Филиппович Ю.Б. - Основы Биохимии
.pdfфермент. его относят J( а- или (3-гликозидазам. Таким образом, ГЛИIЮЗИАазы
обладают ярко выраженной пространственной специфичностью. Кроме ГЛИJ«()оо
зидов, содержащих в качестве агликонов остатки одноатомных спиртов, суб.. стратами, на которые распространяется действие тех или иных гликозидаз, являются олиго- и полисахариды. Из действующих на олигосахариды глико
зидаз упомянем мальтазу (а-гликозидаза) и сахаразу «(3-гликозидаза). Они
ускоряют соответственно гидролиз мальтозы и сахарозы:
|
|
|
|
|
CH20H н |
HO~2Н |
||
|
+Н2 |
0 |
- |
|
Мн |
Н |
+ |
Н но |
|
|
II-ФРУПОфурано- |
|
н |
|
|
н н |
Н2ОН |
н |
н20 Н |
'НА'" (сахар...) |
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
Н |
Н |
|
Н |
|
Сахароза (II-D-rЛЮJCопирано]идо |
|
|
|
~ГЛЮlCоза |
|
Фрупоза |
|
|
_ - D-фруктофураио]и.ll) |
|
(II-D-rЛЮJCопираиоза) (fJ- D-фруктофурвноза) |
|||||
|
|
-:_____ , ~oHHPH:H~ |
|
|
||||
|
|
а-ГШОJ;ОЗИДIJS |
|
|
|
|
|
|
|
|
(мал.т.,,) |
|
Н |
|
|
Н |
|
|
|
|
|
|
Н |
он |
|
|
Мальтоза (II-D-rЛЮJCопиранО1ИДО- |
|
|
|
ГЛЮICО]l |
|
|
||
|
1,4-D-rлюICОПИРВНОза) |
|
(II-О -rЛЮlCопирано]в) |
|
Из гликозидаз, действующих на полисахариды, наиболее известны амилазы. В природе существует несколько видов амилаз, ускоряющих реакции гидролиза
гликозидныхсвязей в молекуле крахмала с образованиемглюкозы, мальтозы или
олигосахаридов_ Их характеристика и механизмдействия рассмотрены в гл. VIII.
Гидролиз других природных полигликозидов: целлюлозы, инулина, ксила
на и т. П.-также ускоряется соответствующими гликозида'зами. Некоторые
гликозидазы катализируют также реакции переноса гликозильных остатков,
т. е. являются трансглнкозидазами.
Пептид-гидролазы. Ферменты этого подкласса ускоряют mдролиз пептид
ных связей в белках и пептидах, а при определенных условиях также и об разование пептидных связей, хотя этот путь синтеза белка не является физио логическим. Химизм процесса гидролиза белков и пептидов при участии
пептидгидролаз можно выразить следующей схемой:
H 2N-CH-CO-[NH-CH-CO] -NН-СН-СООН+(п+I)Н2О
I |
I |
а |
I |
W |
R |
|
R- |
Пептид-rидролаза
_ ------ 'H2N-СН-СООН+ПН.zN-СН-СООН+Н2N-СН-СООН
I |
I |
I |
R' |
R |
R- |
Среди пептид-гидролаз различают протеииазы или .пептидил-пептидогид
ролазы, катализирующие гидролиз небольшого числа внутренних пептидных связей в белковой молекуле, в результате чего последняя распадается до
пептидов. Они являются, следовательно, эидопептидазами. В отличие от этого пептид-гидролазы, называемые пептидазами, обеспечивают отщепление от
пепmдной цепи свободных аминокислот, будучи экзопешКДазами.
Протеиназы в зависимости от механизма их действия на внутренние пеп тидные связи в белковой молекуле делят на 4 подподкласса: 1) сериновые
протеиназы, несущие в активном центре радикалы сер и гис. обеспечивающие
IЗО
осуществление каталитического акта; представителями их являются химотри
псин И трипсин, выделяемые поджелудочной железой, субтилизин, продуциру
емый бактериями, и др.; 2) тиоловые (цистеиновые) протеиназы, имеющие
в активном центре остаток цис; к их числу принадлежат папаин из латекса
дынного дерева Carica рарауа, фицин из латекса фикуса, бромелаин из сока
ствола ананаса, катепсин В-внутриклеточный фермент прзвоночвых и др.;
3) кислые (карбоксильные) протеиназы, имеющие оптимум рН ниже 5 и содер
жащие радикалы дикарбоновых аминокислот в активном центре; сюда отно
сятся пепсин, выделяемый слизистой желудка, катепсин D, характеризующий
ся внутриклеточной локализацией, и ряд кислых протеиназ, продуцируемых
разнообразными микроорганизмами; 4) металлопротеиназы, каталитическое
действие которых зависит от присутствия ионов металлов (Са2 +, Zn2 +) в ак
тивном центре; примерами их могут служить коллагеназа и ряд протеиназ
микробного происхождения (термолизин, компонент проназы и др.).
Пепсин, трипсин и химотрипсин выделяются железистыми клетками в виде
неактивных проферментов-зимогенов: пепсиногена, трипсивогена и химо трипсиногена, так как их активные центры блокированы фрагментами полипеп
тидной цепи, после гидролитического отщепления которых фермент приоб
ретает активность. Это явление впервые было открыто в лаборатории
и. п. Павлова.
Очень важной особенностью протеиназ является выборочный (селективный)
характер их действия на пептидные связи в белковой молекуле. Так, пепсин
избирательно ускоряет гидролиз пептИДНЫХ связей, образованных фен и лей;
трипсин-арг и лиз; химотрипсин-ароматическими аминокислотами; папа
ин-арг, лиз и фен и т. д. В результате индивидуальный белок под действием
определенной пептидил-пептидогидролазы расщепляется всегда на строго
ограниченное число пептидов. Это находит практическое использование при
определении первичной структуры белков и имеет огромное значение для регуляции обмена веществ, так как многие продукты селективного гидролиза
белков обладают высочайшей биологической активностью: именно этим
путем из проферментов возникают ферменты, из предшественников гормо нов-гормоны и рилизинг-факторы и т. п. Причина избирательного действия
пептидпептидогидролаз заключается в том, что радикал аминокислоты, по
соседству с которой гидролизуется пептидпая связь, служит для образования
фермент-субстратного комплекса.
Пептид-гидролазы, катализирующие гидролиз пептидов до свободных
аминокислот, могут отщеплять последние от пеmида, начиная либо с амино
кислоты, обладающей свободной NН2-группой, либо с аминокислоты, име ющей свободную СООН-группу. В первом случае их называют аминопеп тидазами (а-аминоацилпептид-гидролазы), во втором-карбоксипептидазами
(пеmидиламиноацидо-гидролазы).
Схема, поясняющая действие амино- и карбоксипептидаз, а также некото
рых эндопептидаз, приведена на рис. 56.
Некоторые амино- и карбоксипептидазы обладают специфичностью дей
ствия, т. е. отщепляют строго определенные N- или С-концевые аминокисло
ты. Третий подподкласс пептидаз представлен диnеnmид-гидролазами, или
диnеnmидазами. Их известно около десяти. Они завершают гидролиз белка. Недавно из состава пептидаз вычленено еще два подподкласса: дипептидил
пеmидгидролазы, отщепляющие от N-ковца полипептида дипеmид, и пеп тидилдипеmид-гидролазы, отщепляющие дипептид с С-конца.
Амидазы. Эти ферменты ускоряют гидролиз амидов кислот. Из них важ ную роль в биохимических процессах в организме играют уреаза, аспарагина
за и глутаминаза.
131
Леilцин
.амино
|
ПСПТид;lЗa |
Пепсин |
Трипсин |
|
|
|
ХимurpИПСИН |
|
|
|||||
|
|
|
|
|
NНz |
|
|
|
|
ОН |
|
|
|
|
С~э/СНэ |
~ |
|
I |
|
|
|
|
|
|
~ |
||||
|
Ь:: |
|
|
|
|
~ I |
|
|||||||
~H |
|
|
У |
|
fHz |
|
|
?нУ |
|
|
У |
|||
CH |
|
|
CH |
|
CH |
G |
|
CH |
CН |
|
|
CH |
||
1 |
z |
.-, |
1 z |
С |
1 z |
|
1 |
z |
1 |
z |
-::1 |
.... |
1 z |
|
HzN-СН-С:-:NН-СН-С.-jNН-СН-С-·NН-СН-С-NН-СН-С\:jNН-СНz-С-NН-СНz-C\:1NН-CH-COOH |
||||||||||||||
Леil |
|
n...•• |
Феи |
.' |
Лиз |
D |
Сер |
D |
Тир |
11 |
11 |
I |
Фен и дрyrие |
|
|
О |
О |
О |
О |
О |
Гли о |
Гли о |
|||||||
|
|
|
ЛеА |
|
Арг |
|
|
|
|
Фен |
|
|
|
неij,тральные |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
амиi!окислоты |
Тир
Рис. 56. Точки приложения действия протеолитических ферментов на пептидные связи в белковой
молекуле
Уреаза была одним из первых белков-ферментов, полученным в кристал
лическом состояlПШ (Д. Самнер, 1926). Это однокомпонентный фермент (М=480000); молекула его глобуляр:на и состоит из 8 равных субъединиц.
Уреаза ускоряет гидролиз мочевины до NНз и СО2•
Аспарarиназа и глутаминаза ускоряют гидролиз амидов дикарбоновых амино
кислот-аспарагиновой и глутаминовой, например:
|
~O |
Ас:параГИИ.,1 |
НООС-СН-СН.-С |
+ НаО |
|
I |
'NИ. |
(L-8спараГIlИ.8N11· |
ДOГll,дpona31.- |
||
NH. |
|
|
АсП8р1ПIН
-- _ НООС-СН-СН.-СООН + NH.
I
NH. i
АCn8р1Г"ИО8.. Кисд0Т8 ,
к гидролазам, действующим на С-N-связи, отличающиеся от пептИДНЫХ,
кроме амидаз относятся ферменты, катализирующие гидролиз С-N-связей
в линейных амидинах. К их числу принадлежит аргнназа. При посредстве
аргиназы аминокислота аргинин mдролизуется на орнитин и мочевину:
Apr8".sa..
h,N-С-NН-(СИ.)з-СН-СООН + Н.О
" |
I |
NH |
NH. |
Арг... |
|
--1 H.N-C-NH. + H.N-(СН.)з-СН-СООН |
|
а |
I |
о |
NH. |
МOIIе8ИН8
Так как в процессе гидролиза арnrnина отщепляется мочевина, то системати
ческое название аргиназы-L-арnrnин-уреогидролаза. Эта реакция широко пред
ставлена в природе, являясь заключительной стадией биосинтеза мочевины
одного из конечных продуктов распада азотсодержащих веществ. Для аргиназы, как и для уреазы, характерна абсолютная специфичность действия.
4. Лиазы. К классу лиаз относятся ферменты, ускоряющие негидролитичес
кие реакции распада органических соединений по связям С-С; C-N; С-О iI Т. д. При этом замыкаются двойные связи и выделяются такие простейшие
132
продукты, как СО2, Н2О, NНз и т. п. Некоторые из этих реакций обратимы,
и соответствующие ферменты в подходящих условиях катализируют реакциине
только распада, но и синтеза. Таким образом, название этого класса ферментов
не всегда COO"l:ВeTcTByeT содержанию тех процессов, которые ими ускоряются.
Одной из важнейших групп ферментов этого класса являются углерод
углерод-лиазы (С--С-лиазы). Среди них особое значение имеют карбоксили азы (декарбоксилазы) и альдегид-лиазы.
В природе широко распространены декарбоксилазы кетокислот и амино
кислот, катализu:рующие реакции по следующим схемам:
|
|
ПирУ88ТдеКlРбо~смА131 |
~O |
+СО. |
|
снз-со-соон |
• |
СН..-С |
|
|
|
(карБОКС:И• .IIи8311 2-оКСО |
'Н |
|
|
|
ПРОПНОllоаОI KМC~) |
|
|
|
I1ИРО8иногра~наR |
|
|
|
|
кислота |
|
|
|
|
OKC8ll08u.eT.T....K.pCSOКCIIII8SI |
СНз--СО-СООН + СО. |
||
|
---------------------. |
|||
|
|
(окс.лоацlТ8Т·каpCSоКCI· |
|
|
U!аве.nе80УКС:УС:Н8Я КnC:дOTI |
o/IIt8:18' |
|
|
|
|
|
|
||
|
|
ЛИЗИllдекарбокс:н.IIII3I |
|
|
снz-(снz)з-с-н-соон |
------.. H1N-(СНz).-NН. + СО.. |
|||
I |
I |
(L·'nН:lНН·карбоксм. |
|
|
o/Iк.за, |
|
|
||
NH. |
NНa |
|
К...аИJIIIН |
|
|
Ли3ll11 |
|
Эти ферменты двухкомпоненты, простетическими группами их во многих
случаях являются фосфорные эфиры водорастворимых витаминов: тиамина
(В1)---в карбокси-лиазах кетокислот и пиридоксаля (В6)-в карбокси-лиазах
аминокислот. _
Механизм реакциидекарбоксилирования кетокислот при участии декарбокси
лаз с тиаминпирофосфатом в качестве кофермента будет рассмотрен в гл. IV.
Механизм реакции декарбоксилирования аминокислот с помощью карбокси лиазы с пиридоксальфосфатом в качестве кофермента очень близок к тому, который действует при переаминировании аминокислот. Здесь тоже возникает
шиффово основаlШе, в котором электронная плотность у а-углеродного атома
аминокислоты резко·ослаблена. Вследcrвие этого сильно ослабляетсясвязьэтого
углеродного атома с карбоксильной группой, и последняя легко отщепляется.
Характерным представителем альдегид-JШаз является 8ЛЬДWIаза, катализирую
щая обратимую реакцию расщепления фруктозо-l,6-дифосфата до фосфотриоз:
~ |
|
|
I |
|
|
|
|
|
СНОН |
|
~ |
|
c-P-D-tt~'Н |
|
|
А1( |
|
|
C |
~H |
|||||
|
|
|
2 |
|
I |
|
||||||
I |
|
|
|
|
|
|
ЛЬАолаза |
|
I |
|
+ ~HOH ОН |
|
он |
о"" .. |
Н I |
1. |
|
он |
|
|
~ |
С=О |
ОН |
||
|
|
|
I |
|
(фруктоэо-l,6- |
I |
I _ |
|
I |
|||
|
: н; |
|
(н; |
СН -О-Р=О |
днфосфат- |
СН2-О-Р-0 |
|
H2-0-r=0 |
||||
|
.....НО' |
2 |
I |
трноэофосфатnиаэа) |
~H |
|
ОН |
••.•ОН
Фруктофураиоао -1,6- дифосфат |
Фосфоднокси- |
3-Фосфоглицери- |
|
ацетон |
новый альдегИД |
Эта реакция занимает центральное место в преобразовании углеводов. Аналогично альдолазе действуют другие альдегид-лиазы.
Другую важную группу лиаз составляют углерод-- кислород лиазы (гидро
лиазы), ускоряющие реакции гидратирования и дегидратирования органиче
ских соединений. В качестве представителя гидро-лиаз приведем фумарат
гидратазу:
133
|
l{сгидратирование |
НООС-С-Н |
HOOC-СН(ОН)-СНz-СООН |
|
11 +HzO |
|
||
|
|
Н-С-СООН |
Яблочнаs кислота |
Гидратирование |
|
|
|
Фумароваа кислота |
Реакции гидратирования и дегидратирования постоянно идут при распаде
и синтезе углеводов и высших жирных кислот, поэтому гидратазы играют
большую роль в жизнедеятельности организмов.
Примером углерод-азот лиаз может служить аспартат-аммиак-лиаза,
ускоряющая реакцию прямого дезаминирования аспарагиновой кислоты:
СООН
1 |
Аспартат-аммиах-лиаза |
|
CНNHz |
|
НООС-С-Н |
|
||
1 |
11 |
|
CHz |
|
H-C-COONH4 |
1 |
|
Фумарат аммопия |
СООН |
|
|
АспарагllВова"
кислота
Этот фермент характерен для бактерий и ряда растений.
Некоторые лиазы ускоряют реакции не только распада, но и синтеза. Например, из дрожжей выделена L-серии-гидро-лиаза, отщепляющая от серина
воду и присоединяющая сероводород, в результате чего синтезируется амино кислота - цистеин:
ЦистеllВсиитаза
,
Чтобы отличить такие лиазы от ферментов класса лигаз (которые ускоря
ют реакции только синтеза и именуются в связи с этим синтетазами), их
называют также cuн.mазамu.
s. Изомеразы. Ферменты, относящиеся к этому немногочисленному (около 90 индивидуальных ферментов) классу, ускоряют геометрические или струк турные изменения в пределах одной молекулы. Эти измен~ния могут состоять
во внутримолекулярном переносе водорода, фосфатных и ацильных групп,
в изменении пространственного расположения атомных группировок, в пере
мещении двойных связей и т. п.
Важнейшими изомеразами являются триозофосфатизомераза, фосфогли церат-фосфомутаза, альдозомутаротаза и изопентенил-пирофосфатизомераза.
Триозофосфатизомераза ускоряет переное атомов Н в процессе превращения 3-фосфоглицеринового альдегида в фосфодиоксиацетон и обратно:
;0
с |
Триоэофосфатизомераза |
|
СН ОН |
|
||
,'Н |
|
|
|
|
I 2 |
|
|
|
|
|
|
||
СНОН |
ОН" |
|
|
С=О |
ОН |
|
|
|
|||||
I |
I |
|
I |
I |
||
сн2-о-р=0 |
|
СН -о-р=о |
||||
|
I |
2 |
I |
|||
|
ОН |
|
|
ОН |
||
~фоглицериновЫil |
|
~ос4>одиоксиацетон |
||||
альдсПlд |
|
|
|
|
|
|
134
Превращение, вероятно, идет через общую эндиольную форму.
Фосфоглицерат-фосфомутаза обеспечивает достаточную скорость превраще-
ния 2-фосфоглицериновой кислоты в 3-фосфоглицериновую кислоту и обратно:
CHzOH |
ОН |
|
|
ОН |
I |
I |
Фосфогляцерат.фосфомутаза |
|
I |
СН-О-Р=О |
|
I CHz-О-Р=О |
||
I |
I |
|
I |
I |
СООН |
ОН |
|
СНОН |
ОН |
2~осфоглицерат |
|
I |
|
СООН
3-фосфоглицерат
Оба процесса имеют громадное' значение в органическом мире, так как
представляют важнейшие стадии распада и синтеза yrлеводов.
Мутаротаза является представителем стереоизомераз, она ускоряет реак цию превращения а-D-глюкопиранозы в J3-D-глюкопиранозу:
АJlЬАО30- .
МУТВРОТВ31
"( альдоэо-I- эпимераэа)
н ОН |
он |
a-D -1"ЛЮКОПИРВИО38 |
P-D-I"люкопираноза |
Ферменты этого типа (стереоизомеразы) обеспечивают, в частности, вза
имопревращения многих пространственных изомеров моносахаридов, и этот
путь является иногда единственным для синтеза некоторых из них в природе.
К стереоизомеразам относятся также цис-трансизомеразы, например ретинол
нзомераза, переводящая транс-ретинол в цис-ретинол (см. гл. IV).
Изопентенилпирофосфат-изомераза катализирует реакцию перестройки изо пентенилпирофосфата в диметилаллилпирофосфат, что связано с перемещени ем двойной связи из 3-го во 2-е положение:
г------------------, |
|
||||
CH |
з |
о |
о |
I |
|
t 1 |
11 - " |
I |
- |
||
H2C=C-CH -CH -O-P-Q-P-OH + |
НS-фермrнr |
||||
t |
2 2 |
6н |
6н |
,/\llэопентеНИIIПИРО- |
|
'- ______________ ../ |
фосфат-иэомераэа) |
|
|||
|
ИзопеитеНIIЛПИРОфОСфат |
|
|
||
|
~НЗ |
~ |
~ |
|
|
~НзС-~-СIj2-СН2-0-Р-О-Р-ОН - |
|
||||
|
S~фермент |
6н |
6н |
|
|
|
~НЗ |
~ |
~ |
|
|
-нзс-с=ен-сн2-о-р-о-р-он + НS-фермент
I I
ОН ОН
ДимеТИllаnnИЛПИРОфОСфlТ
Изопентенилпирофосфат-изомераза содержит свободные сульфгидрильные
группы, вероятно, в виде радикалов цuс в белковой молекуле. Именно благо даря им обеспечивается указанная выше реахция, имеющая огромное значение
для синтеза полиизопреноидов истеролов. |
• |
135
6. Лигазы (синтетазы). Характерные черты действия ферментов этого K!lac-
са выявлены совсем недавно в связи со значительными успехами в изученци
механизма синтеза жиров, белков и углеводов. Оказалось, что старые пред ставления об образовании этих соединений, согласно которым они возникают при обращении реакций гидролиза, не соответствуют действительности. Пути
их синтеза принципиально иные.
Главная их особенность-сопряженность синтеза с распадом веществ, спо
собных поставлять энергию для осуществления биосинтетического процесса.
Одним из таких природных соединений является АТФ. При отрыве от ее
молекулы в присутствии лигаз одного или двух концевых остатков фосфорной кислоты выделяется большое количество энергии, используемой для активи рования реагирующих веществ. Лигазы же 1<аталитически ускоряют синтез
органических соединений из активированных за счет распада АТФ исходных продуктов. Таким образом, к лигазам относятся ферменты, катализирующие
соединение друг с другом двух молекул, сопряженное с гидролизом пирофос
фатной связи в молекуле АТФ или иного нуклеозидтрифосфата.
Механизм действия лигаз изучен еще недостаточно, но, несомненно, он
весьма сложен. В ряде случаев доказано, что одно из участвующих в основной реакции веществ сначала дает промежуточное соединение с фрагментом рас падающейся молекулы АТФ, а вслед за этим указанный промежуточный продукт взаимодействует со вторым партнером основной химической реакции
собразованием конечного продукта.
Вкачестве примера действия лигазы можно привести синтез пантотеновой кислоты из а, у-диокси-j3, j3-диметилмасляной кислоты и j3-аланина:
,,~ |
|
|
ПffЯ |
|
~ |
|
HO-СНгу-«Н-СООН + H.N-CH.-CH.-COOH + HO-f-O-f-O-f-~, |
- |
|||||
НзСОН |
|
|
ОН ОН ОН |
Н |
Н |
|
11. У-Диокси- Р.Р-дные- |
Р-Алаинн |
|
Н |
Н |
|
|
тиnы.сn.иа. киспота |
|
|
ОН |
ОН |
|
|
|
|
|
|
АТФ |
|
|
Пси••ltТОТтеТI38Т- |
|
|
О11 |
|
NH. |
|
H'j |
|
~ |
|
|||
••• |
|
|
|
|
|
|
.. НО-СН. 1H-Co-NH-CH2-CH~OOH + НO-f-Q~2О |
?, |
~ |
||||
|
Hi |
н |
ОН |
н Н |
+ Ho-P-Q-P-OH |
|
|
"антотеновак. кислота |
Н |
Н |
6н |
6н |
|
|
|
|
|
Н Н |
nирофосфат |
АМФ
Пантотеиатсиитетаза, как следует из приведенного уравнения, относится
к группе лигаз, ускоряющих реакции синтеза C-N-связеЙ. Эта группа лигаз насчитывает около 40 представителеЙ. В настоящее время изучено более 75 различных лигаз, обеспечивающих важнейшие синтетические процессы в жи
вотной и растительной клетках.
Кроме ускорения реакций синтеза С-N-связей, в частности пептидных, лигазы катализируют образование связей с-с, с--о и C-S. к группе лигаз, образующих С-С-связи, относятся карбоксилазы. Они обеспечивают карбок
силирование ряда соединений, в результате чего происходит удлинение угле
роднI6X цепей. Одной из важнейших карбоксилаз является.. пируваткарбок-
136
~аза, ускоряющая реакцию образования щавелевоуксусной кислоты из пи·
ровиноградной кислоты и оксида углерода (IV):
ОН |
ОН |
ОН |
|
NH2 |
HO-~-O-~-O-~=O |
NV:>~ |
|||
11 |
" |
I |
I |
~ |
о |
О? |
|
~ |
|
СНз-СО--\:ООН + С02 |
+ |
Н |
О |
|
2 |
|
Пировиноградная
КllcnoTa (пирув ат)
ОН
АТФ
nнруввткарбо.
кснnаза
~
|
N~ |
о о |
~NJV |
|
+ 11 "
~HOOC-CH2-CO-COOH НО-Р-О-Р-О
ЩаВt.'tВОУКСУСН8Я |
I |
I |
ОН |
ОН |
|
кислота |
|
|
ОН
АДФ
Эта реакция имеет исключительное значение в обмене веществ, обеспечи· вая взаимосвязь обмена углеводов и белков и акцептирование СО2•
Лигазам, катализирующим синтез С-О-связей, принадлежит важнейшая
роль в биосинтезе белков, так как они ускоряют реакции активирования
аминокислот перед вступлением последних в пептидную связь. Одной из
простейших реакций этого типа является образование аминоациладенилатов:
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
~ |
|
|
зr |
|
|
000 |
|
|
|
Il~~ |
|
|||
|
|
|
" |
" |
|
IJ |
|
c~ |
|
|||
СН |
|
Н-СООН + Ho-p-o-f-o-f-o- |
|
о |
|
|
||||||
|
NH2 |
~H |
ОН |
ОН |
|
Н |
|
Н |
|
|||
|
Д.~аИIIН |
|
|
|
|
Н |
|
Н |
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ОН |
ОН |
|
|
|
|
|
|
О |
|
|
N~~ |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
~~ |
|
о |
о |
|||
|
|
з |
1 |
I |
|
2 |
|
|
|
+ |
" |
" |
~ СН |
-СН-СО-О-Р-0-СН |
|
|
|
|
HO-P-O-P-QH |
||||||
|
|
|
NH2 |
ОН |
Н |
Н |
' |
|
|
6н |
ЬН |
|
|
|
|
|
"~Н Н |
|
|
|
Пирофосфат |
||||
|
|
|
|
|
ОН |
ОН |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Аnаниnадениnат |
|
|
|
|
|
|
|
137
с аминоациладенилатов аминокислоты передаются на тРНК, образуя аминоацил-тРНК, используемые непосредственно при синтезе полипептидов.
Эти процессы будут детально рассмотрены в гл. УН.
Лигазы, кроме того, осуществляют ускорение реакций образования C-s-
связей, являясь ацил-коэизим А-синтетазами. В качестве примера действия
ацил-коэнзим А-синтетазы можно привести образование ацетил-коэнзима А из уксусной кислоты и коэнзима А (см. формулу на с. 163), протекающее
сопряженно с распадом АТФ:
Ацетил-КоА-синтеТВЗ8
СНз-СООН +HS-КоА+АТф ------- +
(ацетат-КоА-лиrазв)
о о
11 |
" |
~СНз-СО-S-КоА+АМФ+НО-Р-О-Р-ОН |
|
1 |
1 |
ОН |
ОН |
АцC'I1lJl-l:ОЭВЗИМ А |
Пирофосфат |
|
Ацетил-КоА служит коферментом в реакциях трансацилирования, поэтому
действие ферментов этих двух групп-лигаз и ацилтрансфераз- в живых
системах тесно увязано друг t; другом. Аналогичная взаимозависимость харак терна и для многих других ферментов.
ЛОКАЛИЗАЦИЯ ФЕРМЕНТОВ В КЛЕТКЕ
ОДНИМ из npинципиальных отличий ферментов от катализаторов неби
ологического происхождения является кооперативный характер их действия.
На уровне одиночной молекулы фермента кооперативный принцип реализует ся в тошсом взаимодействии субстратного, активного и аллостерического центров. Однако гораздо большее значение имеет коопераmвное осуществле
ние реакций на уровне ансамблей ферментов. Именно благодаря наличию
систем ферментов-в виде мультиэизимныx комплексов или еще более слож ных образований-метаболонов, обеспечивающих каталитические превраще
ния всех учасIНИКОВ единого метаболического цикла- в клетках с большой
скоростью осуществляются многостадийные процессы как распада, так и син
теза органических молекул. Ферментативный катализ в многостадийных реак циях идет без выделения проМежуточных продуктов: только возникнув, они
тут же подвергаются дальнейшим преобразованиям.
Это возможно ЛИШЬ потому, ЧТО в клеточном содержимом ферменты
распределены не хаотически, а строго упорядоченно. С современной точки
зрения клетка представляется высокоорганизованной системой (см. рис. 3),
в отдельных частях которой осуществляются строго определенные биохими
ческие процессы. В соответствии с приуроченностью их к определенным субклеточным частицам или отсекам (компартментам) клетки в них локализо
ваны те или иные индивидуальные ферменты, мультиэнзимные комплексы, полифункциональные ферменты или сложнейшие метаболоны.
Приведем несколько характерных примеров. Разнообразные гидролазы
и лиазы сосредоточены преимущественно в лизосомах. Внутри этих сравнительно небольших (несколько нанометров в диаметре) пузырьков, отграниченных мембраной отгиалоплазмы клетки, протекают процессы деструкции различных органических соединенийдо тех простейших структурныхединиц, из которых они
138
построены. Сложные ансаfv1бли окислительно·восстановительных ферментов,
такие, например, как цитохромная система, находятся в митохондриях. В этих же
субклеточных частицах локализован набор ферментов цикла дикарбоновых и трикарбоновых кислот (см. гл. VHI). Ферменты активирования аминокислот
распределены в гиалоплазме, но они же есть и ~ ядре. В гиалоплазме присутству
ютмногочисленные метаболоны гликолиза,сгруктурно объединенныестаковы·
мипентозофосфатного ЦИI<ла, что обеспечивает взаимопереключение дихотоми·
ческого и апотомического путей распада углеводов (см. гл. VIH). В то же время
\ ферменты, ускоряющие перенос аминокислотных остатков на растущий конец
полипептидной цепи и катализирующие некоторые другие реакции в процессе
биосинтеза белка, сосредоточены в рибосомальном аппарате клетки. Нуклеоти·
дилтрансферазы, ускоряющие реакцию переноса нуклеотидных осгатков при новообразовании нук:леиновых кислот, локализованы в основном в ядерном
аппарате клетки. Таким образом, системы ферментов, сосредоточенныев тех или
иных структурах,участвуют в осуществлении отдельныхцикловреакций. Будучи тонко координированы другсдругом, эти отдельные циклы реакций обеспечива·
ют жизнедеятельность клеток, органов, тханей и организма в целом.
ПРИМШНЕНИЕФЕРМffiНТОВ
Ферменты способны осущесгвлять свою катa.mrrичесхую функцию и вне клетки, вне организма. Хотя, находясь с сосгаве соответсгвующих сгруктур,
ферменты обладают огромной мощносгью действия, тем не менее, будучи
выделены из биологических объектов, они сохраняют свою каталитическую
81СтивнOCfЬ. Естественно, что ряд фермепmых препаратов используют в практик.е. Практическое применение ферментов в народном хозяйстве нашей страны расширяется с каждым годом. В хлебопекарвоl промьmmеDDОСТВ применяют ферменщые препараты (содержат амилазу и протеиназу), выделяемые из
грибов, относящихсякроду Aspergillus. Будучи добавлены вколичесгве 20-25 г
на 1 т муки, они улучшают качество и аромат хлеба, ускоряют созревание теста
на 30%. сокращают расход сахара на производсгво высших сортов булочных
изделий вдвое, увеличивают пористость мякиша и объем хлеба на 20%.
В nивовареНDD и спиртовой промьпплеDDОСТИ применяют амилазы-фермен· ты, ускоряющие реакцию осахаривания крахмала. Их производство приняло
У нас промышленный характер. Экономический эффект применения амилаз весьма значителен. Так, в пивоварении использование ферментных препаратов
позволяет экономить 165 г ячменя при производстве каждого декалитра пива.
Применение амилазы при производсгве спирта дает возможность полностью
отказаться от зернового солода и одновременно увеличить выход спирта из
сырья на 1,5% при снижении себестоимрсти декалитра спирта. Широкие
перспективы сулит использование ферментов в виноделии. Пектинолитические
ферменты повышают выход соков из плодов и ягод на 15-20%, виноматериа
лов-на 5-7%; они также необходимы для осветления фруктовых соков.
Каталаза и глюкозооксидаза длительно сохраняют букет розовых и белыIx вин. В кожевеDDОМ и меховом производстве для ускорения снятия волоса со шкур
R размягчения кожевенного сырья применяют препараты протеиназ (протелин
и протофрадин), ЯВЛЯЮЩИхся внеклеточными протеиназами стрептомицетов. При этом время на осуществление необходимых процессов сокращается в не·
сколько раз, сортносгь и качество шерсти и кож повышается, а условия труда
в этой отрасли производства резко улучшаются. В текстильной промьпuлен·
ности процесс расшлихтовки тканей ферментными препаратами грибного и бактериального происхождения ускоряется в 7-10 раз; эти же препараты
139