книги из ГПНТБ / Дертингер Г. Молекулярная радиобиология. Действие ионизирующих излучений на элементарные биологические объекты
.pdfрастает, с тем чтобы уменьшиться при дальнейшем росте ЛПЭ . Это дает возможность к асимптотическим наклонам этих кривых, служащим мерой радиочувствительности, при действии высоких доз применить рассуждения, приведенные в разд. 5.3. При по
мощи способа, применяющегося для экспоненциальных |
кривых |
|||||||||||||
доза — эффект, |
в |
выражение для S-образных |
кривых |
вводится |
||||||||||
величина l/D'3V |
являющаяся количественной |
мерой радиочувст |
||||||||||||
вительности. D'37 |
|
находят, |
проводя прямую |
через |
начало коор |
|||||||||
|
|
|
|
|
динат, параллельную |
асимпто |
||||||||
|
|
|
|
|
тической |
части |
кривой |
доза— |
||||||
|
|
|
|
|
эффект. Далее D'^ |
определяют |
||||||||
|
|
|
|
|
так же, как в случаях с одно- |
|||||||||
|
|
|
|
|
ударными |
кривыми. Эти |
фак |
|||||||
|
|
|
|
|
торы следует принять во вни |
|||||||||
|
|
|
|
|
мание, когда |
кривые |
инактива |
|||||||
|
|
|
|
|
ции бактерий анализируются |
с |
||||||||
|
|
|
|
|
помощью |
|
теории |
попадания |
и |
|||||
|
|
|
|
|
теории мишени. По-видимому, |
|||||||||
|
|
|
|
|
правильнее |
всего |
S-образные |
|||||||
|
|
|
|
|
кривые рассматривать как од- |
|||||||||
|
|
|
|
|
иоудариые |
и |
многом пшенные |
|||||||
|
|
|
|
|
кривые. Этот тип кривой под |
|||||||||
|
|
|
|
|
робно проанализирован |
в гл. 2 |
||||||||
|
|
|
|
|
[см. уравнение |
(2.6) |
и |
рис. 5.] |
||||||
|
|
|
|
|
Для них |
характерны |
асимпто |
|||||||
|
|
|
|
|
тическая |
экспоненциальная |
за |
|||||||
О |
20 |
|
40 |
|
висимость |
и |
конечное |
экстра- |
||||||
|
доза, |
крад |
|
поляциоиное |
число, равное |
чи |
||||||||
Рис. 101. Инактивация |
различных |
му слу мишений |
(см. рис. |
5). |
|
|
||||||||
тантов Е. coli |
рентгеновским излуче |
Мансон |
и |
Бриджес |
[29] |
из |
||||||||
нием (150 кв) |
[13]. |
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
брали это |
объяснение, |
иденти |
|||||||
фицировав |
экстраполяционное число с числом хроматидных нитей |
на бактерию. Это не лишено смысла, так как в зависимости от стадии роста бактерии могут иметь несколько ядер (хромосом). У- Е. соИу как известно, каждая хромосома реплицируется в те чение 90% времени клеточного цикла. Следовательно, среднее число хроматидных нитей на хромосому составляет пример но 1,44, а не 1. Таким образом, экстраполяционное число прирав нивается числу хромосом на бактерию, умноженному на 1,44.
В опытах с некоторыми мутантами Е. coli В/г Мансон и Бриджес [29] подтвердили, что эти величины в целом справед ливы, однако полученные результаты все же недостаточно адек ватны, чтобы служить доказательством для всей концепции. Такая простая интерпретация во многих случаях представляется неоправданной, поскольку часто получают чисто экспоненциаль ные кривые инактиваций. На рис. 101 приведены экспоненци альные кривые доза — эффект для дикого штамма Е. coli В и
210
двух |
его |
мутантов |
|
В/г |
и |
Bs-i, |
обладающих различной |
радио |
|||||||
чувствительностью. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
Несмотря |
на |
то, |
что |
все три |
штамма |
содержат |
одинаковое |
|||||||
количество ДНК, |
кривые |
доза — эффект |
имеют |
неодинаковый |
|||||||||||
наклон. Особенно четко в этом отношении |
различаются |
штаммы |
|||||||||||||
В/г и Bs-i. Эти различия |
|
|
|
|
|
||||||||||
обусловлены |
их |
неодима- |
/, |
|
|
|
|
||||||||
ковой |
способностью |
к ре |
|
|
|
|
|
||||||||
парации. |
|
Нерешенным |
|
|
|
|
|
||||||||
остается |
вопрос, не лучше |
|
|
|
|
|
|||||||||
ли |
для |
описания |
|
радиа |
|
|
|
|
|
||||||
ционных |
|
кривых |
инакти |
|
|
|
|
|
|||||||
вации |
использовать |
соот |
|
|
|
|
|
||||||||
ветствующее |
стохастиче |
|
|
|
|
|
|||||||||
ское |
выражение, |
учиты |
|
|
|
|
|
||||||||
вающее |
особенности |
об |
|
|
|
|
|
||||||||
разования |
колоний |
(см. |
|
|
|
|
|
||||||||
разд. |
3.5). |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
УФ-и з л у ч е н и е. |
Со |
|
|
|
|
|
||||||||
вершенно |
. другое |
|
поло |
|
|
|
|
|
|||||||
жение, по-видцмому, на |
|
|
|
|
|
||||||||||
блюдается при УФ-облу- |
|
|
|
|
|
||||||||||
чении |
бактерий, |
так |
как |
|
|
|
|
|
|||||||
в |
данном |
случае |
|
полу |
|
|
|
|
|
||||||
чают |
различные |
|
виды |
|
|
|
|
|
|||||||
кривых |
инактиваций. Об |
|
|
|
|
|
|||||||||
этом |
свидетельствует |
|
и |
|
|
|
|
|
|||||||
рис. 102, на котором при |
|
|
|
|
|
||||||||||
ведены |
кривые |
выживае |
|
|
|
|
'мм* |
||||||||
мости штаммов кишечной |
Рис. 102. Инактивация различных мутантов |
||||||||||||||
палочки |
|
В, |
В/г |
и |
Bs-i. |
Е. coli УФ-светом с Х=254 нм [13] (По оси |
|||||||||
Наряду |
с отчетливо |
|
выра |
абсцисс — доза УФ-излучения). |
|
||||||||||
женной S-образной кри |
|
|
|
|
|
||||||||||
вой для |
В/г обращает на себя внимание высокая УФ-чувствитель- |
||||||||||||||
ность |
Bs-i, которая, правда, с увеличением дозы снижается. До |
||||||||||||||
вольно своеобразна |
|
кривая доза—эффект дикого штамма Е. coli |
|||||||||||||
В. Несмотря |
на заметные |
различия в форме кривых, создается |
впечатление, что все три кривые асимптотически приобретают одинаковый наклон. Эти три штамма Е. coli различаются только лишь способностью репарировать лучевые повреждения, у дико го штамма Е. coli В, очевидно, какую-то роль играет филаментообразоваиие. Для объяснения инактивации кривых в области малых и средних, но не высоких доз можно было бы привлечь интерпретацию, согласно которой форма кривых определяется репарационной способностью клетки. По этому пути пошел Хейнс [14], описавший кривую выживаемости следующим об щим уравнением:
N/Na. |
(13.1) |
211
тде F(D)—число |
потенциальных летальных |
повреждений |
при |
|
дозе D и R{D)—число |
репарированных повреждений. Так |
как |
||
образование |
радиационных повреждений |
пропорционально |
||
.дозе, то |
|
|
|
|
|
|
F (£>) = kD. |
(13.2) |
Хейнс [14] предположил, что с дозой число репарабельных по вреждений R{D) возрастает, чтобы затем при более высоких
.дозах достигнуть постоянного уровня насыщения. Наиболее простое математическое выражение, отражающее это предпо ложение, следующее:
Я ( 0 ) = а ( 1 - е р ' 0 ) . |
(13.3) |
Отсюда следует, что кривая инактивации |
(13.1) в полуло |
гарифмическом масштабе будет иметь начальный наклон k—а(3
лри £ > а р \ Наклон |
этой кривой возрастает с дозой, |
асимптоти |
чески достигая k. |
В этой модели репарационная |
способность |
не влияет на конечный наклон S-образной кривой, а размер пле ча служит мерилом репарации УФ-повреждений. Плечо харак теризуется экстраполяционным числом а, которое отражает максимальное число репарированных повреждений. Для рези стентного штамма В/г, согласно рис. 102 [14], экстраполяцион-
ное |
число а = 466. |
Другими словами, у |
Е. coii В/г, в соответст |
|||||||
вии |
с |
развитой |
здесь схемой, |
может |
репарнроваться до |
46'6 |
||||
УФ-индуцированных повреждений ДНК. |
|
|
|
|||||||
|
Физико-химическое подтверждение репарационной гипотезы |
|||||||||
Хейнса получено в опытах Ханавальта |
и Хеннса (цит. по [15]), |
|||||||||
показывающих, |
что включение меченого тимина при репарации |
|||||||||
УФ-облученной |
бактериальной Д Н К |
подчиняется дозной зависи |
||||||||
мости, сходной |
с уравнением |
(13.3). Этим инактивационная |
мо |
|||||||
дель |
приобретает |
значительную долю |
вероятности, что также |
|||||||
будет |
продемонстрировано в связи |
с обсуждением |
эффекта |
БУ |
||||||
в следующем разделе. Правда, эти |
рассуждения |
неприменимы |
||||||||
к случаю с ионизирующим излучением, поскольку |
здесь репара |
|||||||||
ционная способность отражается на наклоне |
кривой доза — эф |
|||||||||
фект |
(см. рис. |
101). Прежде |
чем перейти к |
подробному разбо |
ру репарации радиационных повреждений, мы попытаемся по казать, что Д Н К является критической мишенью инактивации, так как от этого в значительной мере будет зависеть достовер ность дальнейшей аргументации.
13.3.Бактериальная ДНК как критическая мишень
Вэтом разделе мы ограничимся двумя типами исследова ний, одно из которых касается влияния состава оснований на радиочувствительность, а второе — эффекта включения бромурацила в ДНК.
В л и я н и е |
с о с т а в а |
о с н о в а н и й . Показано, что у мно |
гих бактерий |
существует |
зависимость между радиочувствитель- |
212
ностыо и составом оснований ДНК, выраженным в виде содер жания аденина-тимина (А-Т) в процентах. На рис. 103 видна эта корреляция для некоторых видов бактерий при воздействии
как УФ-, так и рентгеновского |
излучения. |
При этом |
чувстви |
||||||||||||||||
тельность для 50% А-Т (Е. coli) |
принята |
за единицу. Любо |
|||||||||||||||||
пытно, что по отношению |
к ионизи- |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
• рующему |
излучению |
|
чувствитель |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
ность бактерий снижается при уве |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
личении содержания'А-Т, в то вре |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
мя как при действии |
УФ-облучения |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
наблюдается |
отчетливо |
выраженное |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
увеличение чувствительности. Одна |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
ко интерпретация |
этих |
|
интересных |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
результатов, |
среди |
которых, |
|
впро |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
чем, часто |
встречаются |
исключения, |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
требует |
|
большой |
осторожности. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
Нельзя забывать, что радиочувстви |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
тельность |
зависит |
не только |
от со |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
става оснований, но и от множества |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
других параметров и, в частности, |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
от репарационной |
способности |
раз |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
личных |
штаммов. Это |
убедительно |
О |
|
|
25 |
50 |
75 |
|
||||||||||
доказывается |
сравнением |
радиочув |
|
|
|
||||||||||||||
ствительности |
различных |
мутантов |
|
|
Содержание А-Т, X |
|
|||||||||||||
Е. coli |
(см. рис. |
101 |
и |
102), |
кото |
|
Рис. 103. Влияние состава ос |
||||||||||||
рые при идентичном составе осно |
нований |
ДН К |
на |
чувствитель |
|||||||||||||||
ваний существенно различаются по |
ность |
|
(отн. |
ед.) |
|
бактерий |
|||||||||||||
чувствительности. |
Строго |
говоря, |
(ось |
ординат) |
к |
УФ- (2) |
и |
||||||||||||
такого рода |
анализ |
радиочувстви |
ионизирующему |
(/) |
излучени |
||||||||||||||
тельности |
бактерий |
следует |
начать |
ям. В |
обоих случаях |
содержа |
|||||||||||||
ние |
аденина-тимина |
(А.-Т) |
в |
||||||||||||||||
с подразделения их на группы, не |
бактериях: |
|
|
|
|
|
|||||||||||||
различающиеся |
в |
отношении |
ос |
|
Ps. |
fluorescens — 40%; |
S. marces- |
||||||||||||
тальных |
параметров. Поэтому |
это |
cens—42%; E . coli—50%; B . sub- |
||||||||||||||||
tilis—57%; |
M . p y o g e n e s — 6 6 % г и |
В . |
|||||||||||||||||
наблюдение само по себе не дает |
|
cereus—67% |
[12,23[ . |
|
|
|
|||||||||||||
достаточных |
оснований |
для |
утвер |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
ждения, что ДН К и есть первичная |
мишень действия |
излучения. |
Увеличение чувствительности к УФ-облучению с возраста нием содержания А-Т можно объяснить тем, что димеры тимина являются важнейшими из индуцируемых летальных поврежде ний при УФ-облучении и что частота их образования несомнен но возрастает с увеличением содержания А-Т. Не совсем ясно, почему при ионизирующем облучении наблюдается обратный эффект. Однако возможное объяснение причины этой корреля ции, очевидно, лежит в природе индуцированных излучением из менений оснований. В табл. 12 приводились некоторые иденти фицированные радикалы компонентов ДНК, обнаруженные с помощью ЭПР. Оказалось, что у цитозина, в отличие от всех остальных оснований, воздействие на карбонильную группу
213
сопровождается образованием |
радикала СОН' |
[7], что, |
возмож |
но, ведет к разрыву водородной связи. Образование |
радикала |
||
может привести к локальной |
денатурации ДНК, объясняющей |
||
увеличение чувствительности |
к ионизирующему |
излучению при |
возрастающем содержании Г-Ц. В этой связи следует напом нить, что при ионизирующем излучении эффект БУ, возможно,
объясняется |
образованием радикала СОН- (см. разд. 12.5) и что |
||||||||||
|
|
радиочувствительность |
возрастает |
с |
|||||||
|
|
увеличением содержания БУ в составе |
|||||||||
|
|
ДНК. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Э ф ф е к т |
БУ. |
Включение |
галоге- |
|||||
|
|
низированного |
аналога |
оснований |
в |
||||||
|
|
состав |
бактериальной |
ДНК |
|
служит |
|||||
|
|
убедительным |
доказательством |
роли |
|||||||
|
|
ДНК как первичной мишени радиаци |
|||||||||
|
|
онного |
воздействия. Особенно |
важное |
|||||||
|
|
значение |
имеет БУ, который |
может |
|||||||
|
|
быть включен в Д Н К |
вместо |
тимина. |
|||||||
|
|
О |
его |
сенсибилизирующем |
действии |
||||||
|
|
на |
ДНК. вирусов |
уже говорилось |
в |
||||||
|
|
разд. 12.5, так что в этом |
|
разделе |
|||||||
|
|
будут |
рассмотрены |
только |
эффекты, |
||||||
|
|
касающиеся Д Н К бактерий. У |
бакте |
||||||||
|
|
рий, как и у бактериофагов, |
|
наблю |
|||||||
|
|
дается |
увеличение |
чувствительности, |
|||||||
|
|
если в Д Н К встраивается галогенизи- |
|||||||||
|
|
рованное |
основание. |
Сенсибилизация |
|||||||
Рис. 104. УФ-инактивация |
с возрастанием степени замены |
увели |
|||||||||
Е. coli В Т - с |
нормальной и |
чивается |
даже |
и в тех |
случаях, когда |
||||||
замещенной |
бромураци.юм |
аналог |
содержится |
только в |
одной |
из |
|||||
Д Н К [22f: |
|
нитей |
ДНК [22]. На |
рис. 104 |
показано |
||||||
/ — тимин: 2 — БУ. |
влияние максимальной замены БУ на |
||||||||||
|
|
||||||||||
|
|
кривую УФ-инактивации безтиминово- |
|||||||||
го мутанта |
Е. coli В Т - , |
в который |
БУ включается относительно |
легко. Несмотря на то, что включение БУ существенно умень
шает |
плечо кривой |
УФ-инактивации, |
асимптотический |
наклон |
ее практически остается без изменений. |
Попытка интерпретиро |
|||
вать |
этот результат |
только с помощью |
инактивационной |
гипо |
тезы Хейнса, объясняющей наличие плеча на кривой выживае
мости репарацией УФ-повреждений, приведет |
нас |
к выводу, |
|
что включение БУ в ДНК препятствует правильной |
репарации, |
||
как это наблюдалось в случае |
с вирусами |
(см. |
разд. 12.5). |
Этот вывод подтверждается исследованиями Аоки |
с сотр. [1]. |
||
Иначе обстоит дело при ионизирующем облучении, когда |
|||
после включения БУ возрастает |
наклон кривой инактивации |
(рис. 105). Как показал Каплан [21], увеличение чувствитель ности бактерий, содержащих БУ-ДНК, коррелирует с нараста нием числа двойных разрывов нитей Д Н К (рис. 106). Автор
214
лизировал мутант Е. coli К12 й сёдиментировал ДНК в ней тральном градиенте сахарозы. В этих условиях двухцепочечные
разрывы нитей Д Н К вызывают нарушения |
скорости седимента |
|||||
ции. Как видно |
из |
рис. 106, относительная |
седиментация ДНК, |
|||
содержащей |
БУ, |
с увеличением |
дозы |
снижается |
в |
три раза быстрее, чем у нормальной ДНК. Такой же эффект сен-
100^ ,
0,1 > |
1 |
1 |
1 |
|
1 |
L |
|
|
|
|
|
|
О |
|
Ю |
|
20 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Доза, крад |
|
|
|
|
|
|
||
Рис. |
105. |
Инактивация |
рентгенов |
Рис. |
106. |
Снижение |
относительной |
||||
ским |
облучением |
Е. coli |
В Т - |
с |
седиментации нормальной (/) и за |
||||||
нормальной |
(1) |
и |
замещенной |
мещенной бромурацилом (2) Д Н К из |
|||||||
бромурацилом (2) |
Д Н К |
[22]. |
|
мутанта |
Е. coli К 1.2 в |
нейтральном |
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
градиенте сахарозы при у-облучении |
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
Со 6 0 |
вегетативных клеток [21]. |
сибилизации был получен в параллельном опыте, в котором ра диочувствительность оценивалась по способности образовывать колонии. Кроме того, Каплан [21] путем седиментации в щелоч
ном градиенте сахарозы |
(опыт такого рода |
показан |
на рис. 112) |
|
обнаружил, что |
в Д Н К |
Е. coli, содержащей БУ, |
одноцепочеч- |
|
ные разрывы не |
репарируются. |
|
|
|
При включении БУ |
трансформирующая |
Д Н К |
сенсибилизи |
руется в такой же мере, как и способность образовывать коло нии [40]. Этот факт, совместно с другими данными, полученны ми в опытах с БУ, показывает, что и у бактерий Д Н К являет ся критической мишенью, а также что радиационные поврежде
ния Д Н К ответственны |
за репродуктивную гибель |
облученных |
клеток. |
|
|
13.4. Репарация УФ-повреждений |
|
|
Способность клетки |
репарировать повреждения |
Д Н К — важ |
ный фактор, определяющий ее радиочувствительность. Эта ре парационная способность была тщательно изучена у бактерий, и поэтому можно сказать, что основные принципы репарации у этих объектов на сегодняшний день в целом ясны. Как будет
215
видно из последующих разделов, прежде чем говорить о репа рации повреждений, индуцированных ионизирующими излуче ниями, не лишено смысла проанализировать процессы репара ции после воздействия УФ-излучения. Фотореактивация и тем-
новая |
репарация — два |
важнейших |
механизма |
восстановления |
|||||||||||||
от |
УФ-поврежденин. Оба эти |
процесса, |
|
совершенно |
различные |
||||||||||||
по своей природе, управляются |
ферментативно. |
|
|
|
|
|
|||||||||||
|
Ф о т о р е а кт и в а ц и я. Как показали |
самые |
ранние |
иссле |
|||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
дования эффектов УФ-облуче- |
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
ния, |
|
фотореактивация — это |
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
высокоэффективный |
процесс, |
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
охватывающий |
|
многие |
биоло |
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
гические |
системы. |
Начиная с |
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
1904 |
г. мы |
находим |
отдельные |
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
упоминания |
о |
|
фотореактива |
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
ции, но только после вторично |
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
го открытия ее в 1949 г. Кель |
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
нером |
этот |
примечательный |
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
процесс |
|
становится |
объектом |
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
более пристального |
внимания |
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
ученых. |
|
Фотореактивация, |
ха |
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
рактерная также и для виру |
|||||||||
|
|
|
0 |
20 |
|
40 |
сов |
(см. разд. |
12.4), осущест |
||||||||
|
|
|
|
вляется |
|
ферментом, |
элимини |
||||||||||
|
|
|
|
. Время освещения, мин |
|
||||||||||||
Рис. |
107. |
Внеклеточная |
фотореактн- |
рующим УФ-повреждения при |
|||||||||||||
участии |
|
света |
с длиной |
волны |
|||||||||||||
вация УФ-облученной трансформи |
300 |
и |
|
400 нм. |
В |
некоторых |
|||||||||||
рующей |
Д Н К из Haemophilus |
influen |
|
||||||||||||||
zae |
после |
инкубации |
с |
экстрактами |
случаях |
|
фотореактивация |
про |
|||||||||
из |
клеток |
Е. coli В |
(/) |
и |
Е. coli |
текает без |
участия |
ферментов. |
|||||||||
Bphr- |
(2) |
[34]. |
|
|
|
Это |
так |
|
называемая |
непрямая |
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
фотореактивация. |
Мы |
не |
бу |
||||||
дем |
останавливаться |
на |
ней подробно, |
поскольку до сих |
пор |
не вполне ясен механизм, лежащий в ее основе [38]. Как пока зывает пример с трансформацией (рис. 107), ферментативная фотореактивация может проводиться in vi'tro. Реактивация про исходит в том случае, 'когда УФ-облученную Д Н К инкубируют с клеточным экстрактом из Е. coli В, о чем свидетель ствует возрастание числа трансформированных клеток с увеличением времени инкубации. Однако если трансформирую щую Д Н К инкубировать с экстрактом из мутанта Е. coli В phr", не содержащего фермента фотореактивации, трансформирую щая активность остается без изменений. Подобными опытами in vitro доказывается существование следующих этапов процес са фотореактивации.
1. Во время инкубации, даже если она проводится в тем ноте, фермент образует комплекс с УФ-облученной (но не с необлученной) ДНК, что подтверждается центрифугированием и колоночной хроматографией.
216
2. Димеры пиримидиновых оснований, мономеризующиеся в процессе реактивации, являются основными повреждениями, элиминирующимися при воздействии света.
3. После |
освещения ДНК-ферментный комплекс распадает |
ся и процесс репарации завершается. |
|
Кинетику |
'образования внутриклеточного комплекса можно |
проследить с помощью одиночных вспышек света длительностью
примерно в 1 мсек, |
варьируя интервал |
между. УФ-облучением |
|||||
и реактивирующей |
вспышкой [11]. В клетках |
Bs_i, находящихся |
|||||
в стационарной фазе роста, при облучении |
254 |
нм в дозе 4,8 |
|||||
эрг/мм2 |
(1 эрг/мм2 |
индуцирует примерно 6,5 пиримидиновых ди |
|||||
меров |
на геном Е. coli) |
максимальное |
число |
комплексов обра |
|||
зуется |
приблизительно |
за 5 мин |
при |
комнатной |
температуре, |
||
причем |
5 0 % — в течение первых |
10—15 |
сек. |
При |
более высоких |
дозах УФ-облучения максимальное число комплексов достигает постоянного предельного значения 20. Не исключено, что эта цифра примерно соответствует числу молекул фотореактивирующего фермента в каждой клетке. У некоторых мутанов Bs_i это число достигает 100 молекул на клетку [10]. Но все же ясны не все детали механизма, посредством которого видимый свет при нимает участие в процессе реактивации, хотя фотореактивация элиминирует до 90% УФ-повреждений. Более подробную инфор
мацию читатель найдет в статьях |
Сетлоу [38], а также |
Рупер |
та и Харма [35]. Положение гена |
(phr), определяющего |
продук |
цию фермента фотореактивации на карте бактериальной хро мосомы, демонстрируется на рис. 113.
Т е м н о в а я р е п а р а ц и я . Некоторые особенности отли чают этот ферментативный процесс от фотореактивации. Вопервых, как показывает название, репарация протекает без участия света. Однако главное отличие заключается в том, что элиминируются не только УФ-повреждения, т. е. димеры пири мидиновых оснований, но и повреждения, представляющие со бой поперечные сшивки нитей ДНК. Последние возникают при действии на Д Н К алкилирующих веществ, например азотисто го иприта, сшивающего два соседних остатка молекул гуанина, лежащих в противоположных нитях ДНК. Репарация повреж дений, явно отличающихся по строению от димеров тимина, дает возможность считать, что в случае темновой репарации мы имеем дело с универсальным процессом коррекции, позволяю щим выяснить различные изменения конфигурации ДНК. Дей ствительно, кроме азотистого иприта имеются еще другие аген ты, действие которых также частично снимается при темновой репарации. Наконец, темновая репарация отличается от фото реактивации еще и тем, что димеры и сшивки не просто разры ваются, а выщепляются из Д Н К в результате сложного процес са и заменяются-вновь синтезированными участками. Именно поэтому темновую репарацию часто называют репарацией пу тем выщепления.
8 Г. Дертпнгер, X. Юнг |
217 |
Выщепление димеров тимина из УФ-облученной Д Н К одно временно было обнаружено Сетлоу и Керриером [39] и Бойсом
иГовардом-Фландерсом [2].
Вих опытах были использованы чувствительные и резистент ные к УФ-облучению мутанты Е. coli, в Д Н К которых был пред варительно включен Н3 -тимин. После УФ-облучения, за которым следовала инкубация в темноте, клетки лизировали и затем
|
|
|
|
осаждали Д Н К при по |
|||||||
|
|
|
|
мощи |
трихлоруксусной |
||||||
|
|
|
|
кислоты. |
У чувствитель |
||||||
|
|
|
|
ных мутантов |
вся |
радио |
|||||
|
|
|
|
чувствительность |
|
прак |
|||||
|
|
|
|
тически |
|
оставалась |
в |
||||
|
|
|
|
ДНК, в то время как у |
|||||||
|
|
|
|
резистентных |
мутантов |
||||||
|
|
|
|
радиоактивные |
продукты, |
||||||
|
|
|
|
представляющие |
|
собой |
|||||
|
|
|
|
выщепленные |
компонен |
||||||
|
|
|
|
ты ДНК, были |
обнаруже |
||||||
|
|
|
|
ны в надосадочной |
жид |
||||||
|
|
|
|
кости. |
С |
помощью |
бу- |
||||
|
60 |
120 |
180 |
м ажной |
|
хром атогр аф ии |
|||||
|
Время |
инкубации, |
мин |
было |
установлено, |
|
что |
||||
Рис. 108. Потеря Н3 -тимина |
(/) и включе |
этими |
компонентами |
яв |
|||||||
ляются |
димеры |
тимина, |
|||||||||
ние С1 4 -БУ |
(2) в Д Н К УФ-облученных кле |
||||||||||
ток Е. coli |
в зависимости от |
продолжитель |
встречающиеся |
в виде ко |
|||||||
ности инкубации клеток после окончания |
ротких |
олпгонуклеотидов, |
|||||||||
облучения |
[30]. |
|
|
содержащих |
не |
|
более |
||||
|
|
|
|
трех основании. Эти |
опы |
ты показали, что димер тимина не расщепляется в темноте, а выщепляется целиком.
Кроме того, эксперименты Петиджона и Ханавальта [30] под твердили, что при выщеплении поврежденного участка проис ходит ресинтез удаленного материала. Для этих опытов был использован ауксотрофный мутант Е. coli TAU-bar с дефици том урацила, а также ряда аминокислот и тимина. Н3 -тимин включался в бактериальную Д Н К в течение двенадцати поколе ний. После УФ-облучения клетки выращивались на среде, со держащей С1 4 -БУ. С помощью БУ получили четкую картину се диментации экстрагированной ДИК. Как показано на рис. 108, активность трития и, следовательно, количество тимина в Д Н К уменьшается при увеличении времени инкубации в БУ-содер- жащей среде благодаря выщеплению УФ-повреждений. Напро тив, одновременное возрастание См -активности можно отнести за счет внедрения БУ во время реконструкции ДНК. Петиджону и Ханавальту удалось доказать, что БУ включается во время
репарации ДНК, а не во |
время полуконсервативной |
реплика |
ции. Они экстрагировали |
репарированиую Д Н К из |
клеток и |
218
центрифугировали ее в градиенте CsCl. Репарированная Д Н К выявлялась в месте локализации «легкой» тимин-ДНК в про филе седиментации и без труда опознавалась с помощью ра диоактивной метки БУ.
Этот результат можно интерпретировать исключительно в терминах выщепления димеров, беспорядочно распределенных в ДНК, с последующим их замещением БУ. Однако общее ко личество включенного БУ столь мало, что не отражается на скорости седиментации относительно «легкой» ДНК. В проти
вовес этому в |
полукоисервативно реплицироваиной Д Н К |
БУ |
обнаруживается |
в составе гибридной Д Н К (т. е. ДНК, |
несу |
щей БУ в тиминсодержащих тяжах), а также в виде полностью замещенных БУ тяжей ДНК. Кроме того, БУ встречается и в сегментах ДНК, принимающих участие в репликации. Дегра дация Д Н К с помощью ультразвука или ДНК-азы дополни тельно доказывает, что БУ встраивается в небольшие участки ДНК. Такие вновь синтезированные участки содержат по край ней мере 25, а возможно, и не менее нескольких сотен нуклеотидов. Это означает, что из нити Д Н К выщепляются не только димеры тимина, но также и некоторое количество нуклеотидов, находящихся в непосредственной близости от повреждения. Весьма любопытно, хотя и объяснимо на основании всего ска занного, что после предварительной фотореактивации БУ не
встраивается в |
Д Н К |
и что УФ-чувствительный |
мутант ки |
|||
шечной |
палочки |
Bs-i |
не обнаруживает |
этого |
вида |
репарации. |
Две |
модели темповой репарации, основанные на предложе |
|||||
нии Бойса и Говарда-Фландерса [2], а |
также |
Сетлоу |
и Керрие- |
ра [39], полностью соответствуют полученным данным. Они из вестны как гипотезы «замещения — иссечения» и «иссечения— замещения» [9]. Оба эти механизма, которые в настоящее время считаются идентичными, графически представлены на рис. 109. В механизме выщепления — замещения можно выделить следую щие этапы:
1.Узнавание повреждения.
2.Выщепление повреждения путем эндонуклеолитической иицизии и последующей эксцизии (осуществляемой другой эндоиуклеазой или экзонуклеазой).
3.Расширение пробела 5', З'-экзонуклеазой, которое нахо
дит' отражение в наблюдаемой деградации ДНК.
4. Репаративный синтез при помощи 3', 5'-ДНК-полимеразы, для которой роль матрицы выполняет неповрежденная компле ментарная нить.
5. Сшивка конечной фосфоэфирной связи при участии полинуклеотидлигазы.
Модель замещения — иссечения (см. рис. 109, а) стремится избежать образования более протяженных одноцепочечных участ ков, чувствительных к силам сдвига и потому угрожающих вос становлению ДНК. После инцизии эндонуклеазой репаративный
8* 219