Филиппович Ю.Б. - Основы Биохимии
.pdfА |
Б |
|
Рис. 32. Модели свертывания полипептидной цепи в сх-спираль с образованием системы
Boдopoдных связей между витками спирали:
А- в виде БУМ8Jl<ноli neНТ'" с выписанной на ней cтpyктypoli noлипептидвоli цепи; водородные СВRЗИ, МВЛRЮЩНес.
ИСТОЧНИКОМ ВЭaltмодеlСТВИR, ПРИВОДJIЩИМ к спирализации, показаны пунrrиром; Б-в виде хребта полипептидной цепи, составленноrо ИЗ объемно изобра"'ениых NH, СО· и СНR-грynп; атомы водорода н кислорода, участвующие в образова нии водородиы.х са.зеА, помечены знаuми 4( +» н « -) COO11lCTCТвeннo. Модель в виде бумажной ленты может быть использована. Курсе XИМIIН cpeДlleli WJCOJJW и иа КРУЖIЮВЫХ 3IUJJITIWt со 1W<ольниимн ПО орrаничecJCОЙ химии
Первая модель молекулыI белка-миоглобина (рис. 33),отражающая его тре
тичную структуру, бьmа создана Дж. Кендрю с сотр. (1957). На рис. 34 приведены
схематические изображения третичной структуры молекул миоглобина, рибо нуклеазы, лизоцима и химотрипсиногена. Несмотря на большие трудности, за истекшие три с половиной десятилетия удалось установить третичную структу
ру почти трехсот белков, причем более трех десятков из них-в СССР. В нашей
стране, в частности, выясненаструктура пепсина, леггемоглобина, аспартатами
нотрансферазы, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы, пластоцианина, фи
тогемагглютинина, 'У-кристаллина, пирофосфатазы, ряда рибосомальных бел ков, аКТИНOlссантина, лектина, лейnинаминоnептидазы, сх- 1{ f3-интерферона.
лейцинспецифичного белка, родопсина, тубулина, гидрогеназы, метанмоноок сигеназы идр. Ниже некоторые из них будут охарактеризованы более подробно.
Полагают, что третичная структура белковой молекулы определяется ее
первичной структурой, так как решающая роль в поддержании характерного для треmчной структуры расположения полипептИдНОЙ цепи в пространстве
70
Рис. 33. сх- и Р-Структуры во фрагменте молекулы 1UIтохрома Ь, и сх-сnиральные участки в моле-
куле миоглобина:
А-фраrменты полипenтидиоli цепи цитохрома (остапи 21-25, 28-34, 50-54 и 73-79), образуюшие р..::лой, показаны толстыми .1ИНИИМИ, сам слой отмечен знаЧl(ами Р; четыре a..::тpyrrypы (остатхи 34-39, 40-50, 54-63,64-73) изображены в аиде цилиндров; между попарно объединепными а·спирал.1IIИ распоnаrаетса простетичсскаа труппа цитохрома Ь., СОllержоlЦ8Jl атом
железа; Б-восемь а..::пиральных учаСТI<ОВ в молекуле .,иоrлобина (обозlШчены бyuами лаТИНСkоrо алфавита) pe3l<O преобладают
Ш!Д изгибами 1l0липеп"J'ИДlIOЙ цепи (обозначены сочетаниями АВ, ве н Т. д.) ПО ПРОТRженности и nepeceжаются под раЗЛИЧIIЫМИ
У['.lамн; черный дис" в верхней левой части молекулw - труппа rcмa ~ атомом жслеза в центре
71
А
Б
21
в |
г |
Рис. 34. Третичные структуры миоглобина (А), лизоцима (Б), рябону"- леазы (В) н химотриnснногена (г)
Во всех случаJIX показаны конфиrypация и расположение в пространстве хребта полипеПТИДIIОЙ
цепи. РаДИl<алы 8МИ!lОJ:ИСЛОТНЫХ остапов DИгде не обо:mачевы. Ероме трех радикалов в моле
куле химотриnсниогева. А -эаштрвховаllВЬlЙ ДИСI<-reм; пувхтвр-место прихреnлениа его
1< хребту полвпепТИДllOЙ цепи посредством радип.ла mстИДIIВВ; хорошо заметны ",-спирали.
составляющие 75% полвпепТИДllOЙ цепи мвоглобива; цифрами У"азаны номера амиНОJ:ИслОТ пых остатко. в полвпепТИДllOЙ цепи (см. таЮJ:e РИС. 33, 6); Б-снмволами-S-S-обозначены дисульфндRыe мостlП1l, образУе.....е при Оl<Нслевив paдlRалов цистеина; з.метно, ЧТО а-спи
ралънu J:Oнфиrypaциа прнсуща ве более чем ',. полвneпТИДIIОЙ цепи; в верхней части молекулы
ВИДIIО углубление (щель), предиазвачеввое ДЛ8 размещения субстрата, расщеnл.емого лизоци мом; В-сх-cnиральиых конфигураций почти не видно; остальвыe условные обозначеНИR, Jl.'П
в А и Б; Г-.сно выражеllныx а-спвралей не ваблюдается;-S-S,св"зи обозначены точками. здесь же цифрами У"аэаны ПОРUJ:овые номера соответствующих остапов Ц1Iстеина; в центре
молекулы выделены ШТРИХОВКОЙ радикалы ГИCТИДIIВВ (ппиугольниlCИ) И радикал серина (корот·
J:ИЙ Д1IуроnПi отрезок). образующие uтвввыl! цеитр хвмотрипсива (после arrИIIироваива хвмотрипCВRОгена). onoeтcтвeввыll за ГИдРОЛИЗ пептИДIIЫХ "вазей
принадлежит взаимодействию радикалов аминокислот друг с другом. Воз можные типы связей между радикалами представлены на рис. 35. Особое значение в поддержании третичной структуры белка придают дисульфидным мостикам: именно они в ряде белков (см. рис. 29, 34 и 35) прочно фиксируют
расположение участков полипептидной цепи (или цепей) по отношению друг к другу. Таким образом, местоположение в молекуле белка остатков цистеина
(и других аМИНОКI;rСЛОТ) предопределяет характер межрадикальных связей и,
следовательно, третичную структуру. Конечно и здесь, при замыкании дисуль
фидных мостиков, В частности, реализуются далеко не все возможности их
возникновения, резко отличающиеся от расчетных (по Т. Крейтону, при пяти
SS-связях в белковой молекуле |
число их комбинаций достигает 945, при |
|
10-654729075, а при 25-превышает |
5,8 '1030). |
|
. |
. |
|
72
Рис. 35. Типы связей между радикалами аминокислотных остатков в белковой
молекуле:
а-электростатическое взаимодействие; б-водородные св.зн; г-В3811МодеАствне неПОЛRРНЫХ боко вых иепей, вызванное вталкиванием лиофобных радикалов в (<СУХУЮ ЗОН)'» молехулами растворител.
(так называемая <<жири"" капл",'); z-днсульфндные связи. Двойна. изогнуть ЛИНИЯ обозначает хребет
. полипептидной цепи
Кроме ковалентных связей третичная структура белковой молекулы
поддерживается силами слабых взаимодействий (рис. 35). Рассмотрение пол
ных химических структур некоторых белков показало, что в их третичной структуре отчетливо выявляются зоны, где сконцентрированы гидрофобные
радикалы аминокислот и полипеttтидная цепь фактически обматывается вокрут гидрофобного ядра. Более того, в ряде случаев в белковой молекуле
обособляются два и даже три гидрофобных ядра, в связи с чем возникает двух или трехъядерная структура. Такой тип строения молекулы характерен ДЛя
многих белков, обладающих каталитической функцией (рибонуклеаза, лизо-
. цим И др.).
Данные о полной химической структуре молекул ряда белков явились
отравным пунктом для создания учения о доменном принципе строения
белковой молекулы. Под доменом понимают обособленную область молекулы
белка, обладающую в определенной степени структурной и функциональной
автономией. У ряда ферментов, например, обособлены коферментсвязываю
щие домены. С учением о доменном принципе строения белков связано постепенно внедряющееся в белковую химию развитие представлений об элементах однотипности, блочности, стандартности третичной структуры бел ков, об ограlЩченности набора пространственных упаковок полипептидных
цепей, реально существующих в природных белках.
Сейчас домены считают фундаментальными элементами структуры белко вых молекул, и соотношение и характер компоiIовки а-спиралей и р-слоев, как
полагают, дает для понимания эволюции белковых молекул и филогенетиче
ских связей больше, чем сопоставление первичных структур. Причина этого
лежит в том, что в процессе эволюции происходило слияние доменов, их
удвоение, возникновение псевдосимметричных доменов из повторяющихся
субдоменов; некоторые из этих событий связаны с дупликацией генов и други
ми изменениями генетического аппарата.
Есть много оснований полагать, что третичная структура белковой моле
кулы возникает совершенно автоматически. Движущей силой, свертывающей
73
полипептидную цепь белка в строго определенное трехмерное образование,
является взаимодействие аминокислотных радикалов с молекулами окружа
ющего растворителя. При этом лиофобные радикалы вталкиваются внутрь белковой молекулы, образуя там сухие зоны (<<жирная капля»), а лиофиль ные-ориентируются в сторону растворителя. В некоторый момент достига
ется энергетически выгодная конформация молекулы в целом, и белковая
молекула стабилизируется.
Самоорганизация полипептидной цепи определенного белка в только ему
присущую уникальную пространственную структуру, т. е. процесс возникнове
ния третичной структуры, проходит в несколько этапов (рис. 36).
На конформацию возникшей глобулы оказывают сильное влияние такие
факторы, как рН среды, ионная сила раствора, а также взаимодействие
белковых молекул с другими веществами, что лежит в основе регуляции
обмена веществ, в частности аллостерическоli регуляции активности фер
ментов.
Разработка представлений о самоорганизации белковых глобул сопровож
далась не только введением понятия о доменах, о чем уже было сказано выше,
но и новым подходом к характеристике уровней структуры белковых тел:
к ним добавился упомянутый уже доменный уровень и надвторичная структу ра. Под последней подразумевают закономерносm возникновения в процессе . свертывания полипепmдной цепи элементарных структур, представленных
Р-слоями (13, Р'-структура), сочетанием а-спиральных участков (а, а'-структура)
или тех и других одновременно (рис. 37). Преобладаю
щей среди надвторичных структур оказалась топо)югия
I
'"
|
греческого ключа и греческого орнамента. |
|
Существенно, что фрагменты полипептидной цепи, |
|
соответствующие доt1еItам и даже субдоменам, способны |
|
. независимо поддерживать близкую к нативной структу- |
I |
ру. Так, цианбромидный фрагмент (121-316-й аминокис |
1,. |
лотные остатки) и его субдомен (205-316-й остатки) |
"'" |
термолизина (протеолитического фермента из термо |
'. |
фильной бактерии) самопроизвольно образуют стойко |
t. |
|
.. |
удерживаемую нативную структуру. Весь же процесс |
формирования третичной структуры таких, например, |
•п белков, как угольная ангидраза, а- и Р-лактоглобулиn,
~ |
..•.... |
фосфоглицераткиназа и лактамаза, занимает всего лишь |
|||||
0,2 с. Вместе с тем выявлены факторы, лимитирующие |
|||||||
..•.... |
|||||||
|
|
- - |
скорость складывания полипептидов в процессе возник |
||||
-~ |
|
новения третичной структуры; к их числу относится цис |
|||||
|
транс-изомеризаnия связи Х-про (где Х-любая ами- |
||||||
|
|
- |
|
|
|||
|
|
- |
|
|
m нокислота), ускоряемая пептидилпролил-цис-транс-изо- |
||
~","" 1'1 |
Рис. 36. Стружтурные превращеНИJI полипептидной цепИ при форми' |
||||||
-., |
|
1" |
" |
|
ровании белковой l"Лобулы |
|
|
|
|
- |
Нв 1 зтапе ПРОRСХОДП локальные 8З8имодеЙстви. иа разЛRЧНЫХ )"IIIC1'X8X всей полипептидноli |
||||
|
|
|
цепи, 8 результате J:оторыJt 8Озmп:ают флуктуирующие а·сnирали и Р-СЛОН, Образование |
||||
.. -_.. |
|
|
а-i:пиралей ивициируетсs с тоli ТО'ПII полнneптвда, где сосредоточеНlol остатlCИ ДJlкзрбоиовых |
||||
|
|
аминокислот, и терминируете. в зоне остаТI:ОВ диаминоа:ислот~ тогда ка!: центральн8.JI част• |
|||||
-' |
|
- |
ВОЗИИl<ающих а-i:nиpалeli зaIIята аминОКНСЛОТНЫМИ остаnзми с гидрофОБНЫМИ радикалами. |
||||
|
|
|
|
|
На ЭТОМ зтапе самоорганизации беЛJ:овоli молеkУЛW ВОЗRlRает максимально возможное "оличе- |
||
|
|
•••• 1. |
|
IV ство a-i:nИPальных J:онформациli полиnenтида, охватывающее больщую часть полипептндноil |
|||
|
|
|
цепи. Поэтому НЛЛЮСТР!'РуеМ8JI rиnотеза самоорганизации белковых молекул получила назва |
||||
.'1'1'" |
|
ние гипотезы избыточllыJ< спиралей. На 11 этапе осущестВЛRетСR направленное |
сближение |
||||
• |
|
- = |
зародьlшевых структур, «е1<лопыание» а-спиралей и возникновение одного или |
нес1<олысиx |
|||
|
- |
~ |
гидрофобных lIДep за счет контактов гидрофобных p8д1II<алов амИ!юICИСЛОТ а-спиралеll. В этот |
-структур и преобразоаанию промежуточноll, высокоспиральной глобулы в нативную глобулу.
На IV этапе возmп:ает ОJ:ouчатеЛЬНaJI. характерна" дм данного белка третичнu структура"111 этап СВОДИТСR компаI<Тизации зародышевыхмомент возmп:ает глобуЛllpНIUI структура.
молекулы
74
.:::. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
. '." |
|
....... |
, |
|
;,-- |
О; |
|
|
~; |
|
,. |
.'::: |
::- |
о::. |
|||
" |
'. |
|
|
|
:: |
<, |
|
-' |
: |
..,; |
" |
||
: |
~~ |
-"! |
|
'.' |
:' |
I |
|
; |
|||||
|
|
|
|
о"! |
!' |
" |
:" |
.-1 |
: |
---' : |
|||
|
.. |
;;- |
.iIII! |
|
.. |
i:- |
~~ |
|
."t |
"" |
|
:: |
|
|
|
~ |
|
|
|||||||||
. |
|
|
" |
."t |
|
|
|||||||
" |
."" |
-'! |
|
:: |
[, |
" |
I |
~. |
|
|
|||
|
|
~ |
|
|
, |
|
|
|
|
|
-' |
|
|
|
|
" |
|
'о |
|
:- |
f' |
-' |
|
|
|||
|
|
|
|
: |
|
|
|
~ |
|
||||
~, |
," |
;",- |
;.;'. |
|
о', |
|
.... |
|
|
|
|
|
|
" |
", |
|
|
',- |
|
.-1 |
|
|
|
||||
~ |
: |
|
|
|
, |
|
|
, |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
рр' |
|
|
|
рар' |
|
|
" |
|
|
|
|
|
|
|
аа' |
Греческий мюч |
ГречеСJCИiI |
орнамент |
|||||||||
|
|
|
|
|
Рис, 37, НаД8торичные структуры белка
меразой. Рассмотренный механизм самоорганизации белковых глобул полу
чил изящное подтверждение в работах (начиная с 1988 года) по синтезу
искусственных белков. Их создано к настоящему времени более двух десятков.
Исходя из представлений о приуроченности а-спиралей. р-слоев и участков
неорганизованной полипептидной цепи к определенным аминокислотным по
следовательностям в синтетически полученных полипептидах, удалось СIЮНСТ
руировать белковые молекулы, где автоматически и самопроизвольно воз
никали элементы вторичной и надвторичной структуры, неизбежно занима ющие заранее рассчитанные позиции при формировании пространственной структуры молекулы такого искусственного белка. Так созданы методом
белковой инженерии синтетические белки, получившие условные названия
«Феликс» (от анrл. four helices, т. е. из 4-х а-спиралей), «альбебетин» (ш,>строен
из а-спиралей и Р-слоев в соотношении 1:2, т. е. аль:бебе) и т. п. Более того,
они обладали заранее запрограммированными свойствами и биологической
активностью.
Вместе с тем в течение последнего десятилетия 'взгляды на саморегуляцию
процесса свертывания полипептидны}[ цепей белков при формировании их третичной структуры in vivo существенно изменились. Оказалось, что приве денные вьпnе преобразования (см. предыдущую стр. и рис. 36) осуществля
.ются не сами по себе, а под влиянием особых. предназначенных именно для
этой цели специфических белков, названных шаперонами (так в Англии назы
вали пожилую даму, удерживающую от непродуманных контактов молодую
девушку, впервые выходящую в свет под ее руководством). Будучи в большин стве своем трубчатыми 'олигомерами, составленными из 10-90 кДа субъеди
ниц, объединенных в наложенные друг на друга семичленные кольца, они
вовлекают внутрь олигомера пока еще неорганизованную полипептиднyIO
цепь и контролируют ход образования ею вторичных и надвторичных струк
тур и их взаимную пространСтвенную укладку (см. рис. 36), обеспечивающую возникновение третичной, присущей нативной (фymщионально значимой) гло буле данного белка.
Однако и эта концепция, по-видимому,-не последнее слово в далеко
неоднозначно решаемой проблеме складывания (фолдинга) полипептидных
цепей. Исходя из эксперИментальных и теоретических подходов, разработан
ных в процессе исследований кода белкового синтеза (см. ниже. гл. VII)
высказано предположение (Л. Б. Меклер и Р. Г. Идлис; Г. И. Чипенс) о су
ществовании общего стереохимического генетического кода, позволяющего
попить, как трехмерные молекулы белков сформировались из линейных поли
пепт~х цепей. Суть вопроса сводится к наличию кода взаимодействия
75
аминокислотных остатков друг с другом, что обеспечивает реализацию ин
формации, уже заложенной в первичной структуре белка (и, естественно,
в мРНК и ДНК) в виде элементов вторичной и надвторичной структур и,
В конечном счете, в виде уникальной третичной структуры данного белка.
Четвертичная структура белка. Ранее уже было отмечено, что крупные
молекулы белков состоят, как правило, из субъединиц со сравнительно небо льшой молекулярной массой. Такие молекулы называют эпимолекулами (сверхмолекулы) или мультимерамв, а составляющие их элементы-субъеди
иицами или протомерами.
Структура, характеризующаяся наличием в белковой эпимолекуле опреде ленного числа полипептидных цепей (субъединиц), занимающих строго фикси рованное пространственное положение, вследствие чего белок обладает той
или иной биологической активностью, называется четвертичной.
От четвертичной структуры следует отличать олигомериое и агрегироваШlOе
состояние белка. Структура, характеризующаяся существованием в составе белковой частицы нескольких полипептидных цепей, число которых изменяет
ся в определенной пропорции, называется олигомерноЙ. Крайне важно, что,
··~r'l.ЮТРЯ на относительное постоянство числа полипептидных связей в олиго
....l.рс белка и их упорядоченное расположение, у олигомера не возникает биологической активности. Так, например, сывороточный альбумин быка
существует в виде мономера (М = 68000), димера (М = 136000), тримера
(М = 204 000) и тетрамера, причем мономеры, объединяясь волигомерные
·структуры, располагаются в составе ди-, три- И тетрамера упорядоченно.
Однако это не сопровождается возникновением каких-либо новых качеств по сравнению с теми, которыми обладает мономер данного белка.
Под агрегированным состоянием белка подразумевают такую структуру
белковых частиц, которая npедставлена неопределенным и изменяющимся в широких пределах числом полипептидных цепей. При этом агрегация моно
меров тоже не приводит к формированию каких-либо особых свойств у белка,
находящегося в таком структурном состоянии. Так, цитохром с (и другие цитохромы) обладают резко выраженной способностью к агрегации молекул друг с другом, но этому явлению не сопутствует изменение свойств фермента.
Сейчас |
выяснена |
четвертичная структура нескольких сотен белков. |
В 1965 г. |
информация |
о четвертичной структуре ограничивалась примерно |
20 белками; в 1970 г. появилась первая солидная сводка, включавшая 108 бел
ков, а в 1976 г. Д. Дарнелл и и. Клотц опубликовали таблицу, содержавшую
перечень свыше 500 белков и дапные о молекулярной массе мультимеров,
протомеров и количестве последних в эпимолекуле.
Оказалось, что число субъединиц в эпимолекулах колеблется в очень широких
пределах: от 2 до 162. Наиболее часто в составе молекул-мультимеров насчиты вается 2 или 4 протомера, гораздо реже-6, 8, 10, 12 или 24 и в редчайших
случаях-их нечетное количество. Четвертичной структурой обладают в основ
ном белки с молекулярной массой выше 50000-60000, а белки с меньшими молекулярными массами существуют, как правило, в виде мономеров. Критиче
ским пределом молекулярной массы белковой молекулы, сверх которого белок
в большинстве случаев обладает четвертичной структурой, считают 100000. Что
касается молекулярных масс субъединиц, то они npинимают самые разнообраз НbIe значения, от нескольких тысяч (например, 6000 у инсулина) до 330000 (у каждой из двух субъединиц тиреоглобулина-белка щитовидной железы, ответственного за биосинтез гормона тироксина-см. гл. ХН).
Классическим примером белка, имеющего четвертичную структуру, явля ется гемоглобин (рис. 38). Молекула гемоглобина (М=68000) построена из
четырех субъединиц с М = 17000 каждая. Первичная, вторичная и третичная
76
А |
6 |
мо1(J!ин..алыluu nадиие 9нм
CpetJHUU раоиус ~5н,.,
Шаг сnиралu 2,3НМ
~~==ПериоВuiJен/Пu'/ноеmи(6,9нн,
'19 су6ье6иниц)
Ра8и 'с полост" 2Н1'I
b'I~~~ Нуклеuно6аR
кислота Ос, '/QCmuq61
8 |
r |
Рис. 38. Четвертичная структура беmcовых молекул:
А-модели субыДIПIRQ гемоглобииа типа 11 (слева) и 11 (справа). Блоки, из ",оторых составлеRы моделв, хараа:теризуют распределение злеа:тровиых IUJOтностеll в разных частих моле"улы; чернак (слева) и бела. (справа)
линии Уkазывают расположение хребта полипепТИдНоlI цепи; Б-трехмернu модель молекулы reмоглобина;
. субъедииицы типа 11 (светлые) и (3 (темные) располоJl<cRы по утлам почти правильноro тетраэдра, темвые
ДВСЕН-группы reмa; В-модель молекулы вируса табачноll моз3ИItИ: cвapY"'ll вИднЫ бeлt<овые субьедииицы, темна. сnиpaль-НУ1<Лсииоваа JЗlслота; r- раCnОЛОJl<Cние суБЫдllllllll в молекулс вируса табачноll моэаиl<И
(разрез)
структуры субъедиmщ молекулы гемоглобина полностью выяснены. Они
оказались попарно идентичными и были названы субъединицами типа (Х и р.
Субъединица типа (Х представлена полипептидной цепью из 141 аминокис
лотного остатка, J3-из 146. Третичная структура.их сходна. Четыре субъеди
ницы (две типа(Х и две типа J3) соединяются в единую молекулу гемогло бина, располагаясь в углах почти правильного тетраэдра (рис. 38, Б). Та
ким образом, возникает почти шаровидная молекула с параметрами
0,50 х 0,55 х 0,64 нм.
Принципиальный интерес для будущего учителя химии и биологии пред
ставляет вопрос о том, как взаимосвязаны структура гемоглобина с его функцией-способностью связывать, переносить и легко отдавать кислород.
Это явление детально изучается в средней школе. Непосредственно молекула
кислорода присоединяется к Ре2 +, закрепленному в центре молекулы гема
(рис. 39), который, в· свою очередь, удерживается в mдрофобном кармане
каждой .из субъединиц, будучи присоединен координационными связями IC имидазольным радикалам гистидина, расположенным в дистальной и про
ксимальной частях полипептИДНОЙ цепи, образующей (Х- или Р-протомер гемо
глобина. Присоединение кислорода к Ре2 идет без изменения валентности
последнего на одну из его свободных координационных связей; при этом
радиус атома Ре2 + уменьшается и он вместе с 02 перемещается в плоскость
порфиринового кольца. Здесь он удерживается до тех пор, пока молекула
гемоглобина не будет перенесена в ткань с более низким содержанием 02' где И происходит обратный процесс отдачи кислорода. И связывание 02' и его
высвобождение сопровождается конформационными изменениями структуры (Х- и Р-субъединиц гемоглобина и их взаимного расположения в мультимере.
77
Дистanьиый фр3Пdент
пonнnептидноА цепи
субъединицы
На рис. 38 приведена также схе ма строения сложного белка (нукле протеина)-вируса табачной мозаи ки. Его гигантская молекула
(М = 40 000 000) содержит небольшое
количество (около 6%) РНК, осталь
ное приходится на белок. Белковая
Проксимальный
фР3Пdеит
Рис. 39. Структура активноrо центра и механизм
связывания кислорода субъединицей rемоrлоби
на (ПОlIснении в тексте)
часть складывается из большого
числа (2130) субъединиц с М = 17 500
каждая. Молекула вируса -табачной мозаики представляет собой полую палочку длиной около 300 нм и тол щиной примерно 17 нм, с отверсти ем в центре диаметром в 4 НМ. Каж дая субъединица имеет размеры
2 х 7 нм. Субъединицы расположены
по спирали, каждый виток которой
образован примерно 16 субъедини цами. Молекула нуклеиновой кисло
ты, следуя спиральному располо
жению субъединиц, проходит между их рядами. Вдоль молекулы рас полагается свыше ста витков из бел ковых субъединиц.
Самое поразительное явление, на блюдающееся при изучении четвер
тичной структуры белковых молекул, состоит в том, что объединение протоме
ров в молекулу мультимера осуществляется самопроизвольно. Предполагают, что в молекуле каждого протомера есть специфические участки, взаимодей ствующие с таковыми в других протомерах. При соединении протомеров в мультимер возникают ионные связи. В их формировании принимают участие ионы металлов и иногда низкомолекулярные органические соединения. Однако наибольший вклад в поддержание целостности структуры мультимеров вносят
силыслабых взаимодействий, аименно-гидрофобные взаимодействия и водо
родные связи; суммарный эффект тех и других достаточно велик! чтобы обеспечить стабилизацию четвертичной структуры белков. Как вне организма,
так, видимо, и в клетках мультимеры способны обратимо диссоциировать на
протомеры.
Принципиально важно, что малейшее изменение третичной структуры
протомеров делает невозможным соединение их в молекулы мультимера, что
резко сказывается на биологической активности белка. Поскольку третичная структура белка задается его первичной структурой, а также зависит от ряда других факторов (рН среды, концентрация солей и т. п.), то даже незначитель ное изменение первичной структуры белка или стандартных условий в клетке приводит к изменению функциональной активности белков. Указанные явле
ния лежат в основе регулярных процессов в организме.
СВОЙСТВА БЕЛКОВ
Различают химические, физические и биологические свойства белков. Химические свойства белков отличаются исключительным разнообразием.
Обладая аминокислотными радикалами различной химической природы, бел-
78
ковые тела способны давать широкий круг реакций. При рассмотрении
свойств аминокислот эти реакции уже были перечислены. Все они характерны
и для белков.
Особо важную роль в обеспечении определенных структурных особен
ностей белковых молекул и ряда их биологических свойств имеют реакции
между радикалами аминокислотных остатков в пределах одной и той же
белковой молекулы. При этом выявляется отчетливая зависимость третичной структуры белков от ряда внешних условий: рН среды, концентрации солей
в растворе, окислительно-восстановительного режима клетки и др. Типы этих
реакций отмечены на рис. 35. Весьма характерна для белков реакция гид
ролиза пептидных связей. Располагая значительным числом основных и кис
лыIx групп, белки проявляют амфотерные качества.
Некоторые физические свойства белков (молекулярная масса, двойное луче преломление, подвижность в электрическом поле) рассмотрены выше. Кроме них, для белков характерны оптические свойства, заключающиеся в способ
ности вращать плоскость поляризации света (оптическая аКТИВНОСТЬ'белков),
рассеивать световые лучи ввиду значительных размеров белковых частиц
и поглощать ультрафиолетовые лучи. Перечисленные оптические свойства
белков используют при их количественном определении, измеренШI молеку лярной массы и т. п.
Одним из характерных физических свойств белков является их способность
адсорбировать на поверхности молеКУЛ,(а иногда и захватывать внутрь моле
кулы) низкомолекулярные органические соединения и ионы. С этим свойством
белков связана их транспортная функция в организме: некоторые белки явля ются хорошими переносчиками продуктов обмена.
К числу биологических свойств белков относят в первую очередь их биока
талитическую активность. Благодаря особому строению молекулы или нали
чию активной группы, соединенной с белком, 'многие белки обладают способ ностью каталитически ускорять ход химических реакций. Это свойство белков
играет огромную роль в осуществлении процессов жизнедеятельности. Оно
будет детально рассмотрено в главе о ферментах. Другое не менее важное
биологическое свойство белков-их гормональная активность, т. е. способ
ность воздействовать на целые группы реакций в организме. Ряду белков
присущи токсические свойства, патогенная активность, защитные и рецептор
ные функции, триггерное поведение, ответственность за явления клеточной адгезии и, как следствие этого, морфогенеза и т. п.
Огромна пластическая роль белков: в сочетании с другими макромолекула ми они дают начало смешанным биополимерам-нуклеопротеинам, липопро
теинам и гликопротеинам, которые, в свою'очередь, обеспечивают возникнове
ние субклеточных структур и надклеточных образований в организме. Харак
терно, что информация о том, как будет построена та или иная субклеточная структура, содержится именно в белковых молекулах. Сочетание своеобразных химических, физических и биологических свойств белков обеспечивает именно
этому классу органических соединений центральную родь в явлениях жизни.
Еще одно своеобразное качество белковых тел-денатурация. Белки, об
ладающие всеми характерными природными свойствами, называются патив
пыми. Часто под влиянием очень мягкой обработки, например легкого встря хивания, и тем более при грубых физических или химических воздействиях белки быстро теряют нативность и переходят в денатурированное состояние.
Изменение уникальной структуры нативного белка, сопровождающееСJl поте
рей характерных для него свойств: растворимости, биологической активности,
электрофоретической подвижности и т. п., называется денатурацией. Денату
рация, как правило, затрагивает третичную и частичн~ вторичную структуры
79