- •Современные проблемы биологии
- •Содержание
- •Модуль 1. Проблемы современной генетики и смежных наук
- •Введение
- •Модуль 1. Проблемы современной генетики и смежных наук Тема № 1: Особенности развития биологии на современном этапе
- •1. Общая характеристика современной биологии
- •2. Методы и методология современной биологии
- •3. Основные концепции современной биологии
- •4. Основные направления современных биологических исследований
- •Список источников
- •Тема № 2. Проблемы генетической инженерии
- •1. Краткая история генетической инженерии
- •2. Генная и геномная инженерия
- •3. Генетическая инженерия микробиологических систем
- •4. Методология генной инженерии растений
- •5. Достижения генной инженерии растений
- •6. «Плюсы» и «минусы» генетически модифицированных организмов
- •Список источников
- •Тема № 3. Клонирование и трансгеноз животных
- •1. История клонирования животных
- •2. Проблемы в клонировании животных
- •3. Достижения в области клонирования животных
- •4. Трансгеноз животных
- •5. Трансгенные животные и моделирование заболеваний человека
- •Список источников
- •Тема № 4. Современные методы исследования генома
- •1. Классический подход к расшифровке последовательностей днк
- •4. Использование методов биоинформатики в секвенировании
- •5. История прочтения генома человека
- •Зачем учёным тысячи геномов?
- •Список источников
- •Тема № 5. Геномика и медицина
- •1. Ключевые открытия, сделанные в результате анализа генома человека
- •2. Практическая польза знания последовательности генома человека для медицины
- •3. Классификация наследственных заболеваний человека
- •4. Биохимические и молекулярно-генетические методы диагностики наследственных болезней
- •Виды молекулярно-генетической диагностики
- •Методы исследования днк
- •5. Персонализированная медицина. Фармакогенетика. Фармакогеномика
- •6. Генетический паспорт
- •7. Геномная дактилоскопия
- •8. Генотерапия
- •Список источников
- •Тема № 6. Этногеномика и геногеография
- •1.Основные подходы к днк-анализу в популяционных исследованиях
- •2. Африканское происхождение человека современного типа
- •3. Использование анализа днк для изучения истории этносов
- •4. Этногеномика и геногеография Восточно-Европейского региона
- •5. Особенности русского генофонда
- •Список источников
- •Тема № 7. Рнк – интерференция
- •1. Короткие интерферирующие рнк и механизм рнк-интерференции
- •3. Функции и эволюция микроРнк
- •4. Строение, функции и эволюция пиРнк
- •Тема № 8. Генетика индивидуального развития
- •1. Ооплазматическая сегрегация и полярная плазма
- •2. Формирование градиентов в яйцеклетке
- •3. Гены сегментации
- •4. Гомеозисные гены, их роль в развитии
- •5. Гипотеза э. Льюиса о механизме функционирования гомеозисных генов
- •6. Гомеобокс и гомеодомен. Принцип коллинеарности
- •7. Гены — господа и гены — рабы. Опыты Вальтера Геринга
- •Список источников
- •610000, Г. Киров, ул. Московская, 36, тел.: (8332) 64-23-56, http://vyatsu.Ru
3. Классификация наследственных заболеваний человека
Наследственность и среда могут играть большую или меньшую роль в развитии того или иного порока или заболевания.
С генетической точки зрения все болезни в зависимости от относительной значимости факторов наследственности или среды в их развитии можно подразделить на 4 группы.
Первая группа – это наследственные болезни как таковые. Проявление заболевания практически не зависит от среды, которая может только менять выраженность симптомов болезни и тяжесть ее течения. К заболеваниям этой группы относятся хромосомные и генные болезни (болезнь Дауна, гемофилия и др.). Болезнь может проявляться необязательно в детском, но в любом возрасте (например, средний возраст начала хореи Гентингтона равен 38-40 годам).
Во второй группе болезней наследственность играет ведущую роль, но для пенетрантности мутантных генов необходим соответствующий фактор окружающей среды. К таким заболеваниям относятся, например, подагра, диабет, фармако- и экогенетические болезни. Подобные заболевания развиваются после контактов с проявляющим болезнь внешним фактором, специфическим для каждого мутантного гена. Эти болезни можно отнести к группе болезней с наследственной предрасположенностью, или мультифакториальным заболеваниям.
Болезни третьей группы развиваются главным образом под влиянием факторов среды (иногда не одного, а сочетания многих), однако частота возникновения и тяжесть течения болезней существенно зависят от наследственной предрасположенности. К болезням этой группы относятся атеросклероз, гипертоническая болезнь, туберкулез, язвенная болезнь и др. Как и болезни второй группы, они относятся к болезням с наследственной предрасположенностью. Резкой границы между этими группами нет.
В происхождении болезней четвертой группы наследственность не играет никакой роли. Сюда относится большинство травм, инфекционных болезней, ожогов и т.д. Генетические факторы могут влиять только на течение патологических процессов (быстрота выздоровления, скорость восстановительных процессов и т. д.).
В 90-х годах ХХ в. предложена рабочая классификация наследственных болезней человека, включающая:
синдромы, обусловленные хромосомными аномалиями (хромосомные болезни);
болезни, вызванные мутацией отдельного гена (генные, или менделевские болезни);
мультифакториальные заболевания (болезни с наследственной предрасположенностью);
болезни с нетрадиционным типом наследования;
генетические болезни соматических клеток (новообразования, старение, аутоиммунные болезни).
4. Биохимические и молекулярно-генетические методы диагностики наследственных болезней
История применения биохимических методов диагностики наследственных болезней насчитывает около 100 лет, первая половина этого пути отмечена лишь единичными примерами диагностики отдельных болезней с использованием качественных биохимических исследований мочи. Их применение началось с диагностики алкаптонурии в начале XX в., что позволило А. Гарроду открыть наследственные болезни обмена веществ, обусловленные блоком ферментативной реакции. В 30-х годах была открыта простая реакция мочи с хлоридом железа (зеленая окраска) при фенилкетонурии.
Молекулярно-генетические методы диагностики наследственных болезней стали внедрять в практику с 70-х годов XX в., и до настоящего времени они остаются бурно развивающейся областью науки и медицины. Молекулярно-генетические методы обязаны своим развитием Кери Мюллису — изобретателю полимеразной цепной реакции (1986), которая лежит в основе всех широко используемых в клинической диагностике молекулярно-генетических тестов. ПЦР — метод амплификации ДНК in vitro. За несколько часов можно размножить определенную последовательность ДНК в количестве, превышающем исходное в миллион раз и более, что позволяет работать с минимальным объемом исходного материала (вплоть до одной клетки). Амплифицированную ДНК затем анализируют с помощью различных методов.
Развиваясь в качестве самостоятельной группы методов, молекулярно-генетическая диагностика обогатила и дополнила классическую цитогенетику.
Биохимические методы. Биохимические методы направлены на определение биохимического фенотипа организма. Уровни, на которых оценивают фенотип, могут быть разными - от первичного продукта гена (полипептидной цепи) до конечных метаболитов в крови, моче или поте.
Хроматографические методы анализа играют важнейшую роль в диагностике наследственных болезней обмена (НБО). Для количественного анализа маркеров-метаболитов НБО успешно применяют такие хроматографические методы, как газовая и высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ), а также хромато-масс-спектрометрия. Газовая хроматография и ВЭЖХ — универсальные методы разделения сложных смесей соединений, отличающиеся высокой чувствительностью и воспроизводимостью, в обоих случаях разделение осуществляют в результате различного взаимодействия компонентов смеси с неподвижной и подвижной фазами хроматографической колонки.
Для газовой хроматографии подвижной фазой служит газ-носитель, для ВЭЖХ — жидкость (элюент). Выход каждого соединения фиксирует детектор прибора, сигнал которого преобразуется в пики на хроматограмме. Каждый пик характеризуется временем удерживания и площадью. Следует отметить, что газовую хроматографию проводят, как правило, при высокотемпературном режиме, поэтому ограничением для ее применения считают термическую неустойчивость соединений. Для ВЭЖХ не существует подобных ограничений, так как в этом случае анализ проводят в мягких условиях.
Масс-спектрометрия — аналитический метод, с помощью которого можно получать как качественную (структура), так и количественную (молекулярная масса или концентрация) информацию об анализируемых молекулах после их преобразования в ионы. Существенное отличие масс-спектрометрии от других физико-химических аналитических методов состоит в том, что в масс-спектрометре определяют непосредственно массу молекул и их фрагментов. Результаты представляют графически (так называемый масс-спектр).
Иногда невозможно анализировать сложные многокомпонентные смеси молекул без их предварительного разделения. Это можно сделать либо хроматографически (жидкостная или газовая хроматография), либо использовать два последовательно соединенных масс- спектрометра (тандемная масс-спектрометрия — ТМС). ТМС позволяет охарактеризовать структуру, молекулярную массу и провести количественную оценку 3000 соединений одновременно, при этом для проведения анализа длительная подготовка проб не требуется (как, например, для газовой хроматографии), а время исследования занимает несколько секунд.
Материалом для биохимической диагностики могут быть моча, пот, плазма и сыворотка крови, форменные элементы крови, культуры клеток (фибробласты, лимфоциты) и биоптаты мышц. При использовании просеивающего метода в биохимической диагностике можно выделить два уровня: первичный и уточняющий. Основная цель первичной диагностики заключается в том, чтобы обнаружить здоровых людей и отобрать пациентов для последующего уточнения диагноза. Показания для применения биохимических методов диагностики у новорожденных: нарушения сознания, судороги, нарушения ритма дыхания, мышечная гипотония, нарушения вскармливания, желтуха, специфический запах мочи и пота, метаболический ацидоз с дефицитом оснований и гипогликемия. У детей более старшего возраста биохимические методы используют во всех случаях подозрения на НБО (задержка физического и умственного развития, потеря приобретенных функций, увеличение размеров внутренних органов), а также при клинической картине, специфичной для определенного заболевания.
Молекулярно-генетические методы. Многие формы наследственных нарушений можно быстро и надежно диагностировать с помощью молекулярно¬генетических методов. Их диагностические возможности позволяют не только уточнить диагноз и различить гено- и фенокопии, но и разобраться в других сложных случаях, проводить пресимптоматическую, пренатальную и неонатальную диагностику, организовывать программы просеивающей диагностики, а также определять носительство у родственников больных и оказывать помощь при планировании семьи.
Дефекты ДНК отражены во всех ядросодержащих клетках организма, поэтому в большинстве случаев для анализа можно взять любую ткань или биологическую жидкость. Чаще всего в качестве образцов используют цельную кровь или пятна высохшей крови, слюну, буккальный соскоб, мочу, амниоциты или ворсинки хориона.