- •Основы биологической химии предисловие
- •Введение Предмет и задачи биохимии
- •Основные признаки живой материи
- •Глава 1. Химический состав организмов
- •Глава 2. Структура и свойства белков
- •2.1. Роль и определение белков.
- •2.2. Функции белков в организме
- •2.3. Элементный состав белков. Содержание белков в органах и тканях
- •2.4. Аминокислотный состав белков
- •2.5. Кислотно-основные свойства аминокислот
- •2.6. Стереохимия аминокислот
- •2.7. Строение белков
- •2.8. Уровни структурной организации белков
- •Первичная структура
- •Вторичная структура белков
- •Третичная структура белков
- •Четвертичная структура белков
- •2.9. Физико-химические свойства белков
- •Кислотно-основные свойства белков
- •Растворимость белков
- •Денатурация и ренатурация
- •2.10. Классификация белков
- •2.11. Методы выделения и очистки белков
- •Очистка белков
- •Глава 3. Углеводы
- •3.1. Понятие об углеводах и их классификация
- •3.2. Моносахариды
- •Оптические свойства моносахаридов
- •Структура моносахаридов
- •3.3. Химические свойства моносахаридов Реакции с участием карбонильной группы
- •Реакции с участием гидроксильных групп
- •3.4. Сложные углеводы
- •Олигосахариды
- •Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •Гетерополисахариды
- •3.5. Биологические функции углеводов
- •Глава 4. Нуклеиновые кислоты
- •4.1. Общая характеристика нуклеиновых кислот
- •4.2. Химический состав и строение нуклеиновых кислот
- •4.3. Уровни структурной организации нуклеиновых кислот
- •Первичная структура нуклеиновых кислот
- •Вторичная структура днк
- •Вторичная структура рнк
- •Третичная структура рнк и днк
- •Глава 5. Липиды
- •5.1. Общая характеристика и классификация липидов
- •5.2. Липидные мономеры
- •5.3. Многокомпонентные липиды
- •5.4. Биологические функции липидов
- •Глава 6. Ферменты
- •6.2. Химическая природа и структура ферментов
- •6.3. Кофакторы ферментов Ионы металлов как кофакторы ферментов
- •Коферменты
- •6.4. Механизм действия ферментов
- •6.5. Свойства ферментов
- •6.6. Специфичность действия ферментов
- •6.7. Факторы, влияющие на скорость ферментативного катализа
- •Влияние температуры на активность ферментов
- •Влияние рН на активность ферментов
- •Влияние концентраций субстрата и фермента на скорость ферментативной реакции
- •Зависимость скорости реакции от времени
- •6.8. Регуляция активности ферментов
- •Активация ферментов
- •Ингибирование ферментов
- •Аллостерическая регуляций действия ферментов
- •6.9. Определение активности ферментов
- •6.10. Номенклатура и классификация ферментов
- •6.11. Локализация ферментов в организме и клетке
- •6.12. Применение ферментов
- •Глава 7. Витамины
- •7.1.Понятие о витаминах
- •7.2. Классификация витаминов
- •7.3. Жирорастворимые витамины
- •7.4. Водорастворимые витамины
- •7.5. Витаминоподобные вещества
- •Глава 8. Общие закономерности обмена веществ и энергии в организме
- •8.1. Обмен веществ
- •8.2. Обмен энергии
- •Глава 9. Биологическое окисление
- •9.2. Дыхательная цепь
- •9.3. Окислительное фосфорилирование
- •Глава 10. Обмен углеводов
- •10.1. Переваривание углеводов
- •10.2. Метаболизм глюкозы
- •10.3. Биосинтез гликогена
- •10.4. Распад гликогена
- •10.5. Анаэробный гликолиз
- •10.6. Аэробный распад глюкозы
- •Аэробный распад глюкозы в мозге
- •10.7. Пентозофосфатный цикл
- •10.8. Биосинтез глюкозы (глюконеогенез)
- •10.10. Регуляция обмена углеводов
- •Глава 11. Обмен липидов
- •11.1. Переваривание липидов
- •11.2. Метаболизм глицерина
- •11.3. Метаболизм жирных кислот
- •11.4. Биосинтез жиров
- •11.5. Регуляция обмена липидов
- •Глава 12. Обмен нуклеиновых кислот
- •12.1. Пути распада рнк и днк
- •12.2. Распад пуриновых и пиримидиновых оснований
- •12.3. Биосинтез нуклеотидов
- •Биосинтез пурииовых нуклеотидов
- •Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов
- •Биосинтез дезоксирибонуклеотидов
- •12.4. Биосинтез нуклеиновых кислот
- •Биосинтез днк (репликация)
- •Биосинтез рнк (транскрипция)
- •Безматричный синтез рнк
- •12.5. Путь информации от генотипа к фенотипу
- •Глава 13. Обмен белков
- •13.1. Понятие об обмене белков
- •13.2. Переваривание белков пищи и распад белков тканей Переваривание белков
- •Распад белков в тканях
- •13.3. Метаболизм аминокислот
- •Трансаминирование аминокислот
- •Дезамииирование аминокислот
- •Превращение углеродных скелетов аминокислот. Реакции декарбоксилирования
- •13.4. Удаление аммиака из организма. Орнитиновый цикл
- •13.5. Синтез аминокислот
- •13.6. Биосинтез белков (трансляция)
- •Глава 14. Водно-солевой и минеральный обмен
- •14.1. Водно-солевой обмен Содержание воды в организме и клетке
- •Роль и функции воды в процессе жизнедеятельности
- •14.2. Регуляция водно-солевого обмена
- •Регуляция рН
- •14.3. Минеральный обмен Минеральные вещества
- •Функции минеральных веществ
- •Минеральные вещества и обмен нуклеиновых кислот
- •Минеральные вещества и обмен белков
- •Минеральные вещества и обмен углеводов и липидов
- •14.4. Регуляция минерального обмена
- •Глава 15. Взаимосвязь обмена белков, жиров, углеводов и нуклеиновых кислот
- •Глава 16. Гормоны, нервно-гормональная регуляция обмена веществ
- •16.1. Понятие о гормонах. Основные принципы регуляции обмена веществ
- •16.2. Классификация гормонов
- •16.3. Общие представления о действии гормонов
- •16.4. Гормоны щитовидной и паращитовидных желез Гормоны щитовидной железы
- •Гормоны паращитовидных желез
- •16.5. Гормоны поджелудочной железы
- •16.6. Гормоны надпочечников
- •16.7. Гормоны половых желез
- •16.8. Гормоны гипоталамо-гипофизарной системы
- •16.9. Гормоны тимуса и эпифиза
- •16.10. Простагландины
- •16.11. Биохимическая адаптация
- •Рекомендуемая литература
- •Оглавление
Превращение углеродных скелетов аминокислот. Реакции декарбоксилирования
Углеродные скелеты белковых аминокислот после отщепления аминогрупп в конечном итоге превращаются в пять продуктов, которые вовлекаются в цикл Кребса. Глицин, аланин, лейцин, цистеин, серии, треонин, лизин, триптофан превращаются в ацетил-КоА; фенилаланин и тирозин - в ацетил-КоА и фумарат; изолейцин - в ацетил-КоА и сукцинил-КоА; аргинин, гистидин, глутамин, глутамат, пролин - в α-кетоглутарат; аспаргин и аспартат - в оксалоацетат. Сгорая до СО2 и Н2О, аминокислота дает значительное количество энергии, почти такое же, как при аэробном окислении глюкозы.
Частным случаем превращений углеродных скелетов аминокислот является их декарбоксилирование - процесс отщепления карбоксильной группы в виде СО2. Не все аминокислоты подвергаются декарбоксилированию, причем у микроорганизмов и растений этому превращению подвергается большее количество аминокислот, чем у животных и человека. Реакции декарбоксилирования являются необратимыми. Наиболее распространено α-декарбоксилирование, протекающее по схеме:
-
Аминокислота
Амин
Реакция катализируется декарбоксилазами аминокислот с коферментом - пиродоксальфосфатом. Продуктами реакции являются СО2 и амины, названные биогенными вследствие их сильного фармакологического действия на множество физиологических функций человека и животных.
13.4. Удаление аммиака из организма. Орнитиновый цикл
Аммиак очень токсичное соединение, особенно для нервных клеток. При накоплении его возникает возбуждение нервной системы. Поэтому концентрация аммиака в организме должна сохраняться на низком уровне. Уровень аммиака в норме в крови не превышает 1-2 мг/л (это почти в 1000 раз меньше концентрации сахара в крови). На кроликах показано, что концентрация аммиака 50 мг/л является летальной. Таким образом, аммиак должен подвергаться связыванию в тканях с образованием нетоксичных соединений, легко выделяемых с мочой.
Аммиак образуется в ходе следующих процессов:
- дезаминирование аминокислот;
- дезаминирование биогенных аминов;
- дезаминирование пуриновых оснований (гуанина и аденина);
- дезаминирование глутамина и аспарагина;
- распад пиримидиновых оснований (урацила, тимина, цитозина). В тканях организма существуют следующие пути обезвреживания аммиака:
- образование мочевины (орнитиновый цикл);
- восстановительное аминирование кетокислот;
- образование амидов аминокислот - аспарагина и глутамина;
- образование аммонийных солей.
Главный путь обезвреживания аммиака - синтез мочевины, происходящий в печени.
В 1933 году Кребс и Гензелейт установили, что синтез мочевины представляет собой циклический процесс, в котором каталитическую роль играет орнитин. В последующие десятилетия были раскрыты все реакции этого процесса, и он получил название орнитинового цикла, или цикла Кребса-Гензелейта (рис. 39).
Рис. 39. Орнитиновый цикл мочевинобразования
Начальной реакцией этого цикла является синтез высокоэнергетического соединения - карбамоилфосфата под действием фермента - карбамоилфосфатсинтетазы:
Карбамоильная группа далее переносится на орнитин с образованием цитруллина; реакцию катализирует орнитин-карбамоилтрансфераза:
-
Орнитин
Карбамоилфосфат
Цитруллин
Затем цитруллин- реагирует с аспарагиновой кислотой, превращаясь в аргининянтарную кислоту при действии аргининосукцинатсинтетазы:
-
Цитруллин
Аспартат
Аргининосукцинат
Аргининосукцинат под действием аргининосукциназы распадается на аргинин и фумаровую кислоту:
-
Аргининосукцинат
Аргинин
Фумарат
Далее аргинин гидролизуется аргиназой с образованием мочевины и орнитина:
Аргинин |
Орнитин |
Мочевина |
Мочевина поступает с током крови а почки и уносится из организма с мочой, а орнитин возвращается в цикл. Реакции орнитинового цикла до стадии образования цитруллина происходят в митохондриях, а последующие стадии - в цитозоле клеток. Если человек в сутки получает 80-100 г белков, то образуется 25-30 г мочевины.
Важным вспомогательным путем связывания аммиака является образование аспарагина и глутамина с участием аспарагинсинтетазы и глутаминсинтетазы соответственно:
аспартат + АТФ + NH3 = аспарагин + АМФ + Н4Р2О7;
глутамат + АТФ + NH3 = глутамин + АДФ + H3PО4.
Эти процессы активны в нервной и мышечной тканях, в почках, в печени.
Часть аммиака легко связывается с α-кетоглутаровой кислотой, т.е. протекает реакция, обратная окислительному дезаминированию глутаминовой кислоты:
α-кетоглутарат + NH3 глутамат + Н2О
Но вклад этой реакции в обезвреживание аммиака невелик, так как необходимы значительные количества α-кетоглутарата.
Глутамин и в меньшей степени аспарагин считают как бы транспортной формой аммиака, так как, образуясь в тканях, они с кровью попадают в почки, где подвергаются гидролизу под действием специфических ферментов - глутаминазы и аспарагиназы:
аспарагин + Н2О = аспартат + NH3;
глутамин + H2O = глутамат + NH3.
Освободившийся в канальцах почек аммиак нейтрализует кислые продукты обмена при ацидозе, защищая тем самым организм от потери с мочой ионов Na+ и К*. При этом образуются соли аммония:
NH3 + Н+ + СI¯ = NH4CI,
которые выделяются с мочой.