- •Министерство образования и науки Российской Федерации Федеральное агентство по образованию
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Термодинамическое описание биохимических реакций
- •1.1. Расчёт изменения свободной энергии химических реакций
- •1.2. Практические расчеты при описании биохимических реакций
- •1.3. Примеры решения задач
- •1.4. Задачи для самостоятельного решения
- •1.5. Теоретические вопросы для самоподготовки
- •2. Стехиометрические расчеты биотехнологических процессов
- •2.1. Стехиометрия и материальный баланс микробиологических процессов
- •2.2. Расчёт выхода биомассы на углеродный субстрат
- •2.3. Энергетическая эффективность процессов микробиологического синтеза
- •2.4. Примеры решения задач
- •2. Уравнение катаболизма:
- •3. Брутто-реакция:
- •2.5. Задачи для самостоятельного решения
- •2.6. Теоретические вопросы для самоподготовки
- •3. Ферментативная кинетика и катализ
- •3.1. Общая характеристика ферментов
- •3.2. Кинетическое описание ферментативных процессов
- •3.3. Различные типы координат, используемые для графического решения уравнения Михаэлиса-Ментен
- •3.4. Интегральная форма уравнения Михаэлиса-Ментен
- •3.5. Ингибирование ферментативных реакций
- •3.6. Примеры решения задач
- •3.7. Задачи для самостоятельного решения
- •3.8. Теоретические вопросы для самоподготовки
- •Заключение
- •Приложение 1. Свободная энергия образования, теплоты образования различных соединений при стандартных условиях
- •Приложение 2. Константы диссоциации аминокислот, органических кислот и оснований
- •Приложение 3. Элементарный состав сухой биомассы микроорганизмов
- •Список литературы
- •Суясов Николай Александрович
2.3. Энергетическая эффективность процессов микробиологического синтеза
Наиболее часто в биохимии и динамике клеточных популяций используются два термодинамических потенциала – энтальпия (H) и свободная энергия Гиббса (G), которые описывают, соответственно, тепловыделение и самопроизвольность реакции при постоянных температуре и давлении. Примеры ΔН0 и ΔG0кат. для ряда микробиологических процессов представлены в табл. 2.
Расчёт теплового эффекта. Стехиометрическое уравнение позволяет определить тепловой эффект брутто-процесса ферментации. В термохимических расчётах обычно используются стандартные теплоты образования реагентов ∆ Н0f ,298, которые невелики по абсолютной величине, что увеличивает точность расчёта. В микробиологических процессах соответствующее расчётное уравнение имеет вид:
[кДж], (2.10)
где (∆ Н0f ,298)p – теплота образования продуктов, кДж·моль-1;
(∆ Н0f ,298)АСБ – теплота образования биомассы, кДж·моль-1;
(∆ Н0f ,298)S – теплота образования субстратов, кДж·моль-1;
n – общее количество субстратов;
m – общее число продуктов метаболизма;
υj – стехиометрический коэффициент для j-го продукта, моль;
υi – стехиометрический коэффициент для i-го субстрата, моль.
Есть ещё один способ расчёта теплового эффекта, который может быть использоваться для аэробных процессов, если известно количество молекулярного кислорода (О2), израсходованного в брутто-реакции, то тепловыделение можно определить по формуле:
[кДж], (2.11)
где ∆MO2 – количество израсходованного кислорода,·моль;
460 – эмпирический коэффициент.
Расчёт свободной энергии. Разбиение стехиометрического уравнения (2.1) на две части, условно описывающие анаболические и катаболические процессы – уравнения (2.4) и (2.5) – позволяет использовать последнее уравнение для нахождения меры эффективности затрат свободной энергии на биосинтез. Изменение свободной энергии по реакции (2.5) является характеристикой всей совокупности метаболических путей для данных клеток в заданных условиях, и эта характеристика показывает, какое количество свободной энергии, выделившейся при катаболизме, «имели в своем распоряжении и израсходовали» клетки в ходе размножения и роста популяции. ΔG считают для сравнения субстратов (считают на 1 моль субстрата).
В заключение следует отметить, что при расчётах теплового эффекта и изменения свободной энергии не принимается во внимание превращение источника азота в азот биомассы, так как содержание азота в биомассе невелико и им допустимо пренебречь, т.е. при расчётах термодинамических величин NH4OH не учитывают.
Таблица 2.
Оценка свободной энергии некоторых процессов биосинтеза
Тип микро-организма |
Субстрат |
Стехиометрия биосинтеза* |
ΔН0, кДж/г АСБ |
Оценка ΔG0, кДж/г АСБ |
дрожжи |
н-С16Н34 |
– 24,8 |
– 24,7 | |
С2Н5ОН |
– 18,6 |
– 18,0 | ||
СН3СООН |
– 19,5 |
– 22,9 | ||
С6Н12О6 |
– 11,0 |
– 13,0 | ||
С6Н12О6 |
– 4,4 |
– 16,1 | ||
i-С3Н7ОН |
– 60,1 |
– 62,1 | ||
(=СНСООН)2 |
– 13,7 |
– 18,4 | ||
Бактерии |
СН4 |
– 34,2 |
– 30,5 | |
СН3ОН |
– 35,9 |
– 35,7 | ||
С6Н12О6 |
– 4,9 |
– 7,5 | ||
СО2, Н2 |
– 87,2 |
– 64,1 |
* без учёта потребления NH4OH – 0,0063 моль для дрожжей и 0,0069 моль для бактерий.