- •Федеральное агенство по образованИю Белгородский государственный университет
- •Самостоятельная работа студентов по биологической химии
- •Оглавление
- •Раздел №1 Введение в биохимию. Структура и функции белков. Ферменты
- •Тема 1.1. Введение в биологическую химию. Техника безопасности
- •Тема 1.2. Строение и функции белков. Аминокислотный состав белков
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 1.3. Физико-химические свойства белков
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 1.4. Сложные белки
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 1.5. Ферменты. Строение и свойства
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 1.6. Ферменты. Кинетика ферментативных реакций
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 1.7. Регуляция активности ферментов. Медицинская энзимология
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 1.8. Биохимия белков и ферментов (контрольно – итоговое занятие №1)
- •Раздел № 2 Нуклеиновые кислоты. Матричные биосинтезы
- •Тема 2.1. Строение и свойства нуклеиновых кислот и нуклеотидов
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 2.2. Матричные биосинтезы
- •Для усвоения материала темы следует обратить внимание на то, что:
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 2.3. Строение нуклеиновых кислот. Матричные биосинтзы (контрольно – итоговое занятие №2)
- •Раздел № 3 Энергетический обмен. Общие пути катаболизма
- •Тема 3.1. Биологические мембраны
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 3.2. Введение в обмен веществ. Общие пути катаболизма
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 3.3. Энергетический обмен. Окислительное фосфорилировие
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 3.4. Энергетический обмен. Общие пути катаболизма (контрольно-итоговое занятие №3)
- •Вопросы к контрольно-итоговому занятию № 3
- •Раздел № 4 Обмен веществ
- •Тема 4.1. Обмен и функции углеводов. Обмен Гликогена
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.2. Специфические пути распада глюкозы
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.3. Глюконеогенез. Обмен лактата в печени и мышцах
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.4. Пентозофосфатный путь. Обмен фруктозы, галактозы, этанола
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.5. Обмен и функции липидов. Переваривание
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.6. Метаболизм жирных кислот и кетоновых тел
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.7. Метаболизм жиров. Обмен холестерола
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.8. Обмен аминокислот
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.9. Образование и обезвреживание аммиака. Обмен отдельных аминокислот
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.10. Обмен нуклеотидов
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 4.11. Обмен веществ и энергии (контрольно-итоговое занятие №4)
- •Вопросы и задачи к контрольно-итоговому занятию № 4
- •Раздел № 5 Гормональная регуляция Обмен веществ. Витамины
- •Тема 5.1. Гормоны: синтез, секреция, механизм действия
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 5.2. Гормоны, регулирующие обмен углеводов, липидов и аминокислот. Водно-солевой и менеральный обмены
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 5.3. Тиреоидные гормоны и гормоны, регулирующие репродуктивную функцию
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 5.4. Биохимия витаминов
- •Тема 5.5. Гормональная регуляция обмена веществ. Витамины (контрольно-итоговое занятие № 5)
- •Вопросы и задачи к контрольно-итоговому занятию № 5
- •Раздел № 6 биохимия органов и тканей
- •Тема 6.1. Биохимия печени. Канцерогенез
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 6.2. Биохимия крови
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 6.3. Биохимия крови. Гемостаз
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 6.4. Биохимия почек и мочи
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 6.5. Биохимия межклеточного матрикса и мышечной ткани
- •Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
- •Тема 6.6. Биохимия органов и тканей (контрольно-итоговое занятие № 6)
- •Вопросы и задачи к контрольно-итоговому занятию № 6
- •Словарь биохимических терминов
Вопросы и упражнения для самоподготовки и контроля усвоения темы
Напишите формулу АТФ, обозначив макроэргические связи. Какова величина энергии, освобождающейся при распаде 1 М АТФ?
Какие межатомные связи называют макроэргическими?
Укажите роль АТФ в организме.
Какова «длительность жизни» молекул АТФ в клетках высших организмов? Каково суммарное количество АТФ, синтезирующееся (и распадающееся) за сутки в организме взрослого человека?
Охарактеризуйте катаболические, анаболические и амфиболические пути в обмене веществ, их значение и взаимосвязь с обменом энергии.
Какие процессы в организме требуют затрат энергии? Какой компонент пищи является главным источником энергии для человека? В чем заключается биологическая роль процессов распада органических веществ в организме?
Охарактеризуйте стадии катаболизма веществ. Как образуется Н2О и СО2при окислительном распаде в клетках органических субстратов?
Что такое биологическое окисление? Что такое тканевое дыхание? История изучения процессов тканевого дыхания.
Сколько витаминов принимают участие в окислительном декарбоксилировании пировиноградной кислоты?
В чем заключается сущность цикла трикарбоновых кислот?
Укажите, к какому классу относится каждый из ферментов цикла Кребса.
Назовите все субстраты окисления в цикле трикарбоновых кислот.
Какие кофакторы необходимы для работы II,IV,VIиVIIIферментов ЦТК?
При отсутствии какого витамина скорость ЦТК не будет нарушаться: цианокобаламин, тиамин, пантотеновая кислота, никотинамид, рибофлавин?
В клинику доставили пострадавших во время землетрясения, находившихся без пищи 10 дней. Исследования активности ферментов ЦТК показали резкое снижение скорости этого процесса. Какие последствия это имеет для организма?
А. Обезвоживание. Б. Снижение уровня АТФ. В. Снижение уровня глюкозы в крови. Г. Образование большого количества эндогенной воды.
Какие ферменты ЦТК являются регуляторными? Какие метаболиты и как на них влияют?
Что понимают под амфиболичностью цикла Кребса?
Заполните пропуски: НАД-зависимые дегидрогеназы катализирут окисление на этапах превращения …..(1) в…..(2),…..(3) в…..(4),…..(5) в…..(6). С осуществлением каждого из этих этапов сопряжено образование…..(7) молекул АТФ. ФАД-зависимые дегидрогеназы катализируют окисление на этапе превращения…..(8) в…..(9). С осуществлением этого этапа сопряжено образование…..(10) молекул АТФ. Субстратное фосфорилирование происходит на этапе превращения…..(11) в…..(12). С этим этапом сопряжено образование…..(13) молекул АТФ.
Рекомендуется (на отдельном листе) изобразить в виде схемы общий путь катаболизма.
Литература для самоподготовки. Лекционный материал; (1) - С. 186-188, 235-247; (2) - С. 344-349; (3) - С. 119-130; (4) - 1т. С. 172-180, 186-188.
Тема 3.3. Энергетический обмен. Окислительное фосфорилировие
Цель занятия. Изучить химическое строение и последовательность расположения компонентов цепи переноса электронов (ЦПЭ). Понимать химизм процессов передачи электронов и протонов и при участии ферментов дыхательной цепи. Изучить процессы окислительного фосфорилирования и окислительные системы, не связанные с продукцией энергии. Изучить действие окислительно-восстановительных ферментов.
Исходный уровень.Экзергонические и эндергонические реакции, редокс-потенциал, понятие об окислении и восстановлении (курс биоорганической химии) Строение митохондрий (курс гистологии), понятие о свободных радикалах (курс биоорганической химии).
Повторить.Строение ферментов, коферментов, необратимые ингибиторы. Реакции ЦТК, понятие о свободных радикалах.
Содержание теоретического материала. 1. Биологическое окисление и тканевое дыхание. Типы окисляемых субстратов. 2. Строение митохондрий и структурная организация цепи переноса электронов. Цепь переноса электронов как часть системы дыхания. Функции дыхательной цепи. 3. Характеристика компонентов дыхательной цепи: НАД-зависимые дегидрогеназы. ФМН (ФАД) - зависимые дегидрогеназы. Строение и биологическая роль убихинонов. Строение и функции цитохромов. 4. Механизм окислительного фосфорилирования АДФ. Хемиосмотическая теория Митчела. Механизм сопряжения дыхания и фосфорилирования в митохондриях. Создание электрохимического трансмембранного протонного градиента - движущей силы синтеза АТФ. 5. Определение мест сопряженного синтеза АТФ при помощи ингибиторов дыхательной цепи. Характеристика и роль Н+-АТФ-синтетазы в механизме образования АТФ и воды. 6. Регуляция работы цепи переноса электронов. Разобщение тканевого дыхания и окислительного фосфорилирования. Дыхательный коэффициент (Р/О) и дыхательный контроль. 7. Нарушения энергетического обмена: гипоэнергетические состояния как результат гипоксии, гипоавитаминозов и др. причин. (*)8. Термогенная функция энергетического обмена в бурой жировой ткани. Возрастная характеристика энергетического обеспечения организма питательными веществами.
Для усвоения материала темы следует обратить внимание на то, что:
1) Тканевое дыхание – процесс окисления водорода субстратов в дыхательной цепи с образованием эндогенной воды в клетках. Это основной источник энергии для реакции синтеза АТФ в клетках.
2) Ферменты дыхательной цепи располагаются в соответствии с уменьшением величины отрицательных окислительно-восстановительных потенциалов их коферментов и простетических групп.
3) Дыхательная цепь – это последовательно протекающие окислительно-восстановительные реакции. Роль переносчиков электронов при этом выполняют НАД+, ФМН+, КоQ, цитохромы.
4) В результате окисления субстратов и переноса электронов и протонов на кислород в организме синтезируется вода. Этот процесс сопровождается изменением свободной энергии на каждом этапе ЦПЭ.
5) В ЦПЭ есть три участка, в которых наблюдается большое снижение свободной энергии. Эта энергия используется для сопряженного синтеза АТФ (50-60%), а 40-50% ее выделяется в виде тепла.
6) Энергия, выделяемая при транспорте электронов, запасается в виде градиента протонов.
7) При транслокации протонов происходит выброс их из матрикса в межмембранное пространство и на внутренней мембране возникает мембранный потенциал.
8) При работе протонного насоса протоны возвращаются в матрикс, это сопровождается синтезом АТФ при помощи АТФ-синтетазы.
9) Участки сопряжения окисления и фосфорилирования определены с помощью специфических ингибиторов.
10) Разобщители окислительного фосфорилирования - вещества, которые увеличивают проницаемость мембран митохондрий для ионов Nа+, К+, Н+.
11) Коэффициент фосфорилирования (Р/О) показывает число синтезированных молекул АТФ при сопряженном переносе пары электронов по ЦПЭ на один атом кислорода, использованный в процессе дыхания.
12) (*)В митохондриях бурой жировой ткани процесс окисления субстрата и фосфорилирования АДФ в F1 - комплексе разделен специфическим разобщающим белком термогенином, за счет которого протонный градиент снижается без синтеза АТФ, при этом энергия, высвобождающаяся при окислении субстрата, переходит в тепло.