К (рис. 106). Автор

214

лизировал мутант Е. coli К12 й сёдиментировал ДНК в ней­ тральном градиенте сахарозы. В этих условиях двухцепочечные

разрывы нитей Д Н К вызывают нарушения

скорости седимента­

ции. Как видно

из

рис. 106, относительная

седиментация ДНК,

содержащей

БУ,

с увеличением

дозы

снижается

в

три раза быстрее, чем у нормальной ДНК. Такой же эффект сен-

100^ ,

0,1 >

1

1

1

 

1

L

 

 

 

 

 

О

 

Ю

 

20

 

 

 

 

 

 

 

 

Доза, крад

 

 

 

 

 

 

Рис.

105.

Инактивация

рентгенов­

Рис.

106.

Снижение

относительной

ским

облучением

Е. coli

В Т -

с

седиментации нормальной (/) и за­

нормальной

(1)

и

замещенной

мещенной бромурацилом (2) Д Н К из

бромурацилом (2)

Д Н К

[22].

 

мутанта

Е. coli К 1.2 в

нейтральном

 

 

 

 

 

 

 

 

градиенте сахарозы при у-облучении

 

 

 

 

 

 

 

 

Со 6 0

вегетативных клеток [21].

сибилизации был получен в параллельном опыте, в котором ра­ диочувствительность оценивалась по способности образовывать колонии. Кроме того, Каплан [21] путем седиментации в щелоч­

ном градиенте сахарозы

(опыт такого рода

показан

на рис. 112)

обнаружил, что

в Д Н К

Е. coli, содержащей БУ,

одноцепочеч-

ные разрывы не

репарируются.

 

 

При включении БУ

трансформирующая

Д Н К

сенсибилизи­

руется в такой же мере, как и способность образовывать коло­ нии [40]. Этот факт, совместно с другими данными, полученны­ ми в опытах с БУ, показывает, что и у бактерий Д Н К являет­ ся критической мишенью, а также что радиационные поврежде­

ния Д Н К ответственны

за репродуктивную гибель

облученных

клеток.

 

 

13.4. Репарация УФ-повреждений

 

Способность клетки

репарировать повреждения

Д Н К — важ­

ный фактор, определяющий ее радиочувствительность. Эта ре­ парационная способность была тщательно изучена у бактерий, и поэтому можно сказать, что основные принципы репарации у этих объектов на сегодняшний день в целом ясны. Как будет

215

видно из последующих разделов, прежде чем говорить о репа­ рации повреждений, индуцированных ионизирующими излуче­ ниями, не лишено смысла проанализировать процессы репара­ ции после воздействия УФ-излучения. Фотореактивация и тем-

новая

репарация — два

важнейших

механизма

восстановления

от

УФ-поврежденин. Оба эти

процесса,

 

совершенно

различные

по своей природе, управляются

ферментативно.

 

 

 

 

 

 

Ф о т о р е а кт и в а ц и я. Как показали

самые

ранние

иссле­

 

 

 

 

 

 

 

 

дования эффектов УФ-облуче-

 

 

 

 

 

 

 

 

ния,

 

фотореактивация — это

 

 

 

 

 

 

 

 

высокоэффективный

процесс,

 

 

 

 

 

 

 

 

охватывающий

 

многие

биоло­

 

 

 

 

 

 

 

 

гические

системы.

Начиная с

 

 

 

 

 

 

 

 

1904

г. мы

находим

отдельные

 

 

 

 

 

 

 

 

упоминания

о

 

фотореактива­

 

 

 

 

 

 

 

 

ции, но только после вторично­

 

 

 

 

 

 

 

 

го открытия ее в 1949 г. Кель­

 

 

 

 

 

 

 

 

нером

этот

примечательный

 

 

 

 

 

 

 

 

процесс

 

становится

объектом

 

 

 

 

 

 

 

 

более пристального

внимания

 

 

 

 

 

 

 

 

ученых.

 

Фотореактивация,

ха­

 

 

 

 

 

 

 

 

рактерная также и для виру­

 

 

 

0

20

 

40

сов

(см. разд.

12.4), осущест­

 

 

 

 

вляется

 

ферментом,

элимини­

 

 

 

 

. Время освещения, мин

 

Рис.

107.

Внеклеточная

фотореактн-

рующим УФ-повреждения при

участии

 

света

с длиной

волны

вация УФ-облученной трансформи­

300

и

 

400 нм.

В

некоторых

рующей

Д Н К из Haemophilus

influen­

 

zae

после

инкубации

с

экстрактами

случаях

 

фотореактивация

про­

из

клеток

Е. coli В

(/)

и

Е. coli

текает без

участия

ферментов.

Bphr-

(2)

[34].

 

 

 

Это

так

 

называемая

непрямая

 

 

 

 

 

 

 

 

фотореактивация.

Мы

не

бу­

дем

останавливаться

на

ней подробно,

поскольку до сих

пор

не вполне ясен механизм, лежащий в ее основе [38]. Как пока­ зывает пример с трансформацией (рис. 107), ферментативная фотореактивация может проводиться in vi'tro. Реактивация про­ исходит в том случае, 'когда УФ-облученную Д Н К инкубируют с клеточным экстрактом из Е. coli В, о чем свидетель­ ствует возрастание числа трансформированных клеток с увеличением времени инкубации. Однако если трансформирую­ щую Д Н К инкубировать с экстрактом из мутанта Е. coli В phr", не содержащего фермента фотореактивации, трансформирую­ щая активность остается без изменений. Подобными опытами in vitro доказывается существование следующих этапов процес­ са фотореактивации.

1. Во время инкубации, даже если она проводится в тем­ ноте, фермент образует комплекс с УФ-облученной (но не с необлученной) ДНК, что подтверждается центрифугированием и колоночной хроматографией.

216

2. Димеры пиримидиновых оснований, мономеризующиеся в процессе реактивации, являются основными повреждениями, элиминирующимися при воздействии света.

3. После

освещения ДНК-ферментный комплекс распадает­

ся и процесс репарации завершается.

Кинетику

'образования внутриклеточного комплекса можно

проследить с помощью одиночных вспышек света длительностью

примерно в 1 мсек,

варьируя интервал

между. УФ-облучением

и реактивирующей

вспышкой [11]. В клетках

Bs_i, находящихся

в стационарной фазе роста, при облучении

254

нм в дозе 4,8

эрг/мм2

(1 эрг/мм2

индуцирует примерно 6,5 пиримидиновых ди­

меров

на геном Е. coli)

максимальное

число

комплексов обра­

зуется

приблизительно

за 5 мин

при

комнатной

температуре,

причем

5 0 % — в течение первых

10—15

сек.

При

более высоких

дозах УФ-облучения максимальное число комплексов достигает постоянного предельного значения 20. Не исключено, что эта цифра примерно соответствует числу молекул фотореактивирующего фермента в каждой клетке. У некоторых мутанов Bs_i это число достигает 100 молекул на клетку [10]. Но все же ясны не все детали механизма, посредством которого видимый свет при­ нимает участие в процессе реактивации, хотя фотореактивация элиминирует до 90% УФ-повреждений. Более подробную инфор­

мацию читатель найдет в статьях

Сетлоу [38], а также

Рупер­

та и Харма [35]. Положение гена

(phr), определяющего

продук­

цию фермента фотореактивации на карте бактериальной хро­ мосомы, демонстрируется на рис. 113.

Т е м н о в а я р е п а р а ц и я . Некоторые особенности отли­ чают этот ферментативный процесс от фотореактивации. Вопервых, как показывает название, репарация протекает без участия света. Однако главное отличие заключается в том, что элиминируются не только УФ-повреждения, т. е. димеры пири­ мидиновых оснований, но и повреждения, представляющие со­ бой поперечные сшивки нитей ДНК. Последние возникают при действии на Д Н К алкилирующих веществ, например азотисто­ го иприта, сшивающего два соседних остатка молекул гуанина, лежащих в противоположных нитях ДНК. Репарация повреж­ дений, явно отличающихся по строению от димеров тимина, дает возможность считать, что в случае темновой репарации мы имеем дело с универсальным процессом коррекции, позволяю­ щим выяснить различные изменения конфигурации ДНК. Дей­ ствительно, кроме азотистого иприта имеются еще другие аген­ ты, действие которых также частично снимается при темновой репарации. Наконец, темновая репарация отличается от фото­ реактивации еще и тем, что димеры и сшивки не просто разры­ ваются, а выщепляются из Д Н К в результате сложного процес­ са и заменяются-вновь синтезированными участками. Именно поэтому темновую репарацию часто называют репарацией пу­ тем выщепления.

8 Г. Дертпнгер, X. Юнг

217

Выщепление димеров тимина из УФ-облученной Д Н К одно­ временно было обнаружено Сетлоу и Керриером [39] и Бойсом

иГовардом-Фландерсом [2].

Вих опытах были использованы чувствительные и резистент­ ные к УФ-облучению мутанты Е. coli, в Д Н К которых был пред­ варительно включен Н3 -тимин. После УФ-облучения, за которым следовала инкубация в темноте, клетки лизировали и затем

 

 

 

 

осаждали Д Н К при по­

 

 

 

 

мощи

трихлоруксусной

 

 

 

 

кислоты.

У чувствитель­

 

 

 

 

ных мутантов

вся

радио­

 

 

 

 

чувствительность

 

прак­

 

 

 

 

тически

 

оставалась

в

 

 

 

 

ДНК, в то время как у

 

 

 

 

резистентных

мутантов

 

 

 

 

радиоактивные

продукты,

 

 

 

 

представляющие

 

собой

 

 

 

 

выщепленные

компонен­

 

 

 

 

ты ДНК, были

обнаруже­

 

 

 

 

ны в надосадочной

жид­

 

 

 

 

кости.

С

помощью

бу-

 

60

120

180

м ажной

 

хром атогр аф ии

 

Время

инкубации,

мин

было

установлено,

 

что

Рис. 108. Потеря Н3 -тимина

(/) и включе­

этими

компонентами

яв­

ляются

димеры

тимина,

ние С1 4 -БУ

(2) в Д Н К УФ-облученных кле­

ток Е. coli

в зависимости от

продолжитель­

встречающиеся

в виде ко­

ности инкубации клеток после окончания

ротких

олпгонуклеотидов,

облучения

[30].

 

 

содержащих

не

 

более

 

 

 

 

трех основании. Эти

опы­

ты показали, что димер тимина не расщепляется в темноте, а выщепляется целиком.

Кроме того, эксперименты Петиджона и Ханавальта [30] под­ твердили, что при выщеплении поврежденного участка проис­ ходит ресинтез удаленного материала. Для этих опытов был использован ауксотрофный мутант Е. coli TAU-bar с дефици­ том урацила, а также ряда аминокислот и тимина. Н3 -тимин включался в бактериальную Д Н К в течение двенадцати поколе­ ний. После УФ-облучения клетки выращивались на среде, со­ держащей С1 4 -БУ. С помощью БУ получили четкую картину се­ диментации экстрагированной ДИК. Как показано на рис. 108, активность трития и, следовательно, количество тимина в Д Н К уменьшается при увеличении времени инкубации в БУ-содер- жащей среде благодаря выщеплению УФ-повреждений. Напро­ тив, одновременное возрастание См -активности можно отнести за счет внедрения БУ во время реконструкции ДНК. Петиджону и Ханавальту удалось доказать, что БУ включается во время

репарации ДНК, а не во

время полуконсервативной

реплика­

ции. Они экстрагировали

репарированиую Д Н К из

клеток и

218

центрифугировали ее в градиенте CsCl. Репарированная Д Н К выявлялась в месте локализации «легкой» тимин-ДНК в про­ филе седиментации и без труда опознавалась с помощью ра­ диоактивной метки БУ.

Этот результат можно интерпретировать исключительно в терминах выщепления димеров, беспорядочно распределенных в ДНК, с последующим их замещением БУ. Однако общее ко­ личество включенного БУ столь мало, что не отражается на скорости седиментации относительно «легкой» ДНК. В проти­

вовес этому в

полукоисервативно реплицироваиной Д Н К

БУ

обнаруживается

в составе гибридной Д Н К (т. е. ДНК,

несу­

щей БУ в тиминсодержащих тяжах), а также в виде полностью замещенных БУ тяжей ДНК. Кроме того, БУ встречается и в сегментах ДНК, принимающих участие в репликации. Дегра­ дация Д Н К с помощью ультразвука или ДНК-азы дополни­ тельно доказывает, что БУ встраивается в небольшие участки ДНК. Такие вновь синтезированные участки содержат по край­ ней мере 25, а возможно, и не менее нескольких сотен нуклеотидов. Это означает, что из нити Д Н К выщепляются не только димеры тимина, но также и некоторое количество нуклеотидов, находящихся в непосредственной близости от повреждения. Весьма любопытно, хотя и объяснимо на основании всего ска­ занного, что после предварительной фотореактивации БУ не

встраивается в

Д Н К

и что УФ-чувствительный

мутант ки­

шечной

палочки

Bs-i

не обнаруживает

этого

вида

репарации.

Две

модели темповой репарации, основанные на предложе­

нии Бойса и Говарда-Фландерса [2], а

также

Сетлоу

и Керрие-

ра [39], полностью соответствуют полученным данным. Они из­ вестны как гипотезы «замещения — иссечения» и «иссечения— замещения» [9]. Оба эти механизма, которые в настоящее время считаются идентичными, графически представлены на рис. 109. В механизме выщепления — замещения можно выделить следую­ щие этапы:

1.Узнавание повреждения.

2.Выщепление повреждения путем эндонуклеолитической иицизии и последующей эксцизии (осуществляемой другой эндоиуклеазой или экзонуклеазой).

3.Расширение пробела 5', З'-экзонуклеазой, которое нахо­

дит' отражение в наблюдаемой деградации ДНК.

4. Репаративный синтез при помощи 3', 5'-ДНК-полимеразы, для которой роль матрицы выполняет неповрежденная компле­ ментарная нить.

5. Сшивка конечной фосфоэфирной связи при участии полинуклеотидлигазы.

Модель замещения — иссечения (см. рис. 109, а) стремится избежать образования более протяженных одноцепочечных участ­ ков, чувствительных к силам сдвига и потому угрожающих вос­ становлению ДНК. После инцизии эндонуклеазой репаративный

8* 219

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ