- •Современные проблемы биологии
- •Содержание
- •Модуль 1. Проблемы современной генетики и смежных наук
- •Введение
- •Модуль 1. Проблемы современной генетики и смежных наук Тема № 1: Особенности развития биологии на современном этапе
- •1. Общая характеристика современной биологии
- •2. Методы и методология современной биологии
- •3. Основные концепции современной биологии
- •4. Основные направления современных биологических исследований
- •Список источников
- •Тема № 2. Проблемы генетической инженерии
- •1. Краткая история генетической инженерии
- •2. Генная и геномная инженерия
- •3. Генетическая инженерия микробиологических систем
- •4. Методология генной инженерии растений
- •5. Достижения генной инженерии растений
- •6. «Плюсы» и «минусы» генетически модифицированных организмов
- •Список источников
- •Тема № 3. Клонирование и трансгеноз животных
- •1. История клонирования животных
- •2. Проблемы в клонировании животных
- •3. Достижения в области клонирования животных
- •4. Трансгеноз животных
- •5. Трансгенные животные и моделирование заболеваний человека
- •Список источников
- •Тема № 4. Современные методы исследования генома
- •1. Классический подход к расшифровке последовательностей днк
- •4. Использование методов биоинформатики в секвенировании
- •5. История прочтения генома человека
- •Зачем учёным тысячи геномов?
- •Список источников
- •Тема № 5. Геномика и медицина
- •1. Ключевые открытия, сделанные в результате анализа генома человека
- •2. Практическая польза знания последовательности генома человека для медицины
- •3. Классификация наследственных заболеваний человека
- •4. Биохимические и молекулярно-генетические методы диагностики наследственных болезней
- •Виды молекулярно-генетической диагностики
- •Методы исследования днк
- •5. Персонализированная медицина. Фармакогенетика. Фармакогеномика
- •6. Генетический паспорт
- •7. Геномная дактилоскопия
- •8. Генотерапия
- •Список источников
- •Тема № 6. Этногеномика и геногеография
- •1.Основные подходы к днк-анализу в популяционных исследованиях
- •2. Африканское происхождение человека современного типа
- •3. Использование анализа днк для изучения истории этносов
- •4. Этногеномика и геногеография Восточно-Европейского региона
- •5. Особенности русского генофонда
- •Список источников
- •Тема № 7. Рнк – интерференция
- •1. Короткие интерферирующие рнк и механизм рнк-интерференции
- •3. Функции и эволюция микроРнк
- •4. Строение, функции и эволюция пиРнк
- •Тема № 8. Генетика индивидуального развития
- •1. Ооплазматическая сегрегация и полярная плазма
- •2. Формирование градиентов в яйцеклетке
- •3. Гены сегментации
- •4. Гомеозисные гены, их роль в развитии
- •5. Гипотеза э. Льюиса о механизме функционирования гомеозисных генов
- •6. Гомеобокс и гомеодомен. Принцип коллинеарности
- •7. Гены — господа и гены — рабы. Опыты Вальтера Геринга
- •Список источников
- •610000, Г. Киров, ул. Московская, 36, тел.: (8332) 64-23-56, http://vyatsu.Ru
4. Этногеномика и геногеография Восточно-Европейского региона
Народы Восточной Европы до недавнего времени оставались белым пятном в исследованиях по ДНК-полиморфизму. Имелись только отдельные разрозненные данные по некоторым популяциям. К настоящему времени российскими учеными проведено изучение восточноевропейских популяций по нескольким полиморфным локусам ДНК. Полученные результаты вызвали большой интерес.
Изученные полиморфные локусы представлены в основном мини- и микросателлитами, которые обладают расоводиагностическими свойствами, особенно в отношении европеоидных и монголоидных групп. Другими словами, распределение аллельных вариантов каждого маркера существенно различается у европеоидных и монголоидных народов.
В качестве примера можно привести вариабельный участок генома, имеющий особый интерес. Это ген рецепторного белка CCR5. Есть данные, что вирус СПИД использует именно этот рецептор для внедрения в клетки. Оказалось, что у некоторых людей в этом гене имеется нехватка (делеция) 32-х нуклеотидов. В результате свойства рецептора меняются таким образом, что он становится устойчивым к вирусу СПИД. При этом люди, получившие такую делецию от обоих родителей, не могут заразиться СПИД, даже находясь в группах высокого риска.
В Азии и в Африке эта делеция практически не встречается, но обнаруживается с разной степенью частоты в европейских популяциях, причем имеется три очага с максимумом и все они расположены в северной и восточной части Европы.
Совершенно непонятно происхождение этих очагов — ведь европейское население с вирусом СПИД ранее не встречалось. По-видимому, какие-то еще инфекционные агенты (возможно, вирус натуральной оспы) пользуются тем же рецептором для проникновения в клетки, и именно в связи с этими инфекциями произошла селекция, приведшая к накоплению данной делеции в обнаруженных очагах. Тем не менее, наличие или отсутствие делеции в данном гене также является одним из типов полиморфизма, который используется для анализа популяций. Другие маркеры, вариации в которых связаны с тандемными повторами, также обладали свойствами расоводиагностических признаков.
Суммированные результаты по всем локусам были проанализированы с помощью наиболее современного подхода компьютерной геногеографии. Разработка этого подхода была начата под руководством проф. Рычкова Ю. Г. и продолжена его учениками в Медико-генетическом научном центре РАМН и в Институте общей генетики РАН.
Были проведены исследования обобщающих характеристик генофонда восточноевропейского региона. Для этого использовали метод главных компонент в его картографическом варианте. Этот метод позволяет провести «сжатие» объемов статистической информации без потерь ее информативности. Это дает возможность объединить данные по всем изученным локусам и выявить основные закономерности изменчивости генофонда. Первая главная компонента включает в себя основные и наиболее общие закономерности в изменчивости изученных генов в пространстве региона. Вторая главная компонента и так далее — являются следующими по рангу и значимости величинами.
Геногеографические карты главных компонент наглядно отражают изменчивость всей совокупности генов и воспроизводят наиболее общие тенденции в географии генофонда в целом.
Родная Европа и чуждая Азия. Бросается в глаза (рис.1) близость практически всей Европы к нашей «среднерусской популяции». Широкая область светлых тонов фиксирует популяции, наиболее близкие к «среднерусским». Оказывается, что практически все популяции центральной Европы чрезвычайно близки к «среднерусским» значениям: величины генетических расстояний варьируют от 0 до 0.01. Во всей Центральной и Западной Европе от «среднерусских» значений резко отличается только северная часть Скандинавии, одна румынская и одна из множества итальянских популяций. Умеренные отличия показывают Франция, Англия, Испания и Италия - но, например, Германия, Австрия, Польша на карте неотличимы от среднерусской популяции. Однако даже генетические отличия испанцев заметны лишь в общеевропейском масштабе и исчезают, когда мы охватываем взглядом всю Евразию - повторимся, что на фоне Евразии вся Европа удивительно похожа на средний русский генофонд.
Рисунок 5- Карта генетических расстояний по мтДНК: от русского генофонда до популяций Евразии[2]
Главное, что обнаруживает карта генетических расстояний - это удивительную близость «среднерусских» значений к вариациям европейского генофонда. Это сходство - весьма нетривиальный результат, особенно на фоне радикальных отличий генофонда всего остального евразийского населения. Резкий градиент проходит в районе Урала, пересекает Кавказ и далее на юге немного размывается, показывая «слегка русские» Анатолию и Левант. Все популяции к югу и востоку от этой линии обладают иным митохондриальным генофондом, непохожим на средний русский. Территории, расположенные западнее этой линии, за рядом исключений, достаточно близки к «усредненной русской популяции».
Европейцы больше русские, чем сами русские! Однако самое удивительное, что одним из таких исключений является часть русских популяций, белорусы и украинцы Поднепровья: они значительнее отличаются от «среднерусской популяции», чем многие иные популяции Европы. Это - неожиданный результат. Он показывает, сколь велик размах генетических различий в пределах русского генофонда, насколько значительно некоторые русские популяции могут отличаться от усреднённых общерусских величин. Одна зона слегка повышенных отличий от среднерусского генофонда расположилась прямо... в Центральной России! Другая - на северо-западе, хотя эти данные не слишком надёжны, так как основываются всего на одной псковской популяции. Третья - северная зона - особенно обращает на себя внимание. Она отмечает то - пока ещё умеренное - отличие северно-русского генофонда от генофонда усредненно-русского, которое далее переходит уже в резкие отличия финских, саамских и зауральских популяций.
Итак, русский этнос имеет сложную внутреннюю структуру. Карта генетических расстояний по частотам гаплогрупп мтДНК показывает порой большее сходство европейских групп с усреднённой русской популяцией, чем сами русские популяции: между русскими группами выявлены значительные различия.
Коренное население Азиатских регионов Евразии) резко отличается от русских популяций.