- •Министерство образования и науки Российской Федерации Федеральное агентство по образованию
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Термодинамическое описание биохимических реакций
- •1.1. Расчёт изменения свободной энергии химических реакций
- •1.2. Практические расчеты при описании биохимических реакций
- •1.3. Примеры решения задач
- •1.4. Задачи для самостоятельного решения
- •1.5. Теоретические вопросы для самоподготовки
- •2. Стехиометрические расчеты биотехнологических процессов
- •2.1. Стехиометрия и материальный баланс микробиологических процессов
- •2.2. Расчёт выхода биомассы на углеродный субстрат
- •2.3. Энергетическая эффективность процессов микробиологического синтеза
- •2.4. Примеры решения задач
- •2. Уравнение катаболизма:
- •3. Брутто-реакция:
- •2.5. Задачи для самостоятельного решения
- •2.6. Теоретические вопросы для самоподготовки
- •3. Ферментативная кинетика и катализ
- •3.1. Общая характеристика ферментов
- •3.2. Кинетическое описание ферментативных процессов
- •3.3. Различные типы координат, используемые для графического решения уравнения Михаэлиса-Ментен
- •3.4. Интегральная форма уравнения Михаэлиса-Ментен
- •3.5. Ингибирование ферментативных реакций
- •3.6. Примеры решения задач
- •3.7. Задачи для самостоятельного решения
- •3.8. Теоретические вопросы для самоподготовки
- •Заключение
- •Приложение 1. Свободная энергия образования, теплоты образования различных соединений при стандартных условиях
- •Приложение 2. Константы диссоциации аминокислот, органических кислот и оснований
- •Приложение 3. Элементарный состав сухой биомассы микроорганизмов
- •Список литературы
- •Суясов Николай Александрович
1.3. Примеры решения задач
Пример 1
Определите ΔG0(СО2), если известно, что при 30 0С активность углекислого газа в насыщенном растворе составляет 5,310-4 моль/моль, при аэрировании воды газовой смесью с Р(СО2) = 0,05 атм. ΔĞ0(СО2) = (- 382,9) кДж/моль.
Решение:
Исходя из условий задачи, можно записать уравнение, которое соответствует ΔĞ0(СО2):
,
тогда:
;
= - 394348,78 [Дж/моль].
Ответ: [Дж/моль].
Пример 2
а) Рассчитайте, может ли при 300 К самопроизвольно (ΔĞ' < 0) протекать реакция
при физиологических концентрациях (глюкоза – 0,01моль/л, НРО42- – 0,003моль/л, глюкозо-6-фосфат – 0,005моль/л), если известно, что рН = 7,0, а Ка диссоциации Н3РО4 составляют: для первой ступени – 10-2,1, для второй – 10-7,2, для третьей – 10-12,4; Ка1(глюкозо-6-фосфат) = 10-1,21, Ка2(глюкозо-6-фосфат) = 10-6,24. ΔĞ0 реакции равно 13,4 кДж/моль.
б) При каких условиях в расчетах необходимо было бы учитывать диссоциацию аниона НРО42-.
Решение:
а) Необходимо рассчитать для реакции:
,
где – поправка на реакцию аниона НРО42- (поскольку анион слева, то поправка принимается с отрицательным знаком);
–поправка на диссоциацию глюкозо-6-фосфат;
–поправка на физиологические концентрации.
;
= - 26949,3 [Дж/моль];
;
= - 33199,3 [Дж/моль];
;
= 22768,5 [Дж/моль];
;
= 29918,5 [Дж/моль],
следовательно, данная реакция не может протекать самопроизвольно при рассматриваемых условиях.
б) Диссоциацию аниона НРО42- необходимо было бы учитывать при значениях рН, близких к 12,0 – 13,0, так как при рН = 7,0
.
Но настоящая реакция не реализуема в сильно щелочных областях.
Ответ: а) самопроизвольно реакция протекать не будет;
б) диссоциацию аниона необходимо учитывать только в сильно щелочных областях рН.
1.4. Задачи для самостоятельного решения
При решении задач используйте данные, приведённые в приложении 1 и 2.
Задача 1
Рассчитайте растворимость водорода в воде, если известно, что при аэрировании воды газовой смесью с Р(Н2)=0,001 атм ΔĞ0(Н2) составляет 10,8 кДж/моль (Т = 30 0С).
Задача 2
Рассчитайте растворимость азота в воде, если известно, что при аэрировании воды газовой смесью с Р(N2)=0,79 атм ΔĞ0(N2) составляет 28,1 кДж/моль (Т = 30 0С).
Задача 3
Определите ΔG0(СН4), если известно, что при 30 0С активность метана в насыщенном растворе составляет 23,3*10-6 моль/моль, а при аэрировании воды метаном с Р(СН4)=1 атм ΔĞ0(СН4)= -23,9 кДж/моль.
Задача 4
Рассчитайте ΔG0, ΔĞ0, ΔĞ' для реакции в водном растворе:
, если известно, что:
параметр |
R1NH3+ |
R2COOH |
R1NHCOR2 |
H2O |
ΔG0образ. |
316,0 |
- 600,7 |
- 703,1 |
- 237,0 |
анас.р-ра |
9,7 |
14,4 |
4,9 |
- |
рКа |
- |
3,8 |
- |
- |
Физиол. концентрации, моль/л |
0,009 |
0,16 |
0,044 |
- |
Задача 5
Рассчитайте ΔG0, ΔĞ0, ΔĞ' для реакции в водном растворе: , если известно, что:
параметр |
R1NH2 |
R2COOH |
R1NHCOR2 |
H2O |
ΔG0образ. |
316,0 |
-600,7 |
- 703,1 |
- 237,0 |
анас.р-ра |
9,7 |
14,4 |
4,9 |
- |
рКа |
- |
3,8 |
- |
- |
Физиол. концентрации, моль/л |
0,009 |
0,16 |
0,044 |
- |
Задача 6
Рассчитайте ΔG0, ΔĞ0, ΔĞ' для реакции в водном растворе:
, если известно, что:
параметр |
R1NH3+ |
R2COOH |
R1NHCOR2 |
H2O |
ΔG0образ. |
- 354,5 |
- 437,2 |
- 581,4 |
- 237,0 |
анас.р-ра |
11,3 |
10,6 |
3,8 |
- |
рКа |
- |
3,0 |
- |
- |
Физиол. концентрации, моль/л |
3·10-2 |
0,2 |
0,035 |
- |
Задача 7
Рассчитайте ΔG0, ΔĞ0, ΔĞ' для реакции в водном растворе:
, если известно, что:
параметр |
R1NH2 |
R2COOH |
R1NHCOR2 |
H2O |
ΔG0образ. |
- 354,5 |
- 437,2 |
- 581,4 |
- 237,0 |
анас.р-ра |
11,3 |
10,6 |
3,8 |
- |
рКа |
- |
3,0 |
- |
- |
Физиол. концентрации, моль/л |
3·10-2 |
0,2 |
0,035 |
- |
Задача 8.
а) Одна из стадий цикла лимонной кислоты может быть описана следующим уравнением: . Рассчитайте ΔĞ0' для этого процесса, учитывая поправку на диссоциацию пирувата, если известно, что:
ΔĞр-ии() = 2,30 кДж/моль (концентрации компонентов = 1 моль/л, Р(газов) = 1атм,Н2О как компонент не учитывать), рН = 7,0, температура 30 0С, а (растворенных веществ) = 1, Р0'(СО2) = 0,05 атм, учитывая, что аэрирование осуществляется смесью с Р(О2) = 0,25 атм, растворимость кислорода – 7,63 мг/л.
б) Рассчитайте, как изменится ΔĞ0' этого процесса при снижении рН до 6,0. Предположите, можно ли регулировать этот процесс варьированием рН, какие могут быть ограничения.
Задача 9
а) Дрожжи рода Saccharomyces в аэробных условиях (в присутствии О2) способны окислять глюкозу до СО2, в то время как в анаэробных условиях осуществляется спиртовое брожение. Рассчитайте (на 1 моль глюкозы) ΔĞ0, ΔĞ0' (условия: Т = 30 0С, а (растворенных веществ) = 1, Р0'(СО2) = 0,05 атм) для обоих процессов, учитывая, что аэрирование осуществляется смесью с Р(О2) = 0,3 атм, растворимость кислорода – 7,63 мг/л;
б) В каком из двух случаев и во сколько раз будет использовано большее количество глюкозы на конструктивный обмен (анаболизм), где будет больший прирост дрожжевой биомассы? Ответ обоснуйте.
Задача 10
а) Фосфорилирование глюкозы в гликолизе может быть описано следующим уравнением:
Рассчитайте ΔĞ0' для этого процесса, учитывая поправку на реакцию аниона, если известно, что:
ΔĞр-ии() = 2,30 кДж/моль (концентрации компонентов = 1 моль/л, Р(газов) = 1атм,Н2О как компонент не учитывать), рН = 7,0, температура 30 0С, а (растворенных веществ)=1;
б) Объясните, почему при расчетах поправки на реакцию НРО42- диссоциацией этого аниона можно пренебречь (доказать).
Задача 11
а) В результате гетероферментативного кисломолочного сбраживания глюкозы помимо молочной кислоты (CH3CHOHCOOH) может образовываться спектр различных продуктов. Так, в случае бифидобактерий выделяется также уксусная кислота, а при сбраживании глюкозы культурой Leuconostoc mesenteroides помимо целевого продукта выделяется этанол и углекислый газ. Рассчитайте (на 1 моль глюкозы) ΔĞ0, ΔĞ0' (условия: Т = 37 0С, а (растворенных веществ)=1, Р0'(СО2) = 0,05 атм) для обоих процессов;
б) Сравните ΔĞ0 для обоих процессов, обоснуйте разницу с точки зрения статистического смысла энтропии.
Задача 12
а) Сравните к.п.д. (ΔĞ'гидролиз 1 моль АТФ/ΔĞ'образ. 1моль АТФ) получения АТФ из глюкозы при биохимических условиях, если известно, что при гомоферментативном молочнокислом брожении из одного моль С6Н12О6 образуется 2 моль АТФ, а при аэробном (в присутствии О2) – 38 моль АТФ. Процессы протекают при Т = 30 0С, рН = 7,0, ΔG0 (брожение глюкозы)= (- 230,5) кДж/моль, ΔG0(аэробное окисление глюкозы)= (- 2872,0) кДж/моль, Р(СО2) = 0,05 атм, аэрирование осуществляется кислородом воздуха с объемной долей О2 21 %, растворимость кислорода равна 8 мг/л.
ΔĞ'гидролиз АТФ= (- 33,5) кДж/моль.
б) Как изменится ΔĞ'образ. АТФ при молочнокислом брожении?
Задача 13
а) Определите максимальное количество глюкозы, которое может быть получено из СО2 и воды за счет энергии гидролиза 1 моль АТФ при физиологических условиях (РСО2 = 0,05 атм; растворимость СО2 = 5,3·10-4 моль/л; Сглюкоза = 0,01моль/л; рН = 7,0; Т = 300C; ΔĞ'гидролиз АТФ = (- 33,5) кДж/моль);
б) Рассчитайте поправку к процессу гидролиза АТФ ().
Задача 14
а) Определите константу диссоциации фосфоенолпирувата () при биохимических условиях, если известно, что ΔĞ0() = (- 55,6) кДж/моль, рН = 7,0, Т = 300С;
б) Какое влияние на равновесие данной системы окажет понижение рН, какие существуют ограничения по использованию кислотности среды для регулирования процесса?