7.7. Строение витамина в6 и механизм реакции с его участием

Каталитическая роль витамина В6 в реакциях декарбоксилирования и транстаминирования аминокислот сводится к образованию промежуточного соединения - азометина ( основания Шиффа)( реакция нуклеофильного присоединения- элиминирования воды). Витамин В6 существует в трех активных формах. В реакции декарбоксилирования участвует пиридоксамин, а в переаминировании - амино- и альдегидная.

Все 3 формы витамина — бесцветные крис­таллы, хорошо растворимые в воде. Активны в виде фосфорных эфиров – пиридоксальфосфата , пиридоксаминофосфата

R - OH + АТФ ———> R – OРО3 Н2 + АДФ

активный витамин В6

Схема реакции переаминирования

- НОН изомеризация

R₁ - CH –COOH + В₆ – СН = О < =======> R₁ - CH –COOH < =======>

| |

NH₂ N=СН - В₆

аминокислота пиридоксальфосфат азометин ( 1)

+ НОН

R₁ - C –COOH < =======> R₁ - C –COOH + В₆ – СН₂ - NH₂

| | гидролиз | |

N — СН₂ - В₆ О

азометин( 2) кетокислота пиридоксаминфосфат

Аминокислота реагирует с пиридоксальфосфатом - альдегидной формой витамина В6 . Образуется азометин(1), который изомеризуется в азометин (2). После гидролиза образуется кетокислота и аминоформа витамина В6- пиридоксаминфосфат.

Пиридоксаминфосфат реагирует с новой кетокислотой, реакция проходит в обратном направлении в соответствии со схемой через образование азометина (2), затем азометина(1) . Кетокислота в итоге превращается в аминокислоту, а витамин В6 вновь возвращается в альдегидную форму.

7.8. Реакция поликонденсации, образование полипептидов

Аминокислоты способны к поликонденсации, в результате которой образуется полимер- полиамид.

Полимеры, состоящие из а – аминокислот , называются полипептидами, или пептидами. Амидная связь ( СО- NH ) в таких соединениях называется пептидной связь ( пептидной группой).

Механизм реакции поликонденсации S_N аналогичен реакции образования амидов кислот( см. лекцию «Карбоновые кислоты»)

В биологических системах синтез полипептидов происходит на рибосомах, каждая аминокислота связана с транспортной РНК , различные ацил -тРНК последовательно удлиняют полипептидную цепь в соответствии с триплетным кодом иРНК, локализованной на рибосоме. Началом полипептидной цепи является аминогруппа. содержащая свободную а-аминогруппу, а концом – содержащая свободную а- карбоксильную группу.

В последовательное соединение аминокислот принято называть первичной структурой белка.

NH₂ - СН- СООН + NH₂ - СН- СООН + NH₂ - СН- СООН + … ——>

| | |

R₁ R ₂ R₃

пептидная группа

nН₂О + NH₂ - СН- СО- NH - СН- СО- [ NH - СН- СО]х - NH - СН- СООН….

| | | |

R₁ R ₂ R₃ Rn

начало цепи конец цепи

N- концевая С- концевая

аминокислота аминокислота

N -конец С-конец

Номенклатура пептидов

Полипептиды называют как производные С-концевой аминокислоты, название начинают с N- концевой аминокислоты, перечисляют все по порядку( изменяя окончание на ил ), заканчивают С-концевой аминокислоой . Можно записывать полные названия, сокращенные( в латинской транскрипции или на русском языке )

Пример: глицилаланилглутамилвалин ( gly- ala – gly- val или гли-ала-глу-вал)